Aminosyrametabolismen Flashcards
Hur är en aminosyra uppbyggd?
- aminogrupp NH2
- alfa kol med H och R
- karbonylgrupp COOH
Vad är aminosyrapoolen?
Var kommer aminosyrorna ifrån?
I celler har vi en pool av aminosyror som används främst för att syntetisera kroppens proteiner, t.ex. enzymer och strukturer.
Aminosyrorna kommer främst från proteiner som har degraderats från kroppens proteiner, som sedan byggs upp igen. Näst har vi aminosyror som tillförs via kosten, och vi kan även tillverka aminosyror genom transaminisering.
Vilket syfte har aminosyrapoolen
- främst att bilda nya proteiner
- men även en del enklare molekyler med kväve i, som puriner och hormoner.
- om vi äter för mycket kan aminosyrorna även vara substrat för glukoneogenes och ketonkroppar, beroende på om aminosyran är ketogen eller glucogen.
Vad är ubikvitin och hur används det?
Kostar det något?
En form av taggning för proteiner, genom att fosforylisera med en ATP, som ska degraderas i cytosol och cellkärna. Gör att cellen inte äter upp sina proteiner som inte ska förstöras.
På proteasomet finns en ubikvitinreceptor som därmed känner av proteinet indirekt.
Vad är en lysosom?
Vad bryts ner här, och hur går det till.
Proteiner utanför cellen kommer genom endocytos (endosomer) ihop med lysosomer. Lysosomer har en hög vätejonkoncentration och innehåller många proteaser som klyver proteinerna som kommer in.
Lysosomer är en organell som degraderar proteiner som kommer från cellens yta eller de som kommer utifrån cellen, t.ex NT eller hormoner, t.ex. plasmaproteiner.
Hur bryts proteiner i tarmen ner? Key: inaktiv, enzymer,
I magsäcken har vi pepsinogen som kommer att aktiveras till pepsin vid sur miljö pH 2-4.
Pancreatiska enzymer aktiveras av trypsinogen (proenzym i bukspott), som blir trypsin genom att enteropeptidaser på enterocyterna i tunntarmen sojälkar trypsinogen.
Många olika proteaser behövs, då dem klyver efter specifika peptidbindingar (aminosyror)
Nämn 3 proteaser i tarmen
Elastas
Trypsin
Kymotrypsin
Vad är transaminering?
Vilka aminosyror använder inte transaminering?
Aminosyra reagerar med a-KG —> a-ketosyra + glutamat
- flytta en aminogrupp
- vi bildar alltid a-KG eller glutamat, mha transaminaser.
Vilka aminosyror använder inte transaminering?
- lysin och treonin
Beskriv reaktionen med ALT.
alaninaminotransferas
alanin + a-KG pyruvat + glutamat
Vad är skillnaden strukturellt på en alfa-aminosyra och en alfa-ketosyra?
Aminosyra: alfa-kolet har en NH3+
Ketosyra: alfa-kolet har skapat en karbonlgrupp. C=O
Beskriv AST
aspartataminotransferas
OAA + glutamat aspartat + a-KG
Vad är oxidativ deaminering?
Enzym?
Kofaktorer?
Vad stimulerar denna reaktion?
När vi äter, kommer glutamat —> a-KG
- detta leder till att ammoniak, NH3, spjälkas av (=deaminisering), samtidigt kommer vi oxidera glutamat. NAD+ blir NADH.
—–> vidare till ureacykeln
GLUTAMATDEHYDROGENAS
Vid svält, kommer andra reaktionen gå åt vänster, a-KG —> glutamat, eftersom vi spjälkar många proteiner och frisätter mycket ammoniak.
- kofaktor NADPH –> NADP+
Regleras av ADP som stimulerar deamineringen, GTP vice versa
Hur transporteras NH3 ut från kroppen?
Urea
Vilka vägar kan ammoniak ta för att gå till ureacykeln?
Viktiga enzymer här.
1) universellt. Glutamat + NH3 –> glutamin
GLUTAMINSYNTAS
- kostar 1 ATP
I lever
1. glutamin + H20 —> glutamat
GLUTAMINAS
- deaminisering (glutamatdehydrogenas)
2) muskler kan även transportera bort via alanin-glukos cykeln. - pyruvat + glutamat —> alanin + a-KG
- alanin går till levern
- ALT
- pyruvat till glukoneogenes, glutamat till GLUTAMATDEHYDROGENAS för deaminisering
Vad är glukos-alanincykeln?
Vid glukoneogenes behöver vi substrat.
- Glukos bryts ner i muskeln genom glykolys, vi får pyruvat.
- Pyruvat kommer genom ALT –> alanin.
- Alaninets respektive alfa-ketosyra är pyruvat. Pyruvat går in i glukoneogenesen i levern.
Detta är bra för att få energi snabbt via glykolysen. Vi tillför alltså levern pyruvat för att bilda glucos som kan gå in i glykolysen så vi får snabb energi.
Varför transporterar vi inte glutamat istället för glutamin?
Glutamat har två karboxylgrupper, därmed surare. Dessutom mer laddad och svårare att passera cellmembran.
Beskriv översiktligt ureacykeln.
- i mitokondrien har vi NH3 som förts dit via glutamin från celler som brutit ner aminosyror.
- en koldioxid och en NH3 kommer att bilda carbamoylfosfat, en energirik intermediär som kräver 2 ATP. (vi kopplar på en fosfatgrupp).
- Carbamoylfosfat kommer reagera med ornitin och bli citrullin som kommer gå ut i cytosolen. Lämnar av sin fosfatgrupp.
- Citrulline + aspartat (som innehåller nästa NH3) + ATP —> argininosuccinat + AMP + PPi
- fumarat spjälkas, vi får arginin
- arginin kommer hydrolyseras med ARGINAS som är ett unikt enzym i levern. Vi spjälkar av urea. En koldioxid och två amminogrupper.
—> vi får ornitin —> citrullin
Hur mycket ATP kräver ureacykeln?
Hur mycket vatten bildas?
3 ATP
3 H2O