Club de lecture - biopsie liquide - OM Flashcards
Nommer trois indications de la biopsie liquide.
- Dépistage oncologique
- Recherche de mutations pour guider les traitements
- Suivi (réponse au traitement ou résistances)
- Indices pronostics
Nommer trois types de matériel cellulaire pouvant être analysées avec une biopsie liquide.
- ADN (ADN circulant (Cell-free DNA ou cfDNA) et ADN tumoral (CelltumorDNA ou ctDNA))
- Cellules tumorales circulantes et intactes (CTCs)
- ARN tumoral
- Plaquettes «éduquées» (ARN)
- Vésicules extra-cellulaires(ADN ou ARN)
Nommer trois méthodes pour détecter le matériel tumoral dans une biopsie liquide.
ddPCR
qPCR
BEAMing
Fractionnement des cellules tumorales
RNA-Seq
Quels sont les quatre principaux types de prélèvements biologiques pouvant servir de biopsie liquide ?
Urine
Sang
Salive
Selles
Quels sont les deux types d’ADN pouvant être analysés dans un contexte de biopsie liquide ?
ADN circulant (Cell-free DNA)
ADN tumoral (Cell tumor DNA)
Expliquer qu’est-ce qu’une plaquette activée ?
Il s’agit d’une plaquette ayant transité dans le micro-environnement tumoral et pouvant exprimer des caractéristiques moléculaires distinctes et un profil mutationel semblable à celui de la tumeur.
Nommer deux avantages de la biopsie liquide ?
- Absence de l’effet de l’hétérogénéité tumoral
- Technique moins invasive
- Peu être répété dans le temps
- Parfois plus sensible que l’imagerie
Nommer trois désavantages de la biopsie liquide ?
- Absence de spécificité de certaines mutations
- Faible sensibilité analytique
- Ne peut déterminer les sous-types histologiques ou autres critères histopronostic reconnu acutellement
- Coûts faramineux d’implantation de certaines plate-formes en biologie moléculaire
Nommer les quatre organes (et l’altération(s) moléculaire(s) associée(s)) ayant actuellement des tests de biopsie liquide cliniquement approuvés par la FDA.
- Ovaire (mutations BRCA1, BRCA2)
- Poumon (Réarragement ALK pour CPNPC)
- Sein (mutation PIK3CA)
- Prostate (mutations BRCA1, BRCA2 et ATM)
Quelle est l’entrave la plus importante à l’implantation des biopsies liquides pour des fins de dépistage dans le cancer du sein ?
La présence d’un système de dépistage radiologique universel efficace.
Ne pas oublier qu’il est pour l’instant impossible de traiter les femmes avec un diagnostic plus précoce (infra-clinique et radiologique), car il est impossible de retrouver le site tumoral…
Dans quelle population la sensibilité des biopsies liquides pour des fins de dépistage est-elle trop basse.
Toutes les patientes avec des stades précoces (St. I ou II)
En dosant l’ADN tumoral, que peut-on faire pour augmenter la spécificité des mutations recherchées dans la recherche de l’origine d’une tumeur lors d’un dépistage ?
Utilisation d’un panel de plusieurs gènes
Quelles sont les deux paramètres pouvant être utilisés pour isoler les cellules tumorales circulantes ?
Taille cellulaire
Profil immunohistochimique (EpCAM, CD45 et CK)
Nommer deux avantages du dosage des cellules tumorales circulantes lors du suivi post chirurgical ?
- Détection plus précoce des récidives qu’en utilisant les techniques d’imagerie actuelles
- Facteur pronostic indépendant additionel (p/r à l’imagerie) en évaluant l’évolution des taux de CTCs dans le temps.
Quelle altération moléculaire indiquant une résistance à l’hormonothérapie est recherchée par biopsie liquide dans le cancer du sein ?
Mutation du gène ESR1 (codant les récepteurs à l’estrogène alpha)
Quelle altération moléculaire indiquant une une réponse complète aux traitement néo-adjuvant dans le cancer du sein ?
Méthylation du gène RASSF1
Quel est la faiblesse technique de la littérature sur l’usage des biopsies liquides dans le cancer du sein ?
La trop grande variabilité des techniques et des protocoles utilisés.
Nommer deux populations chez qui la biopsie liquide pourrait s’avérer intéressante dans le futur.
Patients trop instables ou sites peu accessibles pour une biopsie
Patients avec primo-diagnostic pour guider la prise en charge thérapeutique (thérapie ciblée)
Suivi des patientes après la chirurgie (absence de matériel supplémentaire à prélever)
Patientes avec métastases multiples (permet de détecter des mutations sans prélever chaque métastase et diminuer l’effet de l’hétérogénéité tumorale)
Définir plaquette éduquée
plaquette qui a intégré de l’ARN tumoral en circulation, ce qui protège ce matériel de la dégradation, et qui potentiellement facilite le potentiel métastatique