microbio-microbiote Flashcards
nommer les deux grandes étapes historiques lié à la recherche sur le microbiote
1-HUMAN GENOME PROJECT;
projet international de 13 ans (1990 à 2033) afin de faire un séquençage du génome humain (soit 3 milliards de nucléotides)
2-HUMAN MICROBIOME PROJECT;
analyse de la composition génétique de la population microbienne qui vit sur et dans les adultes en santé (microbiome)
quel est le ratio bactéries: cellules humaines ?
10:1
qu’est ce que le micro biote?
ensemble des micro organismes qui résident sur un site donné; la peau, les narines, le tractus génito-urinaire, le tractus digestif
**microbiome est l’ensemble des micro-organismes et de leurs gènes qui résident sur un site donné
qu’est ce que le microbiome central?
espèces bactériennes présentes chez plus que 95% des personnes humaines à un site donné
*représente la majorité des bactéries présentes à un site donné
qu’est ce que le microbiome secondaire?
espèces bactériennes qui diffèrent d’un individu à l’autre
*chaque espèce est plus petite quantité comparativement au microbiome central
quel type de microbiome est le plus différencié?
le secondaire!!
bactéries présentes chez plus de 95% des humains au niveau de la peau?
staphylococcus epidermis
coryne bacterium
propionibacterium
bactéries présentes chez plus de 95% des humains au niveau de la bouche?
streptococcus
neisseria
corynnebacterium
bactéries présentes chez plus de 95% des humains au niveau du côlon?
escherichia coli
enterococcus
bacteroides
bactéries présentes chez plus de 95% des humains au niveau du vagin?
lactobacillus
le microbiote de la peau est influencé par quoi?
- par la présence ou non de glandes sébacées et de l’humidité
- varie selon le sexe
- microbiote cutané varie selon le site
ou il y a le plus de microorganismes?
au niveau du colon
*10^11
mettre en ordre de grandeur la quantité de microorganisme selon le site;
salive
estomac
intestin grêle
estomac (10^3)
intestin grêle (10^4)
salive (10^9)
côlon (10^11)
décrire le microbiote du foetus
milieu stérile à 100%
décrie le microbiote à la naissance
contact flore normale de la mère= début de la colonisation de la peau et du système digestif par une flore normale
différence entre un accouchement vaginal et par une césarienne
vaginal;
contact avec flore vaginal (lactobacillus, prevotella spp.) et dermale également (staphylococcus, corynebacterium, propionibacterium)
césarienne;
contact avec flore dermale seulement (badigeonnent bocal des sécrétions vaginales souvent fait)
=plus à risque de développer certaines pathogènes
décrire microbiote à l’enfance
enfant entre en contact avec autres personnes et bactéries de son environnement
- décuplement de la diversité de la flore et du microbiote
- plus instable= change selon diète et maladies
décrie le microbiote à l’âge adulte
dissociation des flores
flore unique et stable
change plus lentement qu’à l’enfance/ se stabilise
décrire microbiote à âge avancé
flore très différente des autres!
**la flore se diversifie et devient de plus en plus unique au gré de la vie
décrie le microbiote du tractus digestif
- système ouvert de la bouche à l’anus
- la diversité et la quantité de bactéries varient selon le segment du tube digestif
nombre de bactéries et d’espèces dans les tractus digestif
10^14 bactéries
plus que 500 espèces! (dont la majorité sont non cultivables, identifiées principalement par séquençage moléculaire)
est-ce que le microbiote est stable/ semblable entre les humains?
microbiote sain varie grandement!!
-change d’une personne à l’autre, d’une région géographique à l’autre et en fonction de l’âge
nommer les trois fonctions du microbiote intestinal
1) fonctions métaboliques
2) stimule l’immunité innée
3) prévient la colonisation par des bactéries pathogènes
le microbiote métabolise certains nutriments afin de…
afin de les rendre plus facilement disponible pour les cellules hôtes!
- ex des grosses molécules d’hydrate de carbone comme la cellulose sont transformées en petites molécules (acétate, propionate et butyrate) facilement absorbées par les cellules hôtes
donner le rôle des acides comme l’acétate, le propionate et le butyrate
limitent la croissance de certaines bactéries indésirables
comment le microbiote est capable de protéger contre certaines infections entériques?
- en tapissant la muqueuse (sert de rempart) et en consommant les nutriments (affame les pathogènes)
- stimulant la production de mucine, d’immunoglobulines IgA et des peptides anti microbiens (AMPs)
- en stimulant la production IL 22 (augmente la résistance des cellules épithéliales) et IL- 1 bêta (augmenter le recrutement de cellules inflammatoires)
quels sont les facteurs externes influençant le microbiote?
- hygiène personnel
- diète (riche en fibre, en graisse, en sucre) + diversifiée ou non
- h20 (chlore ou eau des puit s)
- prise d’antibiotique
que veut dire dysbiose?
altération de la flore normale
les dysbioses peuvent être associées à quoi?
- maladies du SI (atopie, asthme, sclérose en plaque)
- maladie intestinale (maladie inflammatoire de l’intestin, entérocolite nécrosante du nouveau né)
- maladie métabolique (diabète, obésité)
la symbiose du microbiote amène…
une tolérance immune
homéostasie intestinale
métabolisme sain
la dysbiose peut entraîner quel type de maladies?
- c.difficile
- colite ulcéreuse
- maladies cœliaque (entéropathie au gluten)
- vaginite à candida
- obésité (bactéries intestinales ils efficace à transformer des gros hydrates de carbones en petites molécules facilement absorbables)
qu’est ce que le C.difficile?
prise d’antibiotique → altération de la flore normale du côlon → prolifération du C. difficile (pcq manque de compétition
alimentaire) → C. difficile produit des toxines responsables de la diarrhée (DACD)
qu’est ce que la colite ulcéreuse?
prolifération de la bactérie Akkermansia muciniphila (produit sulfatase qui dégrade couche de mucine)
○ augmentation de Prevotellacea (produit des chimiokines inductrices d’inflammation)
qu’est-ce que la vaginite à candida?
quand prescrits antibiotiques, avez vous normalement des démangeaisons (vaginite à champignon)? si oui→ donne anti-vaginite si donne antibiotiques (ordonnance prophylaxique)
○ La femme avait levure dans vagin, mais avec bonne bactérie présente, compétition normale. Si enlève bonne bactérie avec antibiotiques, il n’y a plus de compétition→ levures vont proliférer
est-ce que la manipulation du microbiome humain pourrait s’avérer positif?
OUI
pour des fins thérapeutiques, est un traitement prometteur pour certaines maladies comme la C.difficile (efficacité entre 40-96% après une seule transplantation)
qu’est-ce qu’un probiotique?
- mélange de bactéries et/ou de levures ingérées dans le but de coloniser, même temporairement, l’intestin
- la majorité des probiotiques contiennent des bactéries gram+ comme les bifidobacterium et les lactbacillus et des levures comme les saccharomyces
- l’efficacité dépend des microorganismes choisis, de la dose, de la survie des microorganismes après le passage dans l’estomac (acidité)
les probiotiques sont aussi efficaces que les médicaments?
non!
contrairement aux médicaments, moins bon contrôle sur la composition exacte et la concentration résiduelle de microorganismes après le passage dans l’estomac
*très difficile d’évaluer leur paramètre pharmacologique
qu’est-ce que la pouchite?
inflammation du réservoir
*cette inflammation arrive suite à une colostomie totale avec anastomose iléo-rectale (enlève le colon au complet; patient ont beaucoup de diarrhée car colon n’est plus la pour absorber l’eau!)
qu’est-ce que l’entérocolite nécrosante?
-maladite touche intestin
-enfant né prématurément (en bas de 37 semaines de grossesse)
-se manifeste par un gonflement de l’abdomen, du sang dans les selles et de l’air dans la paroi de l’intestin
-prédispositon génétique , intestin immunoréactif et réponse inflammatoire immature
=dysbiose du tractus digestif?
-mortalité entre 20-30%
les probiotiques ont un rôle favorable pour?
traitement de la pochette et prévention d’une entérocolite nécrosante chez les prématurés
INESS ne recommande pas administration de probiotique pour…
- prévention ou traitement de la DACD
- contre-indiqués chez les patients immunosupprimés
différence entre microbiote et microbiome
- microbiome; ensemble de microorganismes (bactéries, fungi,virus et eukaryotes) vivant sur ou dans un hôte, incluant le matériel génétique
- microbiote; microorganisme eux-mêmes
qu’est-ce qu’une transplantation fécale?
transfert de microorganismes de la flore fécale d’un donneur sain à une personne malade
4 méthodes possibles; côlonoscopies, tube nasto-gastrique, lavement intestinal ou ingestion de capsules
qu’est ce qu’un prébiotique?
produits alimentaires administrés pour favoriser la croissance de microorganismes endogènes désirables