11 S Flashcards
Comment le lactose peut-il être utilisé comme source d’énergie
À l’aide de la B-galactosidase
Que fait le B-galactosidase
-convertit le lactose en glucose et galactose (50%)
-Convertit lactose en allolactose (50%) par isomérisation
La B-galactosidase est quelle genre d’enzyme
Enzyme inductible (elle est seulement présente en grande quantité en présence de lactose)
Que veulent dire les couleurs dans le Test de coloration de Agar sur X-gal
Bleu : présence de galactosidase
Blanches : absence de galactosidase
Les colibacilles peuvent être étudié comme les ?
Éléphants
L’activité du represseur lac est ajusté par quoi ?
allolactose (isomère B-(1-6) du lactose)
Qu’entraine la fixation de l’allolactose au répresseur lac
Induit transformation qui entraine dissociation du represseur de son site de liaison sur l’opérateur
Que permet l’inactivation du represseur
Permet à ARN pol de commencer à transcrire l’opérons et d’induire l’expression des gènes
Lac 1 c’est quoi
Le represseur
Que fait lac 1 concrètement
se lie sur 2 sites voisins de promoteur de l’opéron lac, ce qui crée une boucle dans l’ADN
Que veut dire palindrome
séquence d’ADN identique lorsque lu dans le sens 5’-3’ de chaque brin
Comment se fait la boucle dans l’ADN par lac 1
Vu qu’il s’agit d’un ADN palindrome, il peut y avoir des séquences qui se lient et cela crée une boucle dans l’ADN, ce qui rend le promoteur innacessible
VRAI OU FAUX: le répresseur empêche l’ARN de s’attacher au promoteur
FAUX, ARN peut s’attacher au promoteur, mais ne peut pas débuter la transcription
Grâce à quoi l’opéron Lac peut être régulé de manière positive
Par une prot qui l’ADN de manière spécifique : CRP
Que permet CRP-AMPc
De permettre à l’ARN pol de transcrire plus efficacement
Quelle molécule inhibe l’AMP cyclique chez les bactéries
Glucose
Qu’arrive-t-il si CRP n’a pas d’AMPc
Il ne peut pas activer la transcription
Si glucose + lactose, =
Si AUCUN=
Si lactose seulement=
CRC-CAP non-active, mais répresseur non-plus = transcription faible
répresseur actif= transcription très faible
CRC-CAP est actif et répresseur inactif = transcription maximale
Quelles sont les 2 principaux facteurs de transcription
-Constitutifs
-Régulateurs
Par quoi sont régulés les facteurs régulateurs
-Développement
-Signaux spécifiques
Que font les facteurs signaux spécifiques
-Récepteurs nuclaires
-Signaux de stress
-Voies de signalisation
Que permettent les facteurs de signaux spécifiques
-Liaison de l’ADN de façon spécifique
-Création de 2 domaines fonctionnelles
Quelles sont les 2 domaines fonctionnelles des facteurs signaux spécifiques (facteurs de transcription)
1- Domaine de liaison de l’ADN
2- Domaine de régulation de la transcription
Qu’arrive-t-il avec p53 quand il y a un stress sur l’ADN
Lie l’ADN avec les séquences palindromiques, ce qui va lier en forme de tetramère
Cb y’a-t-il de FT chez l’homme
1052
Cb y’a-t-il de FT vérifiés expérimentalement
62
Quelle est le régulateur des muscles
MyoD
Quelle est le régulateur des cellules rouges
GATA1
Qu’est-ce que les éléments de réponse?
Sites de fixation initiales de FT qui recrutent médiateur, FTG et ARN pol
-souvent situés en amont du promoteur et peuvent agir à distance
Quelles sont les régulateur des cellules souches
Oct4, Sox2, Klf4, Myc
Quelle est le régulateur des macrophages
C/EBPa
Quelle est le régulateur des T Cells, macrophage
Pax 5 ablation
Quelle est le régulateur de Islet B-cells
Pdx1
Ngn3
Mafa
Que permettent les FT spécifiques
Contrôlent l’expression des gènes du développement
Que font les homéodomaines
Reconnaissent la boite homeotique
Quelle est la structure du domaine qui lie l’ADN avec les homeodomaines
3d appelée hélice-tour-hélice
(3 hélices alpha séparées par une boucle et un tour)
Qui a découvert la dédifférenciation
Shinya Yamanaka
C’est quoi un amplificateur (enhancer)
Séquence d’ADN riches en éléments de réponse qui augmentent la transcription et peuvent agir à distance du promoteur en amont et en aval
Quelles sont les propriétés des amplificateurs
-Plusieurs centaine de bps
-Lient plusieurs FT
-Liaison est coopérative
Qu’a besoin l’ARN avant d’être traduit
(modifications possibles durant la maturation)
3 remaniements :
1-soustraction de nt aux transcrits primaires d’ARN
2. addition de séquences nucléotidiques non codées par le gène correspondant
3. modification covalente de certaines bases
Quelle est la maturation d’ARNm chez les procaryotes
Y’en a pas, elle est traduit avant que la transcription s’achève
Ou se passe la traduction et la transcription chez les eucaryotes
Transcription : Dans le noyau
Traduction : Dans le cytosol
Par ou passe les ARNm chez les eucaryotes
Par les pores nucléaires (120 nm de diamètre)
Comment fonctionne la modification de l’extrémité 5’
Extrémité 5’ + phosphohydrolase = -groupe phosphate c
groupe 5’-diphosphate + GTP + quanylyltransferase = 5’triphosphate = la coiffe
Coiffe + méthylation de guanine + méthyltransférases = 7-Méthyl G
Quelles méthylation peut avoir lieu pdt la maturation de l’ARNm
7-Guanine
2’OH des 2 premiers nucléotides
Quand est-ce que commence la formation de la coiffe
Dès que l’ARN sort de la pol 2
À quoi sert la coiffe dans l’ARNm définitif
-À ancrer les ribosomes en vue de la synthèse protéique
À quoi sert la coiffe dans le noyau
À empêcher l’action des 5’-exonucléases
Que fait la coiffe 5’ avec les précurseurs de l’ARNm
Les transforme en substrat pour d’autres enzymes nucléaires de maturation, comme celles qui font l’excision-épissage
Les ARN peuvent avoir quelle autre type de coiffe
Une coiffe NAD des fois
Les modifications 3’
Transcription du signal de polyadénylation (AAUAAA)
3.Clivage/Coupure en aval du signal à une distance de 10-20 nucléotides
4.Ajout de 250 A avec la poly(A) pol qui utilise de l’ATP (Cette queue s’appelle PolyA) sans matrice
-réaction d’ajout est ATP-dépendante
Comment se fait la terminaison
Après le clivage, exonucléasse 5’-3’ (RAT) dégrade ARN naissante
Transcription finit quand Rat1 rentre en collision avec l’ARN pol 2 (modèle torpille)
Queues Poly A + ARN matures + prot PABP = Complexe qui stabilise l’ARNm ce qui l’empêche d’être dégradé par l’extrémité 3’
Existe-t-il des ARNm eucaryotes dépourvus de queues PolyA
Oui
Les procaryotes ont-ils une séquence discontinue
Non
Ou se trouve l’épissage des exons
Chez les eucaryotes seulement
Ou est situé le site d’embranchement sur l’intron
20-50 nt de l’extrémité 3’ de l’intron (5’ de l’exon)
À quoi sert le site d’embranchement
Quand l’extrémité 3’ de l’exon est libéré, l’extrémité 5’ (5’OH) va être lié par réaction phosphodiester avec le 2’OH de l’adénosine du site d’embranchement
Qu’arrive-t-il au 3’OH après qu’il soit libéré pat l’épissage
Il attaque le phosphate de la jonction intron-exon en aval = Jonctions exon-exon ensemble + l’intron cyclisé/lasso
L’intron est dégradé
De quoi est composé le spliceosome
Complexe de 5 molécules d’ARN: U1, U2, U4, U5, U6
-BESOIN D’ATP
Qu’est-ce qu’un RNP
Chaque RNP est formé par un petit ARN nucléaire du splicesosome + plusieurs protéines
après avoir lié l’extrimité 5’ de l’intron et la boite d’embranchement, que se passe-t-il
U4 et U1 quittent le complexe
En quoi consiste l’épissage alternatif
À sélectionner des exons dans le précurseur de l’ARNm mature
Quelle % de gènes composant le génome humain subissent un épissage alternatif
70%
Un gène donne cb de variants
4 variants
Cb de protéines peuvent donner les variants
100k différentes
L’ARN pol 1 synthèse quoi ?
ARNr
Ou se trouve l’ADN ribosomique
Nucléoles
Comment fonctionne l’initiation de l’ARN pol 1
UBF s’attache à UCE (élément du command en amont)
SL1 lie UBF-ADN grâce à sa TBP
UBF recrute pol 1
L’ARN pol 3 synthétise quoi
petits ARN : ARNt et ARNr 5S
Comment fonctionne l’initiation de l’ARN pol 3
TF3C lie boite A et boite B
Recrute ensuite TF3B + pol 3 + TBP
Quelles sont les caractéristiques des petits ARN nucléaires (ARN non codants)
1000 bases contenants bcp de U
Fortements appariés et bcp dans le noyau (100k)
Font partie de snRNP à multiples fonctions
Sm = site de liaison aux prot
Que font les prot Sm
Ceux sont des antigènes ciblés par les anticorps anti-sm chez les gens avec LED (Lupus e. dissiminé = maladie auto-immune)
Les introns du groupe 1 se trouve chez qui ?
Protozoaires
Les introns du groupe 2 se trouve chez qui ?
Mitochondries
Qu’est-ce que l’autoépissage
L’ARN catalyse toutes les réactions d’épissage
Le spliceosome ressemble à quoi ?
Introns groupe 2
Quelles sont les autres ribozymes à part le spliceosome
Hammerhead, hairpin, ribosome
Quelles sont les types d’ARN interférentes
siRNA
miRNA
piRNA
Rôles des ARN interferentes
Reconnaitre ARN spécifique
Reconnaitre ARN aberrantes et toxiques produites par les transposons et les séquences répétées
En résumé : inhibition des ARNm
-fonctionne comme guide pour cibler les ARN spécifiques (ARNm ou ARN toxiques)
Qui a remporté le prix Nobel 2006
Craig Mellow
Andrew Fire
Quelles sont les tailles des ARN interférantes
simple brin entre 20-30nt
Quelles sont les fonctions de siRNA
Voie d’interférence à l’ARN commence par un ARN double brin
-Dicer catalyse la conversion de l’ARN double brin en siARN double brin
-RISC choisit un brin de l’ARN double brin
-RISC a une activité de coupure de l’ARN cible
Que font les miARN
-ont 2 domaines: seed 3’ region
-a plusieurs cibles (forme paires de bases avec seed)
-RISC ne coupe ps les cibles, mais inhibent leur traduction
