Chapitre 4 - Glossaire Flashcards
Qu’est-ce que l’absorbance?
Elle mesure la quantité de lumière d’une longueur d’onde donnée absorbée par un composé. L’abord à ce est égale au logarithme du rapport entre la quantité de lumière incidente et la quantité de lumière transmise.
Qu’est-ce qu’un arbre phylogénétique?
C’est une représentation schématique montrant les relations de parenté entre des entités ayant un ancêtre commun.
Les alignements de séquences permettent également de construire des arbres phylogénétiques à partir des pourcentages de similarité entre protéines orthologues de plusieurs espèces. Ces arbres permettent d’illustrer la distance évolutive entre les organismes. Les analyses phylogénétiques se font à l’aide de logiciels spécialisés.
Qu’est-ce qu’un carboxypeptidase?
C’est un enzyme coupant le lien peptidique à l’extrémité C-terminale d’un peptide ou d’une protéine.
Qu’est-ce que la chromatographie ?
C’est une technique physique de séparation d’espèces chimiques.
Qu’est-ce que le coefficient d’extinction molaire (ε)?
C’est le rapport entre l’absorbance d’une solution et la concentration du soluté dans cette solution. C’est une valeur proposé à chaque composé et qui rend compte de sa capacité à absorber la lumière à une longueur d’onde donnée.
Qu’est-ce qu’une colonne d’échange anionique ?
C’est une méthode de chromatographie utilisant une résine chargée positivement afin de retenir plus fortement les composés chargés négativement (anions).
Qu’est-ce qu’une colonne d’échange cationique?
C’est une méthode de chromatographie utilisant une résine chargée négativement afin de retenir plus fortement les composés chargés positivement (cations).
Qu’est-ce que la composition d’un peptide ?
C’est la nature des résidus d’acides aminés formant la chaîne peptidique. On exprime la composition par le pourcentage de chaque type d’acide aminé formant la molécule.
Qu’est-ce que l’électophorèse?
C’est un processus de séparation des composés d’un mélange selon leur migration dans un champ électrique.
Qu’est-ce que l’éluat?
Este le liquide sortant d’une colonne de chromatographie. C’est le résultat de l’élution, de la remise en solution d’un corps absorbé.
Qu’est-ce qu’une endopeptidase?
C’est un enzyme coupant les liens peptidiques à l’intérieur d’un peptide ou d’une protéine.
Qu’est-ce qu’une exopeptidase?
C’est une enzyme coupant les liens peptidiques aux extrémités d’un peptide ou d’une protéine.
Qu’est-ce que l’extrémité C-terminale ?
C’est le résidu à l’extrémité d’un peptide dont le groupement α-carboxyle ne participe à aucune lien peptidique. Il est donc libre et est le seul comme ça dans la chaîne.
Qu’est-ce que l’extrémité N-terminale?
C’est le résidu à l’extrémité d’un peptide dont le groupement α-aminé ne participe à aucun lien peptidique. Il est donc libre et est le seul comme cela dans la chaîne.
Qu’est-ce qu’un hétéromultimère?
Se dit d’une protéine multimérique formée d’au moins deux chaînes polypeptides différentes.
Qu’est-ce qu’un homomultimère?
Se dit d’une protéine multimérique formée de la répétition d’une seule et même chaîne.
Que signifie in-silico?
Se dit d’une analyse effectuée par ordinateur.
Qu’est-ce qu’une liaison peptidique ?
C’est un lien covalent de type amide se formant entre deux aa.
Qu’est-ce qu’un ligand?
Ion ou molécule qui se lie à une autre molécule.
Qu’est-ce que la peptidase?
C’est une enzyme catalysant l’hydrolyse des liens peptidiques.
Qu’est-ce que le peptide mass fingerprinting?
C’est une méthode analytique permettant d’identifier un peptide à partir de sa masse moléculaire déterminée par spectrophotométrie de masse. Cette méthode nécessite l’utilisation de logiciels sophistiqués et de bases de donnés contenant des séquences gnomiques ou protéiques connues.
Qu’est-ce qu’un peptide ?
C’est une molécule contenant de 2 à 50 résidus d’aa liés entre eux par des liens peptidiques.
Qu’est-ce que la phase mobile ?
En chromatographie, c’est la phase qui se déplace à travers la phase stationnaire.
Qu’est-ce que la phase stationnaire ?
C’est une substance insoluble contenue dans une colonne de chromatographie et interagissant avec les composés chimiques d’intérêt.
Qu’est-ce que la phylogénie?
C’est l’étude des liens de parenté entre différents êtres vivants en vue de comprendre l’évolution des organismes vivants.
Qu’est-ce qu’un polypeptide?
Ce sont des peptides formes par la liaison de plus de 20 résidus d’aa.
Qu’est-ce qu’une protéine monomérique?
C’est une protéine formée d’une seule chaîne polypeptidique.
Qu’est-ce qu’une protéine multimérique/oligomère ?
C’est une protéine formée de plus d’une chaîne polypeptidique.
Qu’est-ce qu’une protéine ?
C’est une biomolécules formée d’une ou de plusieurs chaînes polypeptidiques de plus de 50 résidus.
Qu’est-ce que des protéines homologues?
Ce sont des protéines dont les gènes qui les codent ont une origine commune. Elles ont des structures spatiales proches et des séquences en acides aminés qui présentent des similarités. Les fonctions de ces protéines peuvent être plus ou moins semblables.
Qu’est-ce que des protéines orthologues?
Ce sont des protéines homologues présentes dans au moins deux espèces différentes et ayant une fonction similaire. Elles descendent d’une séquences unique présente dans le dernier ancêtre commun des deux espèces.
Qu’est-ce que des protéines paralogues ?
Ce sont des protéines homologues présentes dans une même espace, mais ayant des rôles différents. Ces protéines proviennent de la duplication d’un gène et de Ssq spécialisation subséquente.
Qu’est-ce que le protéome?
C’est l’ensemble des protéines présentes dans un organisme.
Qu’est-ce que la protéomique?
C’est la branche de la biologie moléculaire consacrée à l’étude des protéomes.
Qu’est-ce que la salting-in?
C’est lorsque la force ionique est faible, la solubilité augmente avec l’ajout de sels.
Qu’est-ce que le salting-out?
C’est lorsque la force ionique est forte, la solubilité diminue avec l’ajout de sels.
Qu’est-ce la définition de la séquence d’un polypeptide?
C’est l’ordre dans lequel les résidus d’aa apparaissent dans la chaîne peptidique (à partir de N-terminale à C-terminale).
Qu’est-ce qu’une sous unité ?
C’est le nom donné à chacune des chaînes peptidiques formant une protéine multimérique.
Qu’est-ce que la spectrométrie de masse?
C’est la méthode analytique permettant de déterminer la masse d’un composé en mesurant le temps que prend une molécule chargée en phase gazeuse pour voyager dans un tube. Son principe réside dans la séparation de ces molécules en fonction de leur masse et de leur charge (m/z).
Qu’est-ce que la spectrophotométrie?
C’est la méthode analytique qui consiste à mesurer l’absorbante (ou la densité optique) d’une substance chimique en solution à une longueur d’onde donnée.
Qu’est-ce que la structure primaire ?
C’est la séquence linéaire des résidus d’un peptide.
Qu’est-ce que la structure quaternaire ?
C’est l’organisation des différentes sous unités d’une protection ne multimérique.
Qu’est-ce que la structure conservative?
C’est la mutation entraînant le remplacement d’un résidu d’aa par un autre résidu ayant des caractéristiques semblables.
