Diagnostic moléculaire Flashcards
C’est quoi la première cause identifiable de mort subite chez les jeunes
La maladie génétique cardiovasculaire
C’est quoi la médecine de précision
C’est la médecine personnalisée qui utilise des informations biologiques et des biomarqueurs.
C’est quoi la pharmacogénétique
C’est la relation et de l’influence du profil génétique d’un patient sur sa réponse aux médicaments. Le choix des médicaments (sélection et la dose) est adapté au profil génétique du patient
C’est quoi la oncogénétique
C’est les thérapies sont adaptées en fonctions des caractéristiques génétiques de la tumeur et du profil génétique du patient.
C’est quoi la cardiogénétique
C’est les caractéristiques génétiques du patient servent à guider le traitement et à dépister les membre de la famille à risque
C’est quoi un gène
C’est l’unité de base de l’hérédité qui représente 2% de notre génome
Le génome est encodé par quoi
Par les chromosomes nucléaires et mitochondriaux
Que sont les chromosomes mitochondriaux
Chromosome qui encodent 37 gènes et qui sont transmis par la mère
Qu’est ce qui arrive à l’ADN
Elle est répliqué lors de la division cellulaire par l’ADN polymérase et sert de matrice pour la transcription en ARN par l’ARN polymérase
Que fait l’ARN
Elle sert de matrice pour la traduction en protéine par le ribosome
Que font les protéines
Ils participent à de multiple fonction cellulaires
Qu’est ce que le transfert d’information permet
Elle permet l’expression du génotype dans le phénotype
C’est quoi l’épissage
L’ARN est épissé pour former l’ARN messager
Le code génétique repose sur quoi
Sa repose sur la correspondance des triplets de nucléotides sur l’ARN messager et les aa
C’est quoi un génotype
C’est l’information codée dans notre génome qui correspond à une composition et séquence génétique spécifique qui est définie par la séquence des deux allèles d’un gène
C’est quoi un phénotype
C’est la manifestation physique, clinique du génotype
C’est quoi un hétérozygote
Deux allèle différente
C’est quoi un homozygote
deux allèle pareille
C’est quoi un hémizygote
Juste un chromosome
C’est quoi la pénétrance
C’est le pourcentage d’individus ayant un génotype donné qui présentent le phénotype associé à ce génotype
C’est quoi une pénétrance incomplète
C’est quand l’individu a le génotype de la maladie, mais l’exprime pas
C’est quoi la pénétrance 100%
C’est que tous les individus qui ont le génotype on la maladie
C’est quoi l’exprésivité
C’est la mesure du niveau d’expression d’un génotype au niveau phénotypique
Comment fonctionne les maladies autosomique dominante
La maladie = un seul allèle muté et si quelqu’un est hétérozygote il est malades, mais si homozygote maladie sévère
Comment fonctionne les maladies autosomique récessive
La maladie = un deux allèle muté et si quelqu’un est hétérozygote il est porteurs, mais si homozygote malade
C’est quoi l’effet fondateur
C’est une perte de variation génétique qui est fait par un petit groupe qui fonde une nouvelle population
C’est quoi l’hérédité mitochondrial
C’est une transmission maternelle non mendélienne, qui arrive lors de la fécondation où le sperme apporte un noyau d’origine paternelle qui va fusionner avec le noyau de l’ovule, d’origine maternelle, mais le cytoplasme est que d’origine maternelle
C’est quoi l’hérédité multifactorielle
Dépend de l’érédité et de l’environnement où l’expression d’un certains nombre de caractères est multigénique et multifactorielle selon une distribution normale
Que sont les variant génétiques rares
C’est des variant qui peut développé des maladies, qui affectent une énorme ou infime partie de l’ADN, ils sont la source de maladie génétique et peut augmenter ou diminuer la fonction de la protéine encodée
Que sont lest types de variant
Variant structuraux, petite insertions ou délétions et changement de nucléotide
C’est quoi l’anomalies chromosomiques de nombres
C’est une anomalie affectant le nombre total de chromosomes présents chez un individu
C’est quoi une monosomie
C’est une aneuploïdie par défaut, donc absence d’un chromosome
C’est quoi une trisomie
C’est une aneuploïdie par excès, donc gain d’un chromosome
C’est quoi une délétions
C’est une portion de chromosome manquante ou supprimé
C’est quoi une duplication
C’est une portion de chromosome dupliquée, générant du matériel génétique supplémentaire
C’est quoi une inversion
C’est une portion du chromosome brisée, tournée tête-bêche et réattachée. le matériel génétique est inversé
C’est quoi une insertion
C’est une portion d’un chromosome supprimée d’un chromosome et insérée dans un autre chromosome
C’est quoi une translocation
C’est un échange de matériel entre 2 chromosomes non homologues après cassure sur chacun des chromosomes impliqués
C’est quoi la mutations ponctuelle faux-sens
C’est un variant qui entraîne le changement d’un codon spécifique d’un aa pour autre aa
C’est quoi la mutations ponctuelle non-sens
C’est un variant qui entraîne l’introduction d’un codon stop prématuré
C’est quoi la mutations ponctuelle synonyme
C’est un changement d’un nt qui n’entraîne pas de modifications du codon, donc ne change pas l’aa
C’est quoi la mutations ponctuelle site d’épissage
C’est un variant qui affecte les sites donneur 5’ ou accepteur 3’
C’est quoi l’épigénétique
C’est tous facteur pouvant affecter le fonctionnement des gènes sans modification du gènotype
C’est quoi le mécanisme épigénétique de la méthylation de l’ADN
C’est une méthylation des dinucléotides CpG. Associée à la répression génique
C’est quoi le mécanisme épigénétique de la modifications des histones
C’est une modification au niveau de la queue des histones. associées à la fois à la répression et l’expression des gènes
C’est quoi le mécanisme épigénétique de variants localisés au niveaux des histones
C’est un variants qui affectent des régions spécifique dans le génome. associé à une instabilité génomique
Les maladies génétique sont associés à quoi
À des variants dans certains gènes spécifiques
C’est quoi un cas-index
C’est un diagnostic clinique ou suspecté peut mener à un dépistage génétique pour une recherche de cause génétique
Qu’est ce qu’on doit faire quand il y a un résultats positif
Un dépistage en cascade dans la famille pour identifier les individus porteurs et à risque et une prise en charge clinique différentielle selon les résultats de génétique
À quoi sert la génétique médicale
diagnostic, prise en charge avec traitement préventifs, détermination risque de récurrence, dépistage en cascade et médecine préventive
C’est quoi l’analyse moléculaire
C’est une analyse qui permet d’identifier des modifications dans l’ADN des gènes associés au développement de maladies
C’est quoi l’extraction de l’ADN
C’est une méthode qui permet d’isoler l’ADN
Que sont les étapes de l’extraction de l’ADN
- Lyse de la cellule, 2. élimination des protéines, 3. éliminations des autres acides nucléiques et 4. concentrations de l’ADN
Comment est ce qu’on contrôle l’extraction
par électrophorèse sur gel d’agarose et par spectrophotométrie ou par fluorescence
C’est quoi le séquençage
C’est une méthode qui consiste à déterminer l’ordre d’‘enchaînement des nucléotides pour un fragment d’ADN donné
C’est quoi l’utilité du séquençage
C’est de déterminer la séquence de gènes individuels, de grandes régions, de chromosome ou de génomes entiers
Que sont les méthodes de séquençage les plus utilisées dans le domaine diagnostique
Le séquençage direct Sanger et le séquençage en parallèle à haut débit
C’est quoi WGS
C’est le séquençage du génome au complet
C’est quoi WES
C’est le séquençage de l’exome
C’est quoi la cardiomyopathie hypertrophique (CMH)
C’est un épaississement du muscle cardiaque, c’est la 1ère cause de mort chez les moins de 40 ans
Que cause la maladie du sarcomère cardiaque
Une perte de l’alignement des myofibrilles
Quand est ce que CMH se développe
Peut se développer à tout âge, mais particulièrement à l’adolescence et au début de l’âge adulte
C’est quoi la prévalence du CMH
1 individu sur 500 à 1 individu sur 200
C’est quoi le mode de transmission du CMH
Autosomique dominant
Qu’est ce que la CMH cause
Fatigue, essoufflement à l’effort, angine, palpitations, arythmies, étourdissements, syncopes, œdème aux jambes et mort subite
C’est quoi la maladie sarcomérique
C’est un variant pathogéniques dans les gènes qui codent pour le sarcomère cardiaque
Qu’est ce qui arrive si pour le CMH une mort subite est considérable
un défibrillateur peut être implanté de façon préventive
C’est quoi le syndrome du QT long (SQTL)
C’est une anomalie électriques sur l’électrogramme qui apparaît normalement pendant l’enfance et l’adolescence qui peut causé des risque d’arythmie ventriculaire, de syncope et d’arrêt cardiaque
C’est quoi la prévalence du SQTL
1 individu sur 3000 à 1 individu sur 2000
C’est quoi le mode de transmission du SQTL
Autosomique dominant
Que sont les présentations clinique du SQTL
Allongement du segment QT, présence de symptômes causés par des arythmies ventriculaire et anomalie électriques
C’est quoi la canalopathie
C’est un variant pathogénique dans les gènes qui codent pour les canaux potassiques et sodiques: LQT1 et LQT2/KCN = perte de fonction LQT3/ SCN = gain de fonction
Comment est ce qu’on confirme SQTL
Près de 30 % des patients ayant un SQTL ont un intervalle QT dans les valeurs de référence. La présence d’un variant causal aide au diagnostic.
Que sont les méthodes de préventions du SQTL
défibrillateur, limitation d’activité physiques, arrêt de travail et éviter médicament qui allonge QT
C’est quoi le syndrome de Marfan (SM)
C’est un désordre génétique multi systémique qui affecte le tissu conjonctif qui est caractérisé par un dysfonctionnement de la fibrine-1, glycoprotéine de la matrice extra-cellulaire, distribué de façon ubiquitaire
C’est quoi la prévalence du SM
1 individu sur 10000 à 1 individu sur 5000
C’est quoi le mode de transmission du SM
Autosomique dominant
Que sont les présentations clinique du SM
Luette bifide, subluxation du cristallin, grande taille, pectus excavatum ou carinatum, hyperlaxité ligamentaire, anévrisme de l’aorte et dissection aortique, prolapsus de la valve mitrale et pneumothorax spontanés
C’est quoi le variant de SM
C’est un variant dans le gène FBN1 qui code pour la fibrilline 1
Qu’est ce qui permet d’identifer SM
L’identification d’un variant pathogénique / probablement pathogénique signe le diagnostic du syndrome de Marfan
C’est quoi l’étalon d’or pour la génétique
Séquençage du gène FBN1
Que cause la mort subite cardiaque
Les anomalies cardiaque non-structurelles correspondent aux arythmies héréditaires et les anomalies cardiaques de structure correspondant aux maladies de la structure de la cellule musculaire cardiaque
C’est quoi la prévalence de la mort subite cardiaque
la mort subite cardiaque représente près de 15 à 20 % de tous les décès et près de 4% de ces morts sont inexpliquées
C’est quoi l’autopsie moléculaires
C’est une analyse génétique post-mortem qui permet d’identifier des modifications dans l’ADN des gènes associés à la mort subite cardiaque
C’est quoi le but de l’autopsie moléculaires
Identifier un (des) déterminants génétiques pouvant expliquer la cause
du décès et identifier les membres de la famille à risque
C’est quoi la dyslipidémies
C’est un groupe hétérogène de désordres fréquents du métabolisme du cholestérol
présentant des niveaux circulants anormaux de lipides et lipoprotéines
C’est quoi l’hypercholestérolémie familiale (HF)
C’est un désordre génétique du métabolisme des lipides associé à une élévation des concentration du cholestérol LDL (LDL-C)
Qu’est ce qu’une concentration élevée de LDL-C cause
Elle entraînent le développement prématuré de maladies cardiovasculaires athérosclérotiques (MCVAS)
C’est quoi la prévalence du HF
Hétérozygote 1/250 et homozygote 1/16000 à 1/30000
C’est quoi le mode de transmission de HF
Semi-dominant ou autosomique récessif
Que sont les présentations clinique du HF
Élévation des niveaux de LDL-C, xanthomes tendineux, au niveau des jointures, xanthélasmas et ars cornéens
Comment fonctionne la transmission autosomique récessif
hétéro = porteurs, homo = HFho
C’est quoi la particularité de HF au Québec
Effet fondateur = 1/81 à 1/250, LDLR variant majoritaire
C’est quoi l’objectif du traitement de l’HF
Abaisser le cholestérol et prévenir/repousser la survenue de MCVAS, avec une diète, statine, ezetimibe, inhibiteur de PCSK9, séquestrant d’acide biliaire et aphérèse plasmatique
C’est quoi l’hyperchylomicronémie familiale (CMF)
C’est un désordre génétique lié à une perte d’activité de la lipoprotéine lipase et l’élévation des Tg à jeun secondaire à une accumulation de lipoprotéines riches en Tg
C’est quoi le mode de transmission de CMF
Autosomique récessif
C’est quoi la prévalence du CMF
1/1000000
Que sont les présentations clinique du CMF
Élévation de Tg, xanthomes éruptifs, lipémie rétinienne, douleurs abdominales, hépatomégalie, splénomégalie et pancréatites aigues
C’est quoi la particularité de CMF au Québec
Effet fondateur = 1/10000
Que sont les traitements de la CMF
diète stricte et thérapies géniques
C’est quoi la dystrophie musculaire de Duchenne (DMD)
C’est maladie neuromusculaires qui cause une atrophie et faiblesse musculaires progressive dues à une dégénérescence progressive des muscles squelettiques, lisses et cardiaques et un défaut de la protéine dystrophine qui est exprimé dans les muscles squelettiques
C’est quoi le mode de transmission de DMD
Récessif lié à l’X
C’est quoi la prévalence du DMD
1/3500
Que sont les présentations clinique du DMD
faiblesse musculaires, signes de Gowers, déficience intellectuelle
Que sont les variants de DMD
Larges délétions dans le gène DMD, larges duplications et petites insertions/délétions ou SNPs
C’est quoi le gène DMD
C’est le plus long gène humain et présentent une grande variété de
variants
C’est quoi la fibrose kystique (FK)
C’est une maladies autosomique récessives fatales qui cause une désordre multi systémique qui affecte principalement les systèmes pulmonaire, gastrointestinal et reproductif qui est caractérisée par un dysfonctionnement du canal chlore CFTR qui provoque une augmentation de la viscosité du mucus et son accumulation dans les voies respiratoires et digestives
C’est quoi la prévalence du FK
1 sur 2000 à 3000
Que sont les présentations clinique du FK
Troubles respiratoire, production insuffisante d’enzymes digestives pancréatique, insuffisance du pancréas exocrine, méconium iléus et obstruction de l’iléus distal, maladies biliaire et infertilité
C’est quoi la base moléculaires de FK
1600 mutation du gène CFTR qu9i code pour la protéine CFTR
