La synthèse protéique Flashcards
Dans quel sens est-ce que l’ARNm est traduit ?
De 5’-3’
Vrai ou Faux, plusieurs codons peuvent coder pour le même acide aminé
Vrai
Quelle série code pour STOP ? et le codon d’initiation
Initiation :
UAA
UGA
UAG
Terminaison :
AUG
À quoi est-ce que ça peut servir que le code génétique soit dégénéré ?
Ça atténue l’effet des mutations
Qu’est-ce qu’un cadre de lecture ? et un cadre de lecture ouvert
le point de départ potentiel d’une suite de codons
quand la suite de codon ne se termine pas avec un codon de terminaison
4 types de mutations génétiques et décrire
Silencieuse (on remplace juste 1 lettre, mais l’a.a reste le même)
Faux-sens (change l’a.a)
Non-sens (codon devient une terminaison, grave)
Continuation (STOP devient un a.a)
À quoi servent les ARNt et décrire les structures
Apporter les a.a en fonction de l’ARNm.
Tige acceptatrice qui lie l’a.a
lobe anticodon qui lie le codon
Lobe D, les deux permettent à la molécule de se replier
Lobe twc
Comment est-ce qu’on lit l’anti codon avec son codon
codon : UCG
Anticodon : CGA
Qu’est-ce qu’un appariement de Wobble ?
en position 5’ de l’anticodon la base azotée est flexible dans le sens que c’est pas obligé d’être complémentaire et donc moins stable
Qu’est-ce que les ARNt isoaccepteurs ?
Dese ARNtqui porte le même acide aminé, mais dont la structure est différente
À quelle extrémité est-ce que l’acide aminé se lie à la molécule d’ARNt ?
3’
Qu’est-ce qu’un aminoacyl-ARNt ? et quels enzymes catalysent la réaction ?
C’est un ARNt ou l’acide aminé est activé et donc qu’il est chargé sur l’ARNt
Les aminoacyl-ARNt synthétases
Réaction globale pour la synthèse d’aminoacyl-ARNt
A.A + ARNt + ATP => Aminoacyl-ARNt+AMP+PPi
Décrire brièvement la synthèse d’aminoacyl-ARNt
Formation d’un intermédiaire réactionnel
Transfert du groupe aminoacyle de l’intermédiaire à l’ARNt
De quelles tailles sont les sous-unités des ribosomes des procaryotes et des eucaryotes ?
Procaryote : 50S + 30S = 70S
Eucaryote : 60S + 40S = 80S
De quoi sont faits les ribosomes ?
2 sous-unités ribonucléopotéiques
Décrire les sites P et A
A : Site de fixation de l’aminoacyl-ARNt
P : Contient un aminoacyl-ARNt et la chaine peptidique naissante
3 étapes de la synthèse protéique et les décrire
Initiation : Assemblage du complexe autour du premier codon d’ARNm
Allongement ou élongation : Progression de l’assemblage dans le sens 5’-3’ en synthétisant la protéine à partir de son extrémité aminée jusqu’à son extrémité carboxyle
Terminaison : Dissociation des ribosomes d’avec l’ARNm
Quel est le rôle de l’initiation dans le mécanisme de traduction ?
Imposer le bon codon d’initiation et le bon cadre de lecture
Quel codon est-ce que l’ARNt initiateur reconnait-il ?
AUG
Quel est l’initiateur chez les Eubactéries ? de quelle enzyme est-il le substrat ?
ARNtfMet
Formyl transférase
Quelle est la différence entre les Eubactéries et les Eucaryotes dans la nature des ARNt initiateur ?
Il n’est pas formylé et est déisgné Met-ARNtiMét
Quels facteurs d’initiation aident à dissocier les sous-unités chez les Procaryotes ?
IF-1
IF-3
Décrire l’assemblage du complexe d’initiation 30S chez les procaryotes ? Décrire l’association
L’ARNm se lie à la petite sous-unités avec la séquence Shine-Dalgarno. Puis, le fMet-ARNtmet arrive directement dans le site P sur le codon d’initiation avec le IF2 directement attaché sur lui
IF2 hydrolyse sont GTP et la sous-unité 50S vient se lier
Rôle de chaque facteurs d’initiation
IF-1 = Dissociation
IF-2 = Protéine de liaison au GTP, lie le premier aminoacyl-ARNt et aide sa fixation
IF-3 = Fixe l’ARNm sur le ribosome et empêche l’association des deux sous-unités du ribosome
Vrai ou Faux, les complexes d’initiation s’assemblent au niveau des codons internes de méthionine
Faux, seulement au niveau des codons initiateurs
Vrai ou Faux, la séquence Shine-Dalgarno est présente chez les procaryotes
Vrai, uniquement
Le ribosome procaryote 70S est fait de quelles sous-unités ?
50S
30S
L’ARNt initiateur chez les bactéries
a)Chargé avec Met
b)Chargé avec fMet
c)Chargé avec Met et modifié après en fMet
c)
Comment est-ce que la traduction est initiée chez les Eucaryotes ?
À l’aide de la séquence Kozak (ACCAUGG)
Comment est-ce que la sous-unité ribosomique 40S trouve la séquence Kozak ?
En faisant une sorte de balayage sur l’ARNm de 5’-3’
Décrire l’étape de dissociation chez les Eucaryotes
eIF1 et eIF3 dissocie les deux sous-unités
Décrire l’étape d’assemblage chez les Eucaryotes
Le complexe ternaire MetARNtMet , le eIF2 et le GTP viennent s’associer
Décrire l’étape de recrutement chez les Eucaryotes
Le complexe vient se lier à l’ARNm grâce à eIF4F : eIF4E, eIF4G, eIF4A
Décrire l’étape d’association chez les Eucaryotes
eIF2 hydrolyse le GTP et permet la liaison de la sous-unités 60S
3 étapes de l’allongement de la chaine
1.Mise en place de l’aminoacyl-ARNt au site A
2.Formation de la liaison peptidique
3.La transolcation, faire avancer le ribosome d’un codon sur l’ARNm
Par quoi est catalysé le placement du prochain aminoacyl-ARNt au site chez les bactéries ?
Par le EF-Tu qui est muni d’un facteur de fixation pour le GTP
Vrai ou Faux, les EF-Tu sont des GTPases
Vrai, ils sont une des molécules les plus abondantes chez les bactéries
Que se passe-t-il lorsque le codon et l’anticodon concernant le complexe EF-Tu-GTP
Hydrolyse du GTP en GDP et Pi
Vrai ou Faux, il n’est pas possible de former une liaison peptidique avant l’hydrolyse du GTP par EF-Tu
Vrai, c’est un mécanisme pour limiter les erreurs
Par quoi et dans quel sens est formée la liaison peptidique ?
Par la peptidyl transférase du 5’ au 3’
L’attaque se fait donc par l’amine du N-terminal au C-terminal
Quelle enzyme catalyse la translocation pendant le microcycle d’allongement ?
EF-G, il glisse en direction 5’-3’ et le peptidyl-ARNt passe du site A au site P
Faire le calcul d’ATP pour une chaine de 10 a.a
Trouver le nb de liaisons peptidiques = 9 *4 ATP
La méthionine requiert un investissement = 2 ATP
= 38ATP
Par quoi sont reconnus les codons de terminaison lorsqu’ils arrivent au site A ?
par des facteurs de relargage et par aucune molécule d’ARNt
Nommer les facteurs de relargage + leur utilité
RF-1 : reconnait UAA et UAG
RF-2 : reconnait UAA et UGA
RF-3 : lié à un GTP et rend plus efficace l’action des autres facteurs
Quelle liaison est-ce que les facteurs de relargage hyrolysent-ils ?
La liaison ester peptidyl-ARNt (entre la chaine et l’ARNt)
Combien de facteurs de relargage nécessaire chez les procaryotes et les eucaryotes ?
Pro : 3
Euc : 2 (EF1 ou EF2 + EF3)
