Human genetics Flashcards
Vilka är våra fyra olika DNA-nukleotider?
Adenin
Tymin
Guanin
Cytosin
Vad är en gen?
Grundenheten för genetisk information
Gener avgör arvsanslagets karaktär
Vad är ett genom?
En individs samling av all hans genetiska material
Vad är kromosomer?
Genernas förvaringsenheter
Vad är DNA?
En nukleinsyra som innehåller genetiska instruktioner som specificerar alla levande cellformers biologiska utveckling
Hur många kromosomer innehåller de flesta mänskliga cellerna?
46 st
Hur många könskromosomer har en människa normalt i sina celler?
2 st - X och Y är de som finns “tillgängliga”
- XY = man
- XX = kvinna
Vad kallas strukturen för kromosomer när de förekommer i par, två och två?
Man säger att de är diploida (2n)
Vad kallas icke-köns kromosomerna med ett annat ord?
Autosomer
Vad är ett karyogram?
“Bilden” du får när du utför en karyotypning och ordnar upp dina kromosompar utifrån storlek och grupp (kön/ickekön)
Vad sker först när mänskligt liv blir till, mitos eller meios?
Meios sker först
Meios är när könsceller, spermier och äggceller delar sig och skapar en ny individ, medan mitos är “vanlig” celldelning. Du måste först skapas innan du kan delas vidare och differentieras!
I vilka celler sker meios?
Bara i könscellerna, spermier och äggceller
Vad är en diploid cell?
En cell med diploid (2n) kromosomuppsättning, 23 st diploida kromosomer
Vad är Mendels 1st law och vad säger den?
En “grundlag” för genetiken och meios
Den säger att: två alleler i ett genpar segregerar från varandra och bildar gameterna. Hälften av gameterna blir bärare av en allel och hälften blir bärare av den andra. Varje bildad könscell har lika stor sannolikhet att bära vilken av allelerna som helst.
Vad säger Mendels 2nd law?
Att arvsmassan är uppdelad i olika enheter vilka ärvs oberoende av varandra
(stämmer när vi snackar om gener på olika kromosomer)
Vad är chiasmata?
Platser på kromosomer där rekombination sker. Kontaktpunkten, den fysiska kopplingen mellan två (icke-syster) kromatider på homologa kromosomer
Vad är den normala mänskliga karyotypen?
46, XY för män
46, XX för kvinnor
Vad innebär trisomi?
En kromosomal avvikelse där man får tre kromosomer i ett kromosompar
Ex. Downs syndrom, trisomi på kromosompar 21
Kromosomala avvikelser delas in i två huvudgrupper, vilka?
Strukturella och numeriska avvikelser
Vad är triploidi och tetraploidi? Hur uppstår dessa?
De är olika former av polyploidier, när embryot som bildas vid meios får för många kromosomer
Vad innebär mixoploiditet? (mixoploidy)
Mixoploidy är när en individ har två eller flera genetiskt annorlunda cellinjer
Vilka två typer av mixoploiditet finns det?
Mosaicism eller chimerism
Vad är skillnaden på mosaicism och chimerism när det gäller mixoploiditet?
- Mosaicism uppstår när en individs genetiskt olika cellinjer kommer från en och samma zygot
- Chimerism uppstår när en individs genetiskt olika cellinjer kommer från två olika zygoter
Vilka två former av kromosomala translokationer finns det?
Reciproka translokationer och Robertsonska translokationer
Vad sker i en reciprok translokation? Är det farligt?
I en reciprok translokation byter segment från två eller flera kromosomer plats med varandra
Det är farligt då translokationen blir obalanserad, kromosomerna blir då instabila i mitos. Två äggceller från mamman fuse:as samman till ett embryo
Vad innebär det att en translokation är obalanserad?
Translokationen innebär netto-vinst eller förlust av genetiskt material för kromosomerna i translokationen
Om centriska fragment byts i en translokation tex så den ena kromosomen blir centromer-lös
Vad innebär det att kromosomala fragment är centric/acentric?
Centric = fragment som innehåller kromosomens centromer
Vilka kromosomer kan få Robertsonska translokationer?
Kromosom 13, 14, 15, 21 och 22
Dessa kromosomer har en kort p-arm
Beskriv en kromosoms struktur (tänk klassiska submetacentriska formen)?
Vilka är de fyra olika möjliga zygoter som kan bildas från en individ som bär på en balanserad translokation?
- Normal zygot
- Balanserad bärare
- Partiell trisomi (kromosom 1) + partiell monosomi (kromosom 2)
- Partiell monosomi (kromosom 1) + partiell trisomi (kromosom 2)
Vilka är de olika möjliga zygoter som kan bildas från en individ som bär på en robertsonsk translokation mellan kromosom 14/21?
Vad är skillnaden mellan en polymorfism och en mutation?
- Polymorfism = vanligt förekommande nukleotidvariation som inte innebär några nämnvärt skadliga effekter
- Mutation = Mycket ovanligt förekommande nukleotidvariation som är mycket farligt, inte alls vanlig!
Vad betyder “locus”?
Platsen för en gen eller markör på en kromosom
Vad betyder “allel”?
En av flera varierande former av en gen/markör på ett specifict locus
Vad finns det för olika typer av mutationer?
- Deletioner
- Insertioner
- Translokationer
- Substitutioner av enskilda baser
- Missense mutationer
- Nonsense mutationer
- Tysta mutationer
- Splice-site mutationer
- Frameshift mutationer
- Dynamiska mutationer
Vad är “CD-CP” teorin? Vad innebär denna? När kan den vara intressant?
- Det står för Common disease-common polymorphism teorin, man tror att vanligt förekommande polymorfismer kan ge upphov till vissa sjukdomar
- Man tror att specifika polymorfismer bidrar till utvecklandet av komplexa polymorfiska skjukdomar (t.ex. högt blodtryck, (bröst)cancer, diabetes… dessa former av ärftliga sjukdomar). Ofta är flera samtida polymorfismer inblandade
- Intressant vid genetisk kartläggning av sjukdomar och etiologiska sjukdomar (bröstcancer!!)
Förklara hur polymorfismer kan användas som genetiska markörer?
SNPs och mikrosatelliter (VNTRs - variable number of tandem repeats) kan i en gensekvens mellan olika människor vara det enda som skiljer olika individer åt
Vad innebär co-segregering?
Att gener kopplade till varandra på en kromosom tenderar till att nedärvas tillsammans
Hur fungerar linkage-mapping?
Vi tittar på genetiska sekvenser hos individer i ett familjeträd. Man undersöker individer från samma familjeträd med en specifik sjukdom och försöker hitta gemensamma genetiska markörer (SNPs och microsatelliter) för dessa individer
Om vi lyckas kan vi dra slutsatsen att den genetiska markören troligtvis befinner sig i närheten av den sjukdoms-orsakande genen (tack vare co-segregering)
Vad är mätenheten som används i genetiska kartor (genetic maps)? Vad uttrycker den?
Enheten är Centi Morgan
Enheten mäter rekombinationsfrekvens i procent
Hur många baspar på en physical map motsvarar 1 Centi Morgan på en genetic map?
1 miljard baspar
Vad är rekombinationsfrekvensen i generation 3?
Vad är lod score för något?
Lod = logarithm of the odds
Lod score är ett värde för den statistiska uppskattningen av oddsen för linkage i ett familjeträd (är loci genetiskt kopplade eller inte?)
Hur räknar man ut ett lod score?
Två antaganden görs:
- Loci är kopplade, rekombinationsfraktion för en meios = 0
- Loci är inte kopplade, rekombinationsfraktion för en meios = 0,5
Frekvensen för dessa två antaganden ger oss ett odds, därefter tar man logaritmen av oddset för att få lod score
Positiva lod scores = bevis som talar för genetisk koppling
Negativa lod scores = bevis som talar mot genetisk koppling
Om lod score > +3 är det statistiskt signifikant att det finns genetisk koppling mellan loci. (sannolikheten att de undersökta loci inte är kopplade är mindre än 1/1000)
Vad är en haplotyp? Hur kan de vara till användning i genomiska studier?
“En individs genbestånd vad gäller den ena delen av ett allelpar, eller uppsättningar av gener som är nära förbundna på en kromosom och ofta överförs i grupp, som t ex generna i histokompatibilitetskomplexet”
Och på svenska: En uppsättning nära kopplade genetiska markörer på en och samma mindre kromosomsegment som tenderar att ärvas ihop (Tack vare att polymorfismer som sitter nära varandra har mycket låg sannolikhet att separeras via rekombination)
De är användbara som kromosomala segment som kan kännas igen i ett familjeträd eller en population
Vad är skillnaden på genotyp och fenotyp?
- Genotyp = de två gener du hittar vid varje locus
- Fenotyp = uttrycket av en genotyp, typ färg på ögonen eller håret
Vad är skillnaden på en dominant och en recessiv allel?
- Dominant = en allel som uttrycks även om den paras ihop med en recessiv allel
- Recessiv = en allel som endast uttrycks om den paras ihop med en annan recessiv allel
Vilka är de fem klassiska Mendel-ianska arvs-mönstren (inheritance patterns)?
- Autosomalt recessiv (Sickle cell anemi, cystisk fibros)
- Autosomalt dominant (Huntingtons sjukdom)
- X-länkad recessivitet (Duschennes muscular dystrophy)
- X-länkad dominant (Hypophosphatemic rickets)
- Y-länkad
Ge exempel på inheritance patterns utöver de 5 klassiska Mendel-ianska mönstrena?
Icke-klassiska mönster:
- Mitokondriell nedärvning
Icke-Mendelianska:
- Oligogena mönster
- Polygena
- Multi-faktor beroende
Vad innebär det att en sjukdom är autosomalt recessiv?
Du kan få sjukdomen om båda dina föräldrar är bärare utav gener som kodar för den. Dina föräldrar behöver inte vara sjuka.
Vad innebär det att en sjukdom är autosomalt dominant?
Föräldrar som är påverkade av sjukdomen kommer att sprida fenotypen vidare till sina barn. Räcker med att en allel för sjukdomen fås för att bli sjuk. Du kan alltså bli sjuk som heterozygot.
Vad innebär det att en sjukdom är X-länkat recessiv?
- Många fler män än kvinnor blir sjuka i sjukdomen
- Alla döttrar till en sjuk man blir bärare
- Inga utav sönerna hos en sjuk man blir bärare
- Exempel: hemofili - blödarsjuka
Vad innebär det att en sjukdom är X-länkat dominant?
- Sjuka män passerar vidare sjukdomen till alla sina döttrar men inga av sina söner
- Sjuka heterozygota kvinnor som får barn med icke-sjuka män passerar sit tillstånd vidare till hälften av deras söner och hälften av deras döttrar
- Exempel: fragile X syndrome
Vad är codominant ärvning?
- Två olika versioner av en gen (alleler) kan uttryckas och varje version skapar en svagt annorlunda variant av ett protein
- Båda allelerna påverkar det genetiska draget eller avgör karaktärsdragen för det genetiska tillståndet. Båda alleler spelar roll för att avgöra slutgiltigt uttryck
- Exempel: AB0 locus (blodgrupp)
Vad är mitokondriell ärvning? Förklara?
- Gäller gener i mitokondriellt DNA
- Mitokondriella sjukdomar kan uppstå hos varje generation i en familj och kan påverka både män och kvinnor, men män förmedlar inte de mitokondriella dragen vidare till sina avkommor (spermierna bidrar inte med några mitokondriella anlag)
- Exempel: Leber’s hereditary optic neuropathy
Förklara begreppen locus heterogenitet, allel-heterogenitet och klinisk heteogenitet?
- Locus heterogenitet = samma kliniska fenotyp uppstår från mutationer på olika loci
- Allel-heterogenitet = många olika mutationer inom en given gen resulterar i samma kliniska fenotyp
- Klinisk heterogenitet = mutationer i samma gen resulterar i två eller fler olika sjukdomar
Vad innebär begreppet penetrans (penetrance)?
Begreppet beskriver sannolikheten att en person med genotyp för ett visst drag kommer att uttrycka draget
Per definition ska dominanta drag alltid ha 100 % penetrans i en heterozygot person… men många mänskliga drag kan hoppa över en generation
Vad innebär age-of-onset?
Åldern då en individ får, utvecklar eller först upplever symtom av en sjukdom
Vad innbär “genetisk förväntan” (Genetic anticipation)?
Tendensen då en ärftlig sjukdoms allvarlighetsgrad ökar och age of onset minskar hos insjuknande individer med varje ny generation i ett familjeträd
Nya generationer blir mer allvarligt sjuka vid en tidig ålder än föregående generation
Genetic anticipation är en hallmark för _________________. Vad?
Dynamic mutation (trinucleotide repeat expansion)
Ex. Huntington’s disease - CAG repeat expansion i den proteinkodande delen av huntingtin (HTT) genen
Beskriv egenskaperna hos repeats i trinucleotide repeat disorders?
Repeats:en är meotiskt instabila och tenderar till att bli längre i samband med att genen förmedlas vidare med generationer
Ju fler repeats desto större är din sannolikhet att bli sjuk och mer allvarligt sjuk
Vad kallas fenomenet när särskilda gener blir epigenetiskt nedtystade och förändrade beroende på deras förälder-origin?
Imprinting
Exempel: X-kromosom inaktivering
Vad är co-dominans?
När båda alleler bidrar till locusets slutliga fenotyp
