La synthèse protéique Flashcards

1
Q

Dans quel sens est-ce que l’ARNm est traduit ?

A

De 5’-3’

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Q

Vrai ou Faux, plusieurs codons peuvent coder pour le même acide aminé

A

Vrai

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3
Q

Quelle série code pour STOP ? et le codon d’initiation

A

Initiation :
UAA
UGA
UAG

Terminaison :
AUG

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4
Q

À quoi est-ce que ça peut servir que le code génétique soit dégénéré ?

A

Ça atténue l’effet des mutations

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5
Q

Qu’est-ce qu’un cadre de lecture ? et un cadre de lecture ouvert

A

le point de départ potentiel d’une suite de codons
quand la suite de codon ne se termine pas avec un codon de terminaison

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6
Q

4 types de mutations génétiques et décrire

A

Silencieuse (on remplace juste 1 lettre, mais l’a.a reste le même)
Faux-sens (change l’a.a)
Non-sens (codon devient une terminaison, grave)
Continuation (STOP devient un a.a)

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7
Q

À quoi servent les ARNt et décrire les structures

A

Apporter les a.a en fonction de l’ARNm.

Tige acceptatrice qui lie l’a.a
lobe anticodon qui lie le codon
Lobe D, les deux permettent à la molécule de se replier
Lobe twc

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8
Q

Comment est-ce qu’on lit l’anti codon avec son codon

A

codon : UCG
Anticodon : CGA

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9
Q

Qu’est-ce qu’un appariement de Wobble ?

A

en position 5’ de l’anticodon la base azotée est flexible dans le sens que c’est pas obligé d’être complémentaire et donc moins stable

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10
Q

Qu’est-ce que les ARNt isoaccepteurs ?

A

Dese ARNtqui porte le même acide aminé, mais dont la structure est différente

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11
Q

À quelle extrémité est-ce que l’acide aminé se lie à la molécule d’ARNt ?

A

3’

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12
Q

Qu’est-ce qu’un aminoacyl-ARNt ? et quels enzymes catalysent la réaction ?

A

C’est un ARNt ou l’acide aminé est activé et donc qu’il est chargé sur l’ARNt
Les aminoacyl-ARNt synthétases

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13
Q

Réaction globale pour la synthèse d’aminoacyl-ARNt

A

A.A + ARNt + ATP => Aminoacyl-ARNt+AMP+PPi

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14
Q

Décrire brièvement la synthèse d’aminoacyl-ARNt

A

Formation d’un intermédiaire réactionnel
Transfert du groupe aminoacyle de l’intermédiaire à l’ARNt

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15
Q

De quelles tailles sont les sous-unités des ribosomes des procaryotes et des eucaryotes ?

A

Procaryote : 50S + 30S = 70S
Eucaryote : 60S + 40S = 80S

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16
Q

De quoi sont faits les ribosomes ?

A

2 sous-unités ribonucléopotéiques

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17
Q

Décrire les sites P et A

A

A : Site de fixation de l’aminoacyl-ARNt
P : Contient un aminoacyl-ARNt et la chaine peptidique naissante

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18
Q

3 étapes de la synthèse protéique et les décrire

A

Initiation : Assemblage du complexe autour du premier codon d’ARNm
Allongement ou élongation : Progression de l’assemblage dans le sens 5’-3’ en synthétisant la protéine à partir de son extrémité aminée jusqu’à son extrémité carboxyle
Terminaison : Dissociation des ribosomes d’avec l’ARNm

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19
Q

Quel est le rôle de l’initiation dans le mécanisme de traduction ?

A

Imposer le bon codon d’initiation et le bon cadre de lecture

20
Q

Quel codon est-ce que l’ARNt initiateur reconnait-il ?

21
Q

Quel est l’initiateur chez les Eubactéries ? de quelle enzyme est-il le substrat ?

A

ARNtfMet
Formyl transférase

22
Q

Quelle est la différence entre les Eubactéries et les Eucaryotes dans la nature des ARNt initiateur ?

A

Il n’est pas formylé et est déisgné Met-ARNtiMét

23
Q

Quels facteurs d’initiation aident à dissocier les sous-unités chez les Procaryotes ?

24
Q

Décrire l’assemblage du complexe d’initiation 30S chez les procaryotes ? Décrire l’association

A

L’ARNm se lie à la petite sous-unités avec la séquence Shine-Dalgarno. Puis, le fMet-ARNtmet arrive directement dans le site P sur le codon d’initiation avec le IF2 directement attaché sur lui

IF2 hydrolyse sont GTP et la sous-unité 50S vient se lier

25
Rôle de chaque facteurs d'initiation
IF-1 = Dissociation IF-2 = Protéine de liaison au GTP, lie le premier aminoacyl-ARNt et aide sa fixation IF-3 = Fixe l'ARNm sur le ribosome et empêche l'association des deux sous-unités du ribosome
26
Vrai ou Faux, les complexes d'initiation s'assemblent au niveau des codons internes de méthionine
Faux, seulement au niveau des codons initiateurs
27
Vrai ou Faux, la séquence Shine-Dalgarno est présente chez les procaryotes
Vrai, uniquement
28
Le ribosome procaryote 70S est fait de quelles sous-unités ?
50S 30S
29
L'ARNt initiateur chez les bactéries a)Chargé avec Met b)Chargé avec fMet c)Chargé avec Met et modifié après en fMet
c)
30
Comment est-ce que la traduction est initiée chez les Eucaryotes ?
À l'aide de la séquence Kozak (ACCAUGG)
31
Comment est-ce que la sous-unité ribosomique 40S trouve la séquence Kozak ?
En faisant une sorte de balayage sur l'ARNm de 5'-3'
32
Décrire l'étape de dissociation chez les Eucaryotes
eIF1 et eIF3 dissocie les deux sous-unités
33
Décrire l'étape d'assemblage chez les Eucaryotes
Le complexe ternaire MetARNtMet , le eIF2 et le GTP viennent s'associer
34
Décrire l'étape de recrutement chez les Eucaryotes
Le complexe vient se lier à l'ARNm grâce à eIF4F : eIF4E, eIF4G, eIF4A
35
Décrire l'étape d'association chez les Eucaryotes
eIF2 hydrolyse le GTP et permet la liaison de la sous-unités 60S
36
3 étapes de l'allongement de la chaine
1.Mise en place de l'aminoacyl-ARNt au site A 2.Formation de la liaison peptidique 3.La transolcation, faire avancer le ribosome d'un codon sur l'ARNm
37
Par quoi est catalysé le placement du prochain aminoacyl-ARNt au site chez les bactéries ?
Par le EF-Tu qui est muni d'un facteur de fixation pour le GTP
38
Vrai ou Faux, les EF-Tu sont des GTPases
Vrai, ils sont une des molécules les plus abondantes chez les bactéries
39
Que se passe-t-il lorsque le codon et l'anticodon concernant le complexe EF-Tu-GTP
Hydrolyse du GTP en GDP et Pi
40
Vrai ou Faux, il n'est pas possible de former une liaison peptidique avant l'hydrolyse du GTP par EF-Tu
Vrai, c'est un mécanisme pour limiter les erreurs
41
Par quoi et dans quel sens est formée la liaison peptidique ?
Par la peptidyl transférase du 5' au 3' L'attaque se fait donc par l'amine du N-terminal au C-terminal
42
Quelle enzyme catalyse la translocation pendant le microcycle d'allongement ?
EF-G, il glisse en direction 5'-3' et le peptidyl-ARNt passe du site A au site P
43
Faire le calcul d'ATP pour une chaine de 10 a.a
Trouver le nb de liaisons peptidiques = 9 *4 ATP La méthionine requiert un investissement = 2 ATP = 38ATP
44
Par quoi sont reconnus les codons de terminaison lorsqu'ils arrivent au site A ?
par des facteurs de relargage et par aucune molécule d'ARNt
45
Nommer les facteurs de relargage + leur utilité
RF-1 : reconnait UAA et UAG RF-2 : reconnait UAA et UGA RF-3 : lié à un GTP et rend plus efficace l'action des autres facteurs
46
Quelle liaison est-ce que les facteurs de relargage hyrolysent-ils ?
La liaison ester peptidyl-ARNt (entre la chaine et l'ARNt)
47
Combien de facteurs de relargage nécessaire chez les procaryotes et les eucaryotes ?
Pro : 3 Euc : 2 (EF1 ou EF2 + EF3)