Micro 1: Bactérie et microbiote Flashcards
Est-ce qu’une bactérie est un procaryote?
Oui
Nomme les parties d’une bactérie.
- Membrane cellulaire
- Peptidoglycan
- Un chromosome circulaire
- Paroi cellulaire
- Plasmide
- Cytoplame
- Ribosomes 70s
- Flagelle?
Nomme des eucaryotes.
- Algues
- Fungi
- Protozoaires
- Plantes
- Animaux
Nomme les parties d’une cellules eucaryote.
- Mitochondrie
- Membrane cellulaire
- Cytoplasme
- Noyau
- Nucléus
- Réticulum endoplasmique lise et rugueux
- Appareil de Golgi
- Ribosomes 80s
- Lysosome
De quoi sont constitués les chromosomes procaryotes?
ADN
Caractéristiques des ribosomes des procaryotes?
70S (50S + 30S)
Est-ce que la membrane cellulaire des procaryotes contient des stérols?
Non, sauf pour les mycoplasmes
Décrit la paroi cellulaire des procaryotes.
- Protéines et peptidoglycanes
- +/- acide téichoïque et/ou lipopolysaccharides
Reproduction des procaryotes?
Reproduction asexuée (fission binaire)
Comment les procaryotes font-ils de l’ATP?
Via la membrane cytoplasmique
Nomme les 4 catégories de bactéries selon la forme.
- Cocci
- Bâtonnet
- Coccobacille
- Spiralée
Nomme les deux catégories de bactéries selon la coloration Gram.
- Gram +
- Gram -
Sur quoi peut être fait le prélèvement des bactéries en vue d’une coloration Gram?
- Peut être faite sur certains échantillons (ex.: prélèvement de pus)
- Peut être faite sur une colonie bactérienne présente sur une gélose nutritive
Décrit le protocole de la coloration de Gram.
- Coloration au violet de cristal
- Fixation au lugol
- Décoloration à l’alcool-acétone
- Coloration à la safranine
Dernière étape de la coloration de Gram pour Gram -?
Bactéries décolorées par l’alcool et recolorées rouge
Dernière étape de la coloration de Gram pour Gram +?
Bactéries non décolorées
par l’alcool restent bleues
Coloration de gram avant la coloration?
-: rien
+: rien
Coloration de gram violet de cristal?
-: bleu
+: bleu
Coloration de gram lugol?
-: bleu
+: bleu
Coloration de gram décoloration à l’alcool acétone?
+: bleu
-: blanc
Coloration de gram safarine?
+: bleu
-: rouge
Pourquoi le violet de cristal reste accroché à la paroi cellulaire des bactéries Gram positif?
Car elle va s’attacher au peptidoglycane qui est épais dans les gram +, mais mince chez les gram -
Décrit la paroi cytoplasmique d’un gram +.
- Peptidoglycane
- Acide téichoique
- Acide lipotéichoique
- 2 Couches de phospholipides
- Protéines structurales
- Protéines enzymatiques
Décrit la membrane cytoplasmique d’un gram -.
- Membrane extérieure
- Peptidoglycane
- Periplasmic space
- 2 Couches de phospholipides
- Protéines structurales
- Protéines enzymatiques
Rôle de la membrane cytoplasmique chez les bactéries?
- Produit l’ATP
- Permet l’entrée et la sortie de certains nutriments/substances
- Contient des protéines structurales qui contribuent à la forme de la bactérie
À quoi sert le peptidoglycan chez les gram+?
- Forme et structure
- Protection de l’environnement
- Tuer
À quoi sert l’acide teichoique chez les gram+?
- Renforce la paroi cellulaire
- Séquestre le Ca et les ions
À quoi sert l’acide lipoteichoique chez les gram+ ?
Active le SI inné de l’hôte
À quoi sert le peptidoglycan chez les gram-?
- Forme et stucture
De quoi est fait la membrane extérieure des gram- ?
- Phospholipides
- LPS
- Protéines
- Enzymes
À quoi sert la membrane externe des gram- ?
- Structure
- Protection contre l’environnement de l’hôte
Nomme deux protéines des gram-.
- Porin channel
- Secretory devices I-V
Rôle des porin channel?
- Perméable aux petites molécules hydrophiles
- Protège de certains antibiotiques
À quoi servent les secretory devices I-V?
Pénètre et livre des protéines dans la membrane, incluant les facteurs de virulence
Nomme 3 LPS des gram-.
- Lipid A
- Core polysaccaride
- O antigen
Fonction des LPS des gram- ?
- Structure de la membrane externe
- Barrière de protection
- Activateur potentiel du SI inné de l’hôte
Différence entre la membrane cytoplasmique des gram - et des gram +?
- Contrairement aux bactéries Gram positif, la couche de peptidoglycane est mince chez les gram-
- Leur paroi cellulaire est entourée d’un espace périplasmatique et d’une membrane externe
Nomme 4 structure des bactéries pas toujours présente.
- Capsule
- Biofilm
- Pili
- Flagelle
Fonction de la membrane cytoplasmique et de la paroi cellulaire?
- Squelette
- Manger et uriner
- Produire de l’énergie
- Bouger (si elle a un ou des flagelles)
- Échanger du matériel génétique (pili)
Les bactéries pathogènes peuvent…
- Adhérer à certaines cellules
- Essayer d’échapper au système immunitaire (S.I.)
- Synthétiser des enzymes pour résister au S.I.
- Synthétiser des enzymes pour détruire les tissus
- Synthétiser des exotoxines
Comparaison Gram- vs Gram+:
membrane extérieure?
Gram+: non
Gram-: oui
Comparaison Gram- vs Gram+:
Peptidoglycan?
Gram+: épais
Gram-: mince
Comparaison Gram- vs Gram+:
Lipopolyaccharides?
Gram+: non
Gram-: oui
Comparaison Gram- vs Gram+:
Endotoxin?
Gram+: non
Gram-: oui
Comparaison Gram- vs Gram+:
Acide telchoic?
Gram+: oui
Gram-: non
Comparaison Gram- vs Gram+:
Sporulation?
Gram+: des fois présent
Gram-: non
Comparaison Gram- vs Gram+:
Capsule?
Gram+: souvent
Gram-: souvent
Comparaison Gram- vs Gram+:
Lysozyme?
Gram+: sensible
Gram -: résistant
Comparaison Gram- vs Gram+:
Susceptibilité à la sécheresse et à la disruption physique?
Gram+: moins
Gram-: plus
Comparaison Gram- vs Gram+:
Production d’exotoxine?
Gram + et -: certaines souches
Nomme 3 cocci gram +.
- Staphylococcus
- Streptococcus
- Enterococcus
Nomme 2 cocci gram -.
- Neisseria
- Moraxella
Nomme 5 bâtonnets gram +.
- Bacillus
- Clostridium
- Clostridioides
- Listeria
- Corynebacterium
Nomme 10 bâtonnets gram -.
- Yersinia
- Campylobacter
- Pseudomonas
- Haemophilus
- Bacteroides
- Escherichia coli
- Klebsiella
- Proteus
- Salmonella
- Shigella
Nomme un cocci gram + en amas.
Staphylococcus
Nomme un cocci gram + en paires.
Streptococcus pneumoniae
Nomme deux cocci gram + en chaines.
- Streptococcus (autres que pneumoniae)
- Enterococcus
Dr Legendre, résidente 1, est appelée pendant sa garde. L’infirmière l’informe que la technicienne du laboratoire de microbiologie l’a avisée par téléphone d’un résultat critique : M. Tremblay a 2 hémocultures positives à cocci Gram positif en amas. Quelle est la bactérie?
Staphylococcus
Qu’est-ce qu’une bactérie sporulée?
Qui peut produire des spores.
Nomme 3 bâtonnets gram + sporulés.
- Clostridium
- Clostridioides
- Bacillus
Est-ce que certain gram - sont sporulés?
NON
Structure des bactéries sporulées?
Structure ronde, très résistante qui peut survivre sans nourriture
Quand une bactérie végétative passe-t-elle en forme sporulée?
Lorsque les conditions de survie sont dangereuses pour la bactérie.
Nomme les 3 principales géloses.
- Sang de mouton
- Chocolat
- MacConkey
Atmosphère d’incubation des géloses?
- Dans une étuve à l’air ambiant (21% d’O2)
- Dans une étuve à CO2 (5% d’O2)
- Dans une tente anaérobie (absence d’O2)
Nomme 2 bâtonnets gram + anaérobie stricte.
- Clostridium
- Clostridioides
Nomme 1 bâtonnets gram- anaérobie strictes.
- Bacteroides
Nomme une bactérie aérobie stricte.
Pseudomonas
Nomme 3 bactéries qui ne peuvent pas être classifiées par la coloration de Gram.
- Mycobactéries
- Mycoplasma
- Chlamydia
Décrit les myobactéries.
Paroi riche en acide mycolique (waxy outer shell) qui interfère avec la coloration de Gram.
Décrit les mycoplasma.
Absence de peptidoglycane dans la paroi cellulaire
Décrit les chlamydia.
Très petites bactéries, non cultivables sur des géloses, qui se multiplient uniquement dans des cellules grâce à des structures appelées «corps élémentaires» et «corps réticulés»
Qu’est-ce que le Human Microbiome Projet?
- Analyse la composition génétique de la population microbienne qui vit «sur» et «dans» les adultes en santé (microbiome)
- Ratio bactéries : cellules humaines est de 10:1
Le fétus vit dans un milieu __________.
stérile
Que se passe-t-il à la naissance? (au niveau des bactéries)
À la naissance, le bébé entre en contact avec la flore normale de sa mère : c’est le début de la colonisation de sa peau et de son système digestif par une «flore normale»
Qu’est-ce que le microbiote?
Le microbiote est l’ensemble des micro-organismes qui résident sur un site donné : la peau, les narines, le tractus génito-urinaire, le tractus digestif, etc.
Qu’est-ce que le microbiome?
Le microbiome est l’ensemble des micro-organismes et de leurs gènes qui résident sur un site donné
Décrit en trois points le microbiome central.
- Espèces bactériennes présentes chez > 95% des personnes humaines à un site donné
- Représente la majorité des bactéries présentes à un site donné
- Moins varié que le microbiome secondaire
Décrit en trois points le microbiome secondaire.
- Espèces bactériennes qui diffèrent d’un individu à l’autre
- Grande variété d’espèces
- Chaque espèce est en plus petite quantité comparativement au microbiome central
Nomme 3 bactéries du microbiome central de la peau.
Staphylococcus epidermidis
Corynebacterium
Propionibacterium
Nomme 3 bactéries du microbiome central de la bouche.
Streptococcus viridans
Neisseria
Corynebacterium
Nomme 5 bactéries du microbiome central du côlon.
Escherichia coli
Klebsiella
Proteus
Enterococcus
Bacteroides (intestin)
Nomme une bactérie du microbiome central du vagin.
Lactobacillus
Par quoi est influencé le microbiote de la peau?
- Site
- Présence ou non de glandes sébacés + humidité
- Sexe
Quantité de microorganisme dans la salive?
10^9 microorganimes/mL
Quantité de microorganisme dans l’estomac?
10^3 organismes/mL
Quantité de microorganisme dans l’intestin grêle?
10^4 organisme/g
Quantité de microorganisme dans le côlon?
10^11 organismes/g
Qu’est-ce que le tractus digestif?
Système ouvert de la bouche à l’anus
Selon quoi varie la diversité et la quantité de bactérie du tractus digestif?
Selon le segment
Décrit les bactéries du côlon.
- 100,000,000,000 bactéries
- Bactéries anaérobies strictes plus nombreuses que les bactéries aérobies
- > 200 espèces
- Dont la majorité sont non cultivables
- Identifiées principalement par séquençage moléculaire
En fonction de quoi le microbiote humain varie-t-il?
- D’une personne à l’autre
- D’une région géographique à l’autre
- En fonction de l’âge
Qu’amène une alimentation variée au niveau du microbiote?
Microbiote diversifié
Vrai ou faux? L’analyse du microbiote ne permet pas de prédire le développement éventuel d’une maladie.
Vrai
Microbiote d’un nouveau-né?
Dépend du mode d’accouchement
Microbiote d’un accouchement vaginal?
Vient de la mère
Microbiote d’une césarienne?
- Plus de risque de contamination par certains pathogènes
- Plus de risques de maladies atopique
Microbiote de l’enfance?
- Nouvelles souches qui vont être en plus grand nombre que les anciennes
- Diversité +++
- Instabilité du microbiote
- Dépend de la diète et des maladies
Microbiote de l’adulte?
- Distinct
- Le microbiote pet continuer de changer, mais plus lentement
Microbiote d’une personne âgée?
Très différent de celle des adultes
Nomme les 3 rôles du microbiote intestinal.
- Fonctions métaboliques
- Stimule l’immunité innée
- Prévient la colonisation par des bactéries pathogènes
Quels nutriments sont mieux métabolisé par le microbiote intestinal?
- Grosses molécules d’hydrates de carbone comme la cellulose sont transformées en petites molécules (acétate, propionate et butyrate) facilement absorbées par les cellules hôtes.
- Les acides comme l’acétate, le propionate et le butyrate limitent la croissance de certaines bactéries indésirables.
Nomme les 2 rôles du microbiote intestinal.
- Métabolise certains nutriments plus facilement ce qui les rend disponibles aux cellules hôtes
- Protège contre certaines infections entériques…
Comment le microbiote intestinal nous protège-t-il des infections entériques?
- En tapissant la muqueuse (sert de rempart) et en consommant les nutriments (affame les pathogènes)
- En stimulant la production de mucine, d’immunoglobuline IgA et des peptides antimicrobiens (AMPs)
- En stimulant la production d’IL-22 (↑ résistance cell épithéliales) et d’IL-1β (↑ recrutement de cellules inflammatoires).
Nomme 4 facteurs externes qui influencent le microbiote.
- Hygiène personnel (savon, déodorant, rince-bouche, douche vaginale)
- Diète (riche en fibre, en graisse, en sucre) + diversifiée ou non
- H2O (avec chlore vs eau de puits)
- Prise d’antibiotique
Nomme 4 dysbiose.
- Diarrhée à Clostridioides difficile (DACD)
- Colite ulcéreuse
- Maladie céliaque (entéropathie au gluten)
- Vaginite à Candida
- Obésité
Décrit la diarrhée à Clostridioides difficile.
- Prise d’antibiotique qui altère la flore normale du côlon
- Prolifération du C. difficile (perte de la compétition alimentaire)
- C. difficile qui produit des toxines responsables de la diarrhée
Décrit la colite ulcéreuse.
- Prolifération de la bactérie Akkermansia muciniphila qui produit une sulfatase qui dégrade la couche de mucine.
- Augmentation de Prevotellaceae qui produit des chemokines inductrices d’inflammation.
Décrit l’obésité (dysbiose).
Personnes qui ont des bactéries intestinales plus efficaces à transformer des gros hydrates de carbone en petites molécules facilement absorbables
Est-ce qu’il est possible de manipuler le microbiote humain à des fins thérapeutiques?
Oui
Que sont les probiotiques?
Mélanges de bactéries et/ou de levures ingérées dans le but de coloniser, même temporairement, l’intestin.
Que contiennent la majorité des probiotique?
La majorité des probiotiques contiennent des bactéries Gram positif comme les Bifidobacterium et les Lactobacillus et des levures comme les Saccharomyces.
De quoi dépend l’efficacité des probiotiques?
L’efficacité dépend des microorganismes choisis, de la dose, de la survie des microorganismes après le passage dans l’estomac (acidité).
Différence entre un médicament et un probiotique?
Contrairement aux médicaments, moins bon contrôle sur la composition exacte et la [ ] résiduelle de microorganismes après le passage dans l’estomac.
Qu’est-ce que la pouchite?
Inflammation du réservoir dans le cas d’une colectomie totale avec anastomose iléo-rectale
Qu’est-ce que l’entérocolite nécrosante?
- Maladie qui touche l’intestin
- Enfant né prématurément (< 37 semaines de grossesse)
- Se manifeste par un gonflement de l’abdomen, du sang dans les selles et de l’air dans la paroi de l’intestin.
- Prédisposition génétique + intestin immunoréactif + réponse inflammatoire immature
- Dysbiose du tractus digestif?
- Mortalité : 20 -30%
Est-ce que l’INESSS recommande l’usage de probiotique pour la prévention/traitement de la DACD?
Non
Contre-indication des probiotiques?
Immunosupprimés
Nomme 3 probiotiques en vente libre.
- Lactobacillus acidophilus CL1285
- Lactobacillus casei LBC80R
- Lactobacillus rhamnosus CLR2
Nomme 3 bactéries dans le yaourt.
- Bifidobacterium lactis
- Lactobacillus casei
- Lactobacillus acidophilus
Qu’est-ce qu’une dysbiose?
Altération de la flore normale
Qu’est-ce qu’une transplantation fécale?
Transfert de microorganismes de la flore fécale d’un donneur sain à une personne malade. Quatre méthodes possibles : colonoscopie, tube naso-gastrique, lavement intestinal ou ingestion de capsules (non commercialisées jusqu’à maintenant)
Qu’est-ce qu’un probiotique?
Mélange d’espèces spécifiques de bactéries et/ou de levure ingérées dans l’espoir d’apporter un bénéfice à l’hôte
Qu’est-ce qu’un prébiotique?
Produits alimentaires administrés pour favoriser la croissance de microorganismes endogènes désirables
Pourquoi le violet de cristal ne tient pas sur les gram -?
Car la couche de peptidoglycan est trop mince
Qu’est-ce qui est sur la membrane des gram - qui est très dangereuse pour l’humain?
LPS
lipopolysaccharide
Que contient la paroi cellulaire des gram +?
- Peptidoglycane
- Acide telchoic
- Acide lipotelchoique
- Protéines
Que contient la paroi cellulaire des gram -?
- Peptidoglycane
- Espace périplasmique
- Membrane externe
- Protéines
- LPS
De quoi est faite la capsule?
Polysaccharides ou polypeptides
À quoi sert la capsule?
Antiphagocyte
De quoi est fait le biofilm?
Polysaccharides
À quoi sert le biofilm?
S’attache aux corps étrangers
De quoi est fait le pilli?
Pilin
Adhésine
À quoi sert les pillis?
- Adhérence
- Échange de plasmides
De quoi est fait la flagelle?
- Protéines motrices
- Flagelline
À quoi sert la flagelle?
Mobilité
Est-ce que la forme spore est pathogène?
Non
Nomme la bactérie aérobie stricte.
Pseudomonas
Pourquoi la coloration de gram ne fonctionne pas dans les selles?
Il y a trop de bactéries de la flore normale
Est-ce que les probiotiques sont tous reconnus comme étant bénéfiques?
Non, seulement certains mix particuliers
