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12 S Flashcards

1
Q

Qu’est-ce qu’une dégénerescence génétique

A

Plusieurs codons qui codent pour un seul acide aminé
ex: 6 pour SER, 4 pour Gly, 2 pour Lys

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Q

VRAI OU FAUX:
Plusieurs codons peuvent donner le même acides aminé
Un codon encode plusieurs acides aminés

A

VRAI
FAUX: Un codon encode seulement 1 acide aminé

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3
Q

Un codon produit cb d’acide aminé

Cb y’a-t-il de codons

A

1

64, dont 61 pour les acides aminés

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4
Q

Comment on appelle plusieurs codons spécifique à un seul acide aminé

A

Codons synonymes

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5
Q

Quels sont les seuls a.a spécifiés par 1 seul codon?

A

Méthionine (AUG)
Tryptophane (UGG)

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6
Q

Quelles codons sont des codons de terminaison

A

UAA, UGA, UAG

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7
Q

C’est quoi un cadre de lecture

Ouvert?

A

Point de départ potentiel d’une suite de codons

Partie du cadre de lecture ou il y a potentiel d’encoder une protéine et ou il n’y a pas de terminaison

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8
Q

Cb d’acide aminé a une protéine chez l’être humain

A

375 (1125 nt)

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9
Q

Que fait un décalage de lecture

A

Addition/perte de 1 ou 2 nt

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10
Q

Expliquer les différents types de mutation dans la traduction

A

Silencieuse :On change 1 nucléotide du codon: ne change pas l’acide aminé produit

Faux-sens: On chane 1 nucléotide: change l’acide aminé produit

Continuation : Anticodon qui codait pour STOP a été muté en un acide aminé donc la traduction continue

Non-sens : Codant qui code pour un acide aminé a été muté en codon STOP, donc la traduction s’arrête

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11
Q

Cb y’a-t-il d’espèces ARNt

Quelles sont les composants d’un ARNt

A

20 MINIMUM (1 pour chaque un acide aminé)

Structure en 2D:
1) Tige acceptrice à l’extrémité 3’ (CCA en haut)
2) Lobe Anticodon (opposée à la tige acceptrice, porte l’anticodon)
-Antiparallèles
-Séquence de 3 bases
3) Lobe tψc à droite
4) Lobe D (résidus dihydro-uridine) à gauche

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12
Q

Quelle est la séquence de la tige acceptrice en 5’-3’

A

CCA

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13
Q

Fonction du lobe anticodon?

A

Reconnaitre le codon
-appariements codon- anticodons sont antiparallèles

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14
Q

Qu’est-ce que le Wobble pairing
autre nom?

Que permet-il?

A

La flexibilité de conformation de la position 5’ de l’anticodon
(G-U)

Position de flottement

Désamination en position 5’ de l’anticodon pour donner une inosine

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15
Q

Que permet la présence d’inosine en 5’ de l’anticodon

A

ARNtAla portant IGC peut choisir de se lier à l’un des 3 codons spécifiant l’alanine (GCA, GCC et GCU) parce que I peut se lier à C, U et A

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16
Q

Comment appelle-t-on les ARNt qui possède le même acide aminé mais pas le même anticodon

A

Des ARNt isoaccepteurs

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17
Q

Comment l’acide aminé se lie au ARNt

A

Par covalence à l’extrémité 3’ de l’ARNt par l’aminoacyl-ARNt synthétase

Produit= aminoacyl-ARNt

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18
Q

Comment appelle-t-on les molécules d’aminoacyl-ARNt

A

ARNt activées
-car laison riche en énergie

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19
Q

Il existe cb d’aminoacyl-ARNt synthétase

A

Minimum 20 (1 pour chaque acide aminé pcq une synthétase peut reconnaitre plusieurs ARNt isoaccepteurs)

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20
Q

Comment se fait la synthèse de l’aminoacyl-ARNt synthétase

A

-Utilise ATP
-Interaction avec anticodon, face concave de la molécule d’ARNt et le site d’aminoacylation

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21
Q

Quelles sont les interactions observées dans la synthèse d’aminoacyl-ARNt

A

-Intéractions avec anticodon + Face concave de molécule d’ARNt + site d’aminoacylation

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22
Q

Quelles sont les 2 étapes de la synthèse de l’aminoacyl-ARNt

A

1- Formation d’un intermédiaire réactionnel (aminoacyl adénylate) : Acide aminé + ATP = Aminoacyl-adénylate + PPi
2- Transfert du groupe aminoacyl de l’intermédiaire à l’ARNt
Aminoacyl-adénylate + ARNt = Aminoacyl-ARNt + AMP

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23
Q

Quelles sont les unités ribosomales des procaryotes

A

30S (ARNr 16S vaut 1.5 kb) et 50S = 70S

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24
Q

Quelles sont les unités ribosomales des eucaryotes

A

60s et 40S = 80S

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25
Comment appelle-t-on les sous-unités de 40S
S-u Svedberg
26
Les ribosomes sont quoi De quelle manière est composé un ribosome
Des ribonucleoproteines 2/3 d’ARNr 1/3 de protéines
27
ARNr 23S a cb de kb ARNr 5S a cb de nt
2.9 120nt
28
Ou se place ARNt chargé qui porte la chaine naissante
Directement dans P
29
Quelle est la matrice de la synthèse protéique Que faut-il pour démarrer la synthèse protéique
L’ARNm Assemblage d’un complexe d’initiation au départ du cadre de lecture
30
Quelle est le rôle de la réaction d’initiation
Bon codon d’initiation et bon cadre doivent être choisis
31
La synthèse de la protéine commence sur quelle extrémité ?
Sur l’extrémité aminée
32
ARNt initiateur des eucaryotes vs eubactéries
Eubactérie : Utilise formyltransférase pour acquérir un fMet-ARNtfMet -1er a.a incorporé = formylméthionine Eucaryote: Met-ARNtiMet (ARNt initiateur n'est pas formylé) -1er a.a incorporé = méthionine
33
Comment se déroule l’initiation de la traduction chez les procaryotes
1) Dissociation des s-u ribosomales 2) Assemblage du complexe d'initiation 30S: petite s-u + complexe ternaire fMet-ARNtfMet se met sur AUG 3) 50S vient sur ARNm grâce à hydrolyse de GTP
34
Qui sont les facteurs d’initiation chez les procaryotes
IF-1 : S’attache sur 30S et provoque la dissociation entre les 2 s-u IF-2 : Prot de liaison au GTP, ramene ARNt initiateur + aide à sa fixation à 30S IF-3 : Fixe ARNm sur ribosome (empêche 30S de s’associer à 50S)
35
De quoi dépend le choix du codon d’initiation chez les procaryotes
-interaction entre anti-codon de l'ARNt et codon de l'ARNm -interaction entre 30S (petite s-u) et matrice d’ARNm
36
À quoi s’associe la 30S (avec les 3 IF et ARNt initiateur) chez les procaryotes
Région riche en purines placé en amont du codon initiateur ARNm (séquence Shine-Galgarno)
37
Comment s’appelle la séquence à laquelle s’attache 30S
Shine-Dalgarno
38
La séquence Shine-Delgarno s’associe à quoi (Quelle ARNr)
Elle est complémentaire à un segment riche en pyrimidines du bout 3' de la molécule d'ARNr 16S
39
Comment se déroule l’initiation de la traduction chez les eucaryotes
40S se fixe à 5’ de ARNm et parcourt de 5’ en 3’ jusqu’à ce qu’elle trouve le codon initiateur (Balayage) Elle privilègera son attachement à la séquence Kozacs (ACCAUGG)
40
Quelles sont les étapes de l’initiation chez les eucaryotes
Dissociation Assemblage complexe ternaire ARNt-Met et 40S Recrutement complexe ternaire sur le 5’ de l’ARNm et balayage Association 60S-40S
41
Quelles sont les facteurs d’initiation des eucaryotes
eIF2 eIF4F: -eIF4A -eIF4G -eIF4E
42
Que fait eIF2 Que fait eIF4F
Se lie à GTP, Met-ARNtiMet = complexe ternaire -ajout de 40S au complexe ternaire Lie complexe ternaire (40S + ARNt chargé) avec ARNm
43
C’est quoi le microcycle de 3 étapes dans l’élongation
Mise en place correcte de l’aminoacyl-ARNt au site A Formation de liaison peptidique Translocation (ce qui fait avancer le ribosome)
44
Quand est-ce que l’allongement commence
Quand le premier ARNt chargé non initiateur se met sur le site A
45
Par quoi est catalysée l’ajout de ARNt chargé au site A
par facteur d’élongation EF-Tu -possède site de fixation pour GTP
46
Quelle est la caractéristique de EF-Tu
Elle possède un site de liaison pour GTP ce qui lui permet de lier l’aminoacyl-ARNt avec le site A
47
À quoi sert de EF-Ts
Aide EF-Tu à échanger GDP en GTP
48
Équivalents de EF-Tu et EF-Ts chez les eucaryotes
EF1A EF1B
49
Dans quelle s-u se trouve l’anticodon Dans quelle s-u se trouve les extrémités aminoacylés
30S 50S
50
Que y’a-t-il dans l’interface 30S-50S
site de fixation de l'ARNm
51
Qu’est-ce qui permet le transfert d’un acide aminé à un autre ARNt
la peptidyl transférase (formation de la liaison peptidique) -se fait après l'hydrolyse de GTP -enzyme appartient à la grande s-u du ribosome
52
Ou se trouve la peptidyl transferase
Grande s-u ribosome
53
Que permet EF-G
Catalyse la translocation (ribosome glisse de 5’ en 3’, de 3nt/1 codon) -Ce glissement fait passer le peptidyl-ARNt du site A au site P -Hydrolyse de GTP
54
C’est quoi le bilan énergétique de chaque liaison peptidique
4 ATP: -ATP en AMP pour la synthèse de l'aminoacyl-ARNt synthétase -2 GTP utilisés durant l'élongation (EF-Ts et EF-G) HYDROLYSE DU GTP ASSURE L'IRÉVERSIBILITÉ DES RÉACTIONS DE LÉLONGATION
55
Comment se déroule la terminaison concrètement
Codons de terminaison ne sont pas reconnus par les ARNt, mais ils sont reconnus par des prot de relargage
56
Quel facteur de relargage reconnait quelle codon stop
RF1 UAA UAG RF2 UAA UGA
57
Que fait RF3
Lié à un GTP et rend plus efficace l’action des RF1 et RF2
58
Que se pass-t-il lors de la dernière translocation?
1 des 3 codons de terminaisons arrive en face du site A
59
Comment RF3-GTP catalyse RF1 et RF2?
La fixation des 2 au site A modifie l'activité de la peptidyl-transférase de sorte qu'elle hydrolyse la liaison ester du peptidyl-ARNt
60
Terminaison =
-hydrolyse de GTP -départ des facteurs de relargage -sous-unités du ribosome se détachent de l'ARNm et se dissocient
61
Cmb de facteurs de relargage procaryotes vs eucaryotes?
procaryotes= 3 eucaryotes = 2 (eRF1 ou eRF2 + RF3)

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