miRNA, siRNA, lncRNA, piRNA Flashcards
caract. de los miRNA
-Los miRNA se emparejan con la secuencia UTR 3’
-RNA no codificante
-Promueven la desadenilación
-Degradan al RNAm
-Tiene forma de pasador (se autocomplementa)
Caminos que puede tomar el miRNA
miRNA tiene dos caminos: corta el RNAm o lleva RNAm a los cuerpos P (dónde se degrada el RNAm)
¿Quién sintetiza al miRNA?
RNA pol II (le pone CAP y poliA)
Puede salir el miRNA con CAP y poliA al citoplasma?
NO, porque si no se haría una proteína del miRNA, en el núcleo sale con esto, antes de salir del núcleo se le tiene que cortar CAP y poliA
¿Cómo sacamos a miRNA del núcleo?
miRNA sale del núcleo por exportina 5 y , una vez en citoplasma sufre otro corte, para quitarle el bucle, y tenemos dos tiras de RNA, llega complejo RISC (le quita una hebra y se queda con una cadena de RNA)
¿Qué pasa si el miRNA sale al citoplasma con poliA y CAP?
Codifican para una proteína
¿Quién corta al miRNA cuando sale del núcleo?
Dicer
Cortes que sufre miRNA y por quién
En el núcleo sufre primer corte por Drosha, se forma el pasador, sale hacia el citoplasma, ahí sufre su segundo corte, por medio de Dicer (le quita el bucle), una vez quitado el bucle llega el complejo RISC (contiene argonauta) -> se escoge solo una hebra y buscamos un RNAm (se complementan totalmente o parcialmente)
¿Qué ocurre si se complementa totalmente o una parte el miRNA?
Si se complementa totalmente argonauta (endonucleasa) corta al RNAm, degradándolo, si se complementa parcialmente se inhibe la traducción y se lleva hacia los cuerpos P para su eventual degradación y la traducción se reduce
¿Qué pasa con lo que queda del miRNA después de haber sido cortado y haber salido al citoplasma?
Se une con el complejo Risc (un complejo de proteínas con endonucleasas) -> complejo silenciador inducido por RNA (RISC)
Formas en las que se puede complementar el miRNA
Completamente (todo)
Parcialmente (una parte)
¿Qué pasa si el miRNA se complementa totalmente con la región 3´UTR de un RNAm?
La endonucleasa lo degrada removiendo cola de poliA y no se puede traducir el RNAm
¿Qué pasa si el miRNA se complementa parcialmente con la región 3´UTR de un RNAm?
Se desestabiliza el RNAm
Se acorta la cola poliA
Se mueve hacia el citosol hacia los cuerpos P
Los cuerpos P degradan al RNAm
¿Qué hace Risc cuando el miRNA se complementa totalmente?
Corta el RNAm
¿Qué son los cuerpo P?
- Sito en donde se degradan los
RNA m - Enzimas que retiran el capuchón
- Exonucleasas
- Región en el citoplasma donde tenemos muchas endo y exonucleasas
¿Qué hace el miRNA unido a Risc?
Trata de unirse a la región 3´UTR de una RNAm
¿Qué pasa si hay una concentración alta o baja de los miRNA?
Hay enfermedades como infartos al miocardio, falla hepática, falla renal, etc.
¿Para qué son importantes los miRNA?
Se pueden usar como biomarcadores -> los cambios en los niveles de estos miRNA pueden proporcionar información útil sobre la presencia, gravedad o progresión de una enfermedad.
-Se pueden cuantificar y son específicos de cada enfermedad y tejido
En el contexto del cáncer ¿Cuál sería el papel de los miRNA?
-Al hacer biomarcadores, ciertos miARN pueden estar sobreexpresados comparación con los niveles normales en tejidos cancerosos.
-Los perfiles de miARN pueden utilizarse como indicadores para diagnosticar o monitorear la respuesta al tratamiento del cáncer y de otras enfermedades.
-Además, como los miARN pueden detectarse en muestras biológicas como la sangre, la orina o el tejido tumoral, su detección se convierte en una herramienta no invasiva
Tipo de RNA que sirven como biomarcadores
miRNA
siRNA tienen diferentes orígenes
Exógeno: virus
Endógeno: Transposones
caract. de los siRNA y su diferencia con los miRNA
-Doble cadena de RNA, siRNA solo escoge a un RNAm, miRNA podía escoger varios RNAm, es más al azar y el siRNA es más específico.
-Ambos se van a unir a región 3´ UTR
-siRNA es RNAm específico y miRNA es promiscuo xd
-miRNA para diagnóstico y los siRNA para tratamiento por especificidad
-miRNA se complementa totalmente o parcialmente y el siRNA totalmente
Pasos en los que formamos el siRNA
Llega dicer y lo hace más pequeño al siRNA -> usa R2D2 (ayuda a seleccionar la hebra con la que se va a quedar el argonauta) -> escoge hebra, llega argonauta y después llega C3PO y ayuda a que venga argonauta y se quede con solo una hebra, viene una proteína que se llama Hen1 (metila al RNA que está escogiendo, y así tenemos el siRNA)
¿Qué son los transposones?
fragmentos de DNA que son externos (exógenos) que se han adaptado a nuestro DNA -> Secuencias de nucleotidos que se pueden mover dentro del genoma.
* Causan mutaciones en el DNA
* Alterando la conformación del genoma
Parte del DNA exógeno que hemos ganado durante la evolución, que se ha infectado y ha podido pasar su DNA de microorganismos (p.e. virus) a nuestros cromosomas
Transposones
¿Quién corta a siRNA?
Dicer y R2D2
Son cofactores
R2D2 y C3PO
¿Qué son las argonautas?
Endonucleasas
Enfermedades que puede haber por mutaciones a los transposones
Distrofia muscular de Duchenne, leucemia, cáncer
¿Cómo se une siRNA al RNAm?
Completamente (si no, no se une)
caract. de los lncRNA
RNA largos no codificantes, 200 nt, no se van a traducir a proteínas, RNA pol II los genera?
Función de los lncRNA
-Mantienen a todos los miRNAs juntos, principal función a nivel del núcleo, interfieren con la transcripción (inhibiendo o favoreciendo)
-Modulan función de la cromatina, promueve corte y empalme de RNAm -> mantiene unidos a todas las nucleoproteínas de corte y empalme (U1, U2, U4, etc)
-Se encuentran desde replicación hasta transcripción
Localización de los lncRNA
- Núcleo
- Citoplasma
- Mitocondrias
- Exosomas
Al hacer tan específicos sirven para diagnóstico
Función de los lncRNA en Alzheimer
Promueven la estabilidad de la proteína β amiloide
lncRNA qué están en concentraciones anormales en cáncer de mama
HOTAIR, XIST y MALAT
caract. de los piRNAs
Utilizan proteína que se llaman PIWI (familia de la argonauta), nos ayudan a quitar proteínas que salen de los trasposones.
RNA pol II los hace?? -> debido que al juntar 5 PIWI´s se hace RNA largo
¿En qué se convierte la suma de varios piRNA?
En lncRNA
Función de los PIWI´s
-Actividad de endonucleasa
* Familia de las Argonautas
* Silenciamiento de genes transponibles
* Regulan la expresión de genes
* Combaten infecciones víricas
Se encuentran asociados a proteínas llamadas PIWI
piRNA´s -> usa proteínas, los lncRNA NO
media el silenciamiento del mRNA diana a través de su degradación o inhibición traduccional
Complejo RISC
