Métabolisme des protéines et des acides aminés Flashcards
Décrit la structure d’un acide aminé.
- Carbone central/alpha
- Groupement carboxylique COOH
- Groupement aminé (NH2)
- Chaine latérale variable R
Qu’est-ce qui distingue les aa entre-eux?
La chaine R
Est-ce que les aa sont une bonne source d’énergie?
NON
source d’énergie secondaire
Est-ce que les aa peuvent être mis en réserve dans l’organisme?
NON
Qui est le constituant chimique caractéristique des aa/prots?
Azote
De quoi provient le NH4+ (ammonium) (réaction)?
De la désamination du gr. amine (NH2)
Quel est le nom du lien qui relie les aa entre-eux et entre quels atomes se fait-elle?
Forme quoi?
Lien peptidique (CO-NH)
Entre COO- (gr. carboxylique) et NH3+ (gr. amine)
Forme des polymères de aa = peptides/ prots
En fonction de quoi COOH et NH2 peuvent-ils s’ionier?
C’est quoi s’ioniser?
pH
Ajout d’un H (proton)
Décrit la charge d’un aa quelconque au pH physiologique de 7,4.
Positif au niveau du NH2
Négatif au niveau du COO
Neutre au bilan
Nom des molécules avec une charge + et - simultanément?
Zwitterion
De quoi dépendent les propriétés acido-basique des aa?
- Des groupements COOH et NH2
- De la présence ou non d’une fonction acidique ou basique sur la chaîne latérale (R)
- De l’environnement local (si liés en peptides ou protéines)
Combien de pK par aa?
Qui en possède dans un aa?
2 ou 3
- 1 pour COOH
- 1 pour NH2
- 1 parfois pour la chaîne latérale (R)
Qu’est-ce que le pK?
pH auquel une molécule ionisable existe à 50% sous forme ionisée et à 50% sous forme non-ionisée
- COOH ou COO-
- NH2 ou NH3+
Qu’est-ce que le PI (point isomérique)?
Le pH auquel la charge nette de l’a.a. est zéro
Combien de PI par aa?
1
Quelle est la charge nette de l’aa au point isoélectrique?
0
Décris les groupements amines/carboxyliques si le pH est plus bas que le pK de l’acide (plus de 50% sont ionisés)?
Et au point isoélectrique?
Et si le pH est plus haut que le pk de l’amine (base)?
NH3+ et COOH
NH3+ et COO- (perte de 1)
NH2 et COO- (perte de 2 H)
Est-ce que la chaine latérale peut être protonée?
Oui
Nomme les aa essentiels et n-essentiels
Essentiels:
Isoleucine
Leucine
Non-essentiel:
Alanine
Qu’est-ce que les aa semi-essentiel?
Aa dont notre capacité de synthèse est limitée
Nomme les 3 rôles de aa.
- Synthèse des protéines
- Rôle énergétique (FAIBLE)
- Précurseurs de molécules contenant de l’azote
Exemple de molécules contenant de l’azote? Comment l’azote leur est incorporée?
Catécholamines
Neurotransmetteurs
Hème
Hormones thyroïdiennes
Par les acides aminés
Combien d’aa élémentaires (répertoir)? Permettent quoi?
Combien de aa au total?
20, la synthèse de toutes les protéines
Centaine
Décrit la structure primaire d’une protéine.
Dépend de sa chaine d’aa (la séquence)
Décrit la structure secondaire d’une protéine.
Aa d’une chaine peptidique qui interragissent ensemble (pont hydrogène) et forment structures particulières (hélice et feuillet)
Décrit la structure tertiaire d’une protéine.
Conformation tridimensionnelle globale d’une protéine
Décrit la structure quaternaire d’une protéine.
Interaction entre plusieurs polypeptides (di, trimère, etc)
Nomme les 3 provenances d’aa.
- Synthèse (aa non-essentiels) (qt varie selon besoin)
- Alimentation (100g/jour)
3. Catabolisme des protéines de l’organisme (400g/jour)
(forme un pool de 100g d’aa)
À partir de quoi se fait la synthèse des aa non essentiels?
acides organiques et azote (NH2 et NH4+)
En quoi sont digérés les protéine ingérées (provenance des prots = alimentation)?
En aa
Qu’est-ce qui se passe avec le aa qui ne sont pas utilisés pour la synthèse de produits?
- Désamination/transamination
- Décarboxylation
(pool ne grossit pas car pas d’entreposage!!)
Nomme les 3 sources de provenances des protéines digérées
- alimentaire
- autres:
- protéines enzymatiques sécrétée dans le tube digestif
- protéines venant des cellules muqueuses mortes
Nombre de g de protéines alimentaire digérées par jour?
Nomme les deux sortes de protéines alimentaires.
100g/jour
* Protéines végétales (protéines «incomplètes»: contiennet pas toutes les prots essentielles)
* Protéines animales (protéines «complètes»)
Nombre de g de protéines “autres” digérées par jour?
30-50
Nomme les deux sortes de protéines autres.
- Protéines enzymatiques sécrétées dans le tube digestif
- Protéines provenant des cellules muqueuses mortes
Localisation du début de la digestion des protéines?
Estomac
Nomme les 2 cellules responsables de la digestion des protéines par l’estomac.
Cellules pariétales: HCl (acide gastrique)
Cellules principales: pepsinogène (inactive) qui devient pepsine avec un pH acide (plus bas que 5)
Est-ce que la pepsine peut également cliver la pepsinogène?
Oui, auto-activation
La pepsine dégrade ____% d’une protéine ingérée
10-15
Décrit la digestion des protéines via la pepsine.
Dégradation partielle → formation de gros polypeptides
Qu’est-ce qui se passe avec le HCl dans le duodénum et quel est son impact?
Neutralisé par le bicarbonate des cellules pancréatiques
Pepsine inactive
Nomme les protéases importantes du pancréas pour la digestion des protéines.
Trypsinogène → trypsine
Chymotrypsinogène → chymotrypsine
Proélastase → élastase
Procarboxipeptidase → carboxypeptidase
Est-ce que les protéases pancréatiques sont sécrétés sous forme active? Si non, comment?
Non, elles comportent un petit fragment d’acides aminés qui bloque le site actif de l’enzyme
Explique l’activation des protéases pancréatiques.
- Trypsinogène clivé par entérokinase sécrétée par la muqueuse intestinale = trypsine
- Trypsine active la trypsinogène et les autres enzymes
Les fragments de protéines qui entrent dans l’intestin sont donc digérés par ___________.
plusieurs protéases
Que font la trypsine et la chymotrypsine avec les fragments de protéines?
Clivent en petits peptides
Par qui sont clivés les petits peptides?
Après l’action de qui?
carboxypeptidase (coupe au côté COO-)
Après creations de petits peptides par chymo et trypsinogene
Que fait l’élastase dans le duodénum?
clive les fibres d’élastine
Nomme les enzymes de la muqueuse intestinale qui complètent la digestion des protéines.
- Dipeptidase
- Aminopeptidase
- Carboxypeptidase
Au final, les protéines sont dégradées en quoi?
Tripeptides
Dipeptides
Aa libres
Qu’utilisent les aa et les dipeptides/tripeptides pour passer les membranes (absorption)?
Transporteurs actifs
Décrit le transport des aa à travers la membrane (absorption).
- Plusieurs transporteurs différents
- Transport couplé au transfert de sodium
Est-ce que le di- et tri-peptides peuvent passer directement dans le sang?
Non, ils sont dégradés en aa libres dans les cellules épithéliale avant d’entrer dans la circulation sanguine
Mais passent dans les enterocytes via PEPT1 (avec Na+ et H+)
Est-ce que les protéines entières peuvent être absorbées?
Non, sauf rare exceptions
Comment sont absorbées les protéines entières?
Chez l’enfant/bébé
Captées par endocytose puis relâchées dans la circulation par exocytose
Explique se qui se passe chez le nouveau-né chez qui l’absorption des protéines entières est fréquent (cause, conséquences)
- Immaturité de la muqueuse intestinale (et de l’estomac) (- étanche)
- Pourrait être une cause des allergies alimentaires précoces, et souvent réversibles
- Permettrait aussi de transmettre les anticorps de la mère
Est-ce que l’azote atmosphérique peut être utiliser par un organisme?
Oui, les microorganismes
Décrit l’azote atmosphérique (N2).
- 78% de l’air (pas toxique)
- Chimiquement inerte
- Inutilisable chez la plupart des êtres vivants
Que font les microorganismes avec l’azote atmosphérique (N2)?
- Transformation de N2 en ammoniac (NH3)
- Nitrification en nitrites (NO2) et nitrates (NO3)
Que font les plante avec l’ammoniac (NH3) et les nitrates (NO3) du sol?
Incorporation dans leurs acides aminés et autres constituants azotés