Cours 9 Flashcards
Pourquoi les recepteurs InsulinR et EGFR sont beaucoup etudiés?
Car ils jouent un role dans le cancer
Quelle est la structure d’un RTK (recepteur tyrosine kinase)?
1 seul passage transmembranaire, agit en dimere
Quelles sont les 3 segment d’un recepteur?
- N-terminal (grande diversité)
- Transmembranaire (sequence d’a.a hydrophobes —> sert a ancrer la prot. dans la memb.)
- C-terminal : domaine kinase peut etre separé en 2 classes : —> domaine kinase continue
—> domaine kinase séparé par sequences d’a.a
Quelles sont les caractéristiques du recepteur EGF?
- 4 recepteurs (EGFR, ErbB2, ErbB3, ErbB4)
- 11 ligands
- ErbB2 : pas de ligand
-Possibilité d’hétéro ou homodimerisation sauf pour ErbB2 et 3 (ne fonctionne qu’en heterodimere (pas possibilité d’etre homodimere))
Expliquez le processus de formation de dimeres chez EGFR
En absence de ligand (ex: EGF), le recepteur est monomerique, lorsque le ligand se lie —> changement conformationnel qui pousse le recepteur à se lier a un autre recepteur pour former un dimere (pas le ligand qui induit la dimerisation, points de contact entre recepteurs (bras de dimerisation))
Vrai/faux :tout travail en complementarité dans les EGFR et un motif present en N-terminal est important pour la phosphorylation induite par EGF
vrai
Comment la dimerisation de la partie intracellulaire fonctionne-t-elle?
Dimerisation asymetrique des domaines cellulaires, la partie amino-terminale d’un recepteur interagit avec la partie carboxyle terminale d’un autre recepteur (interaction dynamique —> 2 monomeres seront phosphorylés)
Comment inhiber la fonction des RTK?
- En utilisant des bloqueurs qui vont empecher la liaison du ligand —> donc empeche l croissance (AC meilleurs bloqueurs : bloque le site extracellulaire qui interagit avec ligand)
- En utilisant des inhibiteurs qui vont bloquer l’activité tyrosine kinase du recepteur
Quelles sont les differences entre RCPG et TRK?
RCPG: - 7 passages TM
- aucune activité enzymatique intrinseque (facteur echange pour proteine G)
- Dimerisation homo-hetero possible, mais non-essentielle
- liaison du ligand peut induire de multiples conformations 3D
TRK: - 1 passage TM
- Activité tyrosine kinase
- dimerisation obligatoire
- liaison ligand stabilise une conformation qui permet aux domaines intracellulaires de se phosphoryler
Quel est le mecanisme de signalisation du RTK?
- ligand arrive
- changement conformation
- dimerisation
- phosphorylation
- recrutement proteines adaptatrices
- assemblage de complexes de signalisation
- activation des effecteurs
Les RTK activés forment des complexes avec quels domaines? quelle est la difference majeure entre ces deux domaines? Quelles liaisons en decoulent?
- PTB et/ou SH2
- PTB peut se lier a la tyrosine phosphorylée ou non mais SH2 doit se lier a la tyrosine phosphorylée seulement
- PTB et SH2 se lie à PH qui se lie au differents phopshoinositides membranaires (mene a leur recrutement aux membranes) —> SH3 et WW se lie a des sequences riches en Proline —> Domaine PDZ se lie aux residus hydrophobes au c-terminal de proteinsc cible —> FYVE se lie au Phosphotydil inositol 3- phosphate
Comment les proteines adaptatrices font-elles pour interagir avec les recepteurs activés?
Elles ont des domaines d’interaction proteine-proteine pour transmettre le signal
Vrai/faux : étant donné que les domaines PH sont formés de differents a.a, la structure peut varier d’un a l’autre
Faux : meme si differents a.a, la structure reste la meme
uelles sont les 4 classes d’interaction PDZ?
- Reconnaissance de domaines C-term dans les peptides
- Reconnaissance de motifs internes dans les peptides
- Dimerisation PDZ-PDZ
- Reconnaissance de lipides
Quel domaine est le plus rencontré?
PDZ
Quels sont les 3 genes de Ras?
H-Ras, N-Ras, K-Ras
Quel est le processus de l’activation de la voie MAPK?
- Recrutement proteines adaptatrices : Shc et/ou Grb2 —> recrutement SOS
- Activation des Ras (GDP—>GTP)
- Activation des MAPKs
Quelles sont les 4 differentes voies de signalisation pouvant etre activée par EGFR?
- MAPK
- PI3K (proliferation cell.)
- PLC-gamma
- STAT (reponse cell., reponse cytokines)
Quel est la fonction de Grb2? Le role?
- Proteine adaptatrice qui sert a lier des proteines de signalisation au recepteur activé
- Développement, differentiation et proliferation
Que se passe-t-il si on enleve Grb2 (Grb2-KO)?
Mort embryonnaire rapide
Quelle est la fonction de Ras?
Proteine G monomerique ou GTPase
Vrai/faux: Ras est l’oncogene le plus retrouvé dans les cancers
vrai
A quoi sert GEF dans le cycle du GTP pour l’activation de Ras? Le role de GAP?
- Il se lie à Ras inactive et change le GDP pour un GTP —> la rend active
- GAP active la GTPase —> rend Ras inactive
Quels sont les roles de la voie PI3K?
- proliferation
- differenciation
- motilité
- trafic intracellulaire
Combien y a-t-il de classes de PI3K? Quelles sont les particularités de la classe II et III?
- 3 classes
- Classe II : unités catalytiques seulement
- Classe III : unités catalytique et regulatrice
Qu’est-ce que l’Akt? Combien y a-t-il d’isoformes d’Akt? Qu’est-ce qui influence la presence d’un isoforme plutot qu’un autre? Dans quelle voie de signalisation est-elle impliquée?
- Aussi connue sous le nom proteine kinase B (PKB)
- Serine/threonine kinase
- 3 isoformes: peuvent differer selon la conformation ou le site de liaison qui est phosphorylé
- Impliquée dans voies de signalisation de PI3K menant au processus anabolique
Quelle est le processus d’activation de la phospholipase C?
- Recrutement PLC-gamma
- Transformation des lipides membranaires
- Signalisation PKC et Ca2+-dependante
Combien d’isoformes de PLC y a-t-il chez l’humain?
2 —> PLCg1 et PLCg2
Pourquoi la PLCg peut etre activée par des RTK?
car elle possede 2 domaines SH2 et un domaine SH3 localisés entre un domaine PH divisé
Comment se fait l’endocytose des RTK?
- une vesicule de clathrine se forme
- amene le recepteur a endosome immature —> enleve le ligand et dephosphoryle
- Fast recycling ou slow recycling et retour a la surface
Qu’est-ce que Eps15?
Une proteine adaptatrice importante pour « regulating intracellular trafficking »
Qu’est-ce qui cause le developpement d’une resistance au inhibiteurs des RTK?
La surexpression d’Axl (atteint les memes effecteurs que RTK donc compense pour RTK pas fonctionnel et proliferation cancer continue)
Qu’est-ce que JAK et STAT?
- JAK est une tyrosine kinase qui necessite une dimerisation heterologue
- STAT sont des facteurs de transcriptions cytosoliques qui doivent etre phosphorylé pour entrer dans le noyau
Quelle est le processus de la voie d’activation JAK/STAT?
- Mesure du niveau de phosphorylation de STAT
- Dimerisation des STAT
- Translocation nucleaire
Vrai/faux: il est maintenant possible avec les differentes technologies de bloquer une seule voie de signalisation avec un bloqueur
Faux: il n’est que possible de bloquer un recepteur generique, qui bloquera donc toutes les voies de signalisations qui en decoulent
Quelle est la structure des recepteurs tyrosine phosphatase (RTP)?
- Differe principalement dans la partie extracell.
- Partie intracell. contient deux domaines : domaine proximal (activité enzymatique) et domaine distal (essentiel pour activité, spécificité, stabilité et interactions prot-prot)
Quelle est la majeure difference entre RTK et RTP?
RTK phosphoryle tandis que RTP dephosphoryle des proteines intracellulaires
Comment fonctionne l’activation des recepteurs de type TGFβ (serine/threonine kinase)
- Dimerisation et recrutement d’un 2e type de recepteur
- TGF-β se lie au recep. de type II qui recrute et phosphoryle les recep. de type I
- Recep. I phosphoryle effecteurs (Smads (facteurs de transcription))
- Smads forment un complexe avec Smad 4 pour transloquer au noyau
** certains Smad ont un effet negatif et recrutent E3 ubiquitine ligase
Comment fonctionne les recepteurs de type ANP (ANF) (guanylyl cyclase)?
- NPR-C est un recepteur de clearance, qui ne possede pas d’activité enzymatique : lie ANP, BNP et CNP
- NPR-A : lie ANP et BNP
- NPR-B : lie CNP
**- NPR-A et B sont phosphorylés de facon maximale a l’etat basale et forment des oligomeres (2,3,4)
- liaison du ligand produit une dephosphorylation de ces recepteurs et une augmentation du GMPc
- GMPc controle activation de canaux ioniques, PKG, phosphodiesterases et AMPc
Qu’est-ce que la PKG?
- Proteine kinase G
- Ser/thr kinase
- 2 types : PKG-I (alpha et beta), PKG-II
- homodimeres
Qu’est-ce que PDE?
- enzymes qui degradent le lien phosphodiester
- 11 types (PDE1 à 11) (AMPc et GMPc)
- PDE5 : GMPc selective
Quels sont les 3 recepteurs a activité enzymatique intrinseques autres que RTK?
- Recepteurs tyrosine phosphatase
- Ser/thr kinase
- Guanylyl cyclase
Quelles sont les ressemblances/differences entre RCPG et les recepteurs activité enzymatique?
- Mode d’activation pareil : changement conformationnel induit pas la liaison d’un ligand
- Effet de l’activation : —> RCPG : Activation de proteins G et productions de seconds messagers
—> R activité enzymatique : transphosphorylation du recepteur et recrutement de proteines adaptatrices et de signalisation - Controle du signal : —> RCPG : desensibilisation et internalisation
—> R act. enzy. : Dephosphorylation et internalisation
Comment sont activés les recepteurs nucleaires?
par des hormones lipophiles (capables de diffuser d’une source et penetrer une cible)
Qu’est-ce qui permet aux recepteurs nucleaires de se lier a l’ADN directement?
La presence du domaine de liaison a l’ADN (DBD), qui contient 2 motifs de type « ZN finger »
Qu’est-ce qu’incluent les recepteurs nucleaires? Cb y en a-t-il chez l’humain?
- 48 chez humain
- incluent : —> recepteurs nucleaire hormonaux (NHR) et orphelins
—> recepteurs cytosoliques en complexe avec un inhibiteur
—> recepteurs nucleaires associés a l’ADN
Quelle est la structure d’un recepteur nucleaire?
- domaine de liaison a l’ADN (DBD)
- Domaine de liaison du ligand (LBD)
**homo ou heterodimeres
Quels roles ont les co-regulateurs des recepteurs nucleaires?
- Supportent l’activité du nucleosome
- Fonctionnent pour former un complexe transcriptionnel actif avec la polymerase
Quels roles ont les co-activateurs des recepteurs nucleaires?
- promouvoir activité transcriptionnelle
- controlent les differentes etapes du processus de transcription
- s’assemblent a un complexe de haut poids moleculaire
- Employés pour la transcription de plusieurs genes puisque c’est le recepteur qui est responsable de la specificité
**ne se lient pas a l’ADN
Quels sont les 4 types de recepteurs nucleaires?
1- recepteur nucleaire endocrine (homodimere), presents dans le cytoplasme
2- RXR partner: principalement dans le noyau, si pas de ligand souvent en complexe avec des co-represseurs (forme homo ou heterodimere)
3- Recepteur nucleaire orphelin dimere (liaison de l’agoniste resulte en formation dimere homo souvent et hetero possible aussi)
4- recepteur nucleaire orphelin monomere
Vrai/faux : RXR doit toujours lier son ligand
Faux : parfois il peut lier seulement l’autre recepteur avec qu’il est en dimere (recepteur agit comme modulateur allosterique)
Nommez un exemple pour les recepteurs nucleaire de classe I et 2
- Classe 1 : recepteurs des oestrogenes
- Classe 2 : VDR —> recepteur de la vit. D
Quelles sont les deux possibilités de signalisation cellulaire? nommez un exemple de chaque
- Divergence des signaux (1 signal pour plusieurs effecteurs) (ex: migration cellulaire)
- Convergence des signaux (plusieurs stimuli pour une reponse) (ex: contractilité cardiaque, augmentation calcium)
