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bioCH > 11 S > Flashcards

11 S Flashcards

1
Q

Comment le lactose peut-il être utilisé comme source d’énergie

A

À l’aide de la B-galactosidase

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Q

Que fait le B-galactosidase

A

-convertit le lactose en glucose et galactose (50%)
-Convertit lactose en allolactose (50%) par isomérisation

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3
Q

La B-galactosidase est quelle genre d’enzyme

A

Enzyme inductible (elle est seulement présente en grande quantité en présence de lactose)

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4
Q

Que veulent dire les couleurs dans le Test de coloration de Agar sur X-gal

A

Bleu : présence de galactosidase
Blanches : absence de galactosidase

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5
Q

Les colibacilles peuvent être étudié comme les ?

A

Éléphants

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6
Q

L’activité du represseur lac est ajusté par quoi ?

A

allolactose (isomère B-(1-6) du lactose)

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7
Q

Qu’entraine la fixation de l’allolactose au répresseur lac

A

Induit transformation qui entraine dissociation du represseur de son site de liaison sur l’opérateur

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8
Q

Que permet l’inactivation du represseur

A

Permet à ARN pol de commencer à transcrire l’opérons et d’induire l’expression des gènes

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9
Q

Lac 1 c’est quoi

A

Le represseur

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10
Q

Que fait lac 1 concrètement

A

se lie sur 2 sites voisins de promoteur de l’opéron lac, ce qui crée une boucle dans l’ADN

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11
Q

Que veut dire palindrome

A

séquence d’ADN identique lorsque lu dans le sens 5’-3’ de chaque brin

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12
Q

Comment se fait la boucle dans l’ADN par lac 1

A

Vu qu’il s’agit d’un ADN palindrome, il peut y avoir des séquences qui se lient et cela crée une boucle dans l’ADN, ce qui rend le promoteur innacessible

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13
Q

VRAI OU FAUX: le répresseur empêche l’ARN de s’attacher au promoteur

A

FAUX, ARN peut s’attacher au promoteur, mais ne peut pas débuter la transcription

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14
Q

Grâce à quoi l’opéron Lac peut être régulé de manière positive

A

Par une prot qui l’ADN de manière spécifique : CRP

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15
Q

Que permet CRP-AMPc

A

De permettre à l’ARN pol de transcrire plus efficacement

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16
Q

Quelle molécule inhibe l’AMP cyclique chez les bactéries

A

Glucose

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17
Q

Qu’arrive-t-il si CRP n’a pas d’AMPc

A

Il ne peut pas activer la transcription

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18
Q

Si glucose + lactose, =

Si AUCUN=

Si lactose seulement=

A

CRC-CAP non-active, mais répresseur non-plus = transcription faible

répresseur actif= transcription très faible

CRC-CAP est actif et répresseur inactif = transcription maximale

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19
Q

Quelles sont les 2 principaux facteurs de transcription

A

-Constitutifs
-Régulateurs

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20
Q

Par quoi sont régulés les facteurs régulateurs

A

-Développement
-Signaux spécifiques

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21
Q

Que font les facteurs signaux spécifiques

A

-Récepteurs nuclaires
-Signaux de stress
-Voies de signalisation

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22
Q

Que permettent les facteurs de signaux spécifiques

A

-Liaison de l’ADN de façon spécifique
-Création de 2 domaines fonctionnelles

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23
Q

Quelles sont les 2 domaines fonctionnelles des facteurs signaux spécifiques (facteurs de transcription)

A

1- Domaine de liaison de l’ADN
2- Domaine de régulation de la transcription

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24
Q

Qu’arrive-t-il avec p53 quand il y a un stress sur l’ADN

A

Lie l’ADN avec les séquences palindromiques, ce qui va lier en forme de tetramère

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25
Q

Cb y’a-t-il de FT chez l’homme

A

1052

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26
Q

Cb y’a-t-il de FT vérifiés expérimentalement

A

62

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27
Q

Quelle est le régulateur des muscles

A

MyoD

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28
Q

Quelle est le régulateur des cellules rouges

A

GATA1

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29
Q

Qu’est-ce que les éléments de réponse?

A

Sites de fixation initiales de FT qui recrutent médiateur, FTG et ARN pol
-souvent situés en amont du promoteur et peuvent agir à distance

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30
Q

Quelles sont les régulateur des cellules souches

A

Oct4, Sox2, Klf4, Myc

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31
Q

Quelle est le régulateur des macrophages

A

C/EBPa

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32
Q

Quelle est le régulateur des T Cells, macrophage

A

Pax 5 ablation

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33
Q

Quelle est le régulateur de Islet B-cells

A

Pdx1
Ngn3
Mafa

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34
Q

Que permettent les FT spécifiques

A

Contrôlent l’expression des gènes du développement

35
Q

Que font les homéodomaines

A

Reconnaissent la boite homeotique

36
Q

Quelle est la structure du domaine qui lie l’ADN avec les homeodomaines

A

3d appelée hélice-tour-hélice
(3 hélices alpha séparées par une boucle et un tour)

37
Q

Qui a découvert la dédifférenciation

A

Shinya Yamanaka

38
Q

C’est quoi un amplificateur (enhancer)

A

Séquence d’ADN riches en éléments de réponse qui augmentent la transcription et peuvent agir à distance du promoteur en amont et en aval

39
Q

Quelles sont les propriétés des amplificateurs

A

-Plusieurs centaine de bps
-Lient plusieurs FT
-Liaison est coopérative

40
Q

Qu’a besoin l’ARN avant d’être traduit
(modifications possibles durant la maturation)

A

3 remaniements :
1-soustraction de nt aux transcrits primaires d’ARN
2. addition de séquences nucléotidiques non codées par le gène correspondant
3. modification covalente de certaines bases

41
Q

Quelle est la maturation d’ARNm chez les procaryotes

A

Y’en a pas, elle est traduit avant que la transcription s’achève

42
Q

Ou se passe la traduction et la transcription chez les eucaryotes

A

Transcription : Dans le noyau
Traduction : Dans le cytosol

43
Q

Par ou passe les ARNm chez les eucaryotes

A

Par les pores nucléaires (120 nm de diamètre)

44
Q

Comment fonctionne la modification de l’extrémité 5’

A

Extrémité 5’ + phosphohydrolase = -groupe phosphate c
groupe 5’-diphosphate + GTP + quanylyltransferase = 5’triphosphate = la coiffe
Coiffe + méthylation de guanine + méthyltransférases = 7-Méthyl G

45
Q

Quelles méthylation peut avoir lieu pdt la maturation de l’ARNm

A

7-Guanine
2’OH des 2 premiers nucléotides

46
Q

Quand est-ce que commence la formation de la coiffe

A

Dès que l’ARN sort de la pol 2

47
Q

À quoi sert la coiffe dans l’ARNm définitif

A

-À ancrer les ribosomes en vue de la synthèse protéique

48
Q

À quoi sert la coiffe dans le noyau

A

À empêcher l’action des 5’-exonucléases

49
Q

Que fait la coiffe 5’ avec les précurseurs de l’ARNm

A

Les transforme en substrat pour d’autres enzymes nucléaires de maturation, comme celles qui font l’excision-épissage

50
Q

Les ARN peuvent avoir quelle autre type de coiffe

A

Une coiffe NAD des fois

51
Q

Les modifications 3’

A

Transcription du signal de polyadénylation (AAUAAA)
3.Clivage/Coupure en aval du signal à une distance de 10-20 nucléotides
4.Ajout de 250 A avec la poly(A) pol qui utilise de l’ATP (Cette queue s’appelle PolyA) sans matrice
-réaction d’ajout est ATP-dépendante

52
Q

Comment se fait la terminaison

A

Après le clivage, exonucléasse 5’-3’ (RAT) dégrade ARN naissante
Transcription finit quand Rat1 rentre en collision avec l’ARN pol 2 (modèle torpille)
Queues Poly A + ARN matures + prot PABP = Complexe qui stabilise l’ARNm ce qui l’empêche d’être dégradé par l’extrémité 3’

53
Q

Existe-t-il des ARNm eucaryotes dépourvus de queues PolyA

A

Oui

54
Q

Les procaryotes ont-ils une séquence discontinue

A

Non

55
Q

Ou se trouve l’épissage des exons

A

Chez les eucaryotes seulement

56
Q

Ou est situé le site d’embranchement sur l’intron

A

20-50 nt de l’extrémité 3’ de l’intron (5’ de l’exon)

57
Q

À quoi sert le site d’embranchement

A

Quand l’extrémité 3’ de l’exon est libéré, l’extrémité 5’ (5’OH) va être lié par réaction phosphodiester avec le 2’OH de l’adénosine du site d’embranchement

58
Q

Qu’arrive-t-il au 3’OH après qu’il soit libéré pat l’épissage

A

Il attaque le phosphate de la jonction intron-exon en aval = Jonctions exon-exon ensemble + l’intron cyclisé/lasso
L’intron est dégradé

59
Q

De quoi est composé le spliceosome

A

Complexe de 5 molécules d’ARN: U1, U2, U4, U5, U6
-BESOIN D’ATP

60
Q

Qu’est-ce qu’un RNP

A

Chaque RNP est formé par un petit ARN nucléaire du splicesosome + plusieurs protéines

61
Q

après avoir lié l’extrimité 5’ de l’intron et la boite d’embranchement, que se passe-t-il

A

U4 et U1 quittent le complexe

62
Q

En quoi consiste l’épissage alternatif

A

À sélectionner des exons dans le précurseur de l’ARNm mature

63
Q

Quelle % de gènes composant le génome humain subissent un épissage alternatif

A

70%

64
Q

Un gène donne cb de variants

A

4 variants

65
Q

Cb de protéines peuvent donner les variants

A

100k différentes

66
Q

L’ARN pol 1 synthèse quoi ?

A

ARNr

67
Q

Ou se trouve l’ADN ribosomique

A

Nucléoles

68
Q

Comment fonctionne l’initiation de l’ARN pol 1

A

UBF s’attache à UCE (élément du command en amont)
SL1 lie UBF-ADN grâce à sa TBP
UBF recrute pol 1

69
Q

L’ARN pol 3 synthétise quoi

A

petits ARN : ARNt et ARNr 5S

70
Q

Comment fonctionne l’initiation de l’ARN pol 3

A

TF3C lie boite A et boite B
Recrute ensuite TF3B + pol 3 + TBP

71
Q

Quelles sont les caractéristiques des petits ARN nucléaires (ARN non codants)

A

1000 bases contenants bcp de U
Fortements appariés et bcp dans le noyau (100k)
Font partie de snRNP à multiples fonctions
Sm = site de liaison aux prot

72
Q

Que font les prot Sm

A

Ceux sont des antigènes ciblés par les anticorps anti-sm chez les gens avec LED (Lupus e. dissiminé = maladie auto-immune)

73
Q

Les introns du groupe 1 se trouve chez qui ?

A

Protozoaires

74
Q

Les introns du groupe 2 se trouve chez qui ?

A

Mitochondries

75
Q

Qu’est-ce que l’autoépissage

A

L’ARN catalyse toutes les réactions d’épissage

76
Q

Le spliceosome ressemble à quoi ?

A

Introns groupe 2

77
Q

Quelles sont les autres ribozymes à part le spliceosome

A

Hammerhead, hairpin, ribosome

78
Q

Quelles sont les types d’ARN interférentes

A

siRNA
miRNA
piRNA

79
Q

Rôles des ARN interferentes

A

Reconnaitre ARN spécifique
Reconnaitre ARN aberrantes et toxiques produites par les transposons et les séquences répétées

En résumé : inhibition des ARNm
-fonctionne comme guide pour cibler les ARN spécifiques (ARNm ou ARN toxiques)

80
Q

Qui a remporté le prix Nobel 2006

A

Craig Mellow
Andrew Fire

81
Q

Quelles sont les tailles des ARN interférantes

A

simple brin entre 20-30nt

82
Q

Quelles sont les fonctions de siRNA

A

Voie d’interférence à l’ARN commence par un ARN double brin
-Dicer catalyse la conversion de l’ARN double brin en siARN double brin
-RISC choisit un brin de l’ARN double brin
-RISC a une activité de coupure de l’ARN cible

83
Q

Que font les miARN

A

-ont 2 domaines: seed 3’ region
-a plusieurs cibles (forme paires de bases avec seed)
-RISC ne coupe ps les cibles, mais inhibent leur traduction

bioCH (12 decks)

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