Microbiota do Corpo Humano Flashcards
Microbiota do Corpo Humano
- O metagenoma humano é o conjunto do DNA do hospedeiro e da microbiota que o coloniza
- Cada local anatómico no corpo humano desenvolve uma biogeografia específica
- A microbiota de cada local anatómico do corpo humano é semelhante entre os indivíduos
Microbiota
Uma comunidade microbiana que habita um ambiente específico (constituída por bactérias, fungos, protozoários, vírus)
Microbioma
É o conteúdo genómico coletivo de uma microbiota. Também indica a capacidade genética de uma comunidade
Metagenomica
É o estudo de um metagenoma (microbioma). A metagenómica pode estar baseada num alvo (16S rRNA) ou sem alvo (sequenciação do genoma total) vai além do genoma individual (transcende)
Metagenoma
É o DNA total que pode ser extraído de um ambiente
Enterotipo
Agrupamento da microbiota de um determinado indivíduo em distintas configurações
Gnotobiotico
Estudo de animais a viver num ambiente definido microbiologicamente, quer livre de microrganismos ou colonizados com determinados grupos
Infamassomas
São complexos proteicos que reconhecem sinais inflamatórios derivados da interação microrganismo-hospedeiro, os perfis moleculares associados aos microrganismos e os perfis moleculares danificados e a sua ativação conduz à maturação das citocinas inflamatórias.
Os inflamassomas participam nas respostas antimicrobianas do sistema imunitário inato, mas também papel em doenças metabólicas como a obesidade e diabetes tipo 2
A metagenomica permite respondermos a 3 questões
Quem está presente?
- Tipos de microrganismos
- Em que quantidade?
Qual a sua funcionalidade?
- Tipos de genes
- Vias metabólicas
- Proporções
Em que medida as amostras são diferentes?
- Comparações múltiplas e em par
- Correlação com os parâmetros ambientais
- Na investigação clínica: correlacionar os microrganismos com a doença
Fatores que podem influenciar a microbiota (principalmente o trato intestinal)
Genética
Sistema imunitário
Dieta
Unidade Taxonómica Operacional (UTO/OTU)
- Definição usada para classificar grupos de organismos intimamente relacionados com base em sequências de DNA
- As sequências são agrupadas de acordo com a sua similaridade
- OTUs são definidas com base no limite de similaridade (similaridade de ~97%)
Benefícios das bactérias do trato gastrointestinal
As bactérias intestinais desempenham várias funções, como a digestão de alimentos, proteção contra agentes patogénicos
Estimulam as respostas imunitárias e participam na produção de vitaminas
Aquisição da microbiota
As fezes dos recém-nascidos saudáveis contêm uma diversidade de bactérias, indicando que os seus intestinos são colonizados no útero
O estabelecimento do ecossistema bacteriano no início de vida tem um papel importante na composição microbiana e na sustentabilidade a doenças ao longo da vida
O impacto da alimentação
Atividade microbiana de efeito saudável:
Degradação de glicosaminoglicanos
Produção de ácidos gordos de cadeira curta
- Síntese de lipopolissacarídeos específicos
- Biossíntese de aminoácidos essenciais e vitaminas
Projeto do Microbioma Humano
O HMP2 expandiu o conhecimento sobre propriedades biológicas quer do hospedeiro, quer do microbioma em particular para: gravidez e parto prematuro (microbiomas vaginais de mulheres grávidas), doenças inflamatórias intestinais (microbioma intestinal) e pré-diabetes (intestino e microbiomas nasais)
Abordagens multiómicas com avaliação das mudanças na composição da comunidade microbiana, viroma, perfis metbolómicos, expressão génica e perfis genéticos, estabelecendo perfis genéticos, epigenómicos, de anticorpos e citocinas- funcionalidade