Module 9: le cycle de Krebs Flashcards
La mitochondrie a une membrane externe et elle est perméable, cela est du à quoi?
La perméabilité est due à la présence d’une protéine, la porine, qui forme des canaux à travers la membrane. Celle interne est beaucoup plus étanche.
Dans le cas de la pyruvate, quelle est la protéine qui transporte le pyruvate dans la mitochondrie?
La pyruvate translocase transpote sélectivement le pyruvate dans la mitochondrie
La formation de l’acétyl-CoA est catalysée par quel complexe?
Le complexe de la pyruvate déshydrogénase
Est ce que le complexe est réversible ou irréversible?
Cette réaction qui fait le pont entre la glycolyse et le cycle de krebs est irréversible.
Quelle est la fonction du complexe?
Elle amène la libération d’une molécule de Co2 ainsi que la formation d’une liaison thioester riche en énergie et d’une molécule de NADH
Le PDH nécessite quels coenzymes et quels groupements prosthétiques? ( les composantes)
La thiamine pyrophosphate, le FAD, NAD+(coenzyme), la lipoamide et la coenzyme A( coenzyme)
Que veux dire le fait que le pyruvate est un acide alpha-cétonique?
C’est un acide dont le groupement carbonyle( C=O) est immédiatement adjacent au groupement carboxyle(-COOH)
Quel est le rôle de la thiamine pyrophosphate?
Elle est capable de former un lien covalent avec le substrat et permettre la délocalisation électronique requise pour stabiliser l’intermédiaire carbanion.
La décarboxylation d’un acide alpha cétonique ne peut pas se produire spontanément alors pour contourner le pro blème toutes les réactions enzymatiques de décarboxylation des alpha cétoniques utilisent la TPP
De quoi est constitué la lipoamide?
Elle est constituée d’un acide lipoique formant une liaison amide avec un résidu lysine de E2. Il sert de bras oscillant dans les réactions d’oxydoréduction ainsi que dans le transfert de groupement acyle.
Un résumé des 5 étapes de transformation de l’acétyl-CoA?
1- DÉCARBOXYLATION: E1 décarboxyle le pyruvate et forme un intermédiaire: l’hydroxyéthyl-TPP
2- OXYDORÉDUCTION: E2 oxyde le groupement hydroxyéthyle en groupement acétyle avec la réduction concomitante de la lipoamide. Le groupemet acétyl est transféré à la lipoamide ce qui produit l’acétyl dihydrolipoamide avec une liaison thioester riche en énergie.
3- FORMATION DE L’ACÉTYL-COA:E2 catalyse le transfert du groupement acétyl à la CoA.
4- OXYDORÉDUCTION: E3 catalyse le transfert des électrons de la forme réduite dihydrolipoamide vers le groupement prosthétique FAD. une formation d’une molécule de FADH et régénération de la forme oxydée de la lipoamide
5- OXYDORÉDUCTION, régénération FAD et formation du NADH: Le FADH2 est réoxydé et les électrons sont transférés ;a une molécule de NAD+. cela permet de régénérer la sous-unité E3-FAD et de transférer le pouvoir réducteur à un coenzyme soluble
À chaque tour du cycle qu’est ce qui est le résultat?
une molécule d’acétyl-CoA entre et 2 molécules de CO2 sont libérées. l’énergie produite par l’oxydation des atomes de carbone est conservée sous forme d’équivalents réducteurs: 3 molécules de NADH et une molécule de FADH2 et le cycle permet la production directe d’une molécule de NTP( ATP ou GTP selon l’organisme)
pourquoi le cycle de Krebs est un sentier amphibolique.
Le cycle de Krebs est de nature catabolique puisqu’il est impliqué dans le processus de dégradation et qu’il assure la conservation de l’énergie libre chez la plupart des organismes.
Par contre, plusieurs voies de biosynthèse utilisent les intermédiaires du cycle de Krebs comme point de départ, le cycle est donc anabolique.
Énumérer les principales réactions cataplérotiques et anaplérotiques.
réactions cataplérotiques:
- la gluconéogenèse
- la synthèse des acides gras qui utilise le citrate
- la synthèse d’acides aminés, qui utilise l’alpha-cétoglutarate et l’oxalo-acétate
- la synthèse des porphyrines qui utilise le succinyl-CaA
réactions anaplérotiques:
- les voies de dégradations des acides aminés qui fournissent du pyruvate
- la glycolyse qui fournit du pyruvate
Discuter du bilan énergétique du PDH et du cycle de Krebs.
Nous obtenons les résultats suivants en terme d’énergie produite à partir d’une molécule de glucose:
- 4 ATP dont 2 sous forme GTP
- 10 NADH qui seront transformés en 25 ATP
- 2 FADH2 qui donneront 3 ATP
total: 32 aTP par molécule de glucose oxydée en CO2
Qu’est ce qu’une réactions cataplérotiques?
Les réactions qui utilisent et donc consomment les intermédiaires du cycle de krebs
