Chapitre 3 - Glossaire Flashcards
Qu’est-ce qu’un acide aminé protéogénique?
C’est un acide aminé incorporé directement dans la chaîne peptidique lors de la synthèse des protéines.
Qu’est-ce que l’activité optique et quels acides aminés en ont une ?
C’est la capacité d’un composé à dévier la lumière polarisée. Les acides aminés standards ont tous une activité optique sauf la glycine.
Qu’est-ce qu’un ampholyte ?
C’est une substance pouvant se comporter à la fois comme un acide et une base.
Qu’est-ce qu’un amphotère?
C’est un adjectif associé aux ampholytes. Un ampholyte est une molécule amphotère.
Qu’est-ce qu’un carbone asymétrique ?
C’est un carbone formant 4 liens covalents avec 4 substituants différents. C’est un carbone chiral.
Qu’est-ce qu’un carbone alpha ?
Dans un acide aminé, il s’agit du carbone lié au carbone du groupement carboxyle.
Qu’est-ce que des diastéréoisomères?
Ce sont des stéréoisomères qui ne sont pas des images miroir.
Qu’est-ce que des énantiomères?
Ce sont des isomères de configuration dont les molécules forment deux images miroir non superposables.
Qu’est-ce qu’une hormone ?
C’est un médiateur chimique produit par une glande et véhicule par le système circulatoire. Les hormones agissent à distance de leur dite de production
Qu’est-ce que l’index d’hydropathie ?
C’est la mesure qui permet de connaître le caractère hydrophile ou hydrophobe de la chaîne latérale d’un acide aminé. L’hydropathie permet de déterminer la nature hydrophobe d’une région d’une protéine. Plus la valeur est positive, plus la molécule est hydrophobe.
Qu’est-ce qu’un ion dipolaire ou Zwitterion ?
C’est une molécule possédant à la fois une charge positive et une charge négative, donc une charge nette nulle.
Qu’est-ce que des isomères de configuration ?
Aussi appelé stéréoisomères. Ce sont des molécules ayant le même squelette structural, mais dont la position spatiale de leurs groupements fonctionnels diffère sur un ou des atomes donnés. On les classe en deux groupes : les énantiomères et les diastéréoisomères.
Qu’est-ce que des isomères de structure ?
Ce sont des molécules possédant la même formule moléculaire, mais dont l’enchaînement des atomes dans ces molécules est différent.
Que sont des isomères ?
Ce sont des molécules composées exactement des mêmes atomes, mais qui sont disposés différemment dans chaque molécule. Il exige plusieurs types d’isomérie.
Qu’est-ce qu’une molécule chirale?
C’est une molécule possédant au moins un carbone asymétrique. Chaque molécule chirale a un énantiomère.
Qu’est-ce qu’un neurotransmetteur ?
C’est un médiateur chimique libéré par les neurones et agissant principalement sur d’autres neurones.
Qu’est-ce que le pont isoélectrique (pI)?
C’est le pH auquel 100% des molécules ne portent aucune charge nette (zwitterion). Si l’aa est diprotique, le pI est égal à la moyenne des pKa tandis que si l’aa est triprotique, le pI est égal à la moyenne des pKa retrouvés chaque côté de la forme zwitterion.
Comment caractériser la l’hydrophilité des aa?
Non-polaires : hydrophobes
Un seul groupement polaire dans chaîne latérale : légèrement hydrophobes
Groupements amide : hydrophiles
Chargés + ou - : hydrophiles
Quels sont les aa qui sont des hormones ?
Épinéphrine : dérivé de la tyrosine et sécrété par glandes surrénales situation de stress
Thyroxine (T4)/Triiodothyronine (T3) : dérivé de tyrosine, fabriquée par thyroïde
Quels sont les aa neurotransmetteurs ?
GABA : dérivé de glutamate, contribue au contrôle moteur
Histamine : dérivé de l’histidine et est responsable des réactions allergiques
Quels sont les aa précurseurs ou intermédiaires métaboliques ?
Homocystéine et homosérine : précurseur pour formation des aa standards
Citrulline et ornithine : intermédiaires métabolise pour cycle de l’urée
S-adénosylméthionine : co-substrat lors de la réaction de méthylation
Quels sont les aa protéogéniques rares?
Sélénocystéine : dans sélénoprotéines, comme cystéine, mais au lieu de S c’est Se
Pyrrolysine : présente chez certaines archaebactéries méthanogènes (dans enzymes participant à la production de méthane)
Qules sont les aa de la série D?
Actinomycine D et gramicidine. Certaines bactéries ou fongiques les utilisent pour synthétiser les peptides dans la paroi cellulaire. Ils induisent des réponses immunitaires plus faibles que leurs équivalents de la série L, peuvent donc contourner les défenses du systèmes immunitaires. Sont présents dans les antibiotiques d’origine bactérienne ou fongique.
Qu’est-ce que sont les modifications popst-traductionnelles ? Quelles sont-elles ?
Certains aa non-standards font leur apparition dans la chaîne polypeptidique suite à la modification chimique d’aa standards déjà intégrés dans la chaîne. Il y a la phosphorylation, la méthylation, l’acétylation, l’hydroxylation et la carboxylation.
