pathogènes alimentaires Flashcards

1
Q

Qu’est ce que le microbiote et le microbiome?

A

Microbiote: Communauté microbienne
Microbiome: Gènes de cette même communauté microbienne

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2
Q

Est ce que le microbiote intestinal est le même partout dans l’intestin?

A

non, c’est différent selon les partis

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3
Q

Quels facteurs affectes le microbiote?

A
  1. diète & nutriments disponibles
  2. antimicrobiens
  3. caractéristiques de la niche écologique
  4. phages
  5. immun modulation de l’hôte
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4
Q

Quel gène vise-t-on lors des méthodes d’analyses pour les amplicons:

  • Bactérien
  • Fungi
  • Protozoaire
A
  • Bactérien: gène codant pour l’ARN ribosomal 16S
  • Fungi: ITS (internal transcribed spacers)
  • Protozoaire: gène codant pour l’ARN ribosomal 18S
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5
Q

Pourquoi vise-t-on le gène 16S?

A
  • Ubiquitaire
  • Faiblement transféré
  • Zones variables et zones conservées
  • Taille d’une région = idéale pour les technologies de séquençage
  • On peut faire des banques de données avec ça
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6
Q

Lors de l’extraction de l’ADN 16S y a-t-il une possibilité de contamination? Comment peut-on y remédier?

A

Oui, des contaminations peuvent arriver.

Des contrôles négatifs sont nécessaire.

De plus, il ne faut pas extraire tous leséchantillons d’un même groupe avec la même méthode

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7
Q

Les amorces ciblent quoi?

A
  • différentes amorces

- différentes tailles d’amplicon

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8
Q

Le nettoyage des données via la bio-informatique permet de faire quoi?

A

– Éliminer les erreurs
– Réduit la taille de la banque de données à analyser
– Moins il y a d’erreur, plus facile sera l’analyse

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9
Q

Quels sont les avantages de OTU?

A
  • Normalisation entre labos
  • Diminue la taille des données à analyser
  • Conservateur (moins d’erreurs)
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10
Q

Quels sont les désavantages de OTU?

A
  • N’est la le réel reflet de l’espèce
  • Ne permet pas de voir les sous-types d’espèce
  • Ne capture pas la “vraie” diversité
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11
Q

Qu’est ce que l’OTU?

A

Ca regroupe toutes les séquence qui sont similaires à plus de 97%.

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12
Q

Donner des caractéristiques de C. jejuni.

A
  1. Gram-
  2. flagelle polaire
  3. croissance de 37 à 42 degré
  4. génome très variable
  5. cause la campylobactériose
  6. asaccharolytique (utilise a.a ou intermédiare de Krebs au lieu des sucres)
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13
Q

Donner la description microbiologique de C. jejuni.

A

T: 30-45 degré
pH: 4.9 à 9.0
Aw min: 0.98
Respiration: Micro aérobie obligatoire

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14
Q

Qu’est ce que la campylobactériose?

A
  1. C’est une infection causant une diarrhée, des crampes et des vomissements.
  2. Durée moyenne: 4 jours
  3. Personnes atteintes: enfant, immunosuprimé ET ceux qui ont des contacts réguliers avec les animaux.
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15
Q

Une infection sévère de campylobactériose cause quoi?

A

en maladies auto-immunes

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16
Q

Répondé aux questions suivantes:
1. Quel est la dose infectieuse pour provoquer la campylobactériose?

  1. Comment peut-elle être contracter?
  2. Vecteur de la maladie
A
  1. environ 500 bactéries
  2. ingestion et pt via les muqueuse des yeux
  3. les oiseaux
17
Q

Campylobacter colonise la volaille de façon asymptomatique et est retrouvé dans le foie et la rate de ceux-ci.
V ou F?

A

vrai

18
Q

existe-t-il des oiseaux campylobacter négatifs?

A

oui

19
Q

Quelle est l’hypothèse pour la croissance et la prolifération des campylobacter?

A

il y a d’autres bactéries qui utilise de l’hydrogène ce qui produit du succinate.-> le succinate va être utiliser par Campy. comme source d’énergie et de carbone.

+ ya de succinate -> + ya de Campy.

20
Q

Donner des caractéristiques de Salmonella

A
  1. Gram-
  2. ne fait pas de spore
  3. mobile -> péritriche
  4. anaérobie facultatif
21
Q

Donner la description microbiologique de Salmonella.

A

T: 5 à 45 degré
pH: 3.5 à 9
Aw min: 0.93

22
Q

Répondez à ces questions sur la Salmonellose:

  1. Que cause la Salmonellose?
  2. Qui est l’agent pathogène qui cause la Salmonellose?
  3. Quelle est la dose infectieuse?
  4. Quels sont les vecteurs?
A
  1. maladie entérique sans complication (septicémie mais c’est rare)
  2. Samonella non-typhoïde
  3. 10 à 10E6 CFU
  4. volaille, porc, boeuf, légume et eau contaminée
23
Q

Qu’est ce qui inhibe la virulence de Salmonella?

A

butyrate et indole

24
Q

Quel est le SCFA produit par le microbiote de Clostridia qui diminue la colonisation de Salmonella?

A

propionate

25
Q

Donner des caractéristiques de L. monocytogenes.

A
  1. Gram+
  2. bâtonnet, non-sporulé
  3. ubiquitaire
26
Q

Donner la description microbiologique de L. monocytogenes.

A

T: 1 à 45 degré
pH: 4.1 à 9.6
Aw: 0.92

27
Q

Où se retrouve L. monocytogenes?

A

dans les produits laitiers et la nourriture prêt–manger

28
Q

Répondez aux questions de L. monocytogenes:

  1. Qui peut être infecté?
  2. Quelle est la dose infectieuse?
  3. Quelle est la période d’incubation?
A
  1. toute le monde!
  2. 100 à 10E6 CFU
  3. 3 jours à 3 mois
29
Q

Quelles sont les 3 formes d’infection de L. monocytogenes?

A

– Gastro-intestinale
– Systémique
– Néonatale (avortement)

30
Q

Est ce que L. monocytogenes peut survivre pendant de longue période de temps?

A

oui (mois/année)