Clase 6 B Flashcards
Operon triptofano
Regula la síntesis de este aminoácido esencial para la producción de proteínas
Que posee el operon triptofano
Promotor: fija la ARN polimerasa
Operador: se fija un represor
5 genes estructurales: cada uno codifica una subunidad enzimatica
trpD
trpE
trpC
trpB
trpA
Que pasa cuando hay suficiente triptofano en el operon triptofano
Triptofano funciona como efector alosterico, se une a la proteina represora activandola. Luego esta va al operador a REPRIMIR
Que pasa en ausencia de triptofano en el operon triptofano
Represor pierde la afinidad por el sitio operador
Islas de patogenicidad
Segmentos de ADN en el cromosoma que difieren entre cepas estrechamente relacionadas
Como se diferencian las islas de patogenicidad
Diferencia contenido de G-C
Bacterias tienen aprox contenido de 45-50 G-C
Hay mucho contenido de virulencia dentro de estas islas
Que presentan las islas de patogenicidad
Integrasas
Transposasas
Regiones de repeticion
Factores de virulencia en una isla de patogenicidad
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Factores de adherencia
Toxinas
Captacion de hierro celular
Invasinas y modulinas
Proteinas de secrecion tipo 3 y 4
Permite comparar la patogenicidad de las bacterias de un mismo genero y con eso predecir: islas de patogenicidad, islas de resistencia e islas metabolicas
Software GIPSY:
- Desvio en el contenido GC.
- Desvio en el uso de codones.
- Factores de virulencia y genes de resistencia.
- Presencia de transposasas y tRNAs.
El programa reconoce todo esto y te da las posibles regiones de donde podria estar ubicada la isla de patogenicidad en el genoma o incluso otras islas que se mencionaron.
Reglas para cumplir transformacion:
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- Que la membrana plasmática de la bacteria y la pared celular esté inestable y llena de poros.
- Que la bacteria esté replicando su material genético, es decir en pleno crecimiento (célula competente)
Resalta la importancia de la genómica comparativa, la cual ha abierto las puertas a un campo muy interesante: ________
Estudios pangenómicos
Core Genoma o Genoma Central:
Son los genes que todas las especies o todos los individuos de una misma especie comparten, funcionando como la huella genética distintiva (la huella de una especie)
Genoma Variable o Genes Accesorios:
Se refiere a la parte del genoma compartida entre dos o más individuos, pero que no está presente en todos
Genes Especie Específico o Género Específico:
Estos genes se encuentran únicamente en una cepa de una determinada especie o en una especie de un determinado género, diferenciando de manera única a esos grupos
Tipos de estudios pangenomicos
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Genoma central
Genoma variable
Genero especifico
Tipos de pangenoma
Abierto
Cerrado
Pangenoma abierto
Cada vez que se secuencia un nuevo individuo, ya sea de una misma especie o de especies distintas dentro de un mismo género, se descubren nuevos genes
Pangenoma Cerrado
En este caso, con la secuenciación de un número limitado de genomas (por ejemplo, 3, 4, 5 o 10), se alcanza el repertorio completo de genes que representa a esos individuos
Que significa tener mas ARNr
Cuanto más ARNr, más capacidad de replicación y división
Pseudogenes
Genes con codones de término al interior del mismo gen. Claramente es un gen mutado y si fuese a sintetizar una proteína, esta sería una proteína truncada y sin función
¿Cómo se puede observar que una bacteria está cambiando a un estilo de vida más específico?
Se debe realizar un estudio de secuenciación de ADN (16s)
Luego realizar un estudio comparativo con el GENOMA CENTRAL o con genomas de otras bacterias del mismo género que tengan estilos de vida libre, para corroborar que haya una pérdida de genes.
