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Thanatopraxie > Microbiologie > Flashcards

Microbiologie Flashcards

1
Q

Flore saprophyte

A

Lorsque les microbes n’ont pas de pouvoirs pathogenes propres. Dans l’environnement les micro organismes se nourrissent de matière en décomposition.

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2
Q

Flore commensale

A

Les agents microscopiques consomment les produits d’un organisme vivant sans lui nuire, voire en lui procurant certains avantages.

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3
Q

Pathogène strict

A

Pathogène strict: ils provoquent une maladie chez un hôte dont les défenses immunitaires sont normales

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4
Q

Pathogène occasionnel

A

Pathogène occasionnel: par exemple les micro organismes des flores commensales de l’homme qui, lorsqu’ils ne se trouvent dans leur milieu habituel, peuvent devenir agressif

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5
Q

Pathogène opportuniste

A

Agent non pathogène qui se révèle offensif chez des sujets immunodéprimés.

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6
Q

Transmission d’un agent infectieux

A

Via un environnement souillé, un vecteur, de façon inter humaine, horizontale ou verticale

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7
Q

Les transmissions de contact

A

Directes: contact avec une personne infectée
Indirectes: contact avec un objet souillé par une personne infectée

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8
Q

Les transmissions aéroportées

A

Émises par la parole, la toux etc.
Par gouttelettes: grosses particules présentes à court terme sur 1 à 3 mètres
Par aérosols: petites particules présentes à long terme à une distance de plus de 3 mètres

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9
Q

Les agents pathogènes les plus connus

A

Bactéries, virus, champignons (fungi ou mycètes), parasites

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10
Q

Les prions

A

Dégénérescence du SNC et formation d’agrégat d’une protéine spécifique.
Encéphalopathies subaiguë spongiforme transmissible.
Protéine normale mais mal conformée: prion.
Creutzfeldt Jakob, Kuru, tremblante du mouton

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11
Q

Les virus

A

Agent infectieux de 20 à 500 nanomètres . Infectent les animaux et végétaux. Ils sont composés d’ARN ou d’ADN, nus ou enveloppés avec capside qui protège le matériel génétique.
Spécifiques à un hôte. Parasite intracellulaire obligatoire.

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12
Q

2 structures différentes de virus

A

Virus nu: composés d’une simple capside contenant le matériel génétique. Ils sont plus résistants et se transmettent de manière indirectes.
Virus enveloppés: capside contenue dans une enveloppe qui comporte des glycoprotéines à sa surface. Plus fragiles et se transmettent de manière directe.

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13
Q

La réplication virale

A

6 étapes:
Attachement
Pénétration
Decapsidation
Réplication
Assemblage et maturation
La libération des virions

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14
Q

L’attachement

A

Le virus se lie à un récepteur membranaire d’une cellule

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15
Q

La pénétration

A

Le virus est internalisé par la cellule, soit par fusion, soit par endocytose.

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16
Q

La décapsidation

A

Après avoir pénétré dans la cellule, le virus se délivre de sa capside et libère son matériel génétique.

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17
Q

La réplication

A

Pour les virus contenant de l’arn, le processus de transcription du inverse est nécessaire en amont de la réplication. Il permet de synthétiser 2 brins d’ADN à partir d’un brin d’ARN. Une fois l’ADN viral reconstitué, il va pouvoir s’intégrer dans l’ADN de la cellule hôte pour se multiplier dans le noyau. Le génome viral va d’abord être exprimé sous forme d’ARNm lors de la transcription, puis cet ARNm. Sera traduit en protéines lors de la traduction.

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18
Q

L’assemblage et la maturation

A

Les nouveaux ARN et protéines formées s’assemblent. Le matériel génétique est encapsidé. Les nouveaux virus, appelés virions, acquièrent leur enveloppe par bourgeonnement grâce à la membrane plasmiques de la cellule.

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19
Q

La libération des virions

A

Une fois reconstitués, les virions sont libérés à l’extérieur de la cellule.

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20
Q

Bactérie

A

1 à 5 micromètres.
Elles peuvent être sphériques (cocci), bâtonnets (bacilles), incurvées/spiralees (spirochètes, vibrions).
Cellules procaryotes.

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21
Q

3 étapes pour qu’une infection se déclare

A

Colonisation de la peau: les bactéries adhèrent à la peau ou muqueuses et se multiplient. Peuvent provenir d’un réservoir exogène ou endogène.
Invasion: bactéries franchissent la barrière cutanée muqueuse grâce à une porte d’entrée ou à l’aide d’enzymes ou de toxines bactériennes.
Infection: les défenses immunitaires du sujet sont mobilisées mais insuffisantes face à l’envahissement de micro organismes.

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22
Q

Les chlamydiaes

A

Groupe de bactéries qui sont toutes des parasites intracellulaires de cellules d’eucaryotes. Proviennent majoritairement d’IST.

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23
Q

Les mycoplasmes

A

Un genre de bactérie sans paroi cellulaire. Insensible aux antibiotiques ciblant les parois cellulaires. Ce genre contient plus de 100 espèces qui sont parasites ou sapotrophes appartenant à la famille des mycoplasmataceae.

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24
Q

Les mycoses

A

Les champignons connus sous le nom de fungi, cellules eucaryotes d’origine végétale. Se propagent par diffusion de spores dans l’air.
Transmission par inoculation, inhalation, contact.
Plusieurs types connus:
Les levures: candidose, crypto coques
les mycoses à filament: aspergillose
les mycoses à grain: mycétome, nocardiose

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25
Les parasites
Etres vivants du règne animal qui tirent profit d’un hôte. Ils peuvent provoquer des maladies dites parasitoses. Transmission par contact ou vecteur. 3 grandes catégories: Protozoaires Métazoaires Arrhropodes
26
Protozoaires
Souvent unicellulaires, vivent exclusivement dans l’eau ou dans les sols humides ou à l’intérieur d’un organisme.
27
Les métazoaires
Vers où helminthes. Etres eucaryotes, pluricellulaires hétérotrophes et généralement mobiles . 3 types: les trématodes, les cestodes, les nématodes
28
Les arthropodes
Les arthropodes: invertébrés au corps formé de segments articulés.
29
Flore
Regroupement de populations bactériennes en fonction de leur mode de vie et nutrition.
30
Réservoir
Milieu dans lequel se développe un microbe. Ex: environnement, hôte spécifique
31
Toxoplasmose
Toxoplasma gondii : protozoaire intracellulaire obligatoire. L’homme s’infecte par ingestion de parasites contenus dans la viande crue ou mal cuite ou présent dans l’eau ou sur des aliments souillées par les déjections de chats infectés.
32
Paludisme/Malaria
Parasite Plasmodium. Essentiellement transmis à l’humain par la piqûre de moustique, anophele femelle.
33
Gale ou scabiose
Sarcopte (parasite acariens)
34
Flore bactérienne commensale résidente chez l’homme
Regroupe l’ensemble des bactéries qui vivent à l’intérieur ou sur l’organisme chez les personnes en bonne santé . Toutes ces bactéries contribuent chacune à leur niveau au bon fonctionnement de l’organisme et sont indispensables pour la santé.
35
4 grands types de flores commensales
Cutanée Respiratoire Génitale (femme uniquement) Digestive
36
La principale bactérie de la flore génitale
Lactobacilles acidophiles ou Bacille de Döderlein
37
Bactéries de la flore cutanée
Staphylocoques non pathogénes Corynébacteries Propionibacterium acnés
38
Bactéries de la flore respiratoire
Staphylocoque doré Streptocoques dont le pneumocoque Corynébactérie Lactobacilles Bactéries anaérobies
39
Les bactéries de la flore digestive
Bouche: bactéries de la flore respiratoire Estomac: limitée par PH acide (1) Intestin grêle: streptocoques, staphylocoque, Lactobacilles Côlon : bactéries anaerobies, entérobactéries, entérocoques, staphylocoques
40
Les 2 approches permettant l’identification bactérienne
Analyser le polymorphisme phénotypique Approches moléculaires
41
Les caractères morphologies de l’identification microbienne
Étude simple microscopie. Forme de coque, bacille, spiralée, filamenteuse. Présence ou non de flagelle, capsule et spores.
42
Caractéristiques culturales de l’identification microbienne
Bactéries ont besoin d’enzymes pour dégrader l’oxygène (péroxydase) Aérobie strict: utilisation d’oxygène Aérobie facultative: plusieurs types métaboliques, densité plus importante avec oxygène Anaerobie obligatoire: absence d’oxygène Anaerobie aéro tolérant: oxygène ne favorise pas la croissance Micro aerophiles: oxygène ne doit pas être trop important.
43
analyse de la composition chimique dans l’identification microbienne: coloration de GRAM
Permet de mettre en évidence les propriétés de la paroi bactérienne et d’utiliser ces propriétés pour distinguer et classifier les bactéries. Information rapide, facile et bon marché. GRAM +: grosse couche de peptydoglycane GRAM -: présence d’une membrane externe Coloration au violet de gentiane et fushine
44
Coloration de Ziehl Neelsen
Méthode de coloration qui permet de mettre en évidence les bacilles Acido alcolo résistants (BAAR). Elle sert à détecter les mycobactéries. 3 étapes: Colorant énergique à chaud (fushine) Décoloration successive par acide fort et alcool à 90. Recoloration au bleu de méthylène
45
Les caractéristiques sérologique de l’identification bactérienne: le principe d’Ouchternoly
Technique non quantitative qui permet d’identifier une interaction anticorps/antigene. Déterminé à l’œil nu la formation ou non d’un arc de précipité.
46
Test d’Elisa
Technique du dosage immunologique qui permet la détection d’un anticorps dans un échantillon. Visualisation d’une réaction Ac/Ag grâce à une réaction enzymatique colorimetrique. L’enzyme préalablement couplée à l’anticorps catalyse une réaction chimique qui transforme son substrat en composé coloré. La méthode peut être quantitative ou qualitative.
47
Définition infection
Manifestations cliniques et biologiques consécutives à la pénétration dans l’organisme d’agents pathogénes microscopiques et vivants.
48
La détermina d’une maladie infectieuse est
Soit directe: multiplication du germe Soit indirecte: par des toxines comme le venin. (La protéine que va fabriquer la bactérie va être dangereuse.)
49
La chaîne de transmission des maladies
Agent infectieux Réservoir Porte de sortie mode de transmission Porte d’entrée Hôte réceptif
50
L’agent infectieux
Micro organisme transmissible. Bactérie, virus, champignon m, parasite ou prion. Flore endogène ou exogène.
51
La porte de sortie
Voie par laquelle l’agent infectieux quitte le réservoir. Sécrétions de toux ou éternuements, bris de peau avec saignement, plaie avec exsudat etc.
52
Porte d’entrée
Voie par laquelle l’agent infectieux pénètre l’hôte. Muqueuse, voie génitale, tractus gastro intestinal, tractus urinaire, lésions cutanées. Dispositifs invasifs etc.
53
Les modes de transmission des maladies
Direct: contact étroit entre sujet infecté et hôte réceptif (tuberculose, sida, siphylis) Indirect: intermédiaire d’un vecteur ou d’un véhicule (eau, aliment). Poliomyélite, choléra.
54
Les modes de transmission directe
Cutané Aérien Génital Périnatal Placentaire Féco oral
55
Les modes de transmission indirecte
Aliments Eau Objets contamines Contact de peau (mains souillées) Vecteurs
56
Les 3 grands mécanismes de défense
Les barrières naturelles Les globules blancs non spécifiques Les globules blancs spécifiques
57
Les barrières naturelles
Peau : épithélium imperméable, barrière biologique sueur fonction antiseptique, barrière chimique muqueuses, cellules épithéliales, barrière mécanique étanche. Mucus, larmes.
58
Globules blancs non spécifiques
Ou immunité innée Appelés phagocytes. Ils captent et digèrent les corps étrangers par la phagocytose.il déclenchent la réaction inflammatoire. Les phagocytes de cette immunité: granulocytes et macrophages, stimulent la production de cytokines et chimiokines.
59
Globules blancs spécifiques
Immunité adaptative ou acquise Ciblent un type de microbe. Lorsque les GB reconnaissent l’antigène du microbes, ils fabriquent des anticorps et se fixer sur l’antigène correspondant uniquement. Voir principe de vaccination.
60
Principe de vaccination
Sert à entraîner le système immunitaire à lutter contre un microbe qui peut provoquer une maladie grave ou mortelle. Le microbe peut être un virus, bactérie, parasite (malaria). Quelques heures après l’injection du vaccin (molécule du microbe désactivée), les GB spécialisés du système immunitaire sont activés: lymphocytes B et T Après environ 15 jours, les lymphocytes B libèrent dans le sang des anticorps capables de se fixer sur le microbe ciblé par le vaccin.
61
Vaccins obligatoires en France
Diphtérie Tétanos Poliomyélite
62
Mesures de prévention des maladies infectieuses
Isolement Désinfection Asepsie Stérilisation
63
Désinfection=
Opération d’élimination des germes, bactéries, virus présente sur une surface inerte. Efficacité temporaire.
64
Stérilisation
C’est l’action de rendre stérile. Détruire tous les germes et virus qui pourraient infecter un ustensile. Par chaleur sèche Par chaleur humide Par agents chimiques Ionisation par rayons gamma
65
Les types de maladies infectieuses
Hépatites virales A, B, C, D, E, G VIH Creutzfeldt Jakob Covid 19
66
Hépatite A
VHA, virus ARN Transmission féco orale Incubation 20/35 jours Vaccin existant
67
Hépatite B
VHB. Virus à ADN enveloppé Souvent asymptomatique pendant plusieurs années. Si non diagnostiquée m, peut évoluer en cirrhose et cancer du foie. Transmission par le sang, sperme, sécrétions vaginales. Période d’incubation 60 à 110 jours. Vaccin existant.
68
Hépatite C
VHC: ARN enveloppé Flavivirus Transmission par voie sanguine (drogue) Incubation 35 à 75 jours. Symptômes souvent inexistants. Pas de vaccin mais traitement existant.
69
Hépatite D
VHD: virus à ARN Touche uniquement les personnes atteintes de l’hépatite B. Même mode de transmission. Incubation 60 à 110 jours. Pas de traitement. Infection simultanée = hépatite aiguë
70
Hépatite E
VHE: virus à ARN Transmission voie féco orale Très rare en France souvent bénigne Incubation 10 à 50 jours Pas de vaccin
71
Hépatite G
VHG: virus à ARN découvert en 1995. Voie sanguine Aiguë ou chronique mais n’attaque pas le foie. Généralement pas de symptômes. Pas de vaccin.
72
Les différentes formes d’hépatites virales
Fulminante ou aiguë grave Chroniques Carcinome hepato cellulaire
73
Hépatite fulminante
Fulminantes ou aiguë grave: nécrose massive du parenchyme hépatique = insuffisance hépatique sévère et troubles neurologiques. Soit amélioration spontanée, soit aggravation irréversible et décès possible. Traitement = transplantation hépatique
74
Hépatite chronique
Dire plus de 6 mois. Souvent concerne les Hépatites B et C, les maladies hépatiques auto immunes et la stéatohépatite. Biopsie hépatique nécessaire. Transplantation hépatique si cirrhose décompensée.
75
Le carcinome hepato cellulaire
Cancer du foie (cellules épithéliales). Lié à l’infection chronique des hépatites B, C et D. Survient entre 10 à 30 ans après l’infection.
76
AES
Accident d’exposition au sang. Il est défini comme tout contact avec du sang ou liquide biologique contenant du sang, et comportant soit: Une effraction cutanée (piqûre ou coupure) Une projection sur muqueuse (œil, bouche) ou peau lésée. Arrête du 10 juillet 2013.
77
Conduite à tenir en cas de coupure/piqure
Ne pas faire saigner Laver immédiatement à l’eau avec savon antiseptique ou ordinaire Rincer abondamment Faire tremper le doigt ou la main dans un antiseptique type solution de Dakin (eau de javel diluée au 10•) pendant 5 on ou à défaut avec de la povidone iodée (betadine) ou de l’alcool à 70.
78
En cas de projection sur muqueuse ou dans les yeux
Rincer abondamment pendant au moins 5 mn avec sérum physiologique ou eau du robinet rincer immédiatement la bouche avec bain de bouche à la betadine verte (1/2 bouchon dans un verre d’eau tiède)
79
En cas d’AES
Recherche du statut sérologique du patient Avis médical en urgence dans les 2h.
80
Prévention de l’AES
Vaccination hépatite B Port de gants Matériel sécurisé et adapté au geste Immédiatement après le geste, déposer objet piquant, coupant, tranchant souillé dans un container adapté, tenu à proximité (<50cm) Ne jamais recapuchonner une aiguille ou un trocart Disposer d’un flacon de DAKIN non périmé dans sa mallette Connaître la conduite à tenir en cas d’AES Connaître le numéro de l’établissement référent le plus proche (« carte conduite à tenir » dans la mallette) Ne pas rester isolé, impact psychologique réel Les déchets d’activité à risque infectieux doivent être éliminés après collection dans des emballages adaptés.
81
Maladie de Creutzfeldt Jakob
Maladie due à des prions découverte en 1922. Affection neuro dégénérative caractérisée par une démence et des troubles de l’équilibre. Évolution rapide et fatale. Forme sporadique + fréquente, représente 85% des encéphalopathies subaiguës spongiformes transmissibles. Possible via greffe de tissus, prise d’hormones de croissance. Tissus à risques : SNC et œil. Pas de traitement. Inactivation par autoclavage à très hâte température, d’oxydation, de traitement par l’urée ou la soude.
82
VIH
Virus de l’immuno déficience humaine ARN enveloppé Affaiblit le système immunitaire Se transmet par voie sexuelle, sanguine, de la femme enceinte à son enfant. Il colonise les lymphocytes T CD4
83
Covid 19
ARN enveloppé Famille des coronavirus Apparition à Wuhan en Chine en décembre 2019. SARS COVID 2 est le 7ème coronavirus pathogène pour l’homme. Se transmet par 2 voies principales: Contact direct avec personne ou surface contaminée Aérienne ou aéroportée: gouttelettes et aérosols
84
Les 2 méthodes permettant de mettre en évidence la réaction antigène/ anticorps
Méthode d’Ouchterlony Méthode ELISA
85
Mode de transmission du choléra
Bactérie Vibriocholerae Ingestion d’eau et d’aliments contaminés par des matières fécales, mains souillées, surfaces contaminées , par les mouches, décharges humaines
86
Modes de transmission de la peste
Bactérie Yersinia Pestis Transmission par piqûres de puces infectées Contact direct avec fluides corporels ou tissus infectés Transmission aéroportée (peste pneumonique) Aliments contaminés (rare) Vecteurs (rats)
87
Modes de transmission maladie du charbon
Bactérie Bacillus anthracis Anthrax Contact direct avec animaux infectés ou produits animaux Inhalation de spores Ingestion de viande contaminée Transmission cutanée Transmission interhumaine rare
88
Mode de transmission orthopoxvirose
Virus Contact direct (lésion cutanée, objet contaminé, fluides corporels) Gouttelettes respiratoires Voie aérienne Transmission par les animaux Transmission mère enfant (placenta accouchement)
89
Modes de transmission des fièvres hémorragiques
Virus Contact direct fluide corporel Piqûres d’insectes Contact animaux infectés
90
Modes de transmission de la rage
Virus Morsures, griffures d’animaux Contacts fluides corporels, muqueuses animaux Transmission interhumaine et via aérosols rare
91
Modes de transmission de la tuberculose
Bactérie bacille Voie aérienne Contact direct sécrétions respiratoires Transmission mère enfant rare, par le lait très rare

Thanatopraxie (12 decks)

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