Chapitre 6 Flashcards
Myoviridae : Nommez la forme de son génome, la capside et son enveloppe
Génome : ADN bicaténaire linéaire
Capside : Binaire
Enveloppe : Non
Podoviridae : Nommez la forme de son génome, la capside et son enveloppe
Génome : ADN bicaténaire linéaire
Capside : binaire
Enveloppe : Non
Siphoviridae : Nommez la forme de son génome, la capside et son enveloppe
Génome : ADN bicaténaire linéaire
Capside : binaire
Enveloppe : non
Inoviridae : Nommez la forme de son génome, la capside et son enveloppe
Génome : ADN monocaténaire circulaire
Capside : Hélicoïdale
Enveloppe : non
Leviviridae : Nommez la forme de son génome, la capside et son enveloppe
Génome : ARN monocaténaire + linéaire
Capside : Cubique
Enveloppe : non
Cystoviridae : Nommez la forme de son génome, la capside et son enveloppe
Génome : ARN bicaténaire segmenté
Capside :cubique
Enveloppe : oui
Quelles protéines précoces sont produites lors de la réplication du phage T4?
ADN polymérase virale pour la réplication du génome viral
Protéine qui interagit avec la polymérase ARN de la bactérie et modifie sa spécificité.
Nommez deux exemples de phages de la famille des Myoviridae
T4 et Mu
Nommez un exemple de phage de la famille des Podoviridae
T7
Discutez du mode de réplication du phage T4
1- Son génome viral est exprimé grâce à un ARN polymérase bactérienne
2- Il y a production de protéines précoces incluant la polymérase ADN virale et la ligase permettant la réplication du génome viral et la formation de concatémères, en plus d’une protéine modifiant la spécificité de l’ARN polymérase bactérienne.
3- Il y a ensuite formation des gènes tardifs, dont les protéines structurales.
Comment le phage T4 contourne-t-il le problème relié aux extrémités de son génome linéaire lors de la réplication?
Il forme des concatémères. Ainsi, lorsque plusieurs dizaines de génomes sont uns à la suite des autres, seuls les deux derniers sont affectés et non fonctionnels, contournant ainsi l’obstacle.
Expliquez le processus d’encapsidation du phage T4?
Encapsidation des concatémères par un mécanisme de tête pleine. L’ADN viral est donc plus grand que le génome viral, mais est composé d’une forme permutée d’un virion à l’autre.
Quel impact a la réplication viral du phage T4 sur le génome bactérien? Comment le virus s’en protège-t’il?
La réplication entraîne une dégradation du génome bactérien, qui servira de précurseurs pour la synthèse du génome viral. Les phages peuvent s’en protéger grâce à une modification qui implique l’introduction de résidus hydroxyméthylcytosine.
Le mode de réplication du phage T7 ressemble beaucoup à celui d’un autre phage, à deux exceptions près. Nommez ce phage et les différences.
Ressemble beaucoup au phage T4.
1- Durant la phase tardive, le génome est transcrit par une polymérase ARN spécifique du virus, codée par le génome viral
2- Lors de l’encapsidation, ce n’est pas par un mécanisme tête pleine ou par permutation, mais les extrémités des génomes des concatémères sont reconnues et clivées spécifiquement pour donner le génome viral intact.
Qu’est ce qui distingue le bactériophage Mu?
Son intégration au génome bactérien et son analogie avec les transposons bactériens.
Vrai ou faux. Deux phages de la même famille ont nécessairement la même stratégie de réplication
Faux (ex, T4 et Mu)
Expliquez l’intégration du phage Mu au génome bactérien
1- L’ADN est injecté dans la cellule bactérienne, et se circularise
2- Il y a transcription du génome viral, qui génère la transposase et peut intégrer l’ADN viral au génome bactérien
3- Une enzyme clive de manière asymétrique l’ADN bactérien, générant des extrémités monocaténaires de 5ntp de longueur
4- La même enzyme clive l’ADN viral sur un seul brin aux deux jonctions avec l’ADN non viral.
5- Il y a ligature des brins viraux et bactériens
6- Une enzyme cellulaire répare les trous de chaque côté du génome cellulaire.
Vrai ou faux. Le génome de Mu peut se retrouver libre pendant son cycle de réplication.
Faux.
À quel moment le phage mu peut-il générer ses protéines virales requises pour l’Encapsidation du génome?
Lorsqu’il est intégré au génome bactérien, il peut alors être transcrit.
Vrai ou faux. Le génome viral Mu s’intègre dans une zone très précise sur le chromosome bactérien.
Faux! Ça semble se faire au hasard, impliquant ainsi un haut taux de mutation. Par contre, certaines régions pourraient être favorisées.
Vrai ou faux. Le phage Mu semble être encapsidé par une variation du mécanisme de tête pleine.
Vrai! Il y a quelques différences, car plus d’ADN bactérien intégré (moins à gauche, plus à droite avec les coupures)
Vrai ou faux. Mu peut induire un cycle lysogénique
Vrai!
Nommez un phage de la famille des Siphoviridae
Lambda
Discutez de la structure du génome du phage lambda.
C’est un ADN bicaténaire linéaire, avec des extrémités monocaténaires complémentaires d’environ 12 nucléotides, permettant la circularisation de l’ADN une fois entré dans la bactérie. Une ligase permet de fermer complètement le cercle et former des liens covalents.
