Control de expresión génica

Question 1

¿Qué es la expresión génica?

Answer 1

Diferentes células en un organismo multicelular pueden expresar grupos muy diversos de genes, aún cuando contienen el mismo ADN.

Question 2

Tipos de control a nivel transcripcional

Answer 2

Regulación en cis
Regulación en trans

Question 3

¿Qué es la regulación en cis?

Answer 3

Una secuencia contigua a un gen que tenga un efecto regulador sobre la tasa de transcripción de ese gen -> potenciadores y silenciadores
TATA

Question 4

¿Qué es la regulación en trans?

Answer 4

-La mayoría de las secuencias reguladoras no pueden, por sí solas, modificar la velocidad de transcripción. Necesitan de proteínas reguladoras (como los activadores)
Las proteínas que leen las secuencias

Question 5

Diferencia entre regulación en cis y trans

Answer 5

Cis -> es la secuencia de nucleótidos (TATA es regulación en cis) -> todo lo que está dentro del DNA
Trans -> es el activador, es decir las proteínas (TFIID es regulación en trans) -> las proteínas que van a poder leer lo que dice el DNA

Question 6

Son reguladores en cis

Answer 6

Potenciadores, silenciadores , TATA

Question 7

Son reguladores en trans

Answer 7

Factores de transcripción
Activadores
Represores
TFIID

Question 8

Donde mejor se puede reconocer la secuencia es ______

Answer 8

En el surco mayor del DNA (todas las proteínas encuentran a las secuencias aquí, porque es dónde se asoman más los nucleótidos)

Question 9

Estructuras que pueden tener los factores de transcripción (4)

Answer 9

Motivo hélice-giro-hélice (desarrollo embrionario)
Motivo dedos de Zn (receptores de hormonas esteroideas)
Motivo zipper de leucina
Hélice-asa-Hélice

Question 10

Cadena de proteínas que pueden mandar la información del activador a los factores de transcripción

Answer 10

Mediadores

Question 11

Sitio en dónde los factores de transcripción y la RNA pol se ensambla

Answer 11

Promotor

Question 12

Son proteínas que actúan directamente con los factores de transcripción y pueden regular la actividad de la RNA pol II

Answer 12

Activadores -> se unen a potenciadores

Question 13

La unión de FT a los potenciadores a que ayudan?

Answer 13

Desarrollo
Diferenciación
Respuesta de las células a las hormonas y los factores de crecimiento

Question 14

Si tenemos promotor + potenciador ¿Qué ocurre con el ARNm?

Answer 14

Aumenta cantidad de RNAm porque acelera la transcripción

Question 15

Son proteínas que se unen a secuencias específicas dentro del DNA para inhibir la transcripción

Answer 15

Represores -> se unen a los silenciadores

Question 16

La descondensación de la cromatina es suficiente para convertir el ADN en una plantilla accesible para la transcripción. VERDADERO O FALSO

Answer 16

FALSO -> Los genes permanecen unidos a las histonas y empaquetados en nucleosomas y los FT y la ARN pol siguen enfrentándose al problema de interactuar con la cromatina y no con el ADN desnudo

Question 17

¿Qué es la epigenética?

Answer 17

Todos los procesos y mecanismos moleculares que afectan a la regulación y expresión de los genes y que son heredables de unos organismos a otros.

Question 18

Los mecanismos de regulación epigenética
más comunes en humanos son _____

Answer 18

La metilación del ADN y las modificaciones post-traduccionales de las histonas (fosforilación, la metilación y la acetilación)

Question 19

Cambios en la expresión del DNA sin que se modifique la secuencia genética

Answer 19

Mecanismos epigenéticos

Question 20

¿En qué consiste la metilación?

Answer 20

En la adición de grupos metilo al carbono 5 de la citosina (5mC) -> equivale al 1% del DNA

Siempre en C que van después de una G

Question 21

¿Qué le ocurre al DNA cuando se metila?

Answer 21

-Modifica la hélice, se distorsiona la hebra por metilaciones

Question 22

¿Quién hace las metilaciones?

Answer 22

Las metiltransferasas -> Reconocen la pareja GC metilada y pone las metilaciones en la hebra hija

Question 23

Por qué es importante que la hebra hija no esté metilada y cómo ocurre este proceso

Answer 23

Tenemos metilación en hebra líder (en la citocina) y en la complementaria para que al momento de la replicación las hebras originales c/u tenga una metilación y la hebra copia o la hija NO tendrá la metilación -> de esta manera la célula puede reconocer cuál es la hebra hija y la original.

Question 24

Una proteína en búsqueda de caja TATA con metilaciones la puede encontrar fácil si o no? y por qué

Answer 24

FALSO -> debido a que mientras más metilación sufra el DNA menos se va a poder leer y por lo tanto menos expresión génica

Question 25

Caract. de la eucromatina

Answer 25

-Regiones relativamente dispersas poco condensadas que ocupan la mayor parte del núcleo. -Niveles alto de acetilación -Cromatina activa transcripcional | **Eu = verdadero**

Question 26

Caract. de la heterocromatina

Answer 26

-Regiones de la cromatina densamente empaquetadas -Inactivas, no se expresan -Abundante en los telómeros y centrómeros -Niveles altos de metilación

Question 27

Son parte del cromosoma que no tiene genes

Answer 27

Telómeros y centrómeros

Question 28

Tipos de heterocromatina

Answer 28

-FACULTATIVA -> Se expresan durante el desarrollo y/o diferenciación y posteriormente se silencian. Ej: mórula-blastocisto-cigoto -CONSTITUTIVA -> Siempre permanecen condensados y se encuentran silenciados. Ej: Telómeros y centrómeros (no tienen info genética ¿Para qué pollos los desenrollo? | **CONSTITUTIVA -> CONSTANTEMENTE EMPAQUETADOS**

Question 29

Dominios de las histonas (2)

Answer 29

-Un carboxilo -COOH -Amino (NH2) terminal que se encuentra fuera del DNA y sufre modificaciones (NH2 terminal siempre está libre)

Question 30

Qué ocurre si a los brazitos amino terminal le agrego cargas positivas?

Answer 30

Les pongo cosas a los brazitos para modificar cargas, DNA tiene carga negativa, si modifico brazos de las histonas (NH2) y hago que se vuelvan positivas, se atraen y el DNA se encuentra cerrado -> si tengo histona (+) abrazando al DNA, la RNA pol NO puede pasar

Question 31

Qué ocurre si a los brazitos amino terminal le agrego más cargas negativas?

Answer 31

Recordar que el DNA tiene carga negativa al añadirle más cargas negativas -> los brazos se abren y DNA se suelta

Question 32

Formas de modificar las histonas (3)

Answer 32

Acetilación Metilación Fosforilación

Question 33

¿Qué hace la acetilación de histonas?

Answer 33

Las acetilaciones lo hago sobre las lisinas -> añade cargas negativas a las histonas y favorece la transcripción -> pues cargas negativas se repelan (negativo del DNA y negativo de las acetilaciones)

Question 34

¿Qué ocurre si quitamos las acetilaciones?

Answer 34

Se vuelve más positivo, se cierra y NO podemos transcribir. (+ y - se atraen)

Question 35

¿Qué promueve la adición de cargas negativas a las histonas?

Answer 35

La transcripción del gen

Question 36

Son las que acetilan las histonas, ¿Y que promueven?

Answer 36

Acetiltransferasas de histonas (HAT) añadiendo cargas negativas y promoviendo la transcripción

Question 37

Son las que quitan la acetilación a las histonas, y ¿Qué ocasionan?

Answer 37

Deacetilasas de histonas (HDAC) Incrementando la carga positiva y reprimiendo la transcripción.

Question 38

La fosforilación de histonas ¿Qué promueve?

Answer 38

Incrementa la carga negativa a la histona favoreciendo la transcripción

Question 39

Mientras menos fosfatos ¿Qué ocurre?

Answer 39

Más positivo, + compactado y reprime transcripción

Question 40

Son las que fosforilan las histonas, ¿y qué ocasionan?

Answer 40

Cinasas -> agregando cargas negativas y favoreciendo la transcripción | (PO₄³⁻) -> TIENE CARGA NEGATIVA

Question 41

Son las que quitan los grupos fosfato de las histonas, incrementando la carga positiva y reprimiendo la transcripción

Answer 41

Fosfatasas

Question 42

¿Qué ocupamos hacer en las metilaciones de Lisina?

Answer 42

Debemos ver todas las demás modificaciones que puede tener la histonas -> NO sabemos si es + ó -

Question 43

Las metilaciones de lisina puede activar o reprimir la transcripción de un gen. V o F

Answer 43

VERDADERO pues no sabemos la carga a menos que veamos todas las demás modificaciones que tiene la histona

Question 44

¿Qué ocurre en las metilaciones de arginina?

Answer 44

Es carga negativa, promoviendo o activando la transcripción

Question 45

Explica que ocurre con p53 en presencia de deacetilasas

Answer 45

-Tenemos gen p53 -> sale proteína p53, cuando tiene señales de daño se activa, favorece transcripción de ciertos genes para apoptosis o detener el ciclo celular -Si tenemos deacetilasas en esas histonas ¿Qué ocurre con el gen? -> se hace positivo y se cierra el gen de p53 y NO se puede hacer la proteína p53,no se puede detener el ciclo celular, las células se siguen replicando y da cáncer

Question 46

Relación de las deacetilasas de histonas con el cáncer

Answer 46

Incrementan la carga positiva suprimiendo la transcripción de p53 y evitando que se detenga el ciclo celular

Question 47

Tratamiento para las deacetilasas de histonas (HDAC) y cómo funcionan?

Answer 47

Inhibiendo HDAC mediante fármacos (romidepsin, belinostat, vorinostat) -> el gen p53 se abre y podemos hacer proteína p53 y se detiene el ciclo.