Cell unit Flashcards
Que veut dire le mot Pathologie?
Origine du Grec
Pathos = souffrance/maladie
Logos = étude
Définir euchromatine
Chromatine déroulée, active transcriptionnellement
Euchromatine = expression
Définir hétérochromatine
Chromatine compacte, inactive transcriptionnellement
Hétérochromatine = répression
Définir les centromères
1) Site d’attache des chromatides durant la mitose
2) Site de formation du complexe protéique du kinétochore
Chromatide = ….
2 chromatides forment un chromosome
Définir le rôle du complexe protéique du kinétochore
Permettre l’attachement et le mouvement des chromatides le long du fuseau mitotique MÉTAPHASIQUE
Définir les télomères
Séquences nucléotidiques répétées :
- riches en GC
- localisées aux extrémités des chromatides
- permettant la réplication des chromatides sans perte de matériel génomique
Quel est le principal rôle biologique du génome?
80% du génome sert à la RÉGULATION DE L’EXPRESSION GÉNIQUE
Nommez les principales classes de séquences non-codantes du génome humain
1) Séquences promoteur et ‘enhancer’
2) Sites de liaison facteurs participant au maintien de la structure de la chromatine
3) gènes exprimant les ARN non-codants (miARN, lncARN)
4) Transposons
5) Centromères/Télomères
Quels sont les deux types de variations d’ADN génomique les plus communes?
1) Polymorphisme nucléotidique
2) Variation du nombre de copies
Définir l’épigénétique
Changement d’expression génique héritable, avec ABSENCE d’altérations génomiques
Ex : jumeaux avec génotypes identiques mais phénotypes différents
Définir nucléosome et chromatine
- Nucléosome :
Segment d’ADN génomique de 147 paires de bases enroulé autour d’une histone - Chromatine :
Arrangement de plusieurs nucléosomes
Décrire les modifications subies par les composantes de la chromatine et leur impact sur l’expression génique
HISTONES
- Phosphorylation/Méthylation : activation et répression transcriptionnelles
- Acétylation: activation transcriptionnelle
ADN
- Méthylation : répression transcriptionnelle
Facteurs de maintien de structure de la chromatine
- Inconnus
Définir un microARN et son fonctionnement
- Séquence d’ARN non-codante, participant à la répression post-transcriptionnelle d’ARN messagers double brin cibles
- Pré-miARN double brin > Maturation par Dicer en segment simple brin (21-30 nucléotides) > Formation du complexe RISC > Appariement si parfait = clivage + expression; si imparfait = clivage + répression
Définir un lncARN et son fonctionnement
- Séquence d’ARN non-codante, participant à la répression post-transcriptionnelle d’ARN messagers cibles
- Liaison à la chromatine
- Modification chromatine
- Activation/Répression expression génique
Où retrouve-t-on exprimés les gènes ‘housekeeping’?
La plupart des gènes ‘housekeeping’ sont retrouvés exprimés dans les organelles intracellulaires liés aux membranes.
Nommez 3 types de phospholipides qui contribuent à l’asymétrie de la membrane plasmique
1) Phosphatidylinositol > DAG + IP3 (par l’action de la phospholipase C)
2) Phosphatidylsérine (signal apoptotique lorsque exposé en surface mitochondriale)
3) Glycolipides et Sphingomyéline (radeaux lipidiques > rôle dans signalisation)
Indiquez les modes courants de transport de molécules à travers la membrane
1) Transporteur
2) Canal
3) Endocytose (vésicules décorées de clathrine, endosomes, bas pH)
4) Exocytose (endosomes précoces)
5) Phagocytose (phagosome, phagolysosome, bas pH)
6) Transcytose
Quels sont les 3 rôles principaux de la membrane plasmique?
1) Transport d’ions et métabolites
2) Absorption de macromolécules
3) Interaction cellule-cellule/matrice/ligand
Quel est le rôle du cytosquelette?
1) adopter la forme
2) maintenir la polarité
3) organiser les interactions entre les différents organelles
Nommez les 3 composantes du cytosquelette
1) Microfilaments d’actine (5-9 nanomètres)
2) Filaments intermédiaires (10 nanomètres) incluant
- kératines (glandes)
- desmine (muscle)
- vimentine (mésenchyme)
- protéines acide fibrillaire gliale (glie)
- neurofilaments (axones neuronaux)
- lamines (noyaux)
3) Microtubules (25 nanomètres)
Comment fonctionne le centre organisateur des microtubules (COMT)?
Association COMT + centriole + protéines motrices (kinésines, mouvement antérograde; dynéines mouvement rétrograde)
> transport moléculaire durant la mitose et motilité (cils, flagelles)
Quel est le rôle des structures membranaires appelées ‘Zona Occludens’ et le nom des protéines qui les composent?
Les jonctions occlusives forment une barrière qui restreint les mouvements paracellulaires
Les jonctions occlusives sont composées de protéines transmembranaires telles que la zonuline, la protéine zona-occludens-1, l’occludine, la claudine et la caténine
Quel est le rôle des structures membranaires appelées ‘Zona Adherens’ et le nom des protéines qui les composent?
Les jonctions adhérentes forment des points d’ancrage des cellules à la matrice (hémidesmosomes) et aux cellules voisines (desmosomes)
Les jonctions occlusives sont composées de protéines transmembranaires telles que la cadhérine, la desmogléine, la desmocolline, et l’intégrine
Quel est le rôle des structures membranaires appelées ‘Macula Communicans’ et le nom des protéines qui les composent?
Les jonctions communicantes forment des passages qui permettent la transmission de signaux électrochimiques
Les jonctions communicantes sont composées de protéines transmembranaires appelées connexines, aquaporines
Le renouvellement des protéines de structures et des enzymes cellulaires dépend de leur…
1) SYNTHÈSE (réticulum endoplasmique/production, appareil de Golgi/livraison)
2) DÉGRADATION (protéasomes, lysosomes)
La synthèse protéique requiert…
1) La reconnaissance du peptide-signal par le réticulum endoplasmique (initiation)
2) La participation de molécules-chaperonnes (repliement)
La dégradation protéique requiert…
La participation des :
1) Lysosomes via :
- HYDROLASES
- autophagie > cellule
- hétérophagie > corps étranger (phago/endocytose, cellules spécialisées; pinocytose ubiquitaire)
2) Protéasomes via :
- UBIQUITINATION ou liaison covalente avec ubiquitine (76 acides aminés) pour produire des polypeptides courts (16 acides aminés)
Définir la mitochondrie et son rôle
Organelle
- ADN propre (1% total cellulaire) hérité de la mère
- responsable de la production d’énergie (ATP) via phosphorylation oxydative
- responsable de production de chaleur via l’action de la thermogénine
Expliquez l’effet Warburg
En cas de besoin énergétique important (tumorigenèse), la cellule peut modifier sa consommation de pyruvate post-glycolyse, en favorisant les réactions de fermentation par rapport à la voie classique du cycle des acides tricarboxyliques, dans le but de préserver des molécules à squelette carboné pour les phases anaboliques subséquentes
Décrire les 2 modes principaux de mort cellulaire
1) Nécrose associée à des dommages cellulaires externes > perméabilisation membrane mitochondriale > dissipation de la chaîne de phosphorylation oxydative > mort cellulaire
2) Apoptose déclenchée par signaux extrinsèques (dommage à ADN, stress intracellulaire) et intrinsèques (cytokines) > perméabilisation membrane mitochondriale > relocalisation cytoplasmique du cytochrome c > activation caspases
Quels sont les types de signaux auxquels les cellules répondent le plus?
1) Pathogènes
2) Dommages aux cellules voisines
3) Contact avec cellules voisines
4) Contact avec la matrice
5) Sécrétion de molécules de signalisation
Quels sont les types de signalisation cellulaire?
1) Paracrine
2) Autocrine
3) Endocrine
4) Synapse
De quelle façon la cellule perçoit-elle un stimulus?
1) via des récepteurs intracellulaires :
- facteur de transcription nucléaire
- oxyde nitrique
2) via des récepteurs extracellulaires :
- canal ionique
- protéine G
- enzyme (kinase, phosphatase)
- facteur de transcription activé par protéolyse
Nommez les classes de protéines impliquées dans la signalisation cellulaire
1) récepteurs avec activité kinase (RTK, non-RTK)
2) récepteur couplé aux protéines G
3) récepteur nucléaire
4) récepteurs autres (Notch, Frizzled)
5) protéine adaptatrice
6) facteur de transcription
Pour induire la transcription d’un gène, un facteur de transcription doit posséder un domaine d’interaction protéine-protéine pour recruter …
1) des enzymes modifiant la structure des histones
2) des complexes protéiques modifiant la structure de la chromatine
3) des ARN polymérases
Associez les facteurs de transcription aux fonctions correspondantes:
- Prolifération hépatocytaire et épithéliale >
- Angiogenèse >
- Synthèse matrice extracellulaire >
- Chimiotaxie et prolifération fibroblastiques >
- Prolifération et migration kératinocytaires >
- Formation du tissu de granulation >
- Prolifération hépatocytaire et épithéliale > TGF-α, HGF
- Angiogenèse > VEGF, FGF
- Synthèse matrice extracellulaire > PDGF, FGF, TGF-β
- Chimiotaxie et prolifération fibroblastiques > PDGF, FGF
- Prolifération et migration kératinocytaires > EGF, FGF
- Formation du tissu de granulation > EGF
Définir un proto-oncogène
Gène ayant acquis une altération ‘gain de fonction’ qui stimule la prolifération cellulaire incontrôlée et la tumorigenèse
Nommez le principal facteur angiogénique connu
VEGF
Décrivez le rôle du VEGF
1) principal facteur angiogénique sécrété en contexte post-lésionnel et tumoral
2) production induite par l’hypoxie
3) exprimé fortement par les podocytes, l’épithélium rétinien et l’épithélium du plexus choroïde
4) cible thérapeutique en prééclampsie, cancer rénal et colorectal
Pourquoi dit-on que le facteur TGF-beta est un agent pléiotropique?
TGF-beta > liaison aux récepteurs spécifiques avec activité sérine/thréonine kinase > activation de facteurs de transcription cytoplasmiques SMAD (ex : SMAD4) > activation et/ou inhibition transcription (ex : synthèse matrice extracellulaire, inhibition collagénases, inhibition inflammation tissulaire, inhibition prolifération lymphocytaire)
Nommez des protéines impliquées dans les interactions cellule-matrice extracellulaire
1) Intégrines
2) complexes d’adhésion focale (vinculine, actinine, taline)
3) Collagène, Fibronectine
Définir le(s) rôle(s) de la matrice extracellulaire
1) Support mécanique (ancrage, migration, polarité)
2) Contrôle prolifération cellulaire
3) Renouvellement tissulaire
4) Micro-environnements tissulaires
Quels sont les deux types de matrice extracellulaire?
1) Interstitium > Collagène fibrillaire types 1-3, 5; Élastine; Hyaluronane; Protéoglycane
2) Membrane basale > Collagène type 4; Laminine; Protéoglycane
Décrivez la distribution et le rôle du collagène fibrillaire (type 1-3, 5)
1) composante majeure du TISSU CONJONCTIF (os, cartilage, tendon, peau, réseau vasculaire)
2) substrat de LYSYL-OXYDASES dont l’activité détermine la force de tension fibrillaire et dépend du niveau de VITAMINE C
Décrivez le rôle du collagène non-fibrillaire (type 4, 7)
1) composante de membrane basale
2) ancrage fibrillaire épithélium malpighien
Décrivez le rôle de l’élastine
Protéine majeure de structures capables d’ÉTIREMENT et de RÉTRACTION:
- Valves cardiaques
- Larges vaisseaux (aorte)
- Ligaments
- Peau
- Utérus
Nommez des maladies fibrillaires 2° défauts génétiques
- hypovitaminose C (fragilisation collagène)
- Osteogenesis imperfecta (mutation collagènes)
- EHLERS-DANLOS (mutation collagènes)
- Anomalie squelettique > Williams (microdélétion 7p11.23)
- Sténose aortique > Marfan (mutation fibrilline)
- Emphysème pulmonaire > déficit α1-antitrypsine
Donnez des classes de glycoprotéines impliquées dans l’adhésion cellule-cellule, cellule-matrice ou matrice-matrice
1) Fibronectine (fibroblasts, endothelium, monocytes) > cicatrisation
2) Laminine > membrane basale
3) Intégrines > agrégation plaquettaire, ancrage matrice (motif RGD)
Nommez des protéines régulatrices du cycle cellulaire importantes
1) Cyclines (ex : D,E, A, B)
2) Kinases dépendantes de cyclines
3) Inhibiteurs de kinases dépendantes de cyclines (p16/CDKN2A, p21/CDKN1A)
Quelles cyclines contrôlent la transition G1-S?
Cyclines D et E
Quelle(s) cycline(s) contrôlent la transition G2-M?
Cycline B
Quel est le rôle du point de restriction G2-M?
Assurer l’intégrité de l’ADN mitotique, de sorte que si les anomalies de l’ADN sont trop importantes, la cellule entre en apoptose ou en sénescence régulée par p53
Quelles sont les deux caractéristiques importantes des cellules-souches?
1) auto-renouvellement
2) division asymétrique (1 cellule-fille produisant des cellules matures, l’autre demeurant indifférenciée)
Quels sont les deux types de cellules-souches?
1) les cellules-souches embryonnaires totipotentes (blastocyte, production de cellules provenant du endoderme, ectoderme ou mésoderme)
2) les cellules-souches adultes résidant dans des niches tissulaires (cœur, cornée, cerveau, peau, tractus gastro-intestinal, moelle osseuse)
Quels sont les deux types de cellules-souches présents dans la moelle osseuse?
Les cellules-souches hématopoïétiques et mésenchymateuses
Définir une lignée de cellules-souches pluripotentes induites
Une lignée de cellules somatiques dérivées de patient(e) (initialement différenciées) dont le génome est altéré pour acquérir des propriétés de cellules-souches pluripotentes
La transplantation autologue de cellules-souches pluripotentes induites peut-elle provoquer une réaction de rejet?
Non.
