miRNA, siRNA, lncRNA, piRNA

Question 1

caract. de los miRNA

Answer 1

-Los miRNA se emparejan con la secuencia UTR 3’
-RNA no codificante
-Promueven la desadenilación
-Degradan al RNAm
-Tiene forma de pasador (se autocomplementa)

Question 2

Caminos que puede tomar el miRNA

Answer 2

miRNA tiene dos caminos: corta el RNAm o lleva RNAm a los cuerpos P (dónde se degrada el RNAm)

Question 3

¿Quién sintetiza al miRNA?

Answer 3

RNA pol II (le pone CAP y poliA)

Question 4

Puede salir el miRNA con CAP y poliA al citoplasma?

Answer 4

NO, porque si no se haría una proteína del miRNA, en el núcleo sale con esto, antes de salir del núcleo se le tiene que cortar CAP y poliA

Question 5

¿Cómo sacamos a miRNA del núcleo?

Answer 5

miRNA sale del núcleo por exportina 5 y , una vez en citoplasma sufre otro corte, para quitarle el bucle, y tenemos dos tiras de RNA, llega complejo RISC (le quita una hebra y se queda con una cadena de RNA)

Question 6

¿Qué pasa si el miRNA sale al citoplasma con poliA y CAP?

Answer 6

Codifican para una proteína

Question 7

¿Quién corta al miRNA cuando sale del núcleo?

Answer 7

Dicer

Question 8

Cortes que sufre miRNA y por quién

Answer 8

En el núcleo sufre primer corte por Drosha, se forma el pasador, sale hacia el citoplasma, ahí sufre su segundo corte, por medio de Dicer (le quita el bucle), una vez quitado el bucle llega el complejo RISC (contiene argonauta) -> se escoge solo una hebra y buscamos un RNAm (se complementan totalmente o parcialmente)

Question 9

¿Qué ocurre si se complementa totalmente o una parte el miRNA?

Answer 9

Si se complementa totalmente argonauta (endonucleasa) corta al RNAm, degradándolo, si se complementa parcialmente se inhibe la traducción y se lleva hacia los cuerpos P para su eventual degradación y la traducción se reduce

Question 10

¿Qué pasa con lo que queda del miRNA después de haber sido cortado y haber salido al citoplasma?

Answer 10

Se une con el complejo Risc (un complejo de proteínas con endonucleasas) -> complejo silenciador inducido por RNA (RISC)

Question 11

Formas en las que se puede complementar el miRNA

Answer 11

Completamente (todo)
Parcialmente (una parte)

Question 12

¿Qué pasa si el miRNA se complementa totalmente con la región 3´UTR de un RNAm?

Answer 12

La endonucleasa lo degrada removiendo cola de poliA y no se puede traducir el RNAm

Question 13

¿Qué pasa si el miRNA se complementa parcialmente con la región 3´UTR de un RNAm?

Answer 13

Se desestabiliza el RNAm
Se acorta la cola poliA
Se mueve hacia el citosol hacia los cuerpos P
Los cuerpos P degradan al RNAm

Question 14

¿Qué hace Risc cuando el miRNA se complementa totalmente?

Answer 14

Corta el RNAm

Question 15

¿Qué son los cuerpo P?

Answer 15

• Sito en donde se degradan los
  RNA m
• Enzimas que retiran el capuchón
• Exonucleasas
• Región en el citoplasma donde tenemos muchas endo y exonucleasas

Question 16

¿Qué hace el miRNA unido a Risc?

Answer 16

Trata de unirse a la región 3´UTR de una RNAm

Question 17

¿Qué pasa si hay una concentración alta o baja de los miRNA?

Answer 17

Hay enfermedades como infartos al miocardio, falla hepática, falla renal, etc.

Question 18

¿Para qué son importantes los miRNA?

Answer 18

Se pueden usar como biomarcadores -> los cambios en los niveles de estos miRNA pueden proporcionar información útil sobre la presencia, gravedad o progresión de una enfermedad.
-Se pueden cuantificar y son específicos de cada enfermedad y tejido

Question 19

En el contexto del cáncer ¿Cuál sería el papel de los miRNA?

Answer 19

-Al hacer biomarcadores, ciertos miARN pueden estar sobreexpresados comparación con los niveles normales en tejidos cancerosos.
-Los perfiles de miARN pueden utilizarse como indicadores para diagnosticar o monitorear la respuesta al tratamiento del cáncer y de otras enfermedades.
-Además, como los miARN pueden detectarse en muestras biológicas como la sangre, la orina o el tejido tumoral, su detección se convierte en una herramienta no invasiva

Question 20

Tipo de RNA que sirven como biomarcadores

Answer 20

miRNA

Question 21

siRNA tienen diferentes orígenes

Answer 21

Exógeno: virus
Endógeno: Transposones

Question 22

caract. de los siRNA y su diferencia con los miRNA

Answer 22

-Doble cadena de RNA, siRNA solo escoge a un RNAm, miRNA podía escoger varios RNAm, es más al azar y el siRNA es más específico.
-Ambos se van a unir a región 3´ UTR
-siRNA es RNAm específico y miRNA es promiscuo xd
-miRNA para diagnóstico y los siRNA para tratamiento por especificidad
-miRNA se complementa totalmente o parcialmente y el siRNA totalmente

Question 23

Pasos en los que formamos el siRNA

Answer 23

Llega dicer y lo hace más pequeño al siRNA -> usa R2D2 (ayuda a seleccionar la hebra con la que se va a quedar el argonauta) -> escoge hebra, llega argonauta y después llega C3PO y ayuda a que venga argonauta y se quede con solo una hebra, viene una proteína que se llama Hen1 (metila al RNA que está escogiendo, y así tenemos el siRNA)

Question 24

¿Qué son los transposones?

Answer 24

fragmentos de DNA que son externos (exógenos) que se han adaptado a nuestro DNA -> Secuencias de nucleotidos que se pueden mover dentro del genoma.
* Causan mutaciones en el DNA
* Alterando la conformación del genoma

Question 25

Parte del DNA exógeno que hemos ganado durante la evolución, que se ha infectado y ha podido pasar su DNA de microorganismos (p.e. virus) a nuestros cromosomas

Answer 25

Transposones

Question 26

¿Quién corta a siRNA?

Answer 26

Dicer y R2D2

Question 27

Son cofactores

Answer 27

R2D2 y C3PO

Question 28

¿Qué son las argonautas?

Answer 28

Endonucleasas

Question 29

Enfermedades que puede haber por mutaciones a los transposones

Answer 29

Distrofia muscular de Duchenne, leucemia, cáncer

Question 30

¿Cómo se une siRNA al RNAm?

Answer 30

Completamente (si no, no se une)

Question 31

caract. de los lncRNA

Answer 31

RNA largos no codificantes, 200 nt, no se van a traducir a proteínas, RNA pol II los genera?

Question 32

Función de los lncRNA

Answer 32

-Mantienen a todos los miRNAs juntos, principal función a nivel del núcleo, interfieren con la transcripción (inhibiendo o favoreciendo)
-Modulan función de la cromatina, promueve corte y empalme de RNAm -> mantiene unidos a todas las nucleoproteínas de corte y empalme (U1, U2, U4, etc)
-Se encuentran desde replicación hasta transcripción

Question 33

Localización de los lncRNA

Answer 33

• Núcleo
• Citoplasma
• Mitocondrias
• Exosomas
  Al hacer tan específicos sirven para diagnóstico

Question 34

Función de los lncRNA en Alzheimer

Answer 34

Promueven la estabilidad de la proteína β amiloide

Question 35

lncRNA qué están en concentraciones anormales en cáncer de mama

Answer 35

HOTAIR, XIST y MALAT

Question 36

caract. de los piRNAs

Answer 36

Utilizan proteína que se llaman PIWI (familia de la argonauta), nos ayudan a quitar proteínas que salen de los trasposones.
RNA pol II los hace?? -> debido que al juntar 5 PIWI´s se hace RNA largo

Question 37

¿En qué se convierte la suma de varios piRNA?

Answer 37

En lncRNA

Question 38

Función de los PIWI´s

Answer 38

-Actividad de endonucleasa
* Familia de las Argonautas
* Silenciamiento de genes transponibles
* Regulan la expresión de genes
* Combaten infecciones víricas

Question 39

Se encuentran asociados a proteínas llamadas PIWI

Answer 39

piRNA´s -> usa proteínas, los lncRNA NO

Question 40

media el silenciamiento del mRNA diana a través de su degradación o inhibición traduccional

Answer 40

Complejo RISC