Control transcripcional

Question 1

¿Qué ocupa mi ARNm para ser maduro?

Answer 1

Ocupa caperuza, poliA y que sólo tenga exones

Question 2

Región entre la caperuza y el codón de inicio

Answer 2

5´ UTR -> importante para la regulación e iniciación de la transcripción

Question 3

Región entre el codón de paro y la cola de poli A

Answer 3

3´ UTR -> sirve para localizar al ARNm, para que se mueve a dónde sea requerido, influye en la localización y estabilidad del ARNm porque decide cuántas A tiene la cola de PoliA

Para llevar el RNAm a donde se requiera

Question 4

Transcrito primario o RNA HN (hetero nuclear)

Answer 4

RNA con intrones, exones y sin caperuza y cola de poli A

Question 5

Proceso mediante el cual se eliminan los intrones dejando solo a los exones

Answer 5

Splicing = corte y empalme

Question 6

Splicing alternativo a que se le llama?

Answer 6

En ciertas células, el mismo gen se va a cortar de manera diferente -> corto de dif forma y tenemos dif tipos de proteínas

Question 7

Obtener diferentes proteínas de un mismo gen

Answer 7

Splicing alternativo -> se da por las secuencias ambiguas de los intrones

Question 8

Para cortar un intron ¿Qué ocupo?

Answer 8

-Ocupo encontrar el extremo 5´, 3´
-Necesito encontrar adenina solita

Question 9

Conformación de la maquinaria de splicing

Answer 9

Spliceosoma mayor y menor

Question 10

Que identifica cada spliceosoma

Answer 10

Dos maquinarias identifican el intron de manera diferente:
El spliceosoma mayor identifica GU y AG extremos 5´y 3´
El spliceosoma menor identifica AU y AC extremos 3´y 5´
y en el 3´identifica una A con C o G (AU y AC)
-> tenemos dos maquinarias las cuáles van a identificar el intron de manera diferente, en una célula tengo al mayor y en la otra el menor -> en una célula se va a leer el gen de una forma y en la otra, el gen se lee dif.

Question 11

Proteínas que identifican al intrón

Answer 11

PROTEINAS hnRNP (ribonucleoproteinas heterogenea nuclear) -> llega splicesoma que llega a cortar

Question 12

Identifican al exón

Answer 12

PROTEINAS SR (proteínas ricas en serina/arginina)

Question 13

Pasos por identificar para su posterior corte de los intrones

Answer 13

-U1 identifica la secuencia GU del extremo 5´
-Factor asociado a U2 (U2AF) -> identifica el extremo 3´
-U2 identifica a adenina solita

Question 14

RNA pequeño nuclear que se une en el sitio de empalme 5´al inicio del splicing

Answer 14

U1

Question 15

Pasos para cortar los intrones

Answer 15

-Llegan U4, U5 y U6 en bola
-U6 quita a U1 y quedan U2, U6, U4 y U5
-U4 se retira tmbn y solo quedan U6, U2 y U5
-(U4 se va pues lo que hace es mantener a U6 sin hacer nada) -> es el inhibidor
-U5 atrae a los exones juntos
-Una vez atraídos U6 ayuda a que se haga el primer corte junto con la A solita
-Y U5 hace el otro corte para unir los exones

Question 16

es inhibidor de la ribozima

Answer 16

U4 snRNA

Question 17

¿Qué hace U5?

Answer 17

Agarra a los exones para juntarlos

Question 18

¿Qué hace U6?

Answer 18

Ayuda a la adenina a hacer el ataque nucleofílico

Question 19

¿Qué hace U4?

Answer 19

Mantiene contenida a U6 hasta que U5 agarra a los exones

Question 20

¿Cuál es el problema de las desaminaciones?

Answer 20

Puede producir un cambio en la secuencia de aminoácido de una proteína -> podemos hacer un codón de paro antes de que se termine el gen (la proteína se hace mas pequeña)
-> desaminas C -> U / A -> I

Adenosin deaminasas

Question 21

¿Qué debe de tener el RNA para que pueda salir del núcleo?

Answer 21

-Metilguanosina en el extremo 5’ (CAP)
-Adición de la cola Poli-A en el extremo 3’
-Eliminación de intrones (puros exones ocuopamos)
-Una señal de exportación nuclear (Nuclear RNA export factor 1)

Question 22

Los RNA m se dirigen a sitios específicos dentro de la célula DESPUÉS de iniciar la traducción? VERDADERO O FALSO

Answer 22

FALSO -> pues los ARNm tienen la señal (en UTR 3´) que les dice a dónde ir ANTES de iniciar la traducción

Question 23

La señal que determina en donde se va a localizar el RNAm ¿Dónde se encuentra?

Answer 23

en la región UTR 3’

Question 24

¿A que se refiere la búsqueda de escape?

Answer 24

Si el reconocimiento es deficiente, la subunidad ribosómica ignorará el primer codón AUG y saltará hasta el segundo o el tercero.

Question 25

Cómo es el control Negativo de la Traducción y cómo afecta el lugar de destino

Answer 25

Se lleva a cabo mediante la unión de proteínas inhibidoras en el extremo 5´-> y no encuentra el 1° AUG, modificamos NH2 terminal y al cambiarlo altero el destino.

Question 26

Proteínas que exportan el RNA fuera del núcleo

Answer 26

Exportinas

Question 27

¿Qué pasa si fosforilo IF2?

Answer 27

Nunca puede llegar a subunidad menor y la traducción NO se inicia -> la bloqueamos

Question 28

¿Qué pasa cuando el RE se estresa?

Answer 28

Va a fosforilar a IF2 inhibiendo la traducción
-La función del RE es plegar proteínas

Question 29

A quién llama el RE para que lo ayude a plegar proteínas

Answer 29

Al sistema UPR: Unfolded Protein Response -> es una respuesta al estrés celular relacionado con el retículo endoplasmático -> lo que hace es fosforilar a IF2 para parar a las proteínas y el RE ya NO tiene que plegar nada :D

Question 30

¿Qué determina la vida de un RNAm?

Answer 30

La cola de poliA -> Los RNAm mas estables son los que tienen mas Adeninas
-Mientras más corta más inestables

Question 31

Vida promedio del RNAm en el citoplasma

Answer 31

30 min hasta 10 horas

Question 32

Formas de degradar el RNAm

Answer 32

-Con deadenilasas, descapsulasas y exonucleasas
-Con deadenilasas y exonucleasas

Question 33

¿Quién quita la cola de poli A y la CAP?

Answer 33

Deadenilasas y la enzima de descapsulación respectivamente

Question 34

¿Quiénes terminan de degradar el RNAm cuando ya no tiene caperuza ni cola de poli A?

Answer 34

Exonucleasas

Question 35

¿Qué pasa cuando hay más adeninas después de la cola de poli A (en 3´ UTR)? Cómo será la vida media del ARNm

Answer 35

-Si son ricos en AU vida media corta -> pues ya tiene A, para qué más???
-Si son ricos en C vida media larga

Question 36

Determinan la velocidad de acortamiento de la cola poli A

Answer 36

Las diferencias en la secuencia en la UTR 3