C6 Flashcards
Equation de Mickaelis et Menten
v= f[(S)] hyperbole
V= (Vmax*[S])/(Km+[S])
à partir d’une certaine concentration en substrat la vitesse de réaction n’évolue plus, on atteint
vmax
si [S]=Km alors v=
1/2Vmax
constante de Michaelis
Km
km=
(k-1+k2)/k1
([S]*[E])/[ES]
représentation de Lineweaver et Burk
avec une pente de Km/Vmax
définie par
1/Vi=((Km/Vmax)*(1/[S]))+1/Vmax
lorsque 1/[S]=0 on 1/Vmax= 1/V
lorsque 1/v=0 alors 1/S= -1/Km
la constante de michaelis explication
concentration car Km correspond à S lorsque v=1/2Vmax
km est la constante de dissociation apparente du complexe ES
la force de liaison
si Km est petite alors l’affinité est forte
au contraire si elle est élevé l’affinité est faible
Vmax
vitesse théorique
v=Vmax= K2*[Et]
K2 est la constante catalytique kcat exprimée en temps^-1
constante catalytique
nombre de substrat transformé en produit par unité de temps permet alors d’apprécier la vélocité de l’enzyme
efficacité catalytique
vitesse et affinité
kcat/Km ou encore Vmax/Km
activité enzymatique
intérêt médical connaitre l’activité enzymatique permet de la doser il faut alors être en condition supérieur à km tel que km<[S] pour atteindre Vmax
ainsi le seul facteur à pH et T fixe est la concentration de l’enzyme
unité internationale activité enzymatique
nombre d’enzyme capable de transformer 1 µmol/min de substrat
isoenzymes
enzymes oligomériques
possède une structure quaternaire catalysent les mêmes réactions biochimiques
elles diffèrent en fct
-de leur sous unités
- leur affinité ainsi que leur comportement -électrophorétique
- propriétés antigéniques
fonction:
est adaptée au métabolisme de la cellule
ex la lactate déshydrogénase
enzyme à cinétique non michaelienne allostériques
enzymes oligomériques
cinétique non michaelienne
effet coopératif qui traduit la modification d’affinité dû modification de conformation , mécanisme de régulation
enzymes allostériques
relachée forte affinité
tendue: faible affinité
cette transition selon les modèles peut se faire progressivement ou d’un bloc
régulation du métabolisme par la régulation de l’activité enzymatique
régulation allostérique
régulation par des effecteurs allostériques
régulation par modification structurale
régulation par variation d’expression
régulation par des effecteurs allostériques
sensibles à des régulateurs n’ayant aucune analogie avec le substrat comme certains métabolites régulateurs, cet effecteur se fixe alors sur un site différent du site actif ou sur une sous unités régulatrice
ceux-ci peuvent être activateur favorisé la forme relachée ou inhibiteur et favoriser forme tendue
protéine kinase A a une fonction
sérine tyrosine kinase et possède un régulateur allostérique
régulations par modification structurale
on off
active inactive réaction rapide et régulée
qui peut être irréversible ou réversible
modification post traductionnelle comme une modification covalente d’un AA ou un clivage protéolytique
modification covalente d’un AA
réaction de transfert, phosphorylation est réversible
clivage protéolytique
précurseur inactif de l’enzyme est appelé zymogène
la protéolyse est irréversible
pour inactiver son effet il faut alors soit un inhibiteur soit une destruction de l’enzyme
variation du taux d’expression de l’enzyme
induction ou la répression des gènes change plus ou moins de synthèse d’une enzyme
contrôle transcriptionnel via des médiateurs solubles va activer une voie de signalisation intracellulaire
adaptation de la cell à son environnement et aux conditions métaboliques
inhibition enzymatique
diminution de l’efficacité catalytique
en présence d’une molécule un ligand qui se fixe sur l’enzyme
les sites de liaison de l’inhibiteur est le site actif ou un autre site via liaisons covalentes ou via interactions. cette liaison peut être réversible
ou irréversible
celle-ci peut être utilisé via thérapeutiques pour l’inhibition compétitive
inhibition compétitive
au niveau du site actif , diminution de l’affinité augmentation du Km
constante d’inhibition
Ki= [E][I]/[EI]
Ki= [I]/((K’m/Km)-1)
si Ki est faible l’affinité est grande
K’m
Km(1+([I]/ki))
vitesse en présence de l’inhibiteur
v’= vmax*[S]/ k’m+[S]
vmax ne ……. pour l’inhibition compétitive mais la ….. est plus élevé avec ……
change pas
pente
l’inhibiteur
inhibition du méthotrexate
reversible inhibiteur de la DHFR
pour observer les effet d’un inhibiteur on regarde la représentation de
lineweaver et burk
