Chapitre 6 - Glossaire

Question 1

Qu’est-ce qu’un activateur ?

Answer 1

Effecteur dont l’effet est d’augmenter l’activité catalytique d’une enzyme.

Question 2

Qu’est-ce que l’allostérie?

Answer 2

Forme de régulation de l’activité de certaines enzymes pour laquelle la fixation à l’enzyme d’un effecteur (modulateur) provoque une modification de la structure 3D de l’enzyme. Cette modification peut entraîner une augmentation ou une diminution de l’activité enzymatique.

Question 3

Qu’est-ce qu’un apoenzyme?

Answer 3

Protéine conjuguée en l’absence de son cofacteur. Forme inactive de l’enzyme.

Question 4

Qu’est-ce qu’une barrière d’activation ?

Answer 4

Énergie nécessaire à un substrat pour atteindre son état de transition. Elle correspond à la quantité d’énergie requise pour convertir une mole de substrat de son état initial à son état de transition. Synonyme : énergie libre d’activation.

Question 5

Qu’est-ce que la canalisation métabolique ?

Answer 5

Dans un sentier métabolique, processus dans lequel le produit d’une réaction enzymatique est transféré directement au site actif suivant d’une enzyme multifonctionnelle ou d’un complexe multienzymatique sans être libéré sous forme libre dans le solvant. Ceci augmente la vitesse de la réaction en diminuant le temps de transit entre 2 sites actifs et en augmentant la concentration locale de substrat.

Question 6

Qu’est-ce que la cinétique enzymatique ?

Answer 6

Étude de la vitesse des réactions chimiques catalysées par des enzymes.

Question 7

Qu’est-ce qu’un coenzyme ?

Answer 7

Molécule organique dont la présence est requise pour l’activité catalytique de certaines enzymes.

Question 8

Qu’est-ce qu’un cofacteur ?

Answer 8

Molécule inorganique ou organique nécessaire à la conversion d’une apoenzyme (forme inactive) en holoenzyme (forme active).

Question 9

Qu’est-ce que le complexe ES?

Answer 9

Nom donné au complexe formé de l’enzyme et de son substrat liés ensemble par des interactions non covalentes.

Question 10

Qu’est-ce que le complexe multienzymatique?

Answer 10

Structure formée par l’association de 2 ou plusieurs enzymes d’un même sentier métabolique menant à la canalisation des métabolites.

Question 11

Qu’est-ce que la constante catalytique ?

Answer 11

Nombre de moles de produit formé par unité de temps et par mole d’enzyme dans des conditions où l’enzyme est saturée de substrat. kcat = Vmax/[E].

Question 12

Qu’est-ce que la constante de Michaelis (Km)?

Answer 12

Correspond à la concentration de substrat lorsque la vitesse initiale est égale à la moitié de la vitesse maximale. La constante de Michaelis est inversement proportionnelle à l’affinité de l’enzyme pour le substrat.

Question 13

Qu’est-ce que la coopérativité?

Answer 13

Interactions homotropes où la fixation du substrat sur l’un des sites actifs modifie l’affinité pour ce substrat des autres sites actifs de cette protéine. C’est donc l’effet de la fixation du substrat sur sa propre fixation sur les autres sous-unités.

Effet coopératif positif : si l’affinité augmente
Effet coopératif négatif : si l’affinité diminue

Question 14

Qu’est-ce qu’un cosubstrat?

Answer 14

Coenzyme faiblement fixée à l’apoenzyme par des liens non covalents.

Question 15

Qu’est-ce qu’un effecteur ?

Answer 15

Molécule dont la liaison à l’enzyme modifie l’activité catalytique de celle- ci. L’effet de l’effecteur peut être positif (augmentation de l’activité) ou négatif
(diminution de l’activité). Synonyme : modulateur

Question 16

Qu’est-ce que l’énergie libre d’activation ?

Answer 16

Énergie nécessaire à un substrat pour atteindre son état

de transition. Synonyme : Barrière d’activation.

Question 17

Qu’est-ce que l’équation de Michaelis-Menten?

Answer 17

Équation décrivant la relation entre la vélocité initiale, la concentration de substrat, la constante de Michaelis et la vitesse maximale. Cette équation permet de déterminer la vitesse initiale d’une réaction pour différentes concentrations de substrat lorsqu’on connait la Km et la Vmax.

Question 18

Qu’est-ce que l’état de transition ?

Answer 18

Forme transitoire d’une molécule qui apparaît lors d’une réaction, mais dont la durée de vie est si courte qu’elle ne peut être récupérée et étudiée. Arrangement particulier des atomes d’une molécule de substrat dans lequel un lien chimique est en train de se former ou de se briser. Il est extrêmement instable. L’électron, l’atome ou le groupe d’atomes en cours de transfert est partagé à égalité entre le donneur et l’accepteur.

Question 19

Qu’est-ce que l’état R?

Answer 19

Conformation la plus active d’une protéine allostérique.

Question 20

Qu’est-ce que l’état T?

Answer 20

Conformation la moins active d’une protéine allostérique.

Question 21

Qu’est-ce qu’un groupement prosthétique ?

Answer 21

Coenzyme solidement fixée à l’apoenzyme par des liens covalents.

Question 22

Qu’est-ce qu’un holoenzyme?

Answer 22

Protéine conjuguée en présence de son cofacteur. Forme active de l’enzyme.

Question 23

Qu’est-ce qu’un inhibiteur ?

Answer 23

Effecteur dont l’effet est de diminuer ou bloquer l’activité catalytique
d’une enzyme.

Question 24

Qu’est-ce qu’un intermédiaire métabolique ?

Answer 24

Produit intermédiaire lors de la synthèse (anabolisme) ou la dégradation (catabolisme) d’une biomolécule. Cette forme est stable et peut être détectée (à ne pas confondre avec l’état de transition). Synonyme : Métabolite.

Question 25

Qu’est-ce que le modèle clé serrure ?

Answer 25

Modèle où la reconnaissance moléculaire dépend de la complémentarité de l’enzyme et du substrat et dans lequel on décrit les molécules comme des entités statiques dont la forme n’est pas modifiée par la formation du complexe ES.

Question 26

Qu’est-ce que le modèle de l’ajustement induit (induced fit)?

Answer 26

Modèle de reconnaissance moléculaire dans lequel la fixation du substrat induit un changement conformationnel de l’enzyme et du substrat de manière à permettre un ajustement précis entre les 2 molécules.

Question 27

Qu’est-ce qu’un proenzyme?

Answer 27

Forme inactive d’une protéine dont l’activité catalytique n’apparaît qu’après protéolyse limitée (coupure de la proenzyme → forme active). Synonyme : zymogène

Question 28

Qu’est-ce que le rapport Kcat/Km ?

Answer 28

Mesure de l’efficacité catalytique dans des conditions non saturantes pour l’enzyme. Synonyme : Efficacité catalytique

Question 29

Qu’est-ce que le site actif de l’enzyme ?

Answer 29

Petite portion de l’enzyme responsable de la liaison au substrat et de l’activité catalytique.

Question 30

Qu’est-ce qu’un substrat ?

Answer 30

Nom donné au réactif dans une réaction enzymatique.

Question 31

Qu’est-ce qu’une vitamine ?

Answer 31

Micronutriment organique qui ne peut être synthétisé par un animal et doit être obtenu dans la diète. La plupart des coenzymes sont des dérivés de vitamines. La plupart des vitamines doivent être transformées par des enzymes afin de correspondre aux coenzymes.

Question 32

Qu’est-ce que la vitesse initiale (Vi ou Vo)?

Answer 32

Vitesse d’une réaction chimique immédiatement après l’ajout de substrat alors que la concentration des produits est encore faible.

Question 33

Qu’est-ce que l’as vitesse maximale (Vmax)?

Answer 33

Vitesse initiale de la réaction lorsque la concentration de substrat est suffisamment élevée pour que chaque molécule d’enzyme soit saturée de
substrat.

Question 34

Qu’est-ce qu’un zymogène?

Answer 34

Forme inactive d’une protéine dont l’activité catalytique n’apparaît qu’après protéolyse limitée (coupure de la forme zymogène → forme active). Synonyme : proenzyme.