Fixation of tissue Flashcards

1
Q

Beskriv den typiske workflow for den TYPISKE histologiske forberedelse af væv.

A
Kollektion af prøven 
Fixering 
Embedding 
Sectioning 
Farvning 
Mikroskopi 
Report
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Hvad er formålet med fixering?

A

At stoppe enzymatisk nedbrydning

Bevarer vævs morfologien

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Hvad gør fixativet strukturelt ved proteiner?

A

Ændre den tertiære struktur

Ændre den kemiske og antigen forholdet af proteinerne sammenlignet med den native form.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Er det godt at fixere sit væv, hvis man ønsker at bruge det i antistof-antigen interaktioner?

A

Nej

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Nævn to aldehyder

A

Formaldehyde

Glutaraldehyde

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Hvad er den kemiske formel for formaldehyde og hvilken del er aldehyde delen?

A

HCHO

Aldehyde = CHO

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Formaldehyde er opløselig i vand og danner methylene hydrate er denne form lige så god som formaldehyde?

A

Ja, de har samme karakteristisk

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Hvad er den kemiske formel for methylene hydrate?

A

HO-CH2-OH

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Hvad sker der når methylene hydrater reagerer med hinanden?

A

De danner polymerer

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Hvad er formalin en blanding af?

A

40 % formaldehyde

60% vand

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Hvad er paraformaldehyde?

A

Formaldehyde polymerer med 100 repeated units, som gør at de er uopløselige.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Hvordan nedbrydes paraformaldehyde?

A

Ved at varme det til 60 grader

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Hvad er en typisk brugbar blanding af formaldehyde?

A

en fortynding mellem 4 til 10%

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Beskriv hvordan formaldehyde/methylene hydrat fixerer vævet?

A

Det er aldehyde gruppen på methylene hydratet der binder til proteinet.
Denne gruppe kan derved med aldehyde gruppe bind et nyt protein. Herved er proteinerne ikke længere opløselige.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Beskriv teksturen af cytoplasmaet af en celle efter fixering

A

Gel agtigt.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Hvilke komponenter fixeres ikke af formaldehyde og hvordan forbliver de uopløselige?

A

Lipider, DNA og kulhydrater.

De fanges i networket af uopløselige cross-links.

17
Q

Hvad gør at fixering kan lede til background staining?

A

Formaldehyde gør vævet mere hydrofobisk.

18
Q

Kan formaldehyde og glutaraldehyde reagere med DNA og RNA?

A

Ja ved 65 grader for DNA og 45 grader for RNA

19
Q

Hvad er den kemiske formel for glutaraldehyde?

A

HCO-(CH2)3-CHO

Der er to aldehyde grupper adskilt af 3 methylene broer.

20
Q

Hvad gør at glutaraldehyde fixerer hurtigere end formaldehyde?

A

Glutaraldehyde er sammensat af polymerer, som har aldehyde grupper der stikker ud, som kan binde proteiner.

21
Q

Hvornår vil man undgå at fixerer med glutaraldehyde og hvornår vil man?

A

Hvis vævet skal bruges til imunnokemisk farvning og man vil bruge det til electron mikroskopi

22
Q

Hvad skal embedding bestå af, når man bruger glutaraldehyde?

A

Resin embedding media da det penetrerer bedre end paraffin.

23
Q

Hvad består Karnocsky´s fixative af, og hvad gør den?

A

1-4% glutaraldehyde i 2-4% formaldehyde.

Formaldehyde er hurtigt penetrerende og glutaraldehyde er hurtigt fixerende.

24
Q

Nævn nogle protein-denaturerings agenter

A

Ethanol og methanol

Methylated spirits

25
Q

Hvordan virker protein denaturerings agenter?

A

De ødelægger hydrofobiske bindinger i proteinet og ændrer dermed proteinets tertiære struktur.

26
Q

Hvornår vil man fixerer med alkoholer?

A

Cytologiske specimens
Frosne sections
Til antigen-antistof interventioner

27
Q

Et alkohol fixativ er alkohol blandet med PEG. Hvad går de to komponenter?

A

Alkohol fixerer cellerne
PEG laver et hydrofobisk lag omkring cellen, som beskytter den fra mekanisk skade og stopper ethanol blandingen og dermed forbygger at cellen tørre ud.

28
Q

Paraffin voks er hydrofobisk og fixativet er mest bestående af vand, som gør at der skal et mellemstep til før prøven kan behandles med paraffin. Forklar disse steps.

A

Vævet behandles med øget konc. af ethanol for at fjerne vandet fra fixativet.
Alkoholen erstattes af en clearing solution såsom xylene
Dette tillader embedding mediet til at erstatte Xylenet.

29
Q

Hvilken størrelse skal slides være ved paraffin embedding?

A

2-5 um.

30
Q

Når man gerne vil undersøge antigener i ens prøve er paraffin ikke den rigtig embedding metode, da de høje temperaturer gør at nogle antigener bliver beskadiget. Hvilken anden metode kan da bruges?

A

Fryse slidesene mde snap freeze.

31
Q

En af ulemperne ved snap freeze er at der kan dannes artefakter, når vævet føres ned i det flydende nitrogen. Hvordan kan man undgå dette?

A

Ved at fryse vævet i isopentane

32
Q

Væv udvider sig når det fryses ned så hurtigt, som kan give problemer med skæring af stykkerne. Hvordan kan man undgå dette?

A

Vævet skal optøs ved -20 grader før man skærer det.

33
Q

Beskriv de forskellige steps, når man bruger snap freeze, som embedding metoden.

A

Vævet føres ned i flydende nitrogen i isopentane
Herefter tøes vævet op til -20 grader og overføres til en cryostat med nedkølet pincetter.
Vævet føres over til et lag af OCT embedding medium i cryostaten, hvor der tilføres mere OCT omkring vævet. Det skal være frossen før man skærer.
Vævet kan skæres

34
Q

Hvilken størrelse bør vævs sektionerne være når man skærer væv der er blevet snap freezed og embedded i OCT?

A

5-10 um

35
Q

Hvad gør man hvis vævet er vandet, for at undgå artefakter i vævet?

A

Behandle vævet med en sucrose behandling i 18 timer

36
Q

Hvornår fixere man frosne vævs stykker og hvordan fixeres de?

A

Efter skæringen med alkohol

37
Q

Hvordan behandler man prøver (knogle, brystcancer biopsier) med calcium depoter?

A

Syre blandinger som:
Hydrochloric
Nitric
EDTA