9 partie 1 Flashcards
Quel est le rôle des transaminases?
redistribuer les groupements NH2 (surtout du glutamate et de l’alanine) pour synthétiser les différents acides aminés (anabolisme) à partir des acides alpha-cétoniques,
Ces réactions sont aussi utilisées pour en catabolisme pour récupérer ces acides alpha-cétoniques et obtenir de l’énergie
Les transaminases utilisent toutes une coenzyme. Laquelle?
le pyridoxal-phosphate (dérivé de la vitamine B6)
Compléter. Les réactions de transamination impliquent toujours un […] donneur de […] et un […] comme accepteur.
Les réactions de transamination impliquent toujours un acide aminé donneur du groupement NH2 et un cétoacide comme accepteur
Quels sont les 2 réactifs d’une réaction de transamination? Dites ce qu’ils deviennent du côté des produits.
Donnez un exemple?
un acide aminé et un α-cétoacide. Dans les produits, l’acide aminé devient l’α-cétoacide et l’α-cétoacide devient l’acide aminé
Exemple: glutamate + pyruvate = alpha-cétoglutarate + Alanine
Compléter. Dans les réactions de transamination, pour chaque acide aminé il y a un […] correspondant.
Dans les réactions de transamination, pour chaque acide aminé il y a un cétoacide correspondant.
V ou F. Les réactions de transamination sont réversibles.
VRAI
Pour la plupart des transaminases, quel est le donneur de NH2?
glutamate
Combien d’acide aminés sont métabolisés par les transaminases?
17
Quelles sont les 3 paires acide aminé- cétoacide importantes?
pyruvate-alanine
Oxaloacétate-Aspartate
Cétoglutarate-glutamate
À partir de quel α-cétoacide l’alanine est-il métabolisé?
pyruvate
À partir de quel α-cétoacide l’aspartate est-il métabolisé?
oxaloacétate
À partir de quel α-cétoacide le glutamate est-il métabolisé?
α-cétoglutarate
Quels sont les 3 acides aminés qui sont métabolisés par des déshydrogénases?
proline, lysine et thréonine
Les acides aminés sont synthétisés à partir des intermédiaires de quoi?
À partir des intermédiaires de
-la glycolyse
-le cycle de Krebs
-la voie des pentoses
Le groupe amine des acides aminés provient de quels composés (2)?
glutamate
glutamine
Combien y a-t-il d’acides aminés en tout?
20
Combien y a-t-il d’acides aminés essentiels?
10
Quel acide aminé est considéré comme essentiel, même s’il est synthétisé par les mammifères, mais à un taux insuffisant?
arginine
Quel autre a. a. est nécessaire à la synthèse de la cystéine ?
méthionine
Quel autre a. a. est nécessaire à la synthèse de la tyrosine?
phénylalanine
Quelle est la phrase pour se rappeler les 10 a. a. essentiels?
Mets le dans la valise, il fait trop d’histoires.
Mets : Met (méthionine)
le : Leu (leucine)
Val : Val (valine)
ise : Lys (lysine)
il : Ile (isoleucine)
fait : Phe (phénylalanine)
trop : Trp (tryptophane)
d’his : His (histidine)
toires : Thr (thréonine)
VRAI OU FAUX: les êtres humains peuvent synthétiser des acides aminés ramifiés ou aromatiques
FAUX, ils ne peuvent pas synthétiser des acides aminés ramifiés ou aromatiques
VRAI OU FAUX: Les êtres humains ne peuvent pas incorporer le souffre de la méthionine
VRAI
La biosynthèse de l’asparte est quel type de réaction?
transamination
Quel est le substrat de la biosynthèse de l’asparte?
et les produits?
substrats: glutamate et oxaloacétate (OAA)
produits: Aspartate et 2-oxoglutarate
Quelle est l’enzyme de la biosynthèse de l’aspartate?
aspartate transaminase (AST) ou
glutamate oxaloacétate transaminase (GOT)
La biosynthèse du glutamate est quel type de réaction?
transamination
Quel est le substrat de la biosynthèse du glutamate?
α-cétoglutarate et aspartate
Quelle est l’enzyme de la biosynthèse du glutamate?
aspartate transaminase (AST) ou glutamate oxaloacétate transaminase (GOT)
Quel autre nom donne-t-on à l’α-cétoglutarate?
oxoglutarate
La biosynthèse de l’alanine est quel type de réaction?
transamination
Quel est le substrat de la biosynthèse de l’alanine?
pyruvate
V ou F. La réaction de transamination pour la biostnthèse de l’aspartate est réversible. Si vrai, quel est le produit de la réaction inverse?
V. La réaction inverse est la biosynthèse du glutamate, donc le produit est le glutamate et l’oxaloacétate.
Quelle est l’enzyme de la biosynthèse de l’asparagine?
asparagine synthétase
Quel est le substrat de la biosynthèse de l’asparagine?
aspartate
Quelles molécules (2) sont nécessaires à la biosynthèse de l’asparagine?
glutamine (donneur du groupe NH2) et ATP
Quelle est l’enzyme de la biosynthèse de la glutamine?
glutamine synthétase (GS)
Quels sont les substrats de la biosynthèse de la glutamine?
glutamate et ammoniaque
V ou F. La biosynthèse de la glutamine nécessite de l’ATP
VRAI
La biosynthèse de la sérine se fait en combien d’étapes?
3
Quel est le substrat de la première étape de la biosynthèse de la sérine? D’où provient-il?
3-phosphoglycérate, c’est un intermédiaire de la glycolyse
Quelle est la réaction de la première étape de la biosynthèse de la sérine? Quelle molécule est utilisée?
réaction de réduction, le NAD+ est réduit en NADH
Quelle est la réaction de la deuxième étape de la biosynthèse de la sérine? Quelle molécule est utilisée?
transamination, le glutamate est utilisé (on obtient alors du α-cétoglutarate)
Quelle est la réaction de la troisième étape de la biosynthèse de la sérine?
déphosphorylation
Quel est le transporteur universel des unités à 1 atome de carbone?
le tétrahydrofolate (THF)
Qu’est-ce que le THF?
-transporteur universel des unités à 1 atome de carbone
-cofacteur pour la réaction de conversion de sérine en glycine (biosynthèse de glycine)
Quelle est la forme de tétrahydrofolate la plus réduite?
Quelle est la forme de tétrahydrofolate la plus oxydée?
Quelle est la forme de tétrahydrofolate intermédiaire entre la plus réduite et la plus oxydée?
méthylène THF
formyl THF
méthenyl THF
La sérine est utilisée pour synthétiser quoi?
La glycine et la cystéine
Quel est le cofacteur utilisé pour la biosynthèse de la glycine?
tétrahydrofolate
Quel est le substrat de la biosynthèse de la proline?
Par quel type de réactions se fait la biosynthèse de la proline? Quelles molécules sont utilisées?
substrat= glutamate
par des réaction rédox utilisant le NADPH comme source d’électrons. De l’ATP est aussi utilisé
Quel est le susbtrat de la synthèse de la tyrosine?
phénylalanine
Quelle est l’enzyme de la biosynthèse de la tyrosine?
phénylalanine hydroxylase (PAH)
Quel cofacteur est utilisé pour la biosynthèse de la tyrosine?
tétrahydrobioptérine
Qu’est-ce que la phénylcétonurie? Par quoi est-ce causé?
Une maladie génétique causée par une déficience en PAH (l’enzyme de la biosynthèse de la tyrosine). La déficience en PAH entraîne l’accumulation des métabolites de la phénylalanine et un manque de tyrosine
Quel acide aminé est un précurseur clé pour les acides aminés essentiels?
aspartate
3 molécules ont un rôle clé dans la synthèse des acides aminés essentiels. Lesquelles?
le pyridoxal-phosphate, l’acide folique et ses dérivés et la vitamine B12
Que sont les nucléotides?
-éléments de base de l’ADN et ARN
-Coenzymes
-2e messagers
-Régulateurs allostériques
-Métabolisme, composés énergétiques (ATP)
V ou F. Chez l’humain, il y a grand besoin alimentaire pour les pyrimidines et les purines.
F, il y a des bonnes voies de synthèse pour les pyrimidines et les purines donc c’est pas nécessaire d’en avoir beaucoup dans l’alimentation
Le pentose d’un nucléotide est phosphorylé en quelle position?
5’
V ou F. Les purines et les pyrimidines ont la même voie de synthèse.
FAUX, elles ont des voies distinctes
La voie de biosynthèse de novo des nucléotides utilise quoi comme précurseur?
La voie de biosynthèse de récupération des nucléotides utilise quoi comme précurseur?
Des précurseurs simples comme des acides aminés et des sucres
d’autres acides nucléiques dégradés, les bases azotées sont récupérées auprès d’autres nucléotides dégradés
Quel est le précurseur des nucléotides dans les voies de synthèse de novo et de récupération?
Par quoi est-il formé?
Par quelle enzyme?
Elle est inhibiée par quoi?
phosphoribosyl-1-pyrophosphate
(un pentose phosphate)
-Il est formé de ribose par phosphorylation ATP dépendant
-Par l’enzyme PRPP synthétase
-L’enzyme est inhibée par les purines et les pyrimidines (inhibition allostérique)
D’où vient le ribose du précurseur des nucléotides?
du cycle des pentoses
La voie biosynthèse des nucléotides par récupération nécessite quoi?
Besoin de :
-PRPP (phosphoribosyl-1-pyrophosphate) et
-des bases azotées
La voie biosynthèse des nucléotides de novo nécessite quoi?
PRPP (phosphoribosyl-1-pyrophosphate),
ATP,
acides aminés et
des unités monocarbonées (unités à 1 atome de carbone)
Quelle voie de biosynthèse des nucléotides (soit de novo ou de récupération) a besoin de plus d’énergie?
la voie de novo
La voie de novo de la biosynthèse des purines génère quel nucléotide?
IMP (inosine monophosphate)
La voie de novo de la biosynthèse des pyrimidines génère quel nucléotide?
UMP (uridine monophosphate)
V ou F. La voie de novo de la biosynthèse des nucléotides comporte 2 étapes.
F. Il y a de nombreuses étapes autant pour la synthèse des purines que des pyrimidines
Purines: 11 étapes et 6 ATP
Pyrimidines: 6 étapes et 2 ATP
Quelle voie de biosynthèse des nucléotides (soit de novo ou de récupération) est préférée par la cellule? Pourquoi?
celle de récupération, car elle demande moins d’énergie et comporte moins d’étapes
Quels sont les 3 acides aminés utilisés pour la synthèse de l’IMP?
glutamine, glycine, aspartate
Quelles sont les 2 molécules donneuses d’unité à 1 atome de carbone utilisées dans la synthèse de l’IMP?
bicarbonate et formyl-tétrahydrofolate
V ou F. La synthèse de novo des purines commence par la formation de la base azotée, puis elle est ensuite ajoutée sur le sucre.
F. La synthèse de l’IMP se fait par assemblage de la base azotée purique sur une molécule de 5-phosphoribosyl pyrophosphate (PRPP) activé directement
La biosynthèse de novo des pyrimidines nécessite quels acides aminés?
glutamine et aspartate
Quelle est la molécule donneuse d’unité à 1 atome de carbone utilisée dans la synthèse de l’UMP?
bicarbonate
Quelle réaction doit être faite pour obtenir les autres pyrimidines à partir du précurseur?
- précurseur = UMP
- UMP doit être phosphorylé en UDP, puis en UTP
- à partir de l’UTP, la CTP par la CTP synthétase
Comment obtient-on le CTP à partir de l’UMP? Quel est le type de la réaction et quelle est l’enzyme utilisée?
l’UMP est phosphorylé en UDP, puis en UTP, ensuite l’UTP est converti en CTP par amination avec l’enzyme CTP synthétase
V ou F. La synthèse de novo des pyrimidines commence par la formation de la base azotée, puis elle est ensuite ajoutée sur le sucre.
V. La base est synthétisée avant, puis ensuite es conjuguée au 5-phosphoribosyl pyrophosphate (PRPP)
V ou F. La synthèse de novo des purines nécessite plus d’ATP que celle des pyrimidines.
vrai
La synthèse des purines se fait où dans la cellule?
cytosol
La synthèse des pyrimidines se fait où dans la cellule?
cytosol et mitochondries
*a besoin de la chaine de transport des électrons
V ou F. Les voies de récupération sont responsables de 90% de la synthèse de nucléotides
vrai
Quelles sont les 2 enzymes importantes dans la récupération des purines?
1) APRT: convertit l’adénine en AMP
2) HGPRT: convertit l’hypoxanthine en IMP et la guanine en GMP (VOIE LA + IMPORTANTE CHEZ L’HOMME)
Que cause la déficience de HGPRT?
Cause du syndrome neurologique de Lesch-Nyhan
-caractérisé par accumulation de l’acide urique et problèmes neurologiques
2 différences les + importantes entre l’ARN et l’ADN?
Présence de désoxyribose et de thymidine dans l’ADN
Comment sont converti les ribonucléotides et désoxyribonucléotides?
Quelles sont les régulations allostériques?
Par réduction via l’enzyme ribonucléotide réductase qui utilise NADPH comme agent réducteur ultime
Régulation allostériques :
-dATP (-)et ATP (+) = domaine d’activité
-dATP, dGTP, dTTP = domaine de spécificité
Quelles drogues ciblent la RR?
Les drogues anticancéreuses
Comment est composé la ribonucléotide réductase?
Quels sont ses substrats?
C’est un tétramère hétérodimérique composé de 2 sous-unités:
R1= Site actif et 2 sites allostériques
R2= radicalTyr et cofacteur métallique requis pour l’activité catalytique
Substrats: ADP, GDP, CDP, UDP
Quels sont les 2 sites de contrôle de la RR?
1) Le site d’activité: maintien la balance entre les ribonucléotides et les désoxyribonucléotides
-L’ATP, un ribonucléotide active l’enzyme et le dATP un
désoxyribonucléotide l’inhibe
2) Le site de spécificité: maintient la balance entre les 4 désoxyribonucléotides. Ici le dATP stimule la formation des dUDP et dCDP, le dTTP stimule la formation de dGDP.
Comment est produite la thymidine?
Par quelle enzyme?
Quel est le donneur d’unités à 1 carbone?
Par quoi est-il regénéré? (qu’est-ce qui inhibe le régénérateur?)
-à partir d’UMP
-Par l’enzyme thymidilate synthase: elle fait la méthylation de dUMP pour former dTMP
-Le donneur d’unité à 1 carbone est le méthylène THF qui est converti en DHF
-une enzyme dépendante de NADPH, appelée dihydrofolate réductase régénère le cofacteur réduit, le THF
-Le méthotrexate est un inhibiteur compétitif de la DHFR utilisé dans la thérapie contre le cancer.
Réaction de formation de la thymidine?
dUMP + méthylène THF = dTMP + dihydrofolate
L’excès de purines est convertit en quoi?
Par quelle enzyme?
Purines devient hypoxanthine
-hypoxanthine est convertit en Acide urique (produit final de la dégradation de purines), éliminé via besoins
-Par l’enzyme Xanthine Oxydase
Que produit la dégradation de pyrimidines?
Produit la bêta-alanine
Qu’est-ce que la goutte?
Que faut-il éviter de manger?
Quel est le traitement?
C’est une maladie métabolique qui cause l’inflammation des articulations (surtout gros orteils)
-à cause de l’accumulation d’acide urique
Il faut éviter de manger de la viande (remplacer lait comme source de protéines
Traitement: inhibiteurs de la Xanthine Oxydase, comme l’allopurinol
