Brainscape's Knowledge GenomeTM

Browse over 1 million classes created by top students, professors, publishers, and experts.


See full index

BMA042, Molekylärbiologi > Mitokondriell och prokaryot transkription > Flashcards

Mitokondriell och prokaryot transkription Flashcards

1
Q

Vad kallas det genom som hittas i en mitokondrie?

A

Mitokondriellt DNA (mtDNA)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Vilka två olika arvsmassor har humana celler? Varifrån ärvs dessa?

A
  • Nukleärt DNA - ärvs från båda föräldrarna
  • Mitokondriellt DNA - ärvs bara från mamman
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Mitokondrien var från början en bakterie. Beskriv hur han utvecklades till en organell?

A
  1. En anaerob värdcell slukade en aerob bakterie
  2. Ett symbiotiskt förhållande utvecklades
  3. Bakterien fann en säker plats med stora mängder substrat för sin energiproduktion
  4. Värdcellen fick en mer effektiv metabolism
  5. Ett steg på vägen mot den eukaryota cellen
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Hur mycket mitokondriellt DNA respektive nukleärt DNA har vi per cell? Vad har de två genomen för struktur/form?

A

Nukleärt DNA har 2 kopior / cell, linjära kromosomer

Mitokondriellt DNA har 1000-10 000 kopior / cell, cirkulärt genom

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Hur många proteiner kodar mtDNA för? Varför behövs dessa?

A

13 stycken proteiner

De är viktiga för andningskedjans funktion

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Vilken form av excisionsreparationsmekanismen har mtDNA?

A

Base-excition repair

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

När kan skador i mtDNA uppstå?

A

Vid dess replikation (kopiering)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Vad kodar mtDNA för?

A
  • 13 proteiner
  • 22 tRNA
  • 2 rRNA
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Kan mtDNA reparera dubbelsträngs-brott?

A

Nej, ingen homolog rekombination

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Hur kan man manipulera mtDNA inne i cellen?

A

Det kan man inte

Man kan däremot ta ut proteiner och mtDNA ur cellen och studera dem i provrör

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Använder mitokondrien samma RNA-polymeras som det nukleära DNAt?

A

No, den har ett eget

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Vilka är symtomen på mitokondriell sjukdom?

A
  • Muskelsvaghet
  • Hörselnedsättning
  • Problem med balans och koordination (ataxi)
  • Inlärningssvårigheter
  • Kramper
  • Diabetes
  • Påskyndat åldrande
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Vad innebär mitokondriell sjukdom?

A

Att ATP produktionen är nedsatt, på grund av störningar i mitokondriefunktion

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Ge exempel på en mitokondriell sjukdom?

A
  • Pearson’s syndrome
  • Leber’s hereditary optic neuropathy (LHON)
  • Progressive external opthalmoplegia (PEO)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Vad är heteroplasmi?

A

En blandning av skadade och normala kopior av mtDNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Vad orsakas LHON (leber’s hereditary optic neuropathy) av och vad händer?

A

Näthinnans celler slutar fungera

Orsakas av skador på mtDNA, som sänker andningskedjans funktion - lägre ATP

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Vad händer / vilka är symtomerna för progressive external ophthalmoplegia (PEO)?

A

Svaghet i de yttre ögonmusklerna och “exercise intolerance”

Ytterligare symtom är att man tappar hörseln, svårigheter att svälja, ataxia (svårighet med samordning av kroppsrörelser)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Vilka är de huvudsakliga molekylärbiologiska processer som utgör den centrala dogmen?

A
  • Replikation
  • Transkription
  • Translation
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Vad är en template strand? Vad är en non-template strand?

A

Template strand - den sträng som fungerar som mall, som är icke-kodande

Non-template strand - den kodande strängen som är “samma” som RNA-strängen

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q
A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Vad är en gen?

A

En nukleotidsekvens i DNA:t som krävs för syntesen av ett fungerande protein ELLER en RNA-molekyl

Det kallas gen även om det kodar för ett tRNA, rRNA eller andra RNA molekyler

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

När sker transkription och translation i prokaryoter?

A

Efter replikation, men samtidigt

23
Q

Vad gör mRNA?

A

Messenger RNA “förmedlar” information från DNA:t till protein

mRNA processas inte hos prokaryoter så som det görs hos eukaryoter (ta det sen, fan)

24
Q

Vad är “housekeeping genes”?

A

“Housekeeping genes” är gener som alltid är påslagna och som behövs för att bakterien ska fungera normalt

Vad som är påslaget beror på vilka funktioner vi vill åt (“vi som bakterier alltså”)

25
Q

Vilka olika typer av RNA finns och vad är dess respektive funktion?

A
26
Q

Hur kan DNA skrivas om till RNA?

A

TRANSKRIPTION BITCHES

27
Q

Vad innebär det att RNA polymeraser kan syntetisera RNA “de novo”?

A

De behöver ingen primer för att starta RNA syntes

28
Q

Vilken av DNA:ts strängar kan användas som template strand för RNA syntes?

A

Båda kan användas

29
Q

I vilken riktning syntetiseras RNA och DNA?

A

Från 5’ till 3’ riktning

30
Q

Hur vet du vilken sträng som är template strand respektive non-template strand?

A

Den sträng som skrivs av till RNA bestäms av riktningen på RNA polymeraset

Om man inte vet riktningen på RNA polymeraset, kan man inte veta vilken sträng som är template strand

31
Q

Vad är rare excision repari?

A

Reparationssystemet som reparerar de fall där U används instället för T

Skillnaden är att T är metylerad och U är inte det

32
Q

Hur vet RNA polymeraset vilken riktning den ska transkribera?

A

Riktningen bestäms med hjälp av en promotor

33
Q

Vad är en promotor?

A

En promotor är den sekvens framför en gen som reglerar genens uttryck genom att olika genregulatoriska proteiner binder till sekvensen

Promotorsekvensen visar också exakt vart RNA polymeraset ska påbörja transkriptionen

34
Q

Vad är en transkriptionsenhet?

A

Den sekvens i DNA:t som transkriberas till RNA

Startar vid promotorn och slutar vid terminatorn

35
Q

Hur ser en terminatorsekvens ofta ut?

A

Det är ett GC-rikt område följt av en mängd A/T på raken

36
Q

Hur hittar RNA polymeraset till promotorn?

A

Sigma-subenheten av RNA polymeraset styr enzymet till promotorn, där transkriptionen påbörjas

37
Q

Hur många subenheter består RNA polymeras av?

A

6 subenheter

38
Q

Vilka är RNA polymerasets subenheter och vad har de för funktioner?

A
  • Två α (alfa) subenheter binder till reglersekvenser (UP-element, dvs uppströms promotor element)
  • β (beta) är den katalytiska subenheten dvs. den som syntetiserar RNA i 5’ till 3’ riktning
  • β’ (beta) binder RNA polymeraset till DNA:t
  • σ (sigma) styr enzymet till promotorn
  • ω (omega) troligtvis nödvändig för RNA polymerasets ”ihopsättning”
39
Q

Vad är skillnaden på kärnenzymet och holoenzymet?

A

Kärnenzymet

  • binder inte specifikt till promotorn
  • binder starkt till icke-specifikt DNA
  • utför katalys

Holoenzymet (kärnenzym + sigma-subenhet)

  • binder specifikt till promotorn
  • svag icke-specifik DNA bindning
  • hittar promotorn 10 000 gånger snabbare än kärnenzym
40
Q
A
41
Q

Vilken är den vanligaste sigma-faktorn? Vad är dess funktion?

A

s70

Uttrycker alla housekeeping genes (= gener som uttrycks hela tiden)

42
Q

Ge exempel på olika sigma-faktorer och dess funktion?

A
  • s70 - housekeeping
  • s54 - styr kvävenivåer i cellen
  • s38 - “stationary phase genes”
  • s32 - “heat shock genes”
  • s28 - “flagella and chemotaxis genes”
    *
43
Q

Hur är en promotor uppbyggd?

A

Två olika regioner på vardera 6 baspar som ligger -10, respektive -35 baspar uppströms från transkriptionens startställe

44
Q

Vad är en konsensus sekvens?

A

I molekylärbiologi och bioinformatik är konsensussekvensen den beräknade ordningen för de vanligaste resterna, antingen nukleotid eller aminosyra, som finns vid varje position i en sekvensinriktning

45
Q

Vad är “strong promoters” respektive “weak promoters”?

A

Strong promoters - nära konsensus sekvensen och spacer

Weak promoters - innehåller flera substitutioner vid -35 och -10 regionerna

46
Q

Själva transkriptionsförloppet kan kortfattat beskrivas i 6 faser. Vilka är det?

A
  1. Bindning till promotorn
  2. Transkriptionsbubbla bildas
  3. Initiering av transkriptionen
  4. Promoter clearance
  5. Elongering av transkriptionen
  6. Terminering av transkriptionen
47
Q

Vad är “promoter clearance”?

A

När RNA polymeraset lämnar nukleotidsekvensen

48
Q

Vad är “abortive transkription”?

A

När RNA polymeraset ramlar av DNA-sekvensen den transkriberar för tidigt

49
Q

Ge exempel på en elongeringsfaktor för RNA polymeras i bakterier?

A

NusA

50
Q

[Ej fråga] Schematisk bild på transkriberande RNA-polymeras

A
51
Q

Hur vet RNA polymeraset när det ska sluta transkribera?

A

Två olika sätt för att terminera transkription hos bakterier:

  1. Rho-oberoende transkriptionsterminering
  2. Rho-beroende transkriptionsterminering
52
Q

Vad innebär Rho-oberoende terminering?

A

RNA-transkriptionen avstannar när RNA:t bildar en G-C rik “hairpin loop”, som följs av en sträcka med U

Denna struktur gör att RNA:t och RNA-polymeraset lossnar från DNA:t

DNA:t blir åter dubbelsträngat

53
Q

Vad innebär Rho-beroende terminering?

A

Rho-proteinet destabiliserar interaktionen mellan DNA och RNA, så att det nysyntetiserade RNA:t frisläpps

BMA042, Molekylärbiologi (17 decks)

Brainscape helps you reach your goals faster, through stronger study habits.
© 2024 Bold Learning Solutions. Terms and Conditions