miRNA, siRNA, lncRNA, piRNA Flashcards

You may prefer our related Brainscape-certified flashcards:
1
Q

caract. de los miRNA

A

-Los miRNA se emparejan con la secuencia UTR 3’
-RNA no codificante
-Promueven la desadenilación
-Degradan al RNAm
-Tiene forma de pasador (se autocomplementa)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Caminos que puede tomar el miRNA

A

miRNA tiene dos caminos: corta el RNAm o lleva RNAm a los cuerpos P (dónde se degrada el RNAm)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

¿Quién sintetiza al miRNA?

A

RNA pol II (le pone CAP y poliA)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Puede salir el miRNA con CAP y poliA al citoplasma?

A

NO, porque si no se haría una proteína del miRNA, en el núcleo sale con esto, antes de salir del núcleo se le tiene que cortar CAP y poliA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

¿Cómo sacamos a miRNA del núcleo?

A

miRNA sale del núcleo por exportina 5 y , una vez en citoplasma sufre otro corte, para quitarle el bucle, y tenemos dos tiras de RNA, llega complejo RISC (le quita una hebra y se queda con una cadena de RNA)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

¿Qué pasa si el miRNA sale al citoplasma con poliA y CAP?

A

Codifican para una proteína

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

¿Quién corta al miRNA cuando sale del núcleo?

A

Dicer

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Cortes que sufre miRNA y por quién

A

En el núcleo sufre primer corte por Drosha, se forma el pasador, sale hacia el citoplasma, ahí sufre su segundo corte, por medio de Dicer (le quita el bucle), una vez quitado el bucle llega el complejo RISC (contiene argonauta) -> se escoge solo una hebra y buscamos un RNAm (se complementan totalmente o parcialmente)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

¿Qué ocurre si se complementa totalmente o una parte el miRNA?

A

Si se complementa totalmente argonauta (endonucleasa) corta al RNAm, degradándolo, si se complementa parcialmente se inhibe la traducción y se lleva hacia los cuerpos P para su eventual degradación y la traducción se reduce

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

¿Qué pasa con lo que queda del miRNA después de haber sido cortado y haber salido al citoplasma?

A

Se une con el complejo Risc (un complejo de proteínas con endonucleasas) -> complejo silenciador inducido por RNA (RISC)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Formas en las que se puede complementar el miRNA

A

Completamente (todo)
Parcialmente (una parte)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

¿Qué pasa si el miRNA se complementa totalmente con la región 3´UTR de un RNAm?

A

La endonucleasa lo degrada removiendo cola de poliA y no se puede traducir el RNAm

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

¿Qué pasa si el miRNA se complementa parcialmente con la región 3´UTR de un RNAm?

A

Se desestabiliza el RNAm
Se acorta la cola poliA
Se mueve hacia el citosol hacia los cuerpos P
Los cuerpos P degradan al RNAm

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

¿Qué hace Risc cuando el miRNA se complementa totalmente?

A

Corta el RNAm

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

¿Qué son los cuerpo P?

A
  • Sito en donde se degradan los
    RNA m
  • Enzimas que retiran el capuchón
  • Exonucleasas
  • Región en el citoplasma donde tenemos muchas endo y exonucleasas
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

¿Qué hace el miRNA unido a Risc?

A

Trata de unirse a la región 3´UTR de una RNAm

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

¿Qué pasa si hay una concentración alta o baja de los miRNA?

A

Hay enfermedades como infartos al miocardio, falla hepática, falla renal, etc.

18
Q

¿Para qué son importantes los miRNA?

A

Se pueden usar como biomarcadores -> los cambios en los niveles de estos miRNA pueden proporcionar información útil sobre la presencia, gravedad o progresión de una enfermedad.
-Se pueden cuantificar y son específicos de cada enfermedad y tejido

19
Q

En el contexto del cáncer ¿Cuál sería el papel de los miRNA?

A

-Al hacer biomarcadores, ciertos miARN pueden estar sobreexpresados comparación con los niveles normales en tejidos cancerosos.
-Los perfiles de miARN pueden utilizarse como indicadores para diagnosticar o monitorear la respuesta al tratamiento del cáncer y de otras enfermedades.
-Además, como los miARN pueden detectarse en muestras biológicas como la sangre, la orina o el tejido tumoral, su detección se convierte en una herramienta no invasiva

20
Q

Tipo de RNA que sirven como biomarcadores

A

miRNA

21
Q

siRNA tienen diferentes orígenes

A

Exógeno: virus
Endógeno: Transposones

22
Q

caract. de los siRNA y su diferencia con los miRNA

A

-Doble cadena de RNA, siRNA solo escoge a un RNAm, miRNA podía escoger varios RNAm, es más al azar y el siRNA es más específico.
-Ambos se van a unir a región 3´ UTR
-siRNA es RNAm específico y miRNA es promiscuo xd
-miRNA para diagnóstico y los siRNA para tratamiento por especificidad
-miRNA se complementa totalmente o parcialmente y el siRNA totalmente

23
Q

Pasos en los que formamos el siRNA

A

Llega dicer y lo hace más pequeño al siRNA -> usa R2D2 (ayuda a seleccionar la hebra con la que se va a quedar el argonauta) -> escoge hebra, llega argonauta y después llega C3PO y ayuda a que venga argonauta y se quede con solo una hebra, viene una proteína que se llama Hen1 (metila al RNA que está escogiendo, y así tenemos el siRNA)

24
Q

¿Qué son los transposones?

A

fragmentos de DNA que son externos (exógenos) que se han adaptado a nuestro DNA -> Secuencias de nucleotidos que se pueden mover dentro del genoma.
* Causan mutaciones en el DNA
* Alterando la conformación del genoma

25
Q

Parte del DNA exógeno que hemos ganado durante la evolución, que se ha infectado y ha podido pasar su DNA de microorganismos (p.e. virus) a nuestros cromosomas

A

Transposones

26
Q

¿Quién corta a siRNA?

A

Dicer y R2D2

27
Q

Son cofactores

A

R2D2 y C3PO

28
Q

¿Qué son las argonautas?

A

Endonucleasas

29
Q

Enfermedades que puede haber por mutaciones a los transposones

A

Distrofia muscular de Duchenne, leucemia, cáncer

30
Q

¿Cómo se une siRNA al RNAm?

A

Completamente (si no, no se une)

31
Q

caract. de los lncRNA

A

RNA largos no codificantes, 200 nt, no se van a traducir a proteínas, RNA pol II los genera?

32
Q

Función de los lncRNA

A

-Mantienen a todos los miRNAs juntos, principal función a nivel del núcleo, interfieren con la transcripción (inhibiendo o favoreciendo)
-Modulan función de la cromatina, promueve corte y empalme de RNAm -> mantiene unidos a todas las nucleoproteínas de corte y empalme (U1, U2, U4, etc)
-Se encuentran desde replicación hasta transcripción

33
Q

Localización de los lncRNA

A
  • Núcleo
  • Citoplasma
  • Mitocondrias
  • Exosomas
    Al hacer tan específicos sirven para diagnóstico
34
Q

Función de los lncRNA en Alzheimer

A

Promueven la estabilidad de la proteína β amiloide

35
Q

lncRNA qué están en concentraciones anormales en cáncer de mama

A

HOTAIR, XIST y MALAT

36
Q

caract. de los piRNAs

A

Utilizan proteína que se llaman PIWI (familia de la argonauta), nos ayudan a quitar proteínas que salen de los trasposones.
RNA pol II los hace?? -> debido que al juntar 5 PIWI´s se hace RNA largo

37
Q

¿En qué se convierte la suma de varios piRNA?

A

En lncRNA

38
Q

Función de los PIWI´s

A

-Actividad de endonucleasa
* Familia de las Argonautas
* Silenciamiento de genes transponibles
* Regulan la expresión de genes
* Combaten infecciones víricas

39
Q

Se encuentran asociados a proteínas llamadas PIWI

A

piRNA´s -> usa proteínas, los lncRNA NO

40
Q

media el silenciamiento del mRNA diana a través de su degradación o inhibición traduccional

A

Complejo RISC