génétique microbienne Flashcards
Quels sont les 3 modes de résistance des bactéries aux atb?
1-altération de la perméabilité
2-modification ou destruction de l’atb
3-modification ou changement de la cible
Nommez les 11 cibles possibles des atb
- membrane
- synthèse ATP
- biosynthèse acide folique
- paroi
- synthèse de protéine (50s)
- synthèse de protéine (30s)
- ARNt synthétase
- facteur d’élongation EF-G
- Fragmentation ADN
- Gyrases à ADN
- Polymérase à ARN
Comment s’appelle la structure qui assure l’empaquetage de l’ADN bactérien?
Nucléoïde
Comment appelle-t-on l’ensemble des gènes de la bactérie?
Génome
Combien de chromosome possède une bactérie?
1
Quel est l’autre élément que le chromosome qui peuvent contenir du matériel génétique?
plasmide
V/F Les plasmides codent pour des gènes essentiels
F, généralement non essentiels
Quels sont les 3 types d’information pouvant se retrouver sur un plasmide?
- résistance aux atb
- capacité métabolique supplémentaire
- facteur favorisant la virulence
Quel est le mode de division des bactéries?
Fission binaire
Quels sont les 3 types de régulation des gènes bactériens?
- changement dans la séquence ADN
- Changement dans le nombre de transcrits
- Changement dans la quantité de produit de gène actif
Quels sont les deux changements possibles dans la séquence d’ADN pour réguler les gènes?
-amplification de gène
réarrangement de gène (mutation)
Quels sont les deux types de changements dans le nombre de transcrits pour réguler les gènes?
activation
répression
Quels sont les 3 types de changements dans la quantité de produit de gène actif dans la régulation des gènes?
- ajout de cofacteur ou groupe prostétique
- clivage protéolytique
- interactions avec d’autres macromolécules
Comment fonctionne la régulation du gène de résistance à la tétracycline?
Lorsqu’il n’y a pas de tétracycline dans la bactérie, le gène répresseur inhibe la transcription du gène de résistance pour économiser de l’énergie. Lorsque la tétracycline entre dans la bactérie, elle se lie au répresseur du gène de résistance. Comme celui-ci n’est plus inhibé, il y a transcription du gène de résistance.
Quelles sont les 3 choses à retenir concernant la régulation des gènes?
- les bactéries ne produisent les protéines que lorsqu’elles en ont besoin (économie d’énergie)
- Régulation=processus actif. Beaucoup plus efficace quand la bactérie est en croissance rapide
- Implique souvent des boucles de contrôle
Qu’est-ce que la régulation simple?
Un promoteur qui contrôle un gène
Qu’est-ce qu’un opéron?
un seul promoteur pour plusieurs gènes adjacents
Qu’est-ce qu’un régulon?
une protéine régulatrice pour plusieurs gènes à différents endroits
Qu’est-ce qu’un stimulon?
un stimulus qui contrôle plusieurs gènes à différents endroits
V/F une mutation se transmet à la cellule fille
V
Quelles peuvent être les causes d’une mutation spontanée?
- radiations cosmiques
- erreurs lors de la réplication
Qu’est-ce qui est le plus fréquent entre mutation spontanée ou induite?
induite
Qu’est-ce qui peut causer les mutations induites?
agents physiques, chimiques, biologiques
Quelles sont les formes que peuvent prendre les différentes mutations au niveau de l’ADN?
- délétions ou insertions de nucléotides
- Substitution de nucléotides
Qu’est-ce qu’un génotype sélectionnable?
permet un avantage sur les autres bactéries dans un environnement avec des conditions sélectives
Donner un exemple de gène sélectionnable
gène de résistance
V/F les mutations entrainent toujours des effets positifs pour la bactérie
F
Quels sont les 5 groupes de système de réparation de l’ADN?
- réparation directe
- réparation par excision
- réparation par recombinaison
- réponse SOS
- réparation sujette à erreur
Quels sont les 3 mécanismes permettant aux bactéries de partager leur matériel génétique?
- transformation
- conjugaison
- transduction
Qu’est-ce que la transformation?
la bactérie prend l’ADN d’une autre bactérie morte
V/F toutes les bactéries ont la capacité de subir la transformation?
F
certaines l’ont déjà et d’autres peuvent l’acquérir, mais elles ne l’ont pas toutes
Qu’est-ce qui permet une optimisation du phénomène de transformation?
si les deux bactéries sont de la même espèce
Quelle méthode de transfert de matériel génétique ressemble le plus à un échange sexuel?
conjugaison
V/F La conjugaison est un processus d’échange bidirectionnel
F, unidirectionnel
Comment appelle-t-on la structure par laquelle les gènes sont transférés lors de la conjugaison?
plasmide conjugatif
Qu’est-ce qui permet l’échange de matériel génétique par transduction?
bactériophage
Quels sont les trois types de cycle de vie des bactériophages?
lytique
lysogénique
chronique
Quel est le mécanisme du cycle lysogénique des phages?
Le matériel génétique du phage s’intègre dans celui de la bactérie. Il est répliqué lui aussi lors de la réplication.
Qu’arrive-t-il à la fin du cycle lysogénique?
un évènement vient rompre le cycle. le matériel génétique s’excise de celui du chromosome. Cycle lytique s’active.
Qu’est-ce que le cycle lytique?
Avec le matériel génétique qui n’est plus à l’intérieur du chromosome, il y a transcription et traduction (donc production de protéines de phage). Quand il y a beaucoup de particules de phages, ils vont se libérer ce qui provoque la lyse de la cellule bactérienne et donc sa mort.
Comment appelle-t-on un phage qui est uniquement capable d’un cycle lytique?
virulent ou strictement lytique
Comment appelle-t-on les phages capables de cycle lysogénique?
lysogènes ou tempérés
Qu’est-ce qu’un phage chronique?
phage qui peut se répliquer et sortir de la bactérie sans entrainer une lyse cellulaire.
Comment est-ce que le matériel génétique des bactéries est-il transféré à d’autres bactéries par le phénomène de transduction?
lorsque le matériel génétique du phage s’excise de celui de la bactérie, il part parfois avec une partie du matériel génétique. Lorsque le phage va aller infecter une autre bactérie, il pourra donc lui transmettre une partie du matériel génétique de l’autre bactérie.
Qu’est-ce qu’une transduction généralisée?
une accumulation de fragments d’adn de bactérie dans une capside de phage.
Est-ce qu’un phage résultant d’une transduction généralisée peut se répliquer?
non car il ne possède pas l’information pour fabriquer une capsule
Les gènes transférés par transduction codent pour quelle sorte de protéine?
toxine
Qu’est-ce que la transposition?
le transfert dans la même bactérie de matériel génétique d’un endroit à un autre (par exemple un gène faisant partie du chromosome se transpose dans le plasmide)
Quelles sont les 3 classes de transposons?
- séquences d’insertion
- transposons complexes
- phages transposables
Pourquoi les transposons complexes ont une importance médicale?
peuvent coder pour des gènes de toxines ou de résistance
Qu’est-ce qu’un intégron?
élément génétique qui permet de recruter des gènes de résistance pour ensuite les intégrer un à un devant des promoteurs forts (pour s’assurer de l’expression du gène).
Où peut-on trouver des intégrons?
transposons complexes
plasmides
Quel est le système de restriction des échanges le mieux connu?
restriction-modification de classe 2
Comment fonction le système restriction-modification de classe 2?
1- une méthylase va ajouter des méthyles sur l’ADN de la bactéries.
2-une nucléase de restriction détruit tout matériel génétique qui ne possède pas de méthyl
Quel est le système de restriction des échanges qui est plus spécifique que restriction-modification classe 2?
CRISPR/Cas
Qu’est-ce que le système CRISPR/Cas?
1-lors d’une infection par un phage, CRISPR incorpore une courte séquence de matériel génétique du phage pour conserver une mémoire du phage.
2-les séquences CRISPR sont transcrites pour générer des ARN CRISPR.
3-Lorsque l’ARN CRISPR reconnait une séquence, il guide la protéine Cas pour qu’elle coupe l’ARN étranger
Nommez des médicaments synthétisés à l’aide de bactéries?
- hormones de croissance humaine
- insuline humaine
- alpha-1-antitrypsine
- DNase
- activateur du plasminogène
- vaccin hépatite B
- anticorps monoclonaux
Quelle technique pourrait nous permettre d’identifer des bactéries en quelques heures?
PCR (polymerase chain reaction)
Comment fonctione la PCR?
on sépare un brin d’ADN, on réplique sur les deux brins. on sépare les 2 nouveaux ADN pour répliquer de nouveau (donc 4 ADN) qu’on sépare encore pour former d’autre ADN et ainsi de suite
