bacterio 3 Flashcards

1
Q

La croissance bactérienne.
a) Sur milieu solide.

A

La culture des bactéries se fait dans des boîtes de pétri, sur ou dans de l’agar (=polysaccharide issu d’algues). L’agar forme un gel, il y a une réticulation qui permet aux cellules de rester en surface ou s’enfoncer, ou bien pour les cellules mobiles de se déplacer. Ça permet aussi la diffusion des nutriments.

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2
Q

La croissance bactérienne.
a) Sur milieu solide.
cette methode permet

A

Cette méthode permet :
o La numération des bactéries vivantes, par le comptage des colonies.
o L’isolement des colonies, si l’on est sûr qu’elles sont issues d’une seule cellule.

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3
Q

La croissance bactérienne.
a) Sur milieu solide.
création

A
  • Pour ensemencer le milieu, : milieu stérile + réaliser des stries, quart par quart, (garde à ne pas perforer la gélose) .
  • si correct : voir des colonies bien individualisées sur le quatrième quart, indiquant que les colonies viennent bien d’une même cellule.
  • La morphologie des colonies permet aussi d’identifier la bactérie.
  • On va récolter ces colonies, et les mettre en culture pour faire des tests biochimiques.
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4
Q

croissance bactérienne milieu solide
antibiogramme

A

Pour l’antibiogramme, on va ensemencer la totalité de la surface de la boîte de pétri, et on va déposer dessus des disques imprégnés d’antibiotique. S’il est efficace, l’antibiotique va créer des halos transparents autour du disque. Plus le halo est étendu, plus l’antibiotique est efficace.

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5
Q

croissance bactérienne
sur milieu liquide

A

Le développement en milieu liquide se fait dans un flacon fermé, de sorte que le milieu soit stérile. Il n’y a pas d’apport du milieu frais. La quantité de nutriments va diminuer au fil du temps, tandis que les déchets métaboliques vont augmenter. Le milieu devient ainsi toxique pour les cellules.

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6
Q

croissance bactérie
sur milieu liquide
graphique

A

La croissance est représentée sur un graphique. En ordonnée, le nombre de cellules vivantes, et en abscisse le temps d’incubation. Elle comporte plusieurs phases :
- La phase de latence
- Puis la phase exponentielle de croissance
- La phase stationnaire
- La phase de mortalité

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7
Q

sur milieu liquide
phase latente

A

La phase de latence au départ, sans multiplications cellulaires. Elle est variable, très courte quand on transpose des bactéries dans un milieu identique, plus longue si les bactéries doivent s’adapter à un nouveau milieu.

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8
Q

sur milieu liquide
phase expo

A
  • Puis la phase exponentielle de croissance. Le nombre de bactéries va doubler par unité de temps. Les bactéries se multiplient à leur vitesse maximum possible, en fonction de leur potentiel génétique, de leur milieu et leurs conditions de culture. A ce moment, elles ont une sensibilité maximale aux anti infectieux.
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9
Q

sur milieu liquide
phase stationnaire

A
  • La phase stationnaire, il n’y a pas de croissance, le nombre de cellules reste constant. C’est pendant cette phase que se forment les endospores car c’est à ce moment que la situation devient critique pour les bactéries.
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10
Q

sur milieu liquide
phase mortalite

A
  • La phase de mortalité, à peu près symétrique à la phase de croissance.
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11
Q

c) L’influence de l’environnement sur la croissance.
L’environnement influence la croissance via divers facteurs :

A

● La température
● L’oxygène
● Le pH
● La pression osmotique.

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12
Q

influence temperature

A

On va parler pour un organisme de température cardinale. Attention c’est ici inversé en ordonnée : le 0 est en haut et les températures plus grandes en bas. Il y a trois températures clé :
o La température minimale : la température la plus basse qui puisse permettre la croissance.
o La température optimale : la température pour laquelle les bactéries se multiplient le plus
rapidement possible
o La température maximale : au-delà de laquelle les bactéries meurent.

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13
Q

influence oxygene

A

Il existe plusieurs catégories de bactéries, en fonction de leur comportement par rapport à l’oxygène. Cela peut être déterminé lorsqu’on les fait croître dans un tube fermé avec un milieu liquide.

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14
Q

differente bacterie en fonction oxygene

A

Les aérobies stricts
Les microaérophiles
Les anaérobies facultatifs
Les anaérobies aérotolérants
Les anaérobies stricts:

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15
Q

Les aérobies stricts

A

Les aérobies stricts : vont se trouver en haut du tube vu que la concentration en oxygène y est la plus élevée, en raison du gradient d’oxygène.

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16
Q

Les microaérophiles :

A

Les microaérophiles : ils respirent eux aussi de l’oxygène, mais ne supportent pas la concentration d’oxygène de l’atmosphère, et doivent vivre entre 2 et 10% d’oxygène, une concentration plus forte les tuera.

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17
Q

les anaerobies

A
  • Les anaérobies facultatifs : synthétisent plus d’atp en utilisant l’oxygène que par fermentation, c’est pourquoi on observe un regroupement en haut du tube, dans la zone où il y a plus d’oxygène.
  • Les anaérobies aérotolérants : n’utilisent que la fermentation mais supportent la présence d’oxygène.
  • Les anaérobies stricts: ne tolèrent pas la présence d’oxygène, mais ce pendant cette tolérance est variable.
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18
Q

Le pH
on retrouve

A

Des acidophiles :
Des acidotolérants
Des neutrophiles :
Des alcalophiles

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19
Q

acidophiles

A

Des acidophiles : vivent en milieu acide. Plage de croissance pH : 1 à 5,5.
Exemple : lactobacillus, streptococcus mutans (Sont des agents de la maladie carieuse. Sont aussi acidogènes, c’est-à-dire qu’ils synthétisent des acides)

20
Q

acidotolérants

A

Des acidotolérants : tolèrent la présence d’acide grâce à des mécanismes de défense adaptés (neutralisation de l’environnement immédiat)
Exemple : Helicobacter pylori, qui vit dans l’estomac et synthétise de l’ammoniaque à partir de l’urée, il a une uréase. Celle-ci pourra servir de test de détection de cette bactérie.

21
Q

neutrophiles

A

Des neutrophiles : plage de croissance pH : 5,5 à 8,5.
Exemple : Porphyromonas gingivalis, impliquée dans les parodontopathies.

22
Q

alcalophile

A

Des alcalophiles : plage de croissance pH: 8,5 à 11,5.
Exemple : Vibrio cholerae.

23
Q

La pression osmotique.
Trois environnements sont possibles :

A

o Le milieu isotonique
o Le milieu hypotonique
o Le milieu hypertonique

24
Q

isotonique

A

les concentrations de solutés sont identiques des deux côtés de la membrane cytoplasmique, il y a un échange d’eau entre les deux côtés. Il n’y aura aucun effet sur la cellule.

25
Q

hypotonique

A
  • la concentration en solutés est plus élevée à l’intérieur de la cellule.
  • L’eau va rentrer dans la cellule.
  • Une cellule normale éclatera dans ces conditions.
  • Cependant la bactérie n’éclatera et ne sera détruite que si sa paroi est endommagée (dû à un antibiotique agissant sur la paroi, des lysozymes…).
  • Cette paroi est une mesure de protection, et sa présence empêche l’eau d’entrer dans la
    cellule.
26
Q

hypertonique

A

la concentration en solutés est plus élevée à l’extérieur de la cellule, par
conséquent de l’eau sort de la cellule. Le cytoplasme va se concentrer et s’effondrer au milieu de l’espace libre entre la capsule et la membrane cytoplasmique. C’est ce que l’on appelle une plasmolyse, qui se caractérise par une déshydratation de la cellule et un effondrement de la membrane cytoplasmique.

27
Q

Transfert horizontal de gènes.

A

Ces transferts sont facilités dans les différents types de biofilm, puisqu’il y a une grande proximité entre bactéries. Le transfert horizontal de gènes peut se faire de trois manières différentes :
o Par transformation : la bactérie meurt et libère son adn dans l’environnement. Cet ADN est ensuite fragmenté et incorporé dans le nucléoïde d’une autre bactérie.
o Par conjugaison : c’est par cette méthode que se propage la résistance bactérienne aux antibiotiques via les plasmides de type R. Un plasmide va être transféré dans une autre cellule.
o Par transduction : dû à la présence de phage.

28
Q

Mode de vie
a) Vie planctonique

A

Dans la vie planctonique les bactéries sont en suspension dans un milieu aqueux (salive et fluide gingival). Ce mode de vie permet un transport passif (mouvement du liquide) ou actif (rotation du flagelle).

29
Q

b) Vie sessile

A

Dans le mode de vie sessile il existe 2 types d’organisation : l’organisation lâche et celle structurée. - Organisation lâche :
Les bactéries se fixent sur des cibles cellulaires, il n’y a pas d’organisation précise.
- Organisation structuré (biofilm):
Les bactéries sont fixées sur des surfaces solides biotiques (ex: émail) ou abiotiques (ex: prothèse). L’adhésion de ces bactéries de manière très structurée forme le biofilm. Les biofilms sont responsables d’environ 65% des infections en milieu hospitalier, notamment sur les cathéters.

30
Q

b) Film de conditionnement

A

Les surfaces ne sont pas colonisables quand elles sont nues, il faut alors le dépôt d’un film de conditionnement celui- ci va conditionner la surface à l’adhésion bactérienne. Toute surface solide exposée à un environnement biologique aqueux acquiert spontanément un film de conditionnement acellulaire constitué de macromolécules organiques qui sont présentes dans l’environnement.

31
Q

csq film

A

Ce film de conditionnement modifie les caractéristiques physico-chimiques de la surface et influence l’adhésion des bactéries, grâce aux récepteurs alors présent sur le solide. RIEN ne peut empêcher le dépôt du film de conditionnement.

32
Q

Constitution du biofilm
1) Phase d’approche :

A

La surface est une source de nutriments pour les bactéries. En effet, elle est recouverte d’un film de conditionnement et donc d’une accumulation de nutriments. Les bactéries ont donc tendance à se déplacer vers ce type de surface. Si elles sont mobiles elles utilisent leur flagelle sinon elles utilisent le mouvement du milieu pour se déplacer.

33
Q

2) Adhésion possible grâce aux adhésine présente le long des flagelles.

A
  • Adhésion d’abord réversible car au départ il n’y a pas un grand nombre de liaisons, entre le flagelle et la surface, donc l’agitation du milieu peut provoquer la détache du flagelle et la bactérie repart alors dans le milieu.
  • Ensuite adhésion irréversible. Dans ce cas-là, la bactérie va établir un plus grand nombre d’interactions au niveau du flagelle ET du corps cellulaire l’adhésion devient alors irréversible
34
Q

adhesion charge

A

Normalement les 2 éléments ont une charge globale négative elles devraient alors se repousser mais “charge globale” ne veut pas dire unique charge, c’est à dire qu’à certains endroits des charges opposées, présentes soit sur la surface soit sur la bactérie, s’attirent.

35
Q

adhesion en se rapprochant

A

En se rapprochant encore (jusqu’à environ 5 nm) le film de conditionnement est visible et les appendices présents à la surface de la bactéries (flagelle, fimbriae, pili), vont réussir à combler cette distance incompressible grâce aux adhésines qui vont interagir avec les récepteurs des molécules du film. C’est à partir de ce moment-là qu’un très grand nombre d’interactions est formé, si il y’a une bonne correspondance entre récepteurs et adhésines, l’adhésion est irréversible. Plus il y a de liaisons, plus cela sera stable.

36
Q

L’interaction adhésine/récepteurs fait intervenir des :

A

o Liaisons hydrophobes
o Liaisonsioniques
o Liaisons covalentes (quelques fois)

37
Q

Quorum sensing

A

La mise en place du biofilm dépend de ce qu’on appelle le “quorum sensing”. C’est un principe qui dépend de petites molécules de signalisation qui va permettre une communication cellulaire entre tous les éléments et également permettre de constituer la structure d’un biofilm.

38
Q

role quorum

A

Le rôle c’est l’échange entre les bactéries : entre la même espèce, entre des espèces différentes ou encore entre des bactéries et des cellules eucaryotes (=communication interrègne)

39
Q

but quorum

A

Contrôler les fonctions qui répondent aux besoins d’une espèce donnée, ici la fonction principale étant de constituer un biofilm, que ce soit pour la colonisation d’un environnement particulier ou l’adaptation rapide à toute modification de ce milieu. Par exemple, si le milieu devient néfaste, les bactéries réactivent leur flagelle grâce aux molécules de signalisation, afin de s’extraire du biofilm.

40
Q

comment quorum

A

Pour que ce principe de “quorum sensing” s’exécute bien, il faut une régulation collective (positive ou négative) de l’expression de gènes cibles. Il faut également une coordination des différents membres de la communauté.

41
Q

resultat quorum

A

Colonies en colonnes ou champignons. Les champignons sont séparés par des vides appelés canaux à queues.

42
Q

auto inducteur

A

es molécules permettant cette communication sont appelées auto-inducteurs (AI) ce sont des molécules qui diffusent. Elles sont synthétisées de façon constitutive lorsque les bactéries se multiplient. A partir de ce moment la concentration en AI va être le reflet de l’intensité en cellule bactérienne, lorsque cette concentration d’AI atteint un seuil critique ils peuvent interagir avec les récepteurs à la surface de la bactérie. Pour certains AI il y a une transduction de signal qui va aboutir à une interaction avec un régulateur transcriptionnel qui contrôlera l’expression de gènes spécifiques. AI des bactéries ≈ nos hormones.

43
Q

2 types AI

A

2 systeme spe d’éspèces
- gram - : derives d’acides gras
- gram + : oligopeptides

1 systeme plus inversel

44
Q

Mec formé

A

Lorsque que les bactéries forment une colonie, sous l’influence du quorum sensing, elles produisent une MEC dans laquelle elles vont évoluer. Ces colonies sont séparées par des canaux qui permettent le passage des nutriments et l’évacuation des déchets. La MEC contient les EPS (substance polymérique extracellulaire) que sont :
o Des molécules d’ADN (qui sont libérées lorsqu’une bactérie meurt)
o Des protéines et des polysaccharides synthétisés par les bactéries (à partir des sucres que nous ingérons
pour la plaque).

45
Q

interaction constituant mec

A

Il y a des interactions entre ces ≠ éléments de la MEC qui sont des interactions de faibles énergies : o Forces électrostatiques attractives
o Forces ioniques répulsives et attractives
o Ponts cationiques (dans la cavité buccale cation divalent = Calcium)
o Liaisonshydrogène.
Finalement cette MEC qui enchâsse les colonies de bactéries va être très résistante.