Club de lecture - biopsie liquide - OM Flashcards
Nommer trois indications de la biopsie liquide.
- Dépistage oncologique
- Recherche de mutations pour guider les traitements
- Suivi (réponse au traitement ou résistances)
- Indices pronostics
Nommer trois types de matériel cellulaire pouvant être analysées avec une biopsie liquide.
- ADN (ADN circulant (Cell-free DNA ou cfDNA) et ADN tumoral (CelltumorDNA ou ctDNA))
- Cellules tumorales circulantes et intactes (CTCs)
- ARN tumoral
- Plaquettes «éduquées» (ARN)
- Vésicules extra-cellulaires(ADN ou ARN)
Nommer trois méthodes pour détecter le matériel tumoral dans une biopsie liquide.
ddPCR
qPCR
BEAMing
Fractionnement des cellules tumorales
RNA-Seq
Quels sont les quatre principaux types de prélèvements biologiques pouvant servir de biopsie liquide ?
Urine
Sang
Salive
Selles
Quels sont les deux types d’ADN pouvant être analysés dans un contexte de biopsie liquide ?
ADN circulant (Cell-free DNA)
ADN tumoral (Cell tumor DNA)
Expliquer qu’est-ce qu’une plaquette activée ?
Il s’agit d’une plaquette ayant transité dans le micro-environnement tumoral et pouvant exprimer des caractéristiques moléculaires distinctes et un profil mutationel semblable à celui de la tumeur.
Nommer deux avantages de la biopsie liquide ?
- Absence de l’effet de l’hétérogénéité tumoral
- Technique moins invasive
- Peu être répété dans le temps
- Parfois plus sensible que l’imagerie
Nommer trois désavantages de la biopsie liquide ?
- Absence de spécificité de certaines mutations
- Faible sensibilité analytique
- Ne peut déterminer les sous-types histologiques ou autres critères histopronostic reconnu acutellement
- Coûts faramineux d’implantation de certaines plate-formes en biologie moléculaire
Nommer les quatre organes (et l’altération(s) moléculaire(s) associée(s)) ayant actuellement des tests de biopsie liquide cliniquement approuvés par la FDA.
- Ovaire (mutations BRCA1, BRCA2)
- Poumon (Réarragement ALK pour CPNPC)
- Sein (mutation PIK3CA)
- Prostate (mutations BRCA1, BRCA2 et ATM)
Quelle est l’entrave la plus importante à l’implantation des biopsies liquides pour des fins de dépistage dans le cancer du sein ?
La présence d’un système de dépistage radiologique universel efficace.
Ne pas oublier qu’il est pour l’instant impossible de traiter les femmes avec un diagnostic plus précoce (infra-clinique et radiologique), car il est impossible de retrouver le site tumoral…
Dans quelle population la sensibilité des biopsies liquides pour des fins de dépistage est-elle trop basse.
Toutes les patientes avec des stades précoces (St. I ou II)
En dosant l’ADN tumoral, que peut-on faire pour augmenter la spécificité des mutations recherchées dans la recherche de l’origine d’une tumeur lors d’un dépistage ?
Utilisation d’un panel de plusieurs gènes
Quelles sont les deux paramètres pouvant être utilisés pour isoler les cellules tumorales circulantes ?
Taille cellulaire
Profil immunohistochimique (EpCAM, CD45 et CK)
Nommer deux avantages du dosage des cellules tumorales circulantes lors du suivi post chirurgical ?
- Détection plus précoce des récidives qu’en utilisant les techniques d’imagerie actuelles
- Facteur pronostic indépendant additionel (p/r à l’imagerie) en évaluant l’évolution des taux de CTCs dans le temps.
Quelle altération moléculaire indiquant une résistance à l’hormonothérapie est recherchée par biopsie liquide dans le cancer du sein ?
Mutation du gène ESR1 (codant les récepteurs à l’estrogène alpha)