Brainscape's Knowledge GenomeTM

Browse over 1 million classes created by top students, professors, publishers, and experts.


See full index

EoN 2.0 > Nukleotidmetabolism > Flashcards

Nukleotidmetabolism Flashcards

1
Q

Beskriv några funktioner som nukleotider har.

A
  1. ATP- energivaluta
  2. Byggstenar i RNA och DNA
  3. UDP-glukos
  4. Co-enzymer (FAD, NAD, CoA
  5. cAMP- signalering
  6. ATP/AMP kvoten. reglering av metabolism.
  7. reglerar allosteriskt enzymer
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Beskriv hur en nukleotid är uppbyggd och vad skillnaden är från en nukleosid.

A

Nukleotid består av:

  • en fosfatgrupp (kol 5)
  • en ribos
  • en kvävebas (kol 1)

Esterbindning med fosfat, beta-glykosidbindning med kvävebasen.

Nukleosid är nukleotid utan fosfatgrupp.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Vilka är dem vanligaste purinerna?

A

adenin och guanin (DNA och RNA)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Vilka pyrdimidiner ingår i RNA? Vilken är också unik för RNA?

A

Cytosin

Uracil (unik)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Vilka pyrimidiner ingår i DNA. Vilken är unik för DNA?

A

Thymin (unik)

Cytosin

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Vad är den strukturella skillnaden på deoxyribos och ribos?

A

På kol nr 2 har DNA en väte, medan RNA har en OH.

Minnesregel: vi har tagit bort en syre på riboset = deoxyribos, ta bort syre.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Vilken är den gemensamma pyrimidinen för DNA och RNA?

A

Cytosin

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Beskriv hur syntesen de novo sker av puriner.

A

Sker i lever främst.

Puriner bildas från en ribos 5P. Därefter kommer PRPP syntas med ATP bilda PRPP. En ribos 5P med två fosfatgrupper på kol 1.
Magnesium behövs som kofaktor.

  1. PRPP spjälkar av sin PP. Glutamin ger sin NH2. Vi får 5-fosforibosylamin.
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Vilka effektorer reglerar PRPP-syntetas?

A 
Fosfat stimulerar
Purinribonucleotider inhiberar (AMP, GMP, IMP)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Vilka effektorer reglerar det andra steget i purinsyntesen?

A 
Stimulering
- PRPP
Inhibering
- AMP
- GMP
- IMP
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Vad heter slutprodukten i purinsyntesen?

Och vad heter basen?

Hur mycket ATP går åt?

A

IMP; inosin 5´-monofosfat

  • basen är hypoxantin
  • 5 ATP förbrukas
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Metotrexat är ett läkemedel som gör vad?

A

Metotrexat hämmar purinsyntesen till Inosin-monofosfat, därmed hämmar vi DNA-syntesen.
- Metotrexat är en behandling vid cancer.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Vilka enzymer hämmar Metotrexat?

A

Formyltransferas.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Vilka produkter skapar vi från IMP?

Vilka aminosyror används vid syntesen för respektive syntes?

A

AMP
- aspartat
GMP
- glutamin

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Hur regleras IMP –> AMP och GMP- syntesen?

A

negativ feedback-inhibering med produkterna.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Hur hämmas PRPP-syntas?

A

ADP (purinnucleotider) AMP + ATP –> ADP + ADP

17
Q

Salvage av puriner innebär att man återanvänder kvävebaser och för att bilda purinnukleotider. När sker salvage?

Beskriv salvage av AMP, GMP och IMP

A

I dem flesta celler, kan vi återskapa nukleotider.

AMP

  • adenin + PRPP —> AMP - PPi
  • enzym APRT

GMP
- guanin + PRPP —-> GMP + PPi

IMP
hypoxantin + PRPP —-> IMP + PPi

  • GMP och IMP har enzymet HGPRT
18
Q

Vad är APRT och HGPRT för enzym?

A

Fosforibosyl-transferaser

19
Q

Vad är en pyrimidin- gin?

Vilka substrat bygger upp den?

A

Det är den enkelringade formen som utgör en del av kvävebaserna

  • uracil
  • cytosin
  • thymin

aspartat, HCO3,

20
Q

Vad skiljer främst syntesen de novo av pyrimidiner och puriner?

A

Pyrimidin
- ringstrukturen byggs först, för att sedan kopplas på med PRPP.

Puriner
- börjar med en Ribos 5P, som fosforyliseras med PRPP-syntetas för att bilda en PRPP. på PRPP syntetiseras sedan purinen. —> IMP

21
Q

Beskriv syntesen av pyrimidin från att vi har erhållet karbamoylfosfat.

A

Pyrimidinringen bildas först genom att vi får Orotat. Denna kopplas sedan till en PRPP, och därefter sker en dekarboxylering för att få UMP, uracilmonofosfat.

22
Q

Vad är UMP, och vad används den till?

A

UMP är byggstenen för våra pyrimidin-nukleotider.

  1. UMP kommer fosforyliseras med kinaser till UTP
  2. UTP kommer sedan vara klar, men cytosin blir direkt trifosfatform CTP.
23
Q

Hur sker syntesen till CTP?

A

UTP —> CTP

  • CTP-syntas
  • glutamin + ATP + H2O —–> glutamat + ADP + Pi

Glutamin donerar sin aminogrupp och vi bildar cytosin av uracil.

24
Q

Våra nukleotider i trifosfatform, vad används dem till?

A

Substrat för DNA-polymeras.

25
Q

Vad gör ribonucleotid-reduktas?

Vilken grad av fosforylisering reducerar enzymet?

A

Omvandlar nukleotider till deoxyukleotider

  • omvandlas alltid i difosfatform!
26
Q

Beskriv uppbyggnaden av ribonucletoid-reduktas.

A
  • 2 identiska subenheter
  • Active site som har affinitet för difosfata nukleotider.
  • Två allosteriska regulatoriska sites, en primär som har affinitet för ATP, och dATP.
  • den andra har affinitet för substrat, och kan därigenom reglera vilka nukleotider som ska syntetiseras
  • enzymet består av 5 reduktioner, tredelenzymer och använder 2 st co-enzymerna NADPH, FADH2
27
Q

Varför syntetiseras dTTP från dUTP?

Enzym?

A

Pyrimidin-ringen har liknande struktur, med skillnaden att d-TTP har en metylgrupp också, som kommer katalyseras av enzymet thymidylatsyntas.

28
Q

Vad är 5-fluoracil?

A

En substans som gör att thymidylatsyntas förstörs efter en katalys till dTTP. Detta är ett cancerläkemedel.

Det är en typ av kemoterapi för att hämma DNA-syntes.

29
Q

Vad är den slutliga produkten av katabolism av puriner?

A

Urinsyra

30
Q

Vad heter intermediären där purinerna har tappat sin ribos vid katabolism?

Vilka puriner kommer ha intermediären hypoxantin?

A

Inosin kommer tappa riboset och bli hypoxantin

IMP och AMP kommer att kataboliseras till hypoxantin, inte GMP

31
Q

Vad är urinsyra för molekyl?

A

En purin som tappat sin ribos (förenklat)

32
Q

Vilken är den gemensamma intermediären för GMP AMP och IMP vid katabolism till urinsyra?

A

Sista steget innan urinsyra, Xanthin

33
Q

Beskriv nedbrytningen av GMP till Xanthin.

A

GMP och kommer bli Guanosin. Guanin har tappat sin fosfatgrupp och blivit nucleosid istället för nukleotid.

Guanosine kommer att tappa sin ribos, och bli guanin, innan den tappar sin aminogrupp och byter ut den mot en karbonylgrupp, för att bli Xanthin.

34
Q

Vad är gikt generellt?

Vad är primär gikt?

A

Gikt är en sjukdom som orsakas av ansamling av urinsyra i kroppen som kristalliseras ihop. Samlar sig gärna i ledbrosk.

Primär gikt är en ärftlig sjukdom. Vi har ingen hämning av PRPP-syntetas och därmed tillverkar vi mycket nukleotider som sedan kataboliseras till urinsyra.

35
Q

Vad är Lesch-Nyhan syndrom?

A

En typ av primär gikt som leder till ökad de novo syntes av puriner.

Enzymet HGPRT är muterat eller avsaknat, och vi kan inte göra salvage av hypoxantin och guanin, därmed ökad katabolism till urinsyra av dessa intemediärer.

( hypoxantin + PRPP —> IMP)

36
Q

Hur behandlas gikt?

A

Med en xantinoxidas-hämmare, som hämmar syntesen av Xanthin från AMP och IMP, samt urinsyra från Xhantin med GMP-vägen.

Intermediärerna är lättare att utsöndra via urin.

Alloxantin ser ut som en kompetetiv hämmare om man tittar på strukutren på sliden.

37
Q

Vad är SCID, severe combined immunodeficiency?

Vilkte enzym?

A

En ärftlig sjukdom där vi inte kan bryta ner AMP till urinyra.

adenosin –> inosin

ADENOSINDEAMINAS

38
Q

Vad blir konsekvensen av SCID)

A

Vi kan inte bryta ner AMP. Jämvikten till dATP kommer förskjutas, och vi får mycket dATP som hämmar ribonukletidreduktas, och därmed DNA-syntesen.

Drabbar hårdast lymfocyter som delar sig mest frekvent av alla celler i kroppen. Lymfocyter har högst nivå av enzymet ADA. Leder till immunbrist.

T och B-lymfocyter, långsammare celldelning.

39
Q

Hur behandlas SCID?

A

Genterapi, ersätta med korrekt gen. Benmärgstransplantation. (Poesen sker i benmärgen).

EoN 2.0 (21 decks)

Brainscape helps you reach your goals faster, through stronger study habits.
© 2024 Bold Learning Solutions. Terms and Conditions