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BCM-1001 (Biochimie structurale) > Module 3: Les acides aminés > Flashcards

Module 3: Les acides aminés Flashcards

1
Q

Quel est cet acide aminé?

A

Alanine

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Q

Quel est cet acide aminé?

A

Glycine

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Q

Quel acide aminé est diaminé ?

A

La lysine, car c’est un acide a-aminé et e-aminé

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Q

Quel est cet acide aminé?

A

Isoleucine

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Q

Quel est cet acide aminé?

A

Leucine

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6
Q

Quel est cet acide aminé?

A

Proline

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7
Q

Quel est cet acide aminé?

A

Valine

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8
Q

Quel est cet acide aminé?

A

Phénylalanine

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9
Q

Quel est cet acide aminé?

A

Tryptophane

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10
Q

Quel est cet acide aminé?

A

Tyrosine

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11
Q

Quel est cet acide aminé?

A

Acide aspartique

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12
Q

Quel est cet acide aminé?

A

Acide glutamique

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13
Q

Quel est cet acide aminé?

A

Arginine

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14
Q

Quel est cet acide aminé?

A

Histidine

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15
Q

Quel est cet acide aminé?

A

Lysine

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16
Q

Quel est cet acide aminé?

A

Sérine

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17
Q

Quel est cet acide aminé?

A

Thréonine

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18
Q

Quel est cet acide aminé?

A

Cystéine

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19
Q

Quel est cet acide aminé?

A

Méthionine

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20
Q

Quel est cet acide aminé?

A

Asparagine

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21
Q

Quel est cet acide aminé?

A

Glutamine

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22
Q

Nommez les 8 principales fonctions biologiques des protéines

A
  • catalyse
  • transport
  • stockage des nutriments
  • structure
  • mouvement
  • décodage de l’information génétique
  • régulation
  • défense ou agression
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23
Q

Donnez un exemple de protéine ayant la fonction biologique de transport

A

hémoglobine

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24
Q

Donnez un exemple de protéine ayant la fonction biologique de stockage des nutriments

A

caséine ou ovalbumine

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25
Q

Donnez un exemple de protéine ayant la fonction biologique de structure

A

collagène ou kératine

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26
Q

Donnez un exemple de protéine ayant la fonction biologique de mouvement

A

myosine

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27
Q

Donnez un exemple de protéine ayant la fonction biologique de décodage de l’information génétique

A

ARN polymérase

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28
Q

Donnez un exemple de protéine ayant la fonction biologique de défense

A

anticorps

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29
Q

Donnez un exemple de protéine ayant la fonction biologique d’agression

A

venin

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30
Q

Nommez les 4 fonctions biologiques des acides aminés

A
  • neurotransmetteurs
  • hormones
  • intermédiaires métaboliques importants
  • principales briques de construction des protéines
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31
Q

Décrire la structure générale d’un acide aminé

A

Ils ont une groupement R, Un groupement COO- et un groupement NH3+

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32
Q

Décrire les 3 principales caractéristiques des acides aminés standards + dire les exceptions lorsque applicable (2/3)

A
  • ils ont tous une fonction carboxyle et une fonction amine primaire (sauf la proline qui a un amine secondaire)
  • ils ont tous une activité optique (sauf la glycine, car elle n’est pas chirale)
  • le carbone a (alpha) porte 4 substituants différents, car c’est un carbone asymétrique
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33
Q

Nommez les 4 acides aminés standards étant aliphatiques

A
  • Glycine
  • Valine
  • Leucine
  • Isoleucine
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34
Q

Vrai ou faux: la leucine et l’isoleucine sont des isomères de structure

A

Vrai

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35
Q

De quoi sont composés les acides aminés aliphatiques ? (2 éléments)

A
  • carbone
  • hydrogène
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36
Q

Nommez le code à 1 lettre et à 3 lettres de la glycine

A

Glycine (G)

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37
Q

Nommez le code à 1 lettre et à 3 lettres de la Valine

A

Val. (V)

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38
Q

Nommez le code à 1 lettre et à 3 lettres de la Leucine

A

Leu (L)

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39
Q

Nommez le code à 1 lettre et à 3 lettres de l’isoleucine

A

Ile (I)

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40
Q

Quel est le seul acide aminé protéogénique à ne pas avoir de carbone chiral ?

A

Glycine

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41
Q

Vrai ou faux: l’isoleucine possède 4 stéréoisomères

A

Vrai, car elle possède 2 carbones asymétriques

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42
Q

Quel est le seul acide aminé à avoir une fonction a-iminoacide ?

A

La Proline

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43
Q

Nommez le code à 1 et 3 lettres de la proline

A

Pro (P)

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44
Q

Qu’est-ce qu’une fonction a-iminoacide ?

A

l’extrémité de la chaine latérale est liée au groupement a-amino, ce qui forme une structure cyclique (anneau pyrrolidine)

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45
Q

Quel est le seul acide aminé ayant une fonction amine secondaire ?

A

La proline, car elle a un anneau pyrolidine

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46
Q

Quels sont les 3 acides aminés ayant une chaine R de type cycle aromatique?

A
  • Phénylalanine
  • Tyrosine
  • Tryptophane
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47
Q

Nommez le code à 1 et 3 lettres de l’acide aminé phénylalanine

A

Phe (F)

48
Q

Nommez le code à 1 et 3 lettres de l’acide aminé tyrosine

A

Tyr (Y)

49
Q

Nommez le code à 1 et 3 lettres de l’acide aminé tryptophane

A

Trp (W)

50
Q

Que contient un cycle aromatique ?

A

contient un cycle de benzène ou un dérivé de celui-ci

51
Q

Quels sont les 3 seuls acides aminés pouvant absorber les rayons ultraviolets ? De quel “classe” font-ils partis ?

A
  • phénylalanine
  • tryptophane
  • tyrosine

Font partis de la classe des acides aminés contenant un cycle aromatique

52
Q

Quels sont les 2 acides aminés ayant une chaine R souffrée ?

A
  • Methionine
  • Cystéine
53
Q

Nommez le code à 1 et 3 lettres de l’acide aminé Methionine

A

Met (M)

54
Q

Nommez le code à 1 et 3 lettres de l’acide aminé Cystéine

A

Cys (C)

55
Q

Quel acide aminé contient un groupement thiol ?

A

Cystéine

56
Q

Quel acide aminé contient un lien thioéther ?

A

Méthionine

57
Q

Quel acide aminé peut créer un pont disulfure ?

A

La cystéine si elle réagit avec une autre cystéine

58
Q

Quels sont les 2 acides aminés possédant une chaine R de type B-hydroxylée ?

A
  • sérine
  • thréonine
59
Q

Nommez le code à 1 et 3 lettres de l’acide aminé sérine

A

Ser (S)

60
Q

Nommez le code à 1 et 3 lettres de l’acide aminé thréonine

A

Thr (T)

61
Q

Vrai ou faux, la thréonine possède 2 carbones chiraux

A

Vrai

62
Q

Que signifie le type d’acide aminé B-hydroxylé ?

A

il y a un groupement hydroxyle sur le carbone B (bêta)

63
Q

Quels sont les 3 acides aminés ayant une 2e fonction basique ?

A

-Lysine
-Histidine
-Arginine

64
Q

Nommez le code à 1 et 3 lettres de l’acide aminé Lysine

A

Lys (K)

65
Q

Nommez le code à 1 et 3 lettres de l’acide aminé Histidine

A

His (H)

66
Q

Nommez le code à 1 et 3 lettres de l’acide aminé Arginine

A

Arg (R)

67
Q

Quels sont les 3 acides aminés basiques ?

A

Lysine, histidine et arginine

68
Q

Que veut dire “avoir une chaine latérale R 2e fonction basique”?

A

chaine R pouvant accepter un proton supplémentaire

69
Q

Quel acide aminé possède un ion guanidium ?

A

Arginine

70
Q

Quel acide aminé possède 3 groupements amines supplémentaires ?

A

Arginine

71
Q

Quel acide aminé possède une structure cyclique non aromatique de type imidazole ?

A

L’histidine

72
Q

Quels sont les 4 acides aminés ayant une 2e fonction acide

A
  • Aspartate
  • Glutamate
  • Asparagine
  • Glutamine
73
Q

Nommez le code à 1 et 3 lettres de l’acide aminé Aspartate

A

Asp (D)

74
Q

Nommez le code à 1 et 3 lettres de l’acide aminé Glutamate

A

Glu (E)

75
Q

Nommez le code à 1 et 3 lettres de l’acide aminé Asparagine

A

Asn (N)

76
Q

Nommez le code à 1 et 3 lettres de l’acide aminé Glutamine

A

Gln (Q)

77
Q

Quelle est la différence entre l’acide aminé glutamate et son dérivé glutamine ( même différence que pour l’acide aminé aspartate et son dérivé asparagine)

A

La seconde fonction carboxyle à l’extrémité de leur chaine R est modifié par l’ajout d’un groupement amine

78
Q

Quels sont les acides aminés non polaires (9) ?

A
  • leucine
  • glycine
  • valine
  • isoleucine
  • proline
  • méthionine
  • phénylalaline
  • tryptophane
  • alanine
79
Q

Quels sont les 6 acides aminés polaires NON chargés ?

A
  • tyrosine
  • sérine
  • thréonine
  • cystéine
  • asparagine
  • glutamine
80
Q

Pourquoi est ce que la cystéine est polaire non chargée ?

A

Car son groupement thiol la rend polaire, mais sa charge reste de 0

81
Q

Pourquoi est ce que l’asparagine et la glutamine sont polaires non chargées ?

A

grâce a leur groupement amine dans leur chaine R

82
Q

Quels sont les 2 acides aminés polaires et chargés (acides) ?

A
  • Aspartate
  • Glutamate
83
Q

Pourquoi les acides aminés aspartate et glutamate sont polaires chargés ?

A

À cause de leur seconde fonction carboxyle qui peut être ionisée et qui les rend acides

84
Q

Quels sont les 3 acides aminés polaires chargés basiques ?

A
  • histidine
  • lysine
  • arginine
85
Q

De quoi dépend la solubilité d’un composé? (2 choses)

A

De la polarité de ses liens covalents et de sa taille

86
Q

Que permet de vérifier l’index d’hydropathie ?

A

Permet de vérifier le caractère hydrophile ou hydrophobe de la chaine R

87
Q

Vrai ou faux: dans l’index d’hydropathie, plus la valeur est positive, plus la molécule est hydrophile ?

A

Faux, plus la molécule est HYDROPHOBE

88
Q

Quels sont les 4 acides aminés légèrement hydrophobes. + Expliquez ce qui les rendent légèrement hydrophobes

A
  • Cystéine ( groupement thiol), sérine (groupement hydroxyle), thréonine (groupement hydroxyle) et tyrosine (groupement hydroxyle)
89
Q

Les acides aminés hydrophiles sont-ils polaire, chargés ou rien de tout cela ?

A

Ils sont polaires et peuvent aussi être chargés

90
Q

Quelle est la fonction des médiateurs chimiques ?

A

permettent la communication entre différentes cellules de l’organisme

91
Q

Quelles sont les 2 principales hormones ayant une fonction de médiateurs chimiques ?

A
  • épinéphrine
  • thyroxine
92
Q

De quel acide aminé sont dérivés l’épinéphrine et la thyroxine ?

A

De la tyrosine

93
Q

Quand et par quoi est sécrétée l’épinéphrine ?

A

Elle est sécrétée par les glandes surrénales en cas de stress

94
Q

Par quoi est fabriquée la thyroxine et que va t-elle influencer ?

A

C’est une prohormone fabriquée par la thyroïde. Elle influence différents processus métaboliques

95
Q

Quels sont les 2 principaux neurotransmetteurs ayant la fonction de médiateurs chimiques ?

A
  • GABA
  • Histamine
96
Q

De quoi est dérivé le neurotransmetteur GABA ?

A

De l’acide aminé glutamate

97
Q

De quoi est dérivé le neurotransmetteur Histamine ?

A

De l’acide aminé histidine

98
Q

À quoi sert le GABA ?

A

neurotransmetteur important contribuant au contrôle moteur.

99
Q

À quoi peuvent servir les drogues contenant un haut niveau de GABA?

A

Pour traiter les crises d’épilepsie et calmer les tremblements de la maladie d’Huntington

100
Q

De quoi est responsable l’histamine?

A

Des réactions allergiques

101
Q

Quels sont les 2 précurseurs pour le métabolisme des acides aminés?

A

L’homocystéine et l’homosérine

102
Q

Quels sont les 2 intermédiaires importants pour le cycle de l’urée

A

La citrulline et l’ornithine

103
Q

À quoi sert le cycle de l’urée?

A

Cycle permettant l’élimination des ions ammonium (NH4+) qui sont toxiques

104
Q

Quel est le précurseur servant de co-substrat lors de réactions de méthylation

A

S-adénosylméthionine (SAM)

105
Q

Dans quoi sont présents les acides aminés de la série D ?

A

Dans des antibiotiques d’origine bactérienne ou fongique

106
Q

Quels “patentes” utilisent les acides aminés de la série D pour synthétiser des peptides présents dans leur paroi cellulaire ?

A

Les bactéries et les mycètes

Ps: je savais pas si j’avais le droit d’écrire micro-organismes à cause des mycètes lol donc patentes fait l’affaire;)

107
Q

Vous analysez une courbe de titration d’un acide aminé:
1- comment trouvez vous le pka (à quoi correspond-il)?
2- À quoi correspond le pI?

A

1- le pka correspond au pH où la courbe est presque nulle
2- le pI correspond à l’endroit où la pente est la plus élevée

108
Q

Qu’est ce qu’une molécule amphotère?

A

molécule possédant une fonction acide et une fonction basique

109
Q

Vrai ou faux: les acides aminés sont des molécules amphotères

A

Vrai, car ils possèdent une fonction acide (COOH) et une fonction basique (NH2)

110
Q

Vrai ou faux; les acides aminés standards sont tous des acides faibles polyprotiques

A

Vrai, car ils possèdent tous au moins 2 groupements ionisables

111
Q

À un pH physiologique, comment se trouve le groupement carboxyle et le groupement amine d’un acide aminé?

A
  • Groupement carboxyle est déprotoné (COO-)
  • Groupement amine est protoné (NH3+)
112
Q

Quelle charge a un acide aminé diprotique au pH physiologique?

A

charge neutre (0)

113
Q

Quelle charge a un acide aminé triprotique?

A

la charge dépend de la chaine R

114
Q

À quoi correspond le point isoélectrique (pI)?

A

correspond au pH où 100% des molécules d’acides aminés ne portent aucune charge nette

115
Q

Quand peut-il y avoir délocalisation de la charge?

A

si il y a présence d’un groupement portant une charge et une double liaison

116
Q

Quel acide aminé pouvons nous appeler acide glutamique ?

A

Glutamate

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