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Biochimie structurale > Module 12 : Les acides nucléiques > Flashcards

Module 12 : Les acides nucléiques Flashcards

1
Q

Lesquels de ces énoncés sont vrais?

A. Les nucléotides les plus fréquents ont un groupement phosphate lié en 5’ de l’ose.
B. L’uracile et la thymine sont des membres de la famille des pyrimidines.
C. Les nucléotides ne contiennent qu’un ose et une base azotée.
D. cAMP est une forme cyclique de l’AMP
E. L’ATP est un exemple de désoxynucléoside phosphate.

A

A. Les nucléotides les plus fréquents ont un groupement phosphate lié en 5’ de l’ose.
B. L’uracile et la thymine sont des membres de la famille des pyrimidines.
D. cAMP est une forme cyclique de l’AMP

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Q

Quel type de lien relie ces composés?

  1. Entre 2 nucléotides dans l’ADN et l’ARN
  2. Entre 2 phosphates d’un NDP
  3. Entre l’ose et le phosphate dans un nucléotide
  4. Entre l’ose et la base azotée dans un nucléotide
A
  1. Lien phosphodiester 3’ - 5’
  2. Lien anhydride phosphorique
  3. Lien ester phosphorique
  4. Lien N-glycosidique
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3
Q

Dans quel type de réaction ces coenzymes jouent-elles un rôle?

  1. Uridine diphosphate glucose
  2. S-adénosylméthionine
  3. ATP
  4. FAD
  5. Coenzyme A
A
  1. Glycosylation
  2. Méthylation
  3. Phosphorylation
  4. Oxydo-réduction
  5. Acylation/acétylation
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4
Q

Associez chacun des termes à la définition correspondante.

  1. Mécanisme par lequel un segment d’ADN est converti en ARN.
  2. Mécanisme par lequel les protéines sont produites à partir de l’ARN.
  3. Mécanisme par lequel l’ARN est transformé en ADN.
  4. Mécanisme par lequel l’ADN est dupliqué avant la division cellulaire.
A
  1. Transcription
  2. Traduction
  3. Rétrotranscription
  4. Réplication
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Q

Sélectionnez un composé correspondant à chacun de ces groupes.

  1. Pyrimidine
  2. Nucléotide
  3. Nucléoside
  4. Purine
A
  1. Cytosine
  2. Adénosine monophosphate
  3. Cytidine
  4. Adénine
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6
Q

Comment se nomme la transition entre l’ADN double-brin et l’ADN simple brin?

A

Dénaturation

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7
Q

Lesquels de ces énoncés sont vrais?

A. Dans toutes les espèces dont le génome est composé d’ADN double brin, le ratio purine:pyrimidine est d’approximativement 1:1.
B. L’absorbance des UV de l’ADN double brin est plus grande que celle de l’ADN simple brin.
C. Les ARN messagers sont présents sous forme simple brin.
D. Il existe 3 conformations d’ADN : A, B et Z.

A

A. Dans toutes les espèces dont le génome est composé d’ADN double brin, le ratio purine:pyrimidine est d’approximativement 1:1.
D. Il existe 3 conformations d’ADN : A, B et Z.

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8
Q

Quel type d’ARN est le plus abondant dans une cellule?

A

ARNr

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9
Q

Vrai ou faux.

Plus le % G+C augmente, plus la température de fusion augmente.

A

Vrai.

Les bases G et C sont reliées par 3 liens H, tandis que les bases A et T sont reliées par 2 liens H. Par conséquent, il faut plus d’énergie (donc de chaleur) pour briser les liens H d’une double hélice riche en G et en C, car les deux brins de celle-ci sont reliés par plus de liens H que les molécules riches en A et T.

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10
Q

Un échantillon d’ADN contient 21% de A. Déterminez le pourcentage de G de cet ADN.

A

29%

Le % A + C + T + G = 100%. Le % A = % T et le % C = % G. Avec les lois de Chargaff, vous devriez être en mesure de résoudre le problème.

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11
Q

Décrivez brièvement les règles de Chargaff.

A

 Purine = Pyrimidine
i. Le ratio purine : pyrimidine est de 1 : 1
 A = T
i. Le ratio adénine : thymine est de 1 : 1
 C = G
i. Le ratio guanine : cytosine est de 1 : 1

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12
Q

Les règles de Chargaff s’appliquent à l’ADN, mais non à l’ARN. Pourquoi?

A

L’ADN est une molécule double brin dont les deux brins sont complémentaires, ce
qui permet de répondre aux règles de Chargaff. L’ARN est une molécule simple brin.

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13
Q

Comment sont orientés les deux brins de l’hélice d’ADN l’un par rapport à
l’autre?

A

Ils sont antiparallèles. L’un est dans l’orientation 5’ → 3’, tandis que l’autre est dans l’orientation 3’ → 5’.

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14
Q

À quel type d’ADN (ADN-A, ADN-B ou ADN-Z) correspond chacun des énoncés
suivants?

A. Hélice gauche.
B. Sa formation est favorisée par une alternance de purines et de pyrimidines
C. Représente la structure la plus compacte
D. Rarement retrouvé in vivo

A

A. ADN-Z
B. ADN-Z
C. ADN-A
D. ADN-A et ADN-Z

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15
Q

Nommez les 3 principaux types d’ARN et décrivez brièvement leurs fonctions

A

 ARN messager (ARNm)
i. Copies de segments d’ADN utilisées lors de la synthèse protéique
 ARN de transfert (ARNt)
i. Transport des acides aminés au lieu de synthèse protéique
 ARN ribosomal (ARNr)
i. Composant des ribosomes
ii. Synthèse protéique

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16
Q

Dans quelle circonstance retrouve-t-on chacune des formes de l’ADN?

A

L’ADN-B est la conformation la plus fréquente et on la retrouve lorsque le taux
d’humidité est élevé.

L’ADN-A est observé lorsque le taux d’humidité est faible et dans les hybrides
ADN/ARN qui se forment lors de la transcription.

L’ADN-Z existe à très faible taux d’humidité. On retrouve également cette
conformation dans les régions présentant une alternance de purines et de
pyrimidines. Ces régions favorisent les interactions des bases avec des protéines
régulatrices.

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17
Q

Qui découcre la “nucléine” (ancêtre des acides nucléiques)?

A

Friedrich Mischer

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18
Q

Quels sont les fonctions des acides nucléiques? (6). Donnez un ex pr ch.

A
  • Gardienne des caractères héréditaires : ADN
  • Médiateur chimique : nucléosides (adénosines) et nucléotides (AMPc)
  • Source d’É : nucléotides
  • Cofacteur dans les rx enzymatiques : nucléotides et dinucléotides
  • Rôle catalytique à la manière d’enzymes : ribozyme (ex : une des espèces d’ARN ds le ribosome)
  • Expression des caractères héréditaires : ARN
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19
Q

Qui suis-je?

Je suis formé d’une base azotée et d’un ose reliés par un lien B-N-glycosidique.

A

Nucléosides

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20
Q

Qui suis-je?

Je suis un ester phosphoriques de nucléoside.

A

Nucléotides

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21
Q

Vrai ou faux.

Il peut y avoir des grpmts phosphoryle dans les nucléosides.

A

Faux.

Aucune grpmt phosphoryle dans les nucléosides.

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22
Q

Qui sont les pyrimidines? Où les retrouve-t-on indivuduellement? (3)

A
  • U (ARN)
  • C (ADN et ARN)
  • T (ADN)
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23
Q

Qui sont les purines? Où les retrouve-t-on indivuduellement? (2)

A
  • A (ADN et ARN)

- G (ADN et ARN)

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24
Q
  • Combien de nucléotides contient les oligonucléotide?

- Les polynucléotides (ARN ou ADN)

A
  • entre 10 et 50

- > 50

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25
Q

Quel rôle joue les dinucléotides dans la cellule?

A

Coenzyme

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26
Q
  • Décrivez le lien permettant de former les dinucléotides.

- Les polynucléotides.

A
  • position 5’ de l’ose de l’un des nucléotides et position 5’ de l’autre
  • liaison phosphodiester 3’-5’ = position 3’ de l’un des oses et position 5’ d’un autre
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27
Q
  • Comment s’appelle les polynucléotides constitués de desoxyribonucléotides?
  • Constitués de ribonucléotides?
A
  • ADN

- ARN

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28
Q

Décrivez comment la caféine combat la somnolence.

A

L’adénosine (nucléoside) agit comme hormone de régulation du sommeil. Qd niveau adénosine aug, sensation fatigue apparait. Caféine bloque les récepteurs neuronaux de l’adénosine.

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29
Q

Quelle structure dans l’ATP fait en sorte qu’ils sont très énergétique?

A

Liens anhydrides phosphoriques

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30
Q

Dans les cellules eucaryotes, où retrouve-t-on aussi de l’ADN ailleurs que dans le noyau? (2)

A
  • mitochondries

- chloroplastes

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31
Q

Pk le génome d’un eucaryote ne comprend pas l’ADN mitochondial et l’ADN chloroplastique?

A

PCq on compte seulement ce qui se trouve dans le noyau pour le génome

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32
Q

Chez la maj des bactéries où se trouve le génome?

A

Dans une seule molécule d’ADN

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33
Q

De quoi est fait l’hélice de l’ADN?

A

2 chaines polynucléotidiques

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34
Q
  • Chaque A se lien avec T via combine de liens H?

- G et C?

A
  • 2

- 3

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35
Q

Dans l’hélice de l’ADN où sont :

  • les pares de bases?
  • les ose-phosphate?
A
  • empilés à l’int

- squelette ext

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36
Q

Quel est le contenu G+C d’un humain?

A

39,8%

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37
Q

Quelle unité est utilisé pour exprimé la taille des molécules d’ADN double brin?

A

paires de bases (pb)
kb (1 kb = 1000 pb)
Mb (1 Mb = 10^6 pb)
Gb (1 Gb = 10^9 pb)

38
Q

Vrai ou faux.

La taille du génome est nécessairement proportionnelle à la complicité d’un org.

A

Faux.

Elle n’est pas nécessairement

39
Q
  • Quelle est la taille du génome d’E coli?

- humain?

A
  • 4,6 Mb

- 3 200 Mb

40
Q

Qui suis-je?

Je suis le processus par lequel les 2 brins d’ADN se séparent complètement suite aux bris des liens H et des interactions hydrophobes. Je peux seulement être provoqué in vitro.

A

Dénaturation de l’ADN

41
Q

Quels sont les agents utilisés pour la dénaturation d’ADN? (3)

A
  • chaleur
  • pH élevé
  • agent chaotrophie (urée)
42
Q
  • Qu’est-ce que l’effet hyperchrome?

- Qqce qui l’explique?

A
  • Qd la température de la solution d’ADN est augmenté jusqu’au point d’ébullition, l’absorbante de la lumière UV à 260 nm augmente fortement.
  • Bases qui absorbent plus lorsqu’ils libérés de la double hélice
43
Q

Pk dit on que la dénaturation est un processus hautement coopératif?

A

Qd processus de dénaturation est commencé, la vitesse de bris des liaisons s’accélère pcq qd la première liens H est brisé, l’int de l’hélice devient plus accessible ce qui facile la rupture des liens adjacents

44
Q

Qui suis-je?

Je suis la température pour laquelle 50% des l’ADN est dénaturé.

A

Tm

45
Q

Vrai ou faux.

Plus facile de brise des C+G que des A+T. Expliquez.

A

Faux.

Plus difficile de briser des C + G pcq plus de lien H que ds A+T.

46
Q

Si le % C+G est aug qu’arrive-t-il à Tm? Expliquez.

A

Est aug pcq + de lien H à briser.

47
Q

Comment pouvons-nous renaturer un ADN qui a été complètement dénaturé?

A

En la refroidissant lentement -> paires de bases de reforment correctement

48
Q

Vrai ou faux.

Les séquences ARN peuvent être produite à partir d’une matrice protéique.

A

Faux.

NE SONT JAMAIS PRODUITE À PARTIR D’UNE MATRICE PROTÉIQUE.

49
Q

Décrivez le dorme central de la bio moléculaire.

A

ADN -> (transcription) ARN -> (traduction) -> Prot

50
Q
  • Pk on dit que code génétique est universel?

- Dégénéré?

A
  • le même pour tous les être vivant et virus

- plus qu’un codon peut être coder pour le même acide aminé

51
Q

Cb y a-t-il de codons possible?

A

64

52
Q

Comment appelle-t-on les 2 ou plusieurs codons qui peuvent coder pour le même acide aminé?

A

codons synonymes

53
Q

Qui est le codon d’initiation de la traduction?

A

AUG

54
Q

Quel type d’ARN on retrouve en min?

A

ARNm

55
Q

Comment s’appelle les ARN qui peuvent porter le même acide aminé?

A

ARNt isoaccepteurs

56
Q
  • Qui sont les ARNs?

- Peuvent-ils codés?

A
  • 2% restant comprenant plusieurs types d’ARN

- Non : ne sont pas traduits en protéines

57
Q

Vrai ou faux.

Les ARN peuvent contenir des régions hélicoïdales formées à l’aide de lien H intracaténaires.

A

Vrai.

58
Q
  • Dans les nucléotides et nucléosides, on retrouve le ribote ou le désoxyribose sous quel forme?
  • En quelle configuration anomérique?
A
  • furanose

- B

59
Q

Qqce que le désoxyribose?

A

Dérivé du ribote dépourvu de Oh en C2 (H à la place)

60
Q

Purine est formé par la fusion de quoi? (2)

A
  • pyrimidine

- cycle imidazole

61
Q
  • les bases azotés sont-elles fortes ou faible?

- sont-elles solubles dans l’eau?

A
  • faibles : peuvent accepter protons en milieu acide

- insolubles

62
Q
  • Liaison B-N-glucosidique sera tjrs N_ pr la pyrimidine?

- Liaison B-N-glucosidique sera tjrs N_ pr la purine?

A
  • 1

- 9

63
Q

Vrai ou faux.

Les nucléosides sont moins solubles ds l’eau que les bases azotées seules. Expliquez.

A

Faux.

Plus solubles, pcq les grpmt OH de l’ose aug la solubilité

64
Q

Nucléosides nommés selon la base azotées, donc si

  • elle continent une pyrimidine, on ajoute le suffixe ___ au nom de la base
  • elle continent une purine, on ajoute le suffixe ___ au nom de la base
A
  • idine

- osine

65
Q

Quel lien attache la nucléoside au grpmt phosphoryle dans les nucléotide?

A

ester phosphorique

66
Q

Pr les nucléotides libres, quel lien domine?

A

5’

67
Q

Dans les nucléotides,

  • pour le ribose, quel positions peuvent être phosphorées?(3)
  • pour le désoxyribose, quel positions peuvent être phosphorées?(2) PK?
A
  • 2’, 3’ et 5’

- 3’ et 5’ Pcq C2 n’a pas OH ds désoxyribose

68
Q

Les nucléotides peuvent porter jusqu’à cb de grmpt phosphates liées entre eux?

A

3

69
Q
  • Les nucléotides sont-ils solubles ds l’eau? PK

- Absorbent-ils les UV? PK?

A
  • Oui, CAR contient plusieurs grpmt ioniques et polaires

- Oui, présence de bases azotées

70
Q

Quel est le rôle dans le métabolisme de l’ATP? (3)

A
  • Tranfert du grpmt phosphoryle
  • Tranfert du grpmt pyrophosphoryle
  • Tranfert du grpmt nucléotidyle
71
Q

Quel est le rôle dans le métabolisme des acides nucléiques suivante étant des coenzymes :

  • S-Adénosylméthionine
  • Uridine diphosphate glucose
  • NAD+ et NADP +
  • FMN et FAD
  • Coenzyme A
A
  • Transfert du grpmt méthyle
  • Transfert du grpmt glycosyle
  • Transfert é
  • Transfert é
  • Transfert de grpmt acyle
72
Q

Qui est le nucléotide le plus souvent utilisé comme coenzyme?

A

ATP

73
Q

La S-Adénosylméthionine est obtenu par la rx de?

A

ATP avec méthionine

74
Q

L’uridine diphosphate glucose est formé par la rx de?

A

UTP et glucose-1-P

75
Q

Le NAD+ et NADP + est formé par la rx de?

A

nicotinamide et AMP

76
Q

Qqce qui différencie le NAD+ et NADP +?

A

Le grpmt OH de l’AMP en position 2’ est phosphorylé dans NADP+

77
Q

Quelle sont les formes réduites résultatantes de l’oxydoréduction chez NAD+ et NADP +?

A

NADH et NADPH

78
Q

La charge nette des NAD+ et NADP + en raison des grmpt phosphates, pk ont-ils un + alors?

A

C’est la charge locale de la base nicotinamide.

79
Q

Qqce qui différencie FMN et FAD?

A 
FMN = flavine monoculéotide
FAD = flavine adénine dinucléotide
80
Q

De quoi est formé la coenzyme A? (3)

A

nucléotide
panthoténate
2-mercaptoéthylamine

81
Q

Qui est le grmpt réactif dans la coenzyme A?

A

thiol (SH)

82
Q

Qqce que l’acétyle-CoA?

A

Qd coenzyme A est liée à grpmt acétyle

83
Q

Qui suis-je?

Grmp fonctionnel obtenu en enlevant OH d’un acide carboxylique.

A

Acyle

84
Q
  • Quelle est la structure primaire de l’ADN?

- Secondaire?

A
  • nucléotides

- double hélice

85
Q

On lit et on écrit tjrs une séquence d’ADN dans quel sens?

A

extrémité 5’P -> extrémité 3’OH

86
Q

Quelles interactions/forces permettent la stabilité de la double hélice d’ADN? Décrivez ch. (4)

A
  • Interaction hydrophobes : entres les bases regroupés à l’int
  • Forces de Van der Waals : causées par empilement des bases
  • Liens H : entre bases appariées ET entre sucres-P et milieux aqueux
  • Interactions ioniques : entre P et cations (Mg+)
87
Q

Lesquels des énoncés suivants sont vrais?

A. L’ADN est transcrit en ARN.
B. L’ADN est transcrit en protéines.
C. L’ADN est traduit en protéines.
D. L’ADN est répliqué de manière à produire une seconde copie de l’ADN avant chaque division cellulaire.

A

A. L’ADN est transcrit en ARN.

D. L’ADN est répliqué de manière à produire une seconde copie de l’ADN avant chaque division cellulaire.

88
Q

Pourquoi la température de fusion d’un ADN riche en adénine est-elle moins élevée que celle d’un ADN riche en guanine?

A. Les purines sont plus stables que les pyrimidines.
B. Le tour de l’hélice est plus long dans les régions riches en adénine.
C. Les appariements de bases impliquant l’adénine contiennent moins de liens H que ceux impliquant la guanine.
D. La présence d’un désoxyose augmente la stabilité de l’hélice.

A

C. Les appariements de bases impliquant l’adénine contiennent moins de liens H que ceux impliquant la guanine.

89
Q

Donnez la séquence du brin dans la double hélice d’ADN, qui est complémentaire à celle du brin indiquée ci-dessous.

5’ –GTTCACGCCTAAACGTAC-3’

A. 5’-CAAGTGCGGATTTGCATG-3’
B. 5-GUACGUUUAGGCGUGAAC-3’
C. 5’-GTACGTTTAGGCGTGAAC-3’
D. 5’-CAAGUGCGGAUUUGCAUG-3’

A

C. 5’-GTACGTTTAGGCGTGAAC-3’

90
Q

Qu’indique le signe ʺ+ʺ dans NAD+?

A. Que la molécule ne peut se lier qu’à une protéine chargée négativement.
B. Que l’atome d’azote de la portion « nicotinamide » est chargé positivement.
C. Que la charge nette de la molécule est positive.
D. Que c’est la forme réduite de la coenzyme.

A

B. Que l’atome d’azote de la portion « nicotinamide » est chargé positivement.

91
Q

Quelle est la différence entre le dGMP et le GMP?

A.	La nature de la base azotée.
B.	Le type de lien glycosidique.
C.	Le nombre de groupements phosphate.
D.	Le type d’ose.
E.	Le type de lien phosphodiester.
A

D. Le type d’ose.

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