Microbio - Pathogénèse & Virulence Flashcards
Processus infectieux - Définition
= ensemble des étapes que le microbe doit passer pour causer une maladie
6 étapes du processus infectieux
1- Pénétrer dans l’organisme; 2- Adhérer aux cellules de l’hôte; 3- Faire compétition à la flore normale; 4- Résister aux défenses immunitaires; 5- Envahir les tissus cibles; 6- Induire des dysfonctions physiologiques.
Caractéristiques possibles d’une infection
aigue, chronique, latente
locale, systémique
Microbes pathogènes - Définition
peuvent rendre un individu malade, ont les capacités de franchir les 6 étapes
Infections opportunistes - Définition
causées par des microbes généralement inoffensifs pour l’homme
svt chez des individus à syst. immunitaire affaibli
Origines possibles d’un réservoir d’agents patho
humaine
animal
inanimée
2 types de porteur de réservoir d’agents patho humain
porteur sain
= pas affecté par un microbe, qui peut faire partie de sa microflore normale habituelle, mais il peut le transmettre à une personne sensible qui en deviendra malade
(déficient immunitaire ++)
porteur latent
=ne démontre pas de
symptôme actuel mais le microbe est potentiellement dangereux et peut s’activer pour le rendre malade car il n’est qu’en état de latence, caché dans un organe quelconque et parfois transmissible
Exemples de maladies transmissibles par un porteur latent (3)
herpès
tuberculose
malaria
Nom des infections données à celles qui se transmettent d’un animal à un humain
zoonose
Réservoir inanimé
L’environnement constitue également un réservoir inanimé de pathogènes, que ce soit le sol (ex. mycètes, spores bactériennes), l’eau (ex. choléra), les aliments (ex. diverses gastroentérites) ou les objets d’usage commun.
3 façons de transmission des microbes
- contact étroit
- vecteur vivant
- véhicule inanimé
Transmission par contact étroit
direct:
mains, toucher, sexe, etc
indirect:
utiliser le même verre
par gouttelettes:
toux, aérosols
Transmission par vecteur vivant
- surtout par arthropodes
(aka insectes)
Beaucoup d’arthropodes parasites, piqueurs ou suceurs, sont vecteurs de maladies, les principaux étant les moustiques et les seconds étant les hématophages du genre acariens, tiques, puces chez l’animal ou pucerons et punaises chez les végétaux.
Transmission par véhicule inanimé
l’exposition à un objet souillé dans la nature (ex. couteau ayant servi à dépecer un animal, clou, épine, etc.).
Pathogénicité
= capacité pour un microbe d’induire une infection
- attribut qualitatif
Pathogène primaire vs pathogène opportuniste
primaire
= peut rendre malade un hôte sain
opportuniste
= rend malade qqun à cause de sa déficience immunitaire sinon il cohabiterait avec sans problème
Virulence
= reflète le degré de pathogénicité
= capacité d’induire une infection d’une +/- grand sévérité
- attribut quantitatif
3 façons de mesurer la virulence
- Taux morbidité
(=nb de maladies) - Taux mortalité
- LD50
la virulence est-elle un facteur constant?
non
Variation de la virulence
augmentation:
- transferts successifs sur des hôtes sensibles
- mutation
diminution:
- l’influence de facteurs physicochimiques ou génétiques
(ex. congélation, mutation, vieillissement, traitements destinés à l’atténuer pour la fabrication de vaccins).
Facteurs de risque/prédisposants à avoir une infection (6)
• Génétiques:
anatomie homme femme, déficience
• Age (- de 2 ans, âgés)
- Habitudes de vie
(malnutrinition, hygiène, drogue IV, etc)
• Maladies chroniques sous jacentes
(SIDA, diabète, FK, cancer)
• Prise de médicaments
(agents immunosupresseurs et antibiotiques large spectre)
• Environnement
Comment les microbes peuvent-ils pénétrer dans l’organisme? (2)
- Muqueuses (respiratoires, digestives, génitales) - Peau (ex. follicules pileux, glandes sudoripares, plaies++) - Voie parentérale (ex. piqûres, coupures, morsures)
Voie parentérale
voie qui n’emprunte PAS la voie orale-digestive
L’adhérence des microbes
- étape cruciale pour qu’un microbe colonise
- difficile à cause de plusieurs conditions
(sébum, HCl, lyzozyme, bile, sucs, anticorps, mvts péristaltiques, etc)
Qu’est-ce qui est nécessaire à l’adhérence?
participation de facteurs microbiens et de facteurs constitutifs des cellules de l’hôte qui interagissent d’une manière complémentaire et spécifique
les deux structures permettant l’adhérence
adhésine
récepteurs
Adhésine
- composantes macromol.
- surface du microbe
- svt des glycoprot ou lipoprot
- peuvent être des pili, fimbria, élémnets de cpasule, polymères agglutinants, etc
Récepteurs
- sur la surface des cell épithéliales de l’hôte
- svt des hydrates de carbone ou protéines
Microbe et foetus humain in vitro
foetus humain in vitro est vierge
Microbiote/flore normal d’un bébé
flore microbienne quantitativement très importante mais qualitativement variable en fonction de l’état physiologique du bébé et de son environnement
qu’est-ce que comporte la flore normale?
souches endogènes
souches exogènes
flore endogène
= l’ensemble de la population microbienne retrouvée habituellement à la surface ou à l’intérieur de certains sites corporels
comprend des microbes résidants
- en permanence
- de façon transitoire
exemples facteurs influençant la flore endogène
l’âge, la diète alimentaire, le cycle menstruel, la grossesse, le diabète, l’alcoolisme, le SIDA, la prise de médicaments, etc.
flore exogène
microbes provenant -et résidant habituellement- dans des sources externes telles que l’environnement mais fréquemment rencontrés dans des échantillons corporels d’individus sains
microbiote- définition
ensemble des micro-organismes rencontrés chez un individu
microbiome - définition
désigne les microbes en lien avec leur environnement
microbiome humain, microbion terrestre, etc
Métagénomique
- c’est quoi
- permet quoi
=étudie l’ensemble des gènes présents dans un environnement complexe (toutes espèces confondues)
- fournit des données à plus large échelle
- Cela permet de voir quelles fonctions biologiques sont activées dans un milieu donné à un moment précis, par un événement quelconque. Par exemple, comment un produit toxique affecte-t-il un système corporel humain ou animal, ou bien la vie présente dans un lac ou un sol contaminé versus normal ?
4 rôles de la flore normal
rôle protecteur
rôle métabolique
stimulation syst. immunitaire
source infections
rôles de la flore normal: protecteur
- contre les autres patho
- utilisent les nutriments et le terrain dispo
- sécrètent des éléments toxiques
rôles de la flore normal:
métabolique
- favorise la digestion et la transformation des aliments ingérés
- production de vitamines
rôles de la flore normal:
stimulation du système immunitaire
présence d’une énorme quantité de bactéries au contact des muqueuses stimule en permanence le rôle protecteur du système immunitaire disséminé le long de ces muqueuses
DONC: production d’anticorps IgA ou présence de leucocytes phagocytaires
rôles de la flore normal:: source d’infection
peuvent causer des maladies opportunistes
Endroits où l’on rencontre le + de micro-organismes (distribution de la flore normale)
peau bouche tube digestif syst. respiratire syst. génito-urinaire
Tissus/organes stériles
pas vrm de micro-organismes
sang liquide sépahlo-rachidien tissus profonds muscles cerveau
Constitution de la flore normale
bactéries +++
virus
champignons
protozoaires
Peau et la flore microbienne
pas un milieu favorable à la croissance microbienne à cause du déssèchement
mais présence d’une flore aux endroits humides
Où sur la peau retrouve-t-on de la flore? La densité de cette flore est influencée par quoi?
cuir chevelu, visage, aisselles, régions génito-urinaires et anales
influencée par la densité:
- des follicules pileux
- des glandes sébacées
- des glandes sudoripares
2 types de flore sur la peau
- résidente
(capable de survivre) - transitoire
(microbes de l’environnement)
Microbes retrouvés dans la flore de la peau (5)
- staphylocoques (S. epidermidis, S, aerus) - corynébactéries -Propionibacterium (causant l’acné) - Entérobactéries (E. coli) - levures
Corynébactéries et odeur de la sueur
sébum (film lipidique sécrété par les glandes sébacées de la peau servant à la protéger et qui, mélangé à la sueur, la protège du dessèchement) est hydrolysé par des enzymes sécrétées par des corynébactéries, ce qui résulte en la production d’acides gras qui acidifient la surface de la peau et sont associés à une forte odeur
Staphylocoques
- bactéries sphériques
- à Gram +
- 2 catégories possibles:
coagulase + ou -
(selon qu’ils produisent l’enzyme ou non)
Types de staphylocoques les + présents sur la peau
à coagulase négative
90% de la flore normale
Staphylocoques à coagulase - de la peau, patho ou non?
En général, ces bactéries ne sont pathogènes que lorsque la barrière cutanée est rompue ou perforée (ex. accident, coupure, brûlure, insertion de cathéters).
Elles sont par conséquent d’importants pathogènes nosocomiaux (acquis en milieu hospitalier)
Staphylocoque de la flore de la peau
- le plus prévalent
- le plus patho
(en précisant leur type)
prévalent:
S. epidermidis (-)
patho:
S. aerus (+)
S. aerus et antiobiotiques
- expositions répétées les rendent résistances
- péniciline: 90% des souches sont résistances
- méticiline:
plusieurs souches résistances (SARM)
S. aerus
- à partir de où il se propage au corps
- résultats possibles de sa contamination (4)
svt à partir des voies nasales
- folliculites (= contamination follicule pileux) - Orgelets (= contamination follicule pileux d'un cil) - furoncle (=abcès infecté assez grave) - Impétigo du nouvea-né (=apparition de vésicules cutanées se recouvrant d’une croûte jaunâtre)
**Note: ces contaminations peuvent être faites par n’importe quelle staphylocoques, pas juste S. aerus)
Acné
- maladie de la peau la + fréquente
- résultat de l’occlusion du conduit des glandes pilo-cébacées (sert à amener sébum à la surface de la peau)
Formation des papules et pustules de l’acné (4)
1) formation de papules à tête blanches + comédons si matière accumulée perce la peau (pts noirs)
2) Propionibacterium acnes entrent et métabolise le glycérol par sécrétion d’acides gras
3) rx inflammatoire
4) papules et pustules
présence d’une éruption ou d’une lésion cutanée n’est pas toujours le signe d’une infection
V/F
vrai
signes d’éruption possibles à définir
(diapo 25)
Érythème Prurit Brûlure Squame Fissures Macule : Papule : Plaque : Vésicule : Bulle : Pustule : Croûte : Ulcère :
Érythème (rougeur)
Prurit (démangeaison)
Brûlure (sensation de)
Squame (peau qui pèle, desquamation)
Fissures (suintantes ou non)
Macule : tache rougeâtre plane (sans aucun relief)
Papule : lésion surélevée de moins de 1 cm de diamètre, sans pus
Plaque : lésion surélevée de plus de 1 cm de diamètre
Vésicule : cloque d’eau de moins de 1 cm (contenant un liquide séreux clair)
Bulle : cloque d’eau de plus de 1 cm (contenant un liquide séreux clair)
Pustule : ampoule de l’épiderme contenant un liquide purulent (pus)
Croûte : zone de sérosité, de sang et de pus séché
Ulcère : petite cavité dans la peau résultant d’une perte de la couche épidermique
La flore buccale est divisée en 2 écosystèmes.
Lesquels?
- Muqueuse buccale
- Dents et plaques dentaires
Muqueuse buccale - Constitution
- streptocoques qui adhèrent aux cell épithéliales
( Streptococcus salivarius) - des bactéroides
- des levures
Colonisation langue et gorge à la levure Candida albicans
Il peut arriver que des levures comme Candida albicans colonisent la langue et la gorge, donnant un muguet blanchâtre, chez les enfants ou chez les adultes recevant des médicaments immunosuppresseurs, de l’antibiothérapie ou de l’hormonothérapie.
Dents et plaque dentaire
- plaque
= film bactérien adhérant à l’émail des dents - constituée de bactéries dans une matrice composée de glycoprotéines et de polymères bactériens
- bactéries sont principalement des streptocoques
Complications de la plaque dentaire (2)
- calcifications qui donnent du tartre
- carie
principal agent causant des bactéries
Streptococcus mutans
Flore du tube digestif: estomac
- très acide
- barrière à la pénétration de bactéries des aliments
- possibilité de colonisation par des bactéries acido-tolérantes
(Helicobacter pylori)
À quoi est associée l’Helicobacter pylori?
ulcères gastriques
Flore du tube digestif:
intestin grêle
DUODÉNUM
flore microbienne comme estomac car pH encore acide
DU DUODÉNUM À ILÉON
pH revedient alcalin donc flore augmente
PARTIE DISTALE ILÉON
présence de bactéries mélangées avec contenu intestinal
Flore du tbe digestif:
colon
- la + forte concentration microbienne de TOUT l’organisme
- espèces présentes varient entre les individus selon certains facteurs
- bactéries anaérobies ++ que aérobies
- 2 rôles: protéger hôte + synthèse de vitamines
Facteurs influençant la flore du colon
- régime alimentaire
- état physio
- médicaments
Principales espèces de la flore du colon
aérobies et anaérobies
-Anaérobies :
Bacteroides, Fusobacterium, Clostridium
-Aérobies :
Entérobactéries
(E. coli, Salmonella, Klebsiella, Proteus, Serratia, etc.)
Entérocoques, Lactobacilles, Staphylocoques, Levures
Par quoi la flore du colon peut être perturbée? Comment restaurer cette perturbation?
prise d’antibio
restaurer avec la prise de probiotiques
Probiotiques
- c’est quoi
- rôle
- 2 exemples
- bactéries ou levures
- aident à la digestion, stimulent sys. immunitaire et restaurent microflore après diarrhée
- ex: Lactobacillus et Bifidobacterium
Les bactéries présentes dans l’air (200-1000/m3) pénètrent dans le système respiratoire supérieur pendant la respiration. Cela veut-il dire que le système respi a une flore dense?
non pas forcément car
la plupart d’entre elles sont arrêtées par les fosses nasales et sont expulsées avec les sécrétions nasales.
Flore respi: 3 espèces retrouvées dans le nez
Staphylocoques
Streptocoques
Haemophilus
Flore respi: gorge & nasopharynx
flore ressemble à celle de la salive
Flore respi: trachées/bronches/poumons
normalement stériles
Comment?
Les grosses particules sont pratiquement toutes arrêtées dans le nasopharynx, tandis que les petites particules peuvent atteindre les alvéoles pulmonaires, où elles seront phagocytées par les macrophages alvéolaires.
Flore du syst. génito-urinaire: reins/vessie
stériles
Flore du syst. génito-urinaire: composition flore urètre (5)
Staphylocoques, Streptocoques, Corynébactéries, Entérobactéries,
Bacilles Gram négatif anaérobies
Flore du syst. génito-urinaire: Vagin
- varie selon cycle menstruel
- complexe
- majeure partie de la flore: lactobacille
- Aérobies :
Streptocoques, Staphylocoques, Corynébactéries, - Anaérobies :
Peptococcus, Peptostreptococcus, Clostridium, Bacteroides - Levures : Candida
Lactobacilles dans la flore vaginale
- fermentent le glycogène présent (qui a été produit par l’épithélium vaginal) et produisent acide lactique
- maintien du pH vaginal acide
- protection de la flore
Flore vaginale avant puberté et après ménopaus
- pas de glycogène:
donc pH alcalin
donc PAS de lactobacilles - composée de:
Staphylocoques, Streptocoques, Corynébactéries
Escherichia coli
Quelles sont les caractéristiques d’une bactéries peut avoir qui lui permettront de résistant aux défenses immunitaires
(Étape 4 du processus)?
(5)
- Masquer leurs composantes vulnérables : virus enveloppés, bactéries encapsulées
- Se protéger contre la phagocytose :
bactéries encapsulées - Survivre à l’intérieur des leucocytes :
VIH, certains parasites et bactéries - Sécréter des enzymes détruisant les leucocytes : leucocidines bactériennes
- Interférer avec les anticorps et le complément : enzymes, changements structurels
Comment les microbes peuvent-ils envahir les tissus cibles? (Étape 5 du processus)
en s’implantant plus profondément dans les structures corporelles de l’höte
plusieurs disposent d’enzymes qu’ils sécrètent de façon extracellulaire, dont l’action entraîne des bris ou des dysfonctions cellulaires chez l’hôte
4 catégories d’enzymes pour envahir les structures de l’hôte
- cytolysine
- hémolysine
- coagulase et fibrinolysine
- leucocidine
Cytolysine
- brisent les composantes cellulaires ou extra-cell (collagène, phospholipide) - ex: collagénases phospholipases
2 bactéries qui sécrètent des cytolysine + le résultat
Clostrodium perfringens (gangrène)
Streptococcus pyogenes (mangeuse de chair)
Hémolysine
- exotoxines
- affectent les hématies
(= glob rouges) - produitent par:
streptocoques, staphylocoques et mycètes
Classification des staphylocoques selon leurs propriétés hémolytiques
pour chaque classe:
- mode d’action
- leur effet sur gélose
ALPHA-HÉMOLYTIQUES
- oxyde le fer de l’hémoglobine
- couleur verte autoir des colonies sur gélose
BETA-HÉMOLYTIQUES
- causent la rupture de la membrane cell des glob rouges
- forment un zone transparente autour des colonies sur gélose
GAMMA-HÉMOLYTIQUES
- pas de production d’hémolysine
- gélose reste rouge autour des colonies
caractéristique propre au beta-hémolytiques
- sont les + nombreuses
- ont une classification à eux
(groupe A, B, C, …)
Les streptocoques bêta-hémolytiques de groupe B sont impliqués entre autres dans les infections …..
de la gorge
Coagulases et fibrinolysines
coagulases:
provoquent la formation de caillot
fibrinolysines:
empêchent la coagulation
Leucocidines
- attaquent les leucocytes
- créent des pores dans les membranes et les détruisent
- altèrent l’infiltration leucocytaire + contribue à la formation de pus
Catégories d’enzymes présente chez la majorité des souches de SARM
leucocidines
Comment les microbes puvent dire induire des dysfcts physiologiques (étape 6 du processus) ?
- ils possèdent également des toxines capables de stimuler de fortes réactions inflammatoires qui contribuent à l’induction de dysfonctions physiologiques parfois graves chez l’hôte infecté
- 2 catégories de toxines
2 catégories de toxines + leur caractéristique
1) endotoxines
=intrinsèquement partie des composantes structurales
2) exotoxines
= activement sécrétées par la bactérie
Endotoxines
- c’est quoi
- sa composition détaillée
- libérée quand
= lipopolysaccharides constitutifs de la paroi cellulaire des bactéries à Gram NÉGATIF uniquement
composition: 1) lipide-A dans paroi = responsable de la toxicité 2) corps central 3) chaine de polysaccharides = antigène O = immunogène (donc active synthèse anticorops)
libération à la mort de la bactérie
Conséquences des endotoxines
responsables de la stimulation d’un inflammation excessive:
- fortes fièvres
- choc septique
Comment les endotoxines peuvent produire des fivères et des choc septiques? (4)
1) Défense du sang pas assez grande: prolifération des bactéries
(bactériémie)
2) Libération de médiateurs inflammatoires, cytokines et médiateurs vasoactifs
3) Début d’infection + symptômes (septicémie)
- fièvre
- frissons
- troubles vasculaires
(chute pression)
4) Choc septique
Le choc septique est médié par quoi?
est médié entre autres par des cytokines inflammatoires (ex. TNF- alpha, IL-1) et des lipides vasoactifs
(ex. prostaglandines) qui dilatent et perméabilisent les capillaires sanguins, laissant diffuser le plasma hors des vaisseaux et provoquant une sévère hypotension systémique et de l’oedème dans les organe
Choc septique lié aux endotoxines & antiobiotiques
un individu en proie au choc septique peut mourir en dépit de l’efficacité d’un antibiotique, car l’action des toxines persiste un certain temps et les mécanismes enclenchés sont parfois irréversibles
**taux de mortalité haut malgré antibio
Autres organes pouvant être affectés par les endotoxines
organes très vascularisés:
reins
poumons
Comment les bactéries à Gram + peuvent indure une septicémie?
bien qu’elles ne possèdent pas d’endotoxine, car des composantes de la paroi cellulaire (ex. acide teichoïque) seraient en cause
Exotoxines
- macro-molécules de nature protéique
- sécrétées par Gram +
- produites de façon normales puis libérées dans l’environnement
(certaines sont toxiques pour humains) - causent le décès par empoisonnement
(et non infection) car très toxique - thermosensibles
- divisées en 3 catégories
Composition des exotoxines
constituées d’une sous-unité A responsable de l’activité toxique et d’une sous-unité B responsable de l’attachement de l’exotoxine à la membrane de la cellule cible.
lequel est le plus toxique?
endotoxine ou exotoxine
exotoxines
Avantage que les exotoxines soit thermosensibles
qu’en les chauffant à 60°C pendant une heure elles perdent totalement leur toxicité
Quand elles perdent leur toxicité, comment appelle-t-on les exotoxines? À quoi peuvent-elles servir à ce stade?
anatoxines
utilisées pour produire certains vaccins
4 maladies associées à des exotoxines
- choléra
- diphtérie
- tétanos
- botulisme
3 catégories d’exotoxines
- Les Cytotoxines
= qui tuent les cellules hôtes ou altèrent leur fonctionnement - Les Neurotoxines
= qui perturbent la transmission des influx nerveux - Les Entérotoxines
= qui s’attaquent aux cellules tapissant le tube digestif.
Tétanos
- Clostridium tetani
- se retrouve dans les sols contaminés par des matières fécales
- persiste longtemps sous forme sporulée
- s’attrape par une plaie
- sécrète une exotoxine puissante (toxine tétanique)
- va bloque l’influx nerveux et empêcher le relâchement musculaire
- résultat:
des spasmes sévères, la paralysie, la mort - vaccin diphtérie/
coqueluche/tétanos est administré aux enfants
Botulisme
= est une intoxication alimentaire
- causée par Clostridium botulinum
(bâtonnet sporulé sécrète la toxine botulinique,
un poison mortel) - neurotoxine causant des paralysies faciales, problèmes cardiorespiratoires
- Sans traitement, le taux de mortalité atteint 70%
- thermolabile et inactivée en anatoxine par la chaleur
