Module 3: Les acides aminés Flashcards
Quel est cet acide aminé?
Alanine
Quel est cet acide aminé?
Glycine
Quel acide aminé est diaminé ?
La lysine, car c’est un acide a-aminé et e-aminé
Quel est cet acide aminé?
Isoleucine
Quel est cet acide aminé?
Leucine
Quel est cet acide aminé?
Proline
Quel est cet acide aminé?
Valine
Quel est cet acide aminé?
Phénylalanine
Quel est cet acide aminé?
Tryptophane
Quel est cet acide aminé?
Tyrosine
Quel est cet acide aminé?
Acide aspartique
Quel est cet acide aminé?
Acide glutamique
Quel est cet acide aminé?
Arginine
Quel est cet acide aminé?
Histidine
Quel est cet acide aminé?
Lysine
Quel est cet acide aminé?
Sérine
Quel est cet acide aminé?
Thréonine
Quel est cet acide aminé?
Cystéine
Quel est cet acide aminé?
Méthionine
Quel est cet acide aminé?
Asparagine
Quel est cet acide aminé?
Glutamine
Nommez les 8 principales fonctions biologiques des protéines
- catalyse
- transport
- stockage des nutriments
- structure
- mouvement
- décodage de l’information génétique
- régulation
- défense ou agression
Donnez un exemple de protéine ayant la fonction biologique de transport
hémoglobine
Donnez un exemple de protéine ayant la fonction biologique de stockage des nutriments
caséine ou ovalbumine
Donnez un exemple de protéine ayant la fonction biologique de structure
collagène ou kératine
Donnez un exemple de protéine ayant la fonction biologique de mouvement
myosine
Donnez un exemple de protéine ayant la fonction biologique de décodage de l’information génétique
ARN polymérase
Donnez un exemple de protéine ayant la fonction biologique de défense
anticorps
Donnez un exemple de protéine ayant la fonction biologique d’agression
venin
Nommez les 4 fonctions biologiques des acides aminés
- neurotransmetteurs
- hormones
- intermédiaires métaboliques importants
- principales briques de construction des protéines
Décrire la structure générale d’un acide aminé
Ils ont une groupement R, Un groupement COO- et un groupement NH3+
Décrire les 3 principales caractéristiques des acides aminés standards + dire les exceptions lorsque applicable (2/3)
- ils ont tous une fonction carboxyle et une fonction amine primaire (sauf la proline qui a un amine secondaire)
- ils ont tous une activité optique (sauf la glycine, car elle n’est pas chirale)
- le carbone a (alpha) porte 4 substituants différents, car c’est un carbone asymétrique
Nommez les 4 acides aminés standards étant aliphatiques
- Glycine
- Valine
- Leucine
- Isoleucine
Vrai ou faux: la leucine et l’isoleucine sont des isomères de structure
Vrai
De quoi sont composés les acides aminés aliphatiques ? (2 éléments)
- carbone
- hydrogène
Nommez le code à 1 lettre et à 3 lettres de la glycine
Glycine (G)
Nommez le code à 1 lettre et à 3 lettres de la Valine
Val. (V)
Nommez le code à 1 lettre et à 3 lettres de la Leucine
Leu (L)
Nommez le code à 1 lettre et à 3 lettres de l’isoleucine
Ile (I)
Quel est le seul acide aminé protéogénique à ne pas avoir de carbone chiral ?
Glycine
Vrai ou faux: l’isoleucine possède 4 stéréoisomères
Vrai, car elle possède 2 carbones asymétriques
Quel est le seul acide aminé à avoir une fonction a-iminoacide ?
La Proline
Nommez le code à 1 et 3 lettres de la proline
Pro (P)
Qu’est-ce qu’une fonction a-iminoacide ?
l’extrémité de la chaine latérale est liée au groupement a-amino, ce qui forme une structure cyclique (anneau pyrrolidine)
Quel est le seul acide aminé ayant une fonction amine secondaire ?
La proline, car elle a un anneau pyrolidine
Quels sont les 3 acides aminés ayant une chaine R de type cycle aromatique?
- Phénylalanine
- Tyrosine
- Tryptophane
Nommez le code à 1 et 3 lettres de l’acide aminé phénylalanine
Phe (F)
Nommez le code à 1 et 3 lettres de l’acide aminé tyrosine
Tyr (Y)
Nommez le code à 1 et 3 lettres de l’acide aminé tryptophane
Trp (W)
Que contient un cycle aromatique ?
contient un cycle de benzène ou un dérivé de celui-ci
Quels sont les 3 seuls acides aminés pouvant absorber les rayons ultraviolets ? De quel “classe” font-ils partis ?
- phénylalanine
- tryptophane
- tyrosine
Font partis de la classe des acides aminés contenant un cycle aromatique
Quels sont les 2 acides aminés ayant une chaine R souffrée ?
- Methionine
- Cystéine
Nommez le code à 1 et 3 lettres de l’acide aminé Methionine
Met (M)
Nommez le code à 1 et 3 lettres de l’acide aminé Cystéine
Cys (C)
Quel acide aminé contient un groupement thiol ?
Cystéine
Quel acide aminé contient un lien thioéther ?
Méthionine
Quel acide aminé peut créer un pont disulfure ?
La cystéine si elle réagit avec une autre cystéine
Quels sont les 2 acides aminés possédant une chaine R de type B-hydroxylée ?
- sérine
- thréonine
Nommez le code à 1 et 3 lettres de l’acide aminé sérine
Ser (S)
Nommez le code à 1 et 3 lettres de l’acide aminé thréonine
Thr (T)
Vrai ou faux, la thréonine possède 2 carbones chiraux
Vrai
Que signifie le type d’acide aminé B-hydroxylé ?
il y a un groupement hydroxyle sur le carbone B (bêta)
Quels sont les 3 acides aminés ayant une 2e fonction basique ?
-Lysine
-Histidine
-Arginine
Nommez le code à 1 et 3 lettres de l’acide aminé Lysine
Lys (K)
Nommez le code à 1 et 3 lettres de l’acide aminé Histidine
His (H)
Nommez le code à 1 et 3 lettres de l’acide aminé Arginine
Arg (R)
Quels sont les 3 acides aminés basiques ?
Lysine, histidine et arginine
Que veut dire “avoir une chaine latérale R 2e fonction basique”?
chaine R pouvant accepter un proton supplémentaire
Quel acide aminé possède un ion guanidium ?
Arginine
Quel acide aminé possède 3 groupements amines supplémentaires ?
Arginine
Quel acide aminé possède une structure cyclique non aromatique de type imidazole ?
L’histidine
Quels sont les 4 acides aminés ayant une 2e fonction acide
- Aspartate
- Glutamate
- Asparagine
- Glutamine
Nommez le code à 1 et 3 lettres de l’acide aminé Aspartate
Asp (D)
Nommez le code à 1 et 3 lettres de l’acide aminé Glutamate
Glu (E)
Nommez le code à 1 et 3 lettres de l’acide aminé Asparagine
Asn (N)
Nommez le code à 1 et 3 lettres de l’acide aminé Glutamine
Gln (Q)
Quelle est la différence entre l’acide aminé glutamate et son dérivé glutamine ( même différence que pour l’acide aminé aspartate et son dérivé asparagine)
La seconde fonction carboxyle à l’extrémité de leur chaine R est modifié par l’ajout d’un groupement amine
Quels sont les acides aminés non polaires (9) ?
- leucine
- glycine
- valine
- isoleucine
- proline
- méthionine
- phénylalaline
- tryptophane
- alanine
Quels sont les 6 acides aminés polaires NON chargés ?
- tyrosine
- sérine
- thréonine
- cystéine
- asparagine
- glutamine
Pourquoi est ce que la cystéine est polaire non chargée ?
Car son groupement thiol la rend polaire, mais sa charge reste de 0
Pourquoi est ce que l’asparagine et la glutamine sont polaires non chargées ?
grâce a leur groupement amine dans leur chaine R
Quels sont les 2 acides aminés polaires et chargés (acides) ?
- Aspartate
- Glutamate
Pourquoi les acides aminés aspartate et glutamate sont polaires chargés ?
À cause de leur seconde fonction carboxyle qui peut être ionisée et qui les rend acides
Quels sont les 3 acides aminés polaires chargés basiques ?
- histidine
- lysine
- arginine
De quoi dépend la solubilité d’un composé? (2 choses)
De la polarité de ses liens covalents et de sa taille
Que permet de vérifier l’index d’hydropathie ?
Permet de vérifier le caractère hydrophile ou hydrophobe de la chaine R
Vrai ou faux: dans l’index d’hydropathie, plus la valeur est positive, plus la molécule est hydrophile ?
Faux, plus la molécule est HYDROPHOBE
Quels sont les 4 acides aminés légèrement hydrophobes. + Expliquez ce qui les rendent légèrement hydrophobes
- Cystéine ( groupement thiol), sérine (groupement hydroxyle), thréonine (groupement hydroxyle) et tyrosine (groupement hydroxyle)
Les acides aminés hydrophiles sont-ils polaire, chargés ou rien de tout cela ?
Ils sont polaires et peuvent aussi être chargés
Quelle est la fonction des médiateurs chimiques ?
permettent la communication entre différentes cellules de l’organisme
Quelles sont les 2 principales hormones ayant une fonction de médiateurs chimiques ?
- épinéphrine
- thyroxine
De quel acide aminé sont dérivés l’épinéphrine et la thyroxine ?
De la tyrosine
Quand et par quoi est sécrétée l’épinéphrine ?
Elle est sécrétée par les glandes surrénales en cas de stress
Par quoi est fabriquée la thyroxine et que va t-elle influencer ?
C’est une prohormone fabriquée par la thyroïde. Elle influence différents processus métaboliques
Quels sont les 2 principaux neurotransmetteurs ayant la fonction de médiateurs chimiques ?
- GABA
- Histamine
De quoi est dérivé le neurotransmetteur GABA ?
De l’acide aminé glutamate
De quoi est dérivé le neurotransmetteur Histamine ?
De l’acide aminé histidine
À quoi sert le GABA ?
neurotransmetteur important contribuant au contrôle moteur.
À quoi peuvent servir les drogues contenant un haut niveau de GABA?
Pour traiter les crises d’épilepsie et calmer les tremblements de la maladie d’Huntington
De quoi est responsable l’histamine?
Des réactions allergiques
Quels sont les 2 précurseurs pour le métabolisme des acides aminés?
L’homocystéine et l’homosérine
Quels sont les 2 intermédiaires importants pour le cycle de l’urée
La citrulline et l’ornithine
À quoi sert le cycle de l’urée?
Cycle permettant l’élimination des ions ammonium (NH4+) qui sont toxiques
Quel est le précurseur servant de co-substrat lors de réactions de méthylation
S-adénosylméthionine (SAM)
Dans quoi sont présents les acides aminés de la série D ?
Dans des antibiotiques d’origine bactérienne ou fongique
Quels “patentes” utilisent les acides aminés de la série D pour synthétiser des peptides présents dans leur paroi cellulaire ?
Les bactéries et les mycètes
Ps: je savais pas si j’avais le droit d’écrire micro-organismes à cause des mycètes lol donc patentes fait l’affaire;)
Vous analysez une courbe de titration d’un acide aminé:
1- comment trouvez vous le pka (à quoi correspond-il)?
2- À quoi correspond le pI?
1- le pka correspond au pH où la courbe est presque nulle
2- le pI correspond à l’endroit où la pente est la plus élevée
Qu’est ce qu’une molécule amphotère?
molécule possédant une fonction acide et une fonction basique
Vrai ou faux: les acides aminés sont des molécules amphotères
Vrai, car ils possèdent une fonction acide (COOH) et une fonction basique (NH2)
Vrai ou faux; les acides aminés standards sont tous des acides faibles polyprotiques
Vrai, car ils possèdent tous au moins 2 groupements ionisables
À un pH physiologique, comment se trouve le groupement carboxyle et le groupement amine d’un acide aminé?
- Groupement carboxyle est déprotoné (COO-)
- Groupement amine est protoné (NH3+)
Quelle charge a un acide aminé diprotique au pH physiologique?
charge neutre (0)
Quelle charge a un acide aminé triprotique?
la charge dépend de la chaine R
À quoi correspond le point isoélectrique (pI)?
correspond au pH où 100% des molécules d’acides aminés ne portent aucune charge nette
Quand peut-il y avoir délocalisation de la charge?
si il y a présence d’un groupement portant une charge et une double liaison
Quel acide aminé pouvons nous appeler acide glutamique ?
Glutamate
