Les acides aminés Flashcards
Quelles sont les fonctions des protéines (acide aminés)?
- catalyse
- transport
- stockage des nutriments
- structure
- mouvement
- décodage de l’info
- régulation
- défense/agression
TOUT SAUF STOCKAGE DE L’INFO GÉNÉTIQUE
Quelle est la structure de la plupart des acides aminés?
Ils possèdent tous (sauf la proline qui elle a un amine secondaire) un groupement carboxyle (-COOH) et un groupement amine (NH3).
Comment appelle-t-on les acides aminés qui constituent les unités de bases?
Les acides aminés standards
Quels sont les acides aminés non standards?
neurotransmetteurs
hormones
intermédiaires métaboliques
Comment se nomme le carbone lié au carbone du groupement carboxyle?
Carbone alpha
Vrai ou Faux: tous les acides aminés standards sont des acides a-aminés
Vrai
Vrai ou Faux: tous les acides aminés ont une activité optique?
Faux, presque tous les acides aminés ont une activité optique. Tous sauf la glycine.
Pourquoi la glycine est-elle inactivement optique?
Car elle a 2 atomes d’hydrogène sur son carbone alpha, elle n’est pas chirale donc elle est inactivement optique
Quelles sont les 2 grandes catégories pour classifier les acides aminés?
1- selon la nature de la chaine R
2- selon la polarité
Quelles sont les 7 classes faisant partie de la catégorie (selon la nature chimique) pour la classification des acides-aminés?
1- ceux ayant une chaine aliphatique
2- ceux contenant une fonction a-iminoacide
3- ceux contenant un cycle aromatique
4- ceux avec un atome de soufre
5- ceux avec un groupement hydroxyle
6- ceux avec un deuxième groupement basique
7- ceux avec un deuxième groupement basique
Comment décire rapidement les acides aminés faisant partie de ceux qui ont une chaine aliphatique?
Que des atomes de C et de H
Quels sont les acides aminés inclus dans la catégorie ayant une chaine aliphatique?
glycine
alanine
valine
leucine
isoleucine
Quel est le seul acide aminé à ne pas avoir de carbone chiral?
Glycine
Quel est le plus petit acide aminé?
Glycine
Quel est le seul acide aminé dont la chaine latérale ne contient aucun C?
Glycine
Pour quelles raisons la leucine et l’isoleucine sont-ils des acides aminés branchés?
Car leur chaine latérale n’est pas linéaire
Quel est le seul acide aminé dans la catégorie de ceux ayant une fonction a-iminoacide?
La proline
Quels sont les acides aminés avec un cycle aromatique?
Phénylalanine
Tyrosine
Tryptophane
Quels sont les acides aminés contenant un atome de soufre?
Méthionine (lien thioéther)
Cystéine (groupement thiol)
Quels sont les acides aminés contenant un groupement hydroxyle?
Sérine
Thréonine
Quels sont les acides aminés contenant un deuxième groupement basique?
Histidine
Lysine
Arginine
Quels sont les acides aminés contenant un deuxième groupement acide?
Aspartate
Glutamate
Asparigine
Glutamine
Quel est le code a 1 et 3 lettres de la glycine?
Gly
G
Code 1 et 3 lettres d’alanine?
Ala
A
Code 1 et 3 lettres valine?
Val
V
Code 1 et 3 lettres leucine?
Leu
L
Code 1 et 3 lettres isoleucine?
Ile
I
Code 1 et 3 lettres proline?
Pro
P
Code 1 et 3 lettres phénylalanine?
Phe
F
Code 1 et 3 lettres tyrosine?
Tyr
Y
Code 1 et 3 lettres tryptophane?
Trp
W
Code 1 et 3 lettres méthionine?
Met
M
Code 1 et 3 lettres cystéine?
Cys
C
Code 1 et 3 lettres sérine?
Ser
S
Code 1 et 3 lettres thréonine?
Thr
T
Code 1 et 3 lettres histidine?
His
H
Code 1 et 3 lettres lysine?
Lys
K
Code 1 et 3 lettres arginine?
Arg
R
Code 1 et 3 lettres aspartate?
Asp
D
Code 1 et 3 lettres glutamate?
Glu
E
Code 1 et 3 lettres glutamine?
Gln
Q
Code 1 et 3 lettres asparigine?
Asn
N
Quels sont les 4 groupes qui divise la catégorie des acides aminés selon la polarité de la chaine R?
- acides aminés non polaires
- acides aminés polaires, mais non chargés
- acides aminés polaires et chargés (acide)
- acides aminés polaires et chargés (basique)
Quels sont les acides aminés non polaires?
Glycine
Alanine
Valine
Leucine
Isoleucine
Proline
Méthionine
Phénylalanine
Tryptophane
Quels sont les acides aminés polaires non chargés?
Tyrosine
Sérine
Thréonine
Cystéine
Asparigine
Glutamine
Quels sont les acides aminés polaires et chargés (acide)?
Aspartate
Glutamate
Quels sont les acides aminés polaires et chargés (basique)?
Histidine
Lysine
Arginine
Pour quelle raison les acides aminés non polaires sont-ils hydrophobes?
Car la solubilité d’un composé dépend de sa polarité et de sa taille.
Est-il vrai de dire que tous les acides aminés chargés sont hydrophiles?
Oui, c’est vrai
Outre, les acides aminés qu’on retrouve dans les protéines, où peut-on retrouver les acides aminés?
- Médiateurs chimiques (hormones et neurotransmetteurs)
- Précurseurs ou intermédiaires métabolliques
- Protéogéniques rares
- Présents suite à des modifications post-traductionnelles
Les acides aminés qui agissent comme des médiateurs chimiques sont-ils présents dans les protéines?
Non, ils sont absents
Que permettent les médiateurs chimiques?
Ils permettent la communication entre différentes cellules de l’organisme
Quels sont les 2 types de médiateurs chimiques?
Hormones (sécrétées par des glandes, circulent dans le sang, agissent à distance)
Neurotransmetteurs (sécrétés par des neurones, agissent à courte distance)
Donnez des exemples et des carcatéristiques d’hormones
1) épinéphrine/adrénaline= dérivée de la tyrosine, sécrétée par les glandes surrénales en réponse à un stress
2) Thyroxine (T4) = dérivée de la tyrosine, c’est une prohormone qui est ensuite convertie en triiodothyronine (T3), influence différents processus métabolliques
Donnez des exemples de neurotransmetteurs et des caractéristiques
1) acide y-aminobutyrique/GABA= neurotransmetteur qui contribue au controle moteur, dérivé du glutamate
2) histamine = médiateur chimique responsable des réactions allergiques, dérivée de l’histidine
Les précurseurs ou intermédiaires métabolliques sont-ils absents ou présents dans les protéines?
Absents
Donnez des exemples de précurseurs ou intermédiaires métabolliques?
1) l’homocystéine et l’homosérrine servent de précurseurs pour la formation de plusieurs acides aminés standards
2) Les a-a citrulline et ornithine sont 2 intermédiaires métabolliques pour le cycle de l’urée
3) S-adénosylméthionine est un acide aminé servant de co-substrat lors des rxn de méthylation
Les protéogéniques rares sont-ils absents ou présents dans les protéines?
Présents
Donnez des exemples de protéogéniques rares
1) La sélénocystéine à la même structure que la cystéine sauf que l’atome de soufre est remplacé par un atome de sélénium
2) La pyrrolosine est présente chez certaines bactéries en particulier dans les enzymes participant à la production de méthane
Quelles sont les modifications post-traductionnelles possibles?
phosphorylation
méthylation
acétylation
hydroxylation
carboxylation
Pourquoi la plupart des acides aminés sont-ils chiraux?
Car au moins 1 de leurs atomes de carbone est attaché à 4 différents substituants
Où peut-on retrouver des acides aminés de la série D?
Certaines bactéries et mycètes
On les retrouve dans la paroi cellulaire et dans les antibiotiques
Pourquoi les acides aminés sont-ils amphotères?
Car ils possèdent un groupement amine (basique) et un groupement carboxyle (acide)
Vrai ou Faux, les a-a standards sont tous des acides faibles polyprotiques?
Vrai, car ils possèdent tous au moins 2 groupements ionisables
Quels sont les charges des groupements carboxyle et amine au pH physiologique?
Le groupement carboxyle est chargé négativement
Le groupement amine est chargé négativement aussi
Qu’est-ce que le point isolélectrique?
C’est le pH où l’acide aminé ne porte aucune charge