Les acides nucléiques Flashcards
Quel est le nom du biologiste suisse qui a découvert le noyau de la cellule?
Friedrich Miescher en 1869
Comment a été nommé le premier noyau découvert?
Nucléine
Vrai ou Faux: la première forme de noyau découverte était ni d’origine protéique ni lipidique
Vrai
2 types de polimères constituent les nucléotides, quels sont-ils?
ADN (acide désoxyribonucléique)
ARN (acide ribonucélique)
Quelles sont les différentes fonctions des acides nucléiques? (6)
- médiateur chimique
- source d’énergie
- cofacteurs dans les rxn enzymatiques
- rôle catalytique à la manière d’enzymes
- gardiens des caractères héréditaires
- expression des caractères héréditaires
Vrai ou Faux: c’est l’ADN qui a comme fonction la source d’énergie
Faux, ce sont les nucléotides
De quoi sont formés les nucléoSides?
Base azotée
Ose
Reliés par un lien
b-N-glycosidique
De quoi sont formés les nucléoTides?
Base azotée
Ose
1 à 3 groupements phosphate
Quel nom donne-t-on généralement aux nucléotides
Nucléosides phosphates
Vrai ou Faux: les bases azotées formant les nucléosides ou les nucléotides sont dérivées d’une purine ou d’une pyrimidine
Vrai
Quelle est la différence entre un nucléosides et un nucléotide au niveau structural?
Nucléosides: base azotée+ ose
Nucléotides: base azotée+ ose+ 1 à 3 groupement phosphate
Vrai ou Faux: les désoxyribonucléotides sont les unités de construction de l’ADN alors que les ribonucléotides sont les unités de construction de l’ARN
Vrai
Vrai ou Faux: dans les oses formant les nucléosides et les nucléotides, on retrouve soit le ribose ou le désoxyribose sous forme de pyranose
Faux, on les retrouve sous forme de furanose
Vrai ou Faux: les oses formant les nucléosides et les nucléotides sont toujours retrouvées en configuration anomérique b?
Vrai
Vrai ou Faux: les bases azotées des nucléosides et nucléotides sont des molécules hétérocycliques
Vrai
Qu’est-ce qu’une molécules hétérocyclique?
Cycle composé d’atome de C et de N
Présence de doubles liaisons conjuguées
Quelles sont les 3 principales pyrimidines?
C
T
U
Quelles sont les principales purine?
A
G
Comment est formée une purine?
C’est formé par la fusion d’un cycle pyrimidine et d’un cycle imidazole
Quelles sont les propriétés importantes des bases azotées?
- bases faibles
- structures planes
- insolubles dans l’eau
- forment des liens H
- absorbent les rayons UV (260 nm)
Vrai ou Faux: on retrouve des bases rares et mineures surtour dans l’ADN
Faux, c’est dans l’ARN
Quelle sera la conformation de la liaison glycosidique dans un nucléoside?
configuration b
car le résidu d’ose est toujours dans cette configuration
Pourquoi les nucléosides sont + solubles dans l’eau que les bases azotées seules?
Les groupements hydroxyles de l’ose augmentent la solubilité de la molécule
Comment nomme-t-on un nucléoside?
Selon la base azotée contenue à l’intérieur
Qu’est-ce qu’un nucléotide?
Nucléoside portant au moins 1 groupement phosphate attaché via un lien ester phosphorique
On dit que les nucléotides peuvent porter jusqu’à 3 groupements phosphates, où sont-ils rattachés?
le premier est lié à l’ose par un lien ester phosphorique
Les suivants sont ajoutés au premier via des liens anhybride phosphorique. Liens riches en énergie
Quelles sont les abréviation utilisées?
NMP
NDP
NTP
N= tous les nucléotides
Pourquoi les nucléotides sont-ils solubles dans l’eau?
Puisqu’ils contiennent plusieurs groupements ioniques et polaires
Vrai ou Faux: les nucléotides peuvent absorber les rayons UV?
Vrai
Quelles sont les fonctions des nucléosides et des nucléotides?
- fonctions de coenzymes
- médiateur chimique
- source d’énergie
Qu’est-ce qu’un nucléotide cyclique?
Nucléotides possédant une structure particulière dans laquelle un même groupement phosphate relie 2 carbones d’un même ose
Donnez un exemple de nucléotide cyclique?
AMPc
Décrire l’adénosine
- nucléoside qui agit comme hormone dans la régulation du sommeil
- niveau d’adénosine augmente= sensation de fatigue augmente
Comment la caféine peut-elle être efficace contre la fatigue?
Elle bloque les récepteurs hormonaux de l’adénosine
Quelle est la source d’énergie chimique par excellence?
NTP (nucléoside triphosphate)
Que contiennent les NTPs qui leur permettent d’être énergétiques?
2 liens anhydrides phosphoriques
Quel est le rôle de l’ATP dans le métabolisme?
Fait le transfert de groupement phosphoryle, pyrophosphoryle et nucléotidyle
Quel est le rôle de S-adénosylméthionine dans le métabolisme?
Transfert de groupement méthyle
Quel est le rôle de l’uridine diphosphate- glucose dans le métabolisme?
Transfert de groupement glycosyle
Quel est le rôle du NAD+ et du NADP+?
Transfert d’électrons
Quel est le rôle du FMN et FAD?
Transfert d’électrons
Quel est la rôle du coenzyme A dans le métabolisme?
Transfert de groupement acyle
Vrai ou Faux: l’ATP est le nucléotide le plus fréquemment utilisé comme coenzyme?
Vrai
Qu’est-ce qu’un groupement pyrophosphoryle?
2 groupements phosphates liés par un lien anhydride phosphorique
Comment le S-adénosylméthionine est-il obtenu?
Méthionine+ ATP
Vrai ou Faux le S-adénosylméthionine est impliqué dans les réactions de méthylation?
Vrai
L’UDP-glucose peut-il servir de transporteurs?
Oui
Comment est formé l’UDP-glucose?
Par la réaction entre un UDP et un glucose-1-P
Quel groupement l’UDP-glucose peut-il donner?
Glucose
Vrai ou Faux: le NAD+ et le NADP+ sont des dinucléotides?
Vrai
Comment sont formés le NAD+ et le NADP+?
Par la liaison entre un AMP et la nicotinamide
Vrai ou Faux: le NAD+ et le NADP+ sont utilisés dans les rxns d’oxydoréduction?
Vrai
Les formes oxydées peuvent accepter 2 électrons et 1 proton supplémentaire sur la base nicotinamide
Qu’est-ce que le FMN?
Flavine mononucléotide
QU’est-ce que le FAD?
Flavine adénine dinucléotides
Vrai ou Faux: le FMN et le FAD sont impliqués dans les rxn d’oxydoréduction
Vrai
Quel est le centre réactif des FMN et FAD?
Les 3 anneaux de la flavine
De quoi est formé le coenzyme A?
Un nucléotide, une molécule de panthoténate et d’une molécule de 2-mercaptoéthylamine
Quel est le centre réactif du coenzyme A?
Groupement thiol
Quels sont les différents polymères pouvant être formés par les nucléotides?
Dinculéotide
Trinucléotide
Décanucléotide
Oligonucléotide
Polynucléotide
Vrai ou Faux: dans les dinucléotides, on rencontre un lien entre la position 5’ de l’ose et la position 5’ d’un autre ose
Vrai
À quoi réfère le terme polynucléotide?
Il est utilisé pour décrire les polymères dont les résidus sont réunis par des liaisons phosphodiester 3’ - 5’
Vrai ou Faux: l’ADN est le support de l’information génétique chez toutes les cellules
Vrai
Quoique chez certains virus c’est l’ARN qui joue ce rôle
Vrai ou Faux: on retrouve l’ADN uniquement dans le noyau chez les eucaryotes
Faux, certains organites comme les mitochondries et les chloroplastes ont leur propre ADN
Qu’est-ce que le génome?
L’ensemble du matériel génétique d’un organisme vivant ou d’un virus
Vrai ou Faux: le génome de toutes les cellules sont composées d’ADN double brin alors que ceux de certains virus sont composé d’ARN
Vrai
Vrai ou Faux: le génome d’un eucaryote ne comprend pas l’ADN mitochondrial et chloroplastique
Vrai
Quelle est la structure primaire de l’ADN.?
séquence des résidus des nucléotides de la chaine polynucléotidique
Quelle est la structure secondaire de l’ADN?
Structure de la double hélice
Vrai ou Faux: l’ADN est presque toujours en forme trimérique?
Faux,
il est en forme dimérique (double brin)
Quelle est l’unité utilisée pour exprimée la taille des molécules d’ADN?
nombre de paire de bases (pb)
Décrire la structure de la double hélice en 4 points
1) ADN est constitué de 2 chaines polynucléotidiques enroulées les unes sur les autres pour former l’hélice
2) chaque A est lié à un T via 2 liens H ET chaque C et lié à un G via 3 liens H
3) les paires de bases sont empilées les unes sur les autres à l’intérieur de la double hélice tandis que le squelette os-phosphate est à l’extérieur
4) les 2 brins de la double hélice de l’ADN sont antiparallèles et complémentaires
Vrai ou Faux: la lecture d’ADN se fait de 5’ vers 3’ alors que l’écriture se fait de 3’ vers 5’
Faux,
la lecture et l’écriture se fait dans le sens 5’ vers 3’
Qui a découvert la strcuture de l’ADN
Watson et Crick
Pourquoi l’ADN est-il soluble dans l’eau?
Car le squelette sucre-phosphate (qui contient les groupements polaires et chargés) est à l’extérieur de la double hélice donc en contact avec le milieu aqueux
Par quoi les régions hydrophobes de la double hélice sont-elles formées?
Les paires de bases qui forment des structures planes
Pourquoi dit-on que les brins formant la double hélice sont antiparallèles et complémentaires?
Antiparallèles car ils ont des orientations opposées
Complémentaire, car chaque purine d’un brin est associée à sa pyrimidine correspondante sur l’autre brin
Quelles sont les 3 conformations de l’ADN?
ADN-B
ADN-A
ADN-Z
Décrire l’ADN-B en 3 points
- conformation la plus fréquente
- on la retrouve lorsque le taux d’humidité est élevé
- hélice droite
Décrire l’ADN-A en 3 points
- structure la plus compacte
- on la retrouve lorsque le taux d’humidité est faible
- hélice droite
Décrire l’ADN-Z en 3 points
- structure la plus allongée
- très faible taux d’humidité
- hélice gauche
Quelles sont les forces qui aident à stabiliser la double hélice de l’ADN
- interactions hydrophobes (entre les bases à l’intérieur)
- forces de Van Der Waals (causées par l’empilement des bases)
- Liaisons hydrogène ( entre les bases et entre le squelette sucre-phosphate et le milieu aqueux)
- Interactions ioniques ( entre les phosphate et les cations)
Décrire le processus de dénaturation de l’ADN
Processus par lequel les 2 brins d’ADN se séparent complètement suite au bris des ponts H et des interactions hydrophobes
Vrai ou Faux: la dénaturation de l’ADN peut avoir lieu dans la cellule
Faux, elle n’a pas lieu dans la cellule mais elle peut être provoquée in vivo
Quels sont les agents utilisés pour la dénaturation de l’ADN?
chaleur
pH élevé
agent cahotrophique (urée)
Est-il possible de renaturer l’ADN?
Oui,
si la solution d’ADN est refroidie lentement, les paires de bases se reforment correctement
Que se passe-t-il lorsqu’une solution d’ADN est refroidie trop rapidement suite à une dénaturation?
Les liaison H entre les bases de reforment de façon non spécifique produisant une structure désordonnée
Vrai ou Faux: le processus de dénaturation est un processus lentement coopératif
Vrai,
la forme sigmoïde de la courbe nous le confirme
Pourquoi dit-on que la dénaturation est coopérative?
Parce qu’à partir du moment où le processus de dénaturation est amorcé, la vitesse des bris des liaisons accélère
Qu’est-ce que la température de fusion ?
Température à laquelle 50% de l’ADN est dénaturé
Vrai ou Faux: la Tm d’un ADN est liée à sa composition en bases?
Vrai, c’est directement liée au contenu C+G
plus le pourcentage C+ G est élevé, plus les liens H sont nombreux donc la température de fusion est élevée
Quel est le contenu du génome humain en % pourcentage C+G?
39,8%
Que décrit le dogme central de la biologie moléculaire?
Il décrit le flux de l’information génétique dans la cellule
Qu’est-ce que la réplication?
Processus par lequel l’ADN est dupliqué avant la division cellulaire
Qu’est-ce que la transcription?
Processus permettant de copier différents segments d’ADN en ARN
Qu’est-ce que la traduction?
Processus par lequel les ARNm sont converties en protéines
Qu’est-ce que la rétrotranscription?
Lorsque les organismes ont la capacité de transformer leurs ARN en ADN
Vrai ou Faux: les séquences d’ARN sont toujours produites à partir d’une matrice protéique
Faux
Que permet le code génétique?
Permet de traduire la séquence d’une molécule d’ARNm en protéine
Vrai ou Faux: la code génétique est universel?
Vrai
Qu’est-ce que des codons synonymes?
2 ou +sieurs codons codant pour le même acide aminé
Pourquoi dit-on que le code génétique est dégénéré?
Car plus d’un codon peut coder pour le même acide aminé.
Quel est le codon de départ?
AUG
Quel est le codon d’arrêt?
STOP
Décrire l’ARN?
- constitué de ribonucléotides
- molécules monocaténaires (un seul brin)
- plus courtes que les molécules d’ADN
- fonctions variées
Vrai ou Faux: l’ARN possède une structure secondaire bien conservée
Faux
Les molécules d’ARN peuvent-elles se replier sur elles-mêmes?
Oui elles se replient sur elle-même et forment des régions hélicoïdales conférant une structure 3D
Quels sont les 3 types d’ARN dans la cellule?
- ARNr (ribosomaux)
- ARNt (de transfert)
-ARNm (messager)
Décrire l’ARNm
- contient l’info requise pour fabriquer une protéine particulière
- sythétisé à partir de l’ADN
Décrire l’ARNr
- composantes structuraux et fonctionnels des ribosomes
Quel est le rôle des ribosomes en lien avec l’ADN-ARN?
- traduit l’information protée par l’ARNm en une protéine
- complexes nucléoprotéiques formés par 3 molécules d’ARNr
Décrire les ARNTt
- petites molécules qui participent à la traduction
Que sont les ARN non-codants?
groupe hétérogène comprenant +sieurs types d’ARN
- fonctions cellulaires diversifiées= modification et maturation d’autres ARN, régulation de l’expression génétique, rôle de défense contre les infections virales
