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BIOLOGÍA > Control de la expresión génica, transcripción y el transcrito 1rio > Flashcards

Control de la expresión génica, transcripción y el transcrito 1rio Flashcards

1
Q

Diferenciacion celular

A

Expresion y represion de genes, y para controlar esto se requiere del control de la expresion genica

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2
Q

La diferenciacion celular se puede realizar de dos formas:

A
  • REPROGRAMACION

- CLONACION

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3
Q

Como se realiza o que características tiene la reprogramación celular

A

Consiste en pasar un tipo celular————–> a otro tipo celular ( forzarle la expresión de genes suprimidos)
Puede ser:
* TRANSDIFERENCIACION
celula adulta————> otra celula adulta
Fibroblasto—————> miocito ( por la expresion del gen que codifica el factor de transcripcion MYOD)
que es un factor de control maestro

*DESDIFERENCIACION
Celula adulta—–> Celula madre pluripotencialmente inducida (IPS)
Se fuerza la expresion de los genes de los factores de transcripcion: OCT 4, SOX2, MYC y KIF4

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4
Q

Como se realiza o que características tiene la Clonacion

A

Generar un organismo GENETICAMENTE identico.
1° Se extrae el nucleo de una celula del organismo que se desea clonar.
2° se extrae un ovocito ‘‘ovulo’’ de un organismo adulto y se le quita el nucleo (enucleado)
3° se Inserta el nucleo del que quiero clonar en el ovocito que no tiene nucleo
4° tengo el cigoto clon

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5
Q

Que es un factor de control maestro

A

Cuando se requiere de 1 SOLO factor de transcripcion para poder modificar totalmente el fenotipo de un organismo

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6
Q

Que son los métodos de estudio de la actividad Génica

A

Sirven para estudiar QUÉ genes estan activos o inactivos y QUÉ factores de transcripcion lo regulan

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7
Q

Cuales son los métodos de estudio de la actividad Genica

A
  • Micromatrices de DNA (Chip.ADn)

- Inmunoprecipitacion de cromatina (CHIP-CHIP-)

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8
Q

Micromatrices de ADN

A

Comparar la actividad génica de 1 o + TIPOS CELULARES DIFERENTES.

  1. Prep. de la matriz :
    - se extraen los genes de un genoma
    - se almacenan los genes en los ‘‘pozos’’
    - se transfieren los genes por separado al portaobjeto
  2. Prep. de la muestra:
    - Se extraen todos los mRNA ( mediante transcripción inversa)
    - se generan copias de ADN o cDNA marcados con fluorocromos.
  3. Hibridacion:
    - La matriz (chip) se sumerge en una solucion salina caliente que contiene los cDNA, y estos se hibridan con los genes que tienen las secuencias complementarias.
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9
Q

Colores de las micromatrices

A

Sin color: Genes inactivos en ambas celulas
Amarillo: Genes activos en ambas celulas
Verde: activo en una celula
rojo: Activo en la otra celula

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10
Q

Inmunoprecipitación de Cromatina (chip-chip)

A

Para Reconocer la secuencia de ADN a las que se unen los FACTORES DE TRANSCRIPCION

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11
Q

Inmunoprecipitación de Cromatina (chip-chip). Pasos

A
  1. Preparacion de la matriz:
    - se extraen las SECUENCIAS INTERGENICAS( incluyen promotores y reguladores) de un genoma
    - se colocan en pozos y se transfieren un portaobjeto de vidrio
  2. Reparacion de la muestra:
    - Se deja que los Fact. de transcripcion se unan normalmente
    - Se digiere el ADN donde No esta el Fact. de Trans. por una DNAasa
    - se exponen los pequeños fragmentos a anticuerpos especificos para los FdeT
    - Se eliminan el anticuerpo + y el factor
    - Me sale el ADN donde se unen.
  3. Hibridacion
    - Se sumerge la matriz en una solucion salina caliente que contiene el cDNA.
    - Se hibrida con las secuencias complementarias
    - se extrae y se mira con el MO de fluorescencia
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12
Q

El control de la expresión génica se produce en 4 niveles, los cuales son…

A
  • Control a nivel de la transcripción del gen
  • Control a nivel del proc. del transcrito 1rio
  • Control a nivel de la traducción
  • Control a nivel post-traduccional
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13
Q

Control a nivel de la transcripción del gen

A

MÁS IMPORTANTE
—- Depende de proteínas llamadas FACTORES DE TRANSCRIPCION——-
Y se agrupan en 3 grupos:
promotores proximales, promotores distales y potenciadores

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14
Q

——————Secuencias Génicas——————

A

PROMOTORES PROXIMALES

  • entre +1 y -150
  • ej: caja TATA(prom. central) (-32 y -24)—-> TFIID
    caja GC -100———–> Sp-1
    caja CAAT -110——–> NF-1

PROMOTORES DISTALES (REGULADORES)

  • entre -150 y -400
  • ej: caja GRE——> factor Gr
    caja TRE———–> Factor TR
    caja IRE————> factor IR

POTENCIADORES (reguladores)
se hallan a miles de p de b

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15
Q

Factores de Transcripción

A

Proteinas que poseen dominios llamados motivos de union a ADN.

  • Poseen helices alfa lectoras (del surco mayor) (ricas en aa y carga +)
  • Forma interacciones con los p de b nitrogenados
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16
Q

Los motivos de union de un factor de transcripcion a ADN pueden ser:

A
  • DEDOS DE ZN
  • en el GTF llamado TFIIA
  • 2 laminas beta y 1 helice alfa
  • His y Cys + Zn
  • HELICE-ASA-HELICE (HLH)
  • en el STF llamado MYC
  • se disponen como homo o heterodimeros.
  • CREMALLERA DE LEUCINA (LEU-ZIP)
  • STF llamado AP-1
  • 2 helices alfa y bZip llamadas FOS Y JUN
  • 1 Leu cada 2 vueltas (7,2 nm)
17
Q

Los factores de Transcripción se clasifican en dos grandes grupos que son…

A
  • Generales (GTF) ——–> prom proximales

- Especificos (STF)———>prom. distales y potenciadores ( reguladores)

18
Q

Tipos de GTF

A
  • De mRNA:
    Nf1, Sp-1, TFII A,B,D,E,F,H
  • De rRNA 45s:
    SL-1
  • De rRNA 5s y tRNA:
    TFIII A,B,C.
19
Q

Tipos de STF

A

ACTIVADORES

favorecen la transcripción
ej, GR (F. de resp. a glucocorticoide)
TR (F. de resp. a hormona tiroidea)
IR (F. de resp. a insulina)

REPRESORES

impiden la transcripción
ej: XIST RNA (INC)

20
Q

Como actuan los STF activadores

A

Reclutan y activan a co activadores

  • los que activan a la RNA polim (factores de elongación o los TAF). :)
  • los que modifican histonas( hacen PTM a las colas de histonas, ej HAT Cpb, HMT set 1 set 2) =D
  • Remodelan la cromatina (SWI/SNF :D) alteran la relacion entre el ADN y el octamero histonico, exponen la caja tata, etc.
21
Q

Como actuan los STF represores

A

Activan otra co represores

  • que pausan a la RNA polim: DISF Y NELF
  • que modifican histonas: HDAX (sin3) , HDMT(Lsd-1), SOUV39H1
  • que metilan ADN: caja GC provocan el silenciamiento del gen ej. DNMT-1
22
Q

Impronta Genomica

A

En mamiferos, 80 LOCI son silenciados por metilacion del ADN. este patron de silenciacion depende del ORGEN PARENTAL que recibe este nombre,

Gracias a la impronta la celula sabe cual cromosoma fue dado por la madre o el padre y le permite detectar anomalias

23
Q

Síndrome de Prader-willy

A
  • PAR 15
  • Existe solo el alelo materno
  • el paterno esta a la mitad
  • obesidad, hambre insaciable, facilidad para llorar
24
Q

Síndrome de Angelman

A
  • PAR 15
  • Existe solo el alelo paterno
  • delgadez extrema, risa incontrolable
25
Q

El control a nivel de procesamiento del Transcrito primario

A

se utilizan 2 mecanismos

  • cortes y empalmes alternativos
  • Edición el mRNA
26
Q

Cortes y empalmes alternativos

A

Ocurre cuando al pasar del pre mRNA al mRNA maduro, se excluyen exones o se incluyen intrones, dando lugar a dif tipos de mRNA Maduros.

el proceso depende de_

  • PROTEINAS SR (Ser y Arg):
  • ESE (poten. exonico de emplame)
  • ISE (poten.intronico de empalme)
  • PROTEINAS HNRNP ( se unen a secuencias)
  • ESS ( silenciador Exonico)
  • ISS (silenciador intronico)
27
Q

Proceso de los cortes y empalmes alternativos

A

1° Los SR (ESE e ISE) reconocen los extremos de un intron y exon e impulsan su eliminacion. Le orienta al empalmosoma

2° Los hnRNP (ESS e ISS) pueden ocultar esos extremos permitiendo que sean incluidos en el mRNA maduro

28
Q

Edición del mRNA

A

la info contenida en el mRNA es editada por enzimas despuees de la transcripcion (post- transcripcional)

ADENOSINA———>(enzima)———> INOSINA (G)
CITOSINA————->(enzima)——–> URIDINA (u)

( en el ADN es mutacion, pero en ARN es edición)

29
Q

Inosina

A

Nucleotido

Hipoxantina + ribosa

30
Q

n =

A

23 cromosomas

31
Q

c=

A

23 cromatides

32
Q

por cada cromatide tengo

A

1 DNA

33
Q

Cremallera de Leu

A

STF

AP1 FOS Y JUN

34
Q

HELICE ALFA HELICE

A

STF

MYC

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