déficience intellectuelle Flashcards
critère pour confirmer une DI
limitations dans 2 ou + avant 18 ans:
- communication
- habiletés sociales
- autonomie
- santé / sécurité
- utilisation ressources sociales
- apprentissage scolaire
- loisirs
- travail
% pop avec QI < 70
3%
la plupart entre 85-100 ou 100-115
prévalence DI statistique
2.3%
prévalence DI en occident
1 à 3%
impact socio-économique DI
coûts +++ pour les diagnostiques ICD-10 9
& + de 1M par individu en occident
cause des DI
50%: génétique
20%: environnementaux (alcool, anoxie, prématurité, infections)
reste: inexpliqués (génétiques non investigués)
retard global développement p/r déficience intellectuelle
global: trop jeune pour un diagnostique de DI
DI = à partir de 4-5 ans
QI d’une DI légère
55-70
QI d’une DI modérée
40-55
QI d’une DI sévère
< 40
v ou f
plus le niveau de DI est sévère, plus on a de risque de développer de l’épilepsie
v
v ou f
20% des sujets autistes ont une DI
f
plus autour de 50%
v ou f
20% des sujets autistes sont épileptiques
v
v ou f
20% des sujets avec DI sont épileptiques
v
phénotype avec une seule mutation spécifique est rare ou commun
extrêmement rare
phénotype avec un gène muté est rare ou commun
très rare
même phénotype pour 2-3 gènes différents mutés
rare
v ou f
dans des maladies communes comme le NLGN3 ou le S. de Miller, on a plusieurs gènes en cause
f
NLGN3 = extrême rare = mutation spécifique
mais maladies communes comme DI, autisme, épilepsie, schizophérine = plusieurs gènes
v ou f
maladies mitochondriales sont communes
v
v ou f
les CNV causant une DI sont majoritairement identifié au caryotype
f
5% au caryotype,
14% par hybridation génomique
la majorité des CNV qui causent la DI arrivent de novo ou sont transmises?
de novo mais peuvent être transmises
cause génétique de CNV la plus fréquente de DI
trisomie 21
2 types de contextes où on trouve des mutations ponctuelles
liées à l'X (affecte plus les gars) ou autosomique (récessive/dom)
majorité = autosomique: 250 gènes connus associés à DI
v ou f
on associe 20 gènes sur le chR X à la DI
f
100 gènes
v ou f
10% des DI sont chez les gars
v
qté de gènes associés à la DI
800
taux de mutations du génome
1 x 10^-8
nb nucléotides génome humain
6 milliards
nb de mutation de novo chez tous les individus diploïde
60 mutations de novo
exome
région codante du génome: 2% du génome
nb de mutation de novo par exome (codant)
1.2 mutations de novo par exome (non-sens ou faux-sens)
v ou f
il est rare de trouver des mutation aux sites régulateurs CpG
f
10x plus fréquent qu’ailleurs
taux de grandes variations de structure (>100kb) de novo par génération
0.01-0.02
taux de petites variations de structures (>20 bp) de novo
0.16
taux d’insertions/délétions de novo
2.94
taux de SNV de novo
60-70
nb de SNV de novo par exome
1
v ou f
les exomes mutés sont les régions les plus impliquées dans les maladies
v
gène S. de Schinzel-Gideon
SETBP1
gène trouvé avec l’aide de 4 familles qui avait la même région mutée
type de séqençage pour identifier une mutation de novo
en trio: on compare les EXOMES du cas index avec ceux de ses parents
v ou f
on trouvent généralement 2 mutations de novo par cas-index (enfant de parents sans la mutation) ayant un DI
f
fraction importante de cas DI sont causées par des mutations de novo qui ne touchent qu’un seul gène
v ou f
les mutations de novo sont la cause principale des DI qui explique 30% des cas
v
hérité lié à X ou autosomique aussi des contributeurs mais de novo = vrm plus important
3 facteurs pour distinguer une mutation de novo comme pathogénique ou bénigne
- impact sur la protéine (activité et structure)
- fonction gène touché (ecq important dans neurodev)
- fréquence mutation pop cible vs pop générale
v ou f
dans une haploinsuffisance, la protéine traduite par un allèle muté et un autre normal a des fonctions réduites
f
2 allèles mutés: amorphique
perte complète de fonctions originales de la protéine (réduction de 50 à 100% de la protéine produite)
haploinsuffisance
v ou f
dans une haploinsuffisance en contexte de dominance, si un allèle est muté et que la concentration de protéine diminue de 50%, on est porteur et non atteint
f
on est atteint, dominance = 50% ,moins de protéine affecte
mutation hypomorphique
la protéine est traduite par un allèle normal à 50% et un allèle anormal lui fait perdre ses fonctions
mutation antimorphique
dominant-négatif:
ici, la protéine mutante est antagoniste/contre la protéine d’origine.
on parle d’une protéine instable et en interaction avec une autre: ex récepteurs
souvent mutation non-sens
v ou f
une mutation dominant-négatif est moins sévère qu’une haploinsuffisance
f
1/4 des récepteurs fonctionnels, le reste non-fonctionnel comparé à haploinsuffisance où 50% chance d’être fonctionnel
mutation dans S. de marphan
dominant-négatif (antimorphique)
mutation néomorphique
gain de fonction: nouvelle activité aberrante
ex. protéine exprimée dans un tissu ectopique, elle acquis une nouvelle activité (ex être activée malgré le fait qu’il n’y a pas de ligand)
mutation ostéogénèse imparfaite type II
dominant-négatif (antimorphique)
mutation achondroplasie
gain de fontion: mutation néomorphique (mutation FGFR3)
caractères anormaux ou retardés associés à l’autisme
avant 3 ans
soit dans:
1) interactions sociales
2) langages pour communications sociales efficaces
3) jeu symbolique ou imagination (caractère restreint , répétitif ou stéréotypé comportements/intérêts/activités)
on compare quels individus d’une famille pour détecter un TSA
exomes de quatuor: on veut voir si les frères et soeurs on les mêmes mutations de novo
v ou f
les mutations qui affecte le cadre de lecture ont un impact direct sur le TSA
f
pas vrm d’effet
v ou f
+ de 25% des TSA sont attribuables à des mutations de novo
v
v ou f
les mutations CNV ont plus d’impact que les mutation faux-sens sur le développement de TSA
f
contraire
v ou f
corrélation directe entre l’âge augmenté du père et le taux de mutations de novo
v
père + âgé = + mutation de novo
pourquoi un cadet d’une famille de 4 enfants ont plus de chance d’être atteint d’une mutation de novo que son frère aîné
pcq père a vieillit entre temps
dans quel stade trouve-t-on le plus de mutation de novo
lignée germinale:
mutation germinale en mosaïque dans les gamètes (spermato ou ovule) avant la formation du zygote.
Toutes les cellules du zygote sont porteurs de la mutation
+ tôt dans le dév = + de cellules atteintes
v ou f
une mutation post-zygotique veut dire que les parents sont nécessairement atteints de mosaïcisme
f
mutation se fait dans le zygote formé, ne veut pas dire que ses parents ont la mutation en mosaïque dans leurs gamètes
risque de transmission d’une mutation de novo (lignée germinale) à un membre de la fraterie (ou dand une future grossesse)
1.3%
=> ici, si 2 enfants ont la même mutation, ça veut dire qu’un parent a une mosaïcisme germinal
pénétrance dans une CNV héritée
réduite: les parents étaient porteurs mais sans DI parce qu’ils ont pu se reproduire
une mutation ponctuelle n’était pas assez pour produire un phénotype
95% des mutations qui créé la DI chez l’enfant sont transmis par un parent sans DI: l’enfant a surement une 2e mutation
pénétrance dans une CNV de novo
grande pénétrance, on parle souvent de conditions plus sévères. pas besoin de vérifier si l’individu atteint a une 2e mutation CNV. Une seule suffisante pour DI
une seule mutation ponctuelle donne un phénotype: plus difficile de se reproduire avec une DI donc bcp plus de novo que hérité
dans une mutation à pénétrance réduite, on a besoin de quoi pour voir un phénotype, une DI
1 première mutation ex CNV héritée ou de novo
et 2e CNV de grande taille pour causer la DI
facteurs à considérer dans l’éval de la pathogénicité d’un CNV
transmission de novo ou héritée?
données empiriques
taille CNV et contenu des gènes mutés
v ou f
un CNV de novo est nécessairement pathogénique
f
tout le monde a 60 mut de novo
v ou f
un CNV hérité est toujours bénin
f
SNV qui contribue au TSA est majoritairement héritée ou de novo
transmis par parent non-atteint
facteurs qui contribuent au développement de TSA en majorité
CNV de novo
CNV hérité (moins que de novo tho)
SNV hérités
rapport homme/femme atteints de DI et autisme
4 H pour 1 F
25% plus de garçon
pourquoi les garçon sont plus susceptibles à developper une DI
+ vulnérables aux conditions liées à l’X
=> >100 gènes liés à X sont associés à la DI
=> moins tolérants que femmes
- PAS LA SEULE CAUSE
v ou f
on explique que plus d’hommes sont atteints de DI que de femmes à cause des mutations liées à l’X
f
juste 10% des cas chez les H sont liés à l’X
incidence S. X fragile
2% des H avec DI
1/6000
v ou f
on retrouve plus de femmes porteuses dans les CNV rares et de grandes tailles
v
femmes + tolérantes, il leur faut + grand ou + rare pour être affectées
pourquoi plus de CNV rares sont transmis par la mère
F + tolérante, plus protégée contre effets de CNV et donc pas tant d’impact sur leur capacité à se reproduire: transmission
v ou f
CNV de petites tailles hérités viennent à 75% de la mère
f
50 mère
50 père
grande taille de la mère
les variations à pénétrance réduite sont plus sensibles au sexe/genre.
