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BCM-1001 (Biochimie structurale) > Module 12 : Les acides nucléiques > Flashcards

Module 12 : Les acides nucléiques Flashcards

1
Q

Est-ce qu’il y a des groupements phosphoryles dans les nucléosides ?

A

NON

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Q

Quelle est la composition générale des nucléosides ?

A

Base azoté + un ose reliés par un lien bêta-N-glycosidique

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Q

Quelle est la composition générale des nucléotides ?

A

Base azoté + un ose + un ou plusieurs groupements phosphates

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Q

Vrai ou Faux ?
Les nucléotides sont des éthers phosphoriques de nucléosides.

A

FAUX
Les nucléotides sont les ESTERS phosphoriques de nucléosides.

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Q

De quoi sont formés habituellement les monomères d’acides nucléiques ?

A

-Une base azoté
-Un monosaccharide
-1 à 3 groupements phosphoryles

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6
Q

Il y a 2 types de bases azotés dans les acides nucléiques. Nommez-les

A

Les pyrimidines et les purines.

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7
Q

Vrai ou Faux ?
Les pyrimidines sont la cytosine, l’uracile (ARN) et la thymine (ADN).

A

VRAI

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8
Q

Qui sont des purines (2) ?
a) Adénine
b) Guanine
c) Cytosine
d) Thymine

A

a) Adénine et b) Guanine

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9
Q

Le ribose et le désoxyribose sont sous quelle configuration / forme cyclique dans les nucléotides/nucléosides ?

A

Le ribose ou désoxyribose sont sous forme furanose et toujours en configuration anomérique bêta.

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10
Q

Qu’est-ce que le désoxyribose ?

A

C’est un dérivé du ribose qui est dépourvu de groupement hydroxyle en C2 (sur le carbone #2)

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11
Q

Les ribonucléosides et les ribonucléotides contiennent…
a) du ribose
b) du désoxyribose

A

a) Du ribose

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12
Q

Les désoxyribonucléosides et les désoxyribonucléotides contiennent quoi comme monosaccharide ?

A

Du désoxyribose

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13
Q

Quelle est LA principale différence entre l’ADN et l’ARN ?

A

Ils se différencient au niveau de l’ose : les ribonucléotides sont les unités de construction des acides ribonucléiques (ARN) et les désoxyribonucléotides sont les monomères des acides désoxyribonucléiques (ADN)

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14
Q

Vrai ou Faux ?
Les bases azotées sont des molécules homocycliques.

A

FAUX
Les bases azotés sont des molécules hétérocycliques (cycles composés d’atomes de carbone et d’azote).

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15
Q

Par quoi sont caractérisés les cycles des bases azotées ?

A

présence de double liaisons conjuguées.

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16
Q

Vrai ou Faux ?
Les bases azotées sont des bases faibles.

A

VRAI
Elles peuvent accepter des protons en milieu acide.

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17
Q

Est-ce que les bases azotées sont chargées au pH physiologique ?

A

NON, elles ne sont pas chargées

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18
Q

Les bases azotées ont quelle type de structure ?
a) Ovale
b) Hélicoïdale
c) Plane

A

c)
Ces molécules ont des structures planes ou presque planes

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19
Q

Est-ce que les bases azotées sont insolubles dans l’eau ?

A

OUI

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20
Q

Vrai ou Faux ?
Les bases azotées sont des molécules aromatiques. Elles ont la capacité d’absorber les rayons UV d’une longueur de 260 nm.

A

VRAI

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21
Q

Vrai ou Faux ?
Les bases azotées peuvent participer à la formation de liaison hydrogène, ces liens étant important pour la formation de la double hélice d’ADN

A

VRAI

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22
Q

Pourquoi les nucléosides sont plus solubles dans l’eau que les bases azotées seules ?

A

Puisque les groupements hydroxyle de l’ose augmentent la solubilité de la molécule.

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23
Q

Pourquoi les nucléotides sont solubles dans l’eau ?

A

Puisqui’ils contiennent plusieurs groupements ioniques et polaires

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24
Q

Pourquoi les nucléotides ont la capacité d’absorber les ultraviolets ?

A

Compte tenu de la présence de base azotée.

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25
Q

Les nucléotides peuvent former des polymères de différentes longueurs via la formation de liens _______________.
a) éthers
b) glucidique
c) diesters
d) phosphodiester

A

d) phosphodiesters 3’-5’

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26
Q

Combien il y a de résidus de nucléotides dans un polynucléotides (ADN OU ARN) ?

A

Plus de 50 résidus de nucléotides

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27
Q

Vrai ou Faux ?
Les dimères de nucléotides remplissent des fonctions importantes dans la cellule en agissant comme récepteur.

A

FAUX
Ils agissent comme des coenzymes!

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28
Q

Vrai ou Faux ?
La formation de liens phosphodiester sucessifs entre plusieurs résidus de nucléotide résulte en un polymère linéaire.

A

VRAI

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29
Q

Comment sont appelés les polynucléotides constitués de désoxyribonucléotides ?

A

Acides désoxyribonucléiques (ADN)

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30
Q

Comment sont appelés les polynucléotides constitués de ribonucléotides ?

A

Acides ribonucléiques (ARN)

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31
Q

Quelles sont les fonctions des nucléosides, nucléotides à l’état libre et des dinucléotides et de leurs dérivés ?

A

Remplissent des fonctions :
- De coenzymes dans la cellule
- De médiateur chimique
- De source d’énergie

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32
Q

Vrai ou Faux ?
Lors de la réaction enzymatique, un groupement de la coenzyme est souvent transféré à l’enzyme.

A

FAUX
Le groupement est transféré au substrat.

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33
Q

La coenzyme peut également servir d’Accepteur ou de donneur de protons ou d’électrons lors des _________________.

A

Des réactions d’oxydoréduction.

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34
Q

Quelle nucléotide est les plus fréquement utilisé comme coenzyme et pourquoi ?

A

C’est l’ATP. les nucléosides triphosphates sont utilisés comme source de groupement phosphoryle par les kinases (enzymes phosphorylant les protéines)

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35
Q

Vrai ou Faux ?
Le NAD+ et le NADP+ sont des dinucléotides tous les formés par la liasion entre une AMP et un nucléotide contenant une base rare : la nicotinamide.

A

VRAI

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36
Q

Qu’est-ce qu’un médiateur chimique ?

A

Un nucléotide avec une structure particulière dans laquelle un même groupement phosphate relie 2 carbones d’un même ose. On les appelle nucléotides cycliques.

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37
Q

Donnez un exemple de de nucléotides cyclique.

A

AMP CYCLIQUE

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38
Q

Qu’est ce que l’adénosine ?

A

Un nucléoside qui agit comme une hormone dans la régulation du sommeil (médiateur chimique)

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39
Q

Quelle est LA source d’énergie chimique par excellence ?

A

Les nucléosides triphosphates (NTPs), en particulier l’ATP.

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40
Q

Qu’est ce qui explique que l’ATP est la monnaie énergétique de la cellule ?

A

Les liens anhydrides phosphoriques de l’ATP sont hautement énergétiques, puisqu’ils en contiennent 2.

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41
Q

Qu’est ce qui permet de libérer l’énergie de l’ATP au moment approprié ?

A

Les NTPs stockent une quantité appréciable d’énergie sous forme de liaison covalente et l’hydrolyse de ces liens permet de libérer l’énergie au moment approprié.

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42
Q

L’ADN est le support de l’information génétique chez toutes les cellules. Chez certains virus, qui joue ce rôle ?

A

L’ARN

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43
Q

Où est principalement situé l’ADN chez les cellules eucaryotes ?

A

Dans le noyau principalement, mais aussi dans des organites comme les mitochondries et les chloroplastes

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44
Q

Définissez le terme génome

A

Ensemble du matériel génétique d’un organisme vivant ou d’un virus.

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45
Q

Vrai ou Faux ?
Les génomes de toutes les cellules sont composés d’ADN double brin, alors que ceux de certains virus sont composés d’ARN.

A

VRAI

46
Q

Est-ce qu’un génome peut être contenu dans une seule molécule d’ADN ?

A

OUI
C’est le cas pour la majorité des bactéries

47
Q

Vrai ou Faux ?
Chez les eucaryotes, le jeu complet des différentes molécules d’ADN qui sont présentes dans le noyau (autrement dit, l’ADN correspondant au jeu haploïde des chromosomes chez les organismes diploïdes) constitue le génome avec l’ADN mitochondrial et l’ADN choroplastique.

A

FAUX
Par convention, le génome d’un eucaryote ne comprend pas l’ADN mitochondrial et l’ADN chloroplastique.

48
Q

Résumez dans vos mots la structure de la double hélice d’ADN.

A

1) L’ADN est constitué de 2 chaînes polynucléotidiques qui sont enroulées l’une sur l’autre pour former une hélice régulière. Cette structure hélicoïdale présente un petit et un grand sillon à sa surface
2) Adénine d’un brin appariée à une thymine sur l’autre via 2 liens H, alors que guanine appariée à une cytosine sur l’autre brin via 3 liens H
3) Paires de bases empilées les unes sur les autres = à l’intérieur de la double hélice
Squelette ose-phosphate = à l’extérieur
4) Les 2 brins de l’hélice d’ADN sont antiparallèles et complémentaires.

49
Q

Vrai ou Faux ?
La composition en bases de l’ADN varie selon l’espèce.

A

VRAI

50
Q

Le contenu G+C du génome humain est de combien en % ?

A

39,8%

51
Q

Vrai ou Faux ?
La taille du génome est proportionnelle à la complexité dun organisme.

A

FAUX
La taille du génome n’est pas nécessairement proportionnelle à la complexité d’un organisme (exemple de la plante herbacée Paris Japonica qui a une génome 50 x celui du génome humain)

52
Q

À quoi correspond la structure primaire de l’ADN ?

A

Correspond à l’orde ou la séquence des résidus de nucléotides de la chaîne polynucléotidique

53
Q

Pourquoi l’ADN est presque toujours sous forme dimérique ?

A

Puisque les 2 chaînes polynucléotidiques s’associent habituellement pour former une double hélice.

54
Q

À quoi correspond la structure de la double hélice de l’ADN ?

A

À sa structure secondaire

55
Q

Vrai ou Faux ?
Les molécules d’ADN sont très longues et doivent être fortement compactées pour entrer dans la cellule.

A

VRAI

56
Q

La condensation des molécules d’ADN est décrite par quoi (2) ?

A

Les structures tertiaires et quaternaires.

57
Q

Dans chaque brin d’ADN, les désoxyribonucléotides sont reliées entre eux par quoi ?

A

Des liens phosphodiester 3’ - 5’

58
Q

Vrai ou Faux ?
La structure primaire correspond à la séquence des 2 brins d’ADN.

A

FAUX
La structure primaire correspond à la séquence d’un seul brin, même si l’ADN existe généralement sous la forme de double brin.

59
Q

La double hélice d’ADN possède un petit et un grand sillon à sa surface. Que permet le sillon majeur ?

A

Permet aux enzymes impliquées dans la réplication ou la transcription d’avoir accès à l’intérieur de la double hélice.

60
Q

Vrai ou Faux ?
À l’extérieur de la double hélice, on retrouve le squelette sucre-phosphate qui est hydrophile grâce à ces nombreux groupements polaires et chargés.

A

VRAI

61
Q

Vrai ou Faux ?
Les paires de bases forment des structures planes qui sont empilées à l’intérieur de la double hélice, formant une région hydrophobe.

A

VRAI

62
Q

Vrai ou Faux ?
Les plans des paires de bases sont parallèles les uns par rapport aux autres, mais perpendiculaires par rapport au grand axe de l’hélice.

A

VRAI

63
Q

L’ADN est-elle soluble ? Si oui, expliquez.

A

Oui, à cause du squelette sucre-phosphate qui est hydrophile

64
Q

La double hélice d’ADN est-elle stable ?

A

OUI!
Énormément de forces et d’interactions!

65
Q

Expliquer les règles de Chargaff

A

A et T: 2 liens H
G et C: 3 liens H
Règles de Chargaff
- A/T=1
- G/C=1
- Purine/pyrimidine =1

66
Q

Qu’est ce que la dénaturation de l’ADN ?

A

C’est un processus par lequel les 2 brins d’ADN se séparent complètement suite aux bris des liaisons hydrogènes et des interactions hydrophobes

67
Q

Est-ce que la dénaturatuon de l’ADN a lieu dans les cellules ?

A

NON
Peut seulement être provoquée in vitro

68
Q

Nommer les agents utilisés pour séparer les brins d’ADN.

A

1) La chaleur
2) Un pH élevé
3) Un agent chaotropique (exemple: urée)

69
Q

Qu’est ce que l’effet hyperchrome (l’hyperchromicité) ?

A

Augmentation de l’absorbance observée lors de la dénaturation de l’ADN dû au fait que l’ADN simple-brin absorbe plus fortement la lumière UV que l’ADN double brin.

70
Q

Vrai ou Faux ?
L’empilement des bases à l’intérieur de la double hélice augmente leur capacité à absorber les rayons UV.

A

FAUX
L’empilement des bases à l’intérieur de la double hélice DIMINUE leur capacité à absorber les rayons UV

71
Q

Qu’est ce qui démontre que la dénaturation de l’ADN est un processus hautement coopératif ?

A

La forme sigmoïde de la courbe de fusion (ABS de l’ADN en fonction de la température = courbe sigmoïde)

72
Q

Vrai ou Faux ?
Les liens H à l’intérieur de la double hélice sont plus stables que les liens H en milieu aqueux parce qu’ils sont à l’intérieur de la zone hydrophobe.

A

VRAI

73
Q

Pourquoi le bris des premières liaisons H entre les 2 brins demande plus d’énergie ?

A

Puisque la structure de la double hélice est stable.

74
Q

Qu’arrive-t-il lorsque les premières liaisons H sont brisées lors de la dénaturation de l’ADN ?

A

L’intérieur de l’hélice devient plus accessible aux molécules d’eau, ce qui facilite la rupture des liens adjacents

75
Q

Pourquoi la dénaturation de l’ADN est dite “coopérative” ?

A

Parce qu’à partir du moment où le processus de dénaturation est amorcé, la vitesse de bris des laisions s’accélère.

76
Q

Qu’est-ce que la température de fusion (Tm) ?

A

La température correspondant à la moitié de l’augmentation d’absorbance observée, ou autrement dit, la température pour laquelle 50% de l’ADN est dénaturé.

77
Q

Vrai ou Faux ?
La valeur de la Tm d’un ADN est directement proportionnelle au contenu en G+C, puisque le nombre de liens H est plus important entre les bases G et C qu’Entre les bases A et T.

A

VRAI

78
Q

Plus le % G+C est élevé, plus la température de fusion___________.
a) Augmente
b) Diminue

A

a) Augmente

79
Q

Est-il possible de renaturer un ADN qui a été dénaturé complètement par la chaleur ?

A

OUI
Lorsque la solution d’ADN est refroidie LENTEMENT suite à la dénaturation, les paires de bases se reforment correctement.

80
Q

Vrai ou Faux ?
Plusieurs techniques d’analyse d’ADN sont basées sur la dénaturation et la renaturation de l’ADN.

A

VRAI

81
Q

Qu’est ce que le dogme central de la biologie moléculaire ?

A

Décrit le flux de l’information génétique dans la cellule.

82
Q

Décrivez la version simplifiée du dogme central.

A

ADN transcrit en ARN, puis ARN traduit en protéine

83
Q

Qu’est ce que la réplication ?

A

Le processus par lequel l’ADN est dupliqué avant la division cellulaire.

84
Q

Qu’est ce que la transcription ?

A

C’est le processus permettant de copier différents segments de l’ADN en ARNs (plusieurs types d’ARN)

85
Q

Qu’est ce que la traduction ?

A

Processus par lequel les molécules d’ARNm sont converties en protéines.

86
Q

Certains organismes ont la capacité de transformer leurs ARNs en ADN. Comment appelle-t-on ce processus ?

A

La rétrotranscription

87
Q

Vrai ou Faux ?
Les séquences d’ARN peuvent être produite à partir d’une matrice protéique.

A

FAUX
Les séquences d’ARN ne sont JAMAIS produites à partir d’une matrice protéique.

88
Q

Que permet le code génétique ?

A

Il permet de traduire la séquence primaire d’une molécule d’ARN messager en protéine.

89
Q

Est-ce que le code génétique est le même pour tous les êtres vivants, même les virus ?

A

OUI
Le code génétique est universel

90
Q

Que veux dire “codons synonymes” ?

A

C’est 2 ou plusieurs codons codant pour le même acide aminé.

91
Q

Nommer les 3 types d’ADN.

A

1) L’ADN-B
2) L’ADN-A
3) L’ADN-Z

92
Q

Parmis les 3 types d’ADN, lequel est la conformation la plus fréquente ?

A

L’ADN-B

93
Q

Parmis les 3 types d’ADN, lequel est la conformation que l’on retrouve lorsque le taux d’humidité est élevé et qui possède une hélice droite?

A

L’ADN-B

94
Q

Parmis les 3 types d’ADN, lequel possède la structure la plus compacte et qui forme une hélice droite ?

A

L’ADN-A

95
Q

Parmis les 3 types d’ADN, lequel a la structure la plus allongée et qui est une hélice gauche ?

A

L’ADN-Z

96
Q

Parmis les 3 types d’ADN, lequelle correspond au modèle de Watson-Crick ?

A

L’ADN-B

97
Q

Nommez les 3 types/classes majeurs d’ARN dans la cellule avec leur proportions.

A

1) ARN ribosomaux (ARNr) (80% des ARNs cellulaires)
2) ARN de transfert (ARNt) (15%)
3) ARN messager (ARNm) (3%)

98
Q

Nommer une autre différence entre l’ARN et l’ADN.

A

Elle concerne la taille. Les molécules d’ARN sont bcp plus courtes que l’ADN.

99
Q

Est-ce que les molécules d’ARN peuvent toutefois contenir des régions hélicoïdales ?

A

OUI
Cela confère une structure tridimensionnelle précise à certains types d’ARN. Ces régions en double hélice se forment à l’aide de liaisons H intracaténaires

100
Q

Quelle est la fonction des ARN ribosomaux ?

A

1) Composants des ribosomes
2) Synthèse protéique

101
Q

Quelle est la fonction des ARN de transfert ?

A

Transport des acides aminés au lieu de synthèse protéique.

102
Q

Qu’est ce qu’un ARNt isoaccepteur ?

A

Des ARNt différents qui peuvent porter le même acide aminé

103
Q

Quelle est la fonction des ARN messager ?

A

Copies de segments d’ADN utilisées lors de la synthèse protéique.

104
Q

Les ARNs restants (2%) appartient à quelle catégorie? Décrivez-les un peu

A

À la catégorie des petits ARNs. Il s’agit d’un groupe hétérogène comprenant plusieurs type d’ARN comme par exemple ARNsno, ARNmicro, ARNsi, ARNpi.

105
Q

Vrai ou Faux ?
Comme les ARNr et ARNt, les petis ARNs sont non codants, c’est-à-dire qu’ils ne sont pas traduit en protéine.

A

VRAI

106
Q

Vrai ou Faux ?
Les petits ARNs ont une fonction unique.

A

FAUX
Les petits ARNs ont des fonctions cellulaires très diversifiées.

107
Q

Les règles de Chargaff s’appliquent à l’ADN, mais pas à l’ARN. Pourquoi ?

A

L’ADN est une molécule double brin dont les deux brins sont complémentaires, ce qui permet de répondre aux règles de Chargaff. L’ARN est une molécule simple brin.

108
Q

Nommer une coenzyme impliquée dans les réactions de méthylation.

A

S-adénosylméthionine

109
Q

Les 3 types d’ARN ont un point en commun ! C’est quoi ?

A

Ces 3 types d’ARN travaille ensemble lors de la traduction.

110
Q

Nommez les 6 fonctions biologiques possibles des acides nucléiques

A
  • Médiateur chimique
    (Nucléosides (adénosine) et nucléotides (AMPc))
  • Source d’énergie
    (Nucléotides)
  • Cofacteur dans les réactions enzymatiques
    (Nucléotides et dinucléotides)
  • Rôle catalytique à la manière d’enzymes
    (Ribozymes)
  • Gardienne des caractères héréditaires
    (ADN)
  • Expression des caractères héréditaires
    (ARN)

BCM-1001 (Biochimie structurale) (13 decks)

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