Clase 5 C

Question 1

Contenido C+G
Para que sirve

Answer 1

Proporcion de guanina y citosina en una secuencia de ARN y ADN
Calcular temperaturas para el PCR

Question 2

Variación GC

Answer 2

Mayor a 5, probablemente especies diferentes
Mayor a 10 probablemente generos diferentes

Question 3

Contenido G+C es taxonomía …

Answer 3

Taxonomia molecular

Question 4

Hibridación de ácidos nucleicos

Answer 4

Se separan las hebras de genomas distintos y se unen para ver el porcentaje de unión
Mas alto el porcentaje de hibridación mas cercanas son

Question 5

Porcentaje de hibridación para considerarlo misma especie

Answer 5

Mayor a 70 porciento

Question 6

Analisis filogenéticos

Answer 6

Hipótesis acerca de las relaciones evolutivas y determinan relaciones de parentesco

Comparación de secuencias de ADN o ARN. En este caso es ARN ribosomal

Question 7

Que genes escoger para filogenia

Answer 7

1 No influenciado por transferencia horizontal de género
2 Distribución universal, por eso se eligio ARN ribosomal
3 Función homologa en todos los MO
4 Cantidad de info suficiente
5 Tamaño adecuado
6 Copia unica en el genoma, si hay mas copias piede haber variabilidad
7 Se utilizan basados en el ADN ribosomal 16S y genes de proteinas esenciales como 23S y 5S

Question 8

Genes utilizados para la secuenciación bacteriana

Answer 8

ADN ribosomal
16S de la subunidad menor
23S y 5S, genes que codifican para proteinas de la subunidad mayor

Question 9

Tecnica de secuenciación para genes pequeños

Answer 9

Tecnica de Sanger

Question 10

Amplificacion y marcado, tecnica de secuenciación

Answer 10

1 Generan PCRs de diferentes tamaño
2 En cada PCR se marca un nucleotido. Cada marcador determina el punto final de cadena
3 Separan y detectan fragmentos, los framentos mas cortos bajan primero, laser detecta esos fragmentos y a medida que se suman los marcadores de los fragmentos de mayor longitud se forma la secuencia. Secuencia registra estos picos de diferentes colores que seran nucleotidos distintos
4 Interpreta la secuencia

Question 11

Cuando recurrir a secuenciación en el laboratorio clínico

Answer 11

Tecnica MALDI TOF genera un perfil de proteinas ionizado, si el resultado es solo del 70 porciento, se realizan pruebas bioquímicas tradicionales, si no ahi SECUENCIACIÓN

Question 12

Al ingresar una secuencia de ADN a una base de datos pueden surgir 2 resultados:

Answer 12

Menor a 3 porciento de diferencia: nueva cepa, misma especie
Mayor a 3 porciento: candidata a nueva especie

Question 13

Fingerprinting

Answer 13

Genes Housekeeping (5) mas secuencia 16S seria la huella de la especie

Question 14

Descripción de una nueva especie, necesita criterios:
/3

Answer 14

Morfológicas
Fenotípicas
Genéticas