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bioCH > 12 S > Flashcards

12 S Flashcards

1
Q

Qu’est-ce qu’une dégénerescence génétique

A

Plusieurs codons qui codent pour un seul acide aminé
ex: 6 pour SER, 4 pour Gly, 2 pour Lys

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Q

VRAI OU FAUX:
Plusieurs codons peuvent donner le même acides aminé
Un codon encode plusieurs acides aminés

A

VRAI
FAUX: Un codon encode seulement 1 acide aminé

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3
Q

Un codon produit cb d’acide aminé

Cb y’a-t-il de codons

A

1

64, dont 61 pour les acides aminés

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4
Q

Comment on appelle plusieurs codons spécifique à un seul acide aminé

A

Codons synonymes

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5
Q

Quels sont les seuls a.a spécifiés par 1 seul codon?

A

Méthionine (AUG)
Tryptophane (UGG)

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6
Q

Quelles codons sont des codons de terminaison

A

UAA, UGA, UAG

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7
Q

C’est quoi un cadre de lecture

Ouvert?

A

Point de départ potentiel d’une suite de codons

Partie du cadre de lecture ou il y a potentiel d’encoder une protéine et ou il n’y a pas de terminaison

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8
Q

Cb d’acide aminé a une protéine chez l’être humain

A

375 (1125 nt)

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9
Q

Que fait un décalage de lecture

A

Addition/perte de 1 ou 2 nt

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10
Q

Expliquer les différents types de mutation dans la traduction

A

Silencieuse :On change 1 nucléotide du codon: ne change pas l’acide aminé produit

Faux-sens: On chane 1 nucléotide: change l’acide aminé produit

Continuation : Anticodon qui codait pour STOP a été muté en un acide aminé donc la traduction continue

Non-sens : Codant qui code pour un acide aminé a été muté en codon STOP, donc la traduction s’arrête

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11
Q

Cb y’a-t-il d’espèces ARNt

Quelles sont les composants d’un ARNt

A

20 MINIMUM (1 pour chaque un acide aminé)

Structure en 2D:
1) Tige acceptrice à l’extrémité 3’ (CCA en haut)
2) Lobe Anticodon (opposée à la tige acceptrice, porte l’anticodon)
-Antiparallèles
-Séquence de 3 bases
3) Lobe tψc à droite
4) Lobe D (résidus dihydro-uridine) à gauche

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12
Q

Quelle est la séquence de la tige acceptrice en 5’-3’

A

CCA

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13
Q

Fonction du lobe anticodon?

A

Reconnaitre le codon
-appariements codon- anticodons sont antiparallèles

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14
Q

Qu’est-ce que le Wobble pairing
autre nom?

Que permet-il?

A

La flexibilité de conformation de la position 5’ de l’anticodon
(G-U)

Position de flottement

Désamination en position 5’ de l’anticodon pour donner une inosine

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15
Q

Que permet la présence d’inosine en 5’ de l’anticodon

A

ARNtAla portant IGC peut choisir de se lier à l’un des 3 codons spécifiant l’alanine (GCA, GCC et GCU) parce que I peut se lier à C, U et A

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16
Q

Comment appelle-t-on les ARNt qui possède le même acide aminé mais pas le même anticodon

A

Des ARNt isoaccepteurs

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17
Q

Comment l’acide aminé se lie au ARNt

A

Par covalence à l’extrémité 3’ de l’ARNt par l’aminoacyl-ARNt synthétase

Produit= aminoacyl-ARNt

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18
Q

Comment appelle-t-on les molécules d’aminoacyl-ARNt

A

ARNt activées
-car laison riche en énergie

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19
Q

Il existe cb d’aminoacyl-ARNt synthétase

A

Minimum 20 (1 pour chaque acide aminé pcq une synthétase peut reconnaitre plusieurs ARNt isoaccepteurs)

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20
Q

Comment se fait la synthèse de l’aminoacyl-ARNt synthétase

A

-Utilise ATP
-Interaction avec anticodon, face concave de la molécule d’ARNt et le site d’aminoacylation

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21
Q

Quelles sont les interactions observées dans la synthèse d’aminoacyl-ARNt

A

-Intéractions avec anticodon + Face concave de molécule d’ARNt + site d’aminoacylation

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22
Q

Quelles sont les 2 étapes de la synthèse de l’aminoacyl-ARNt

A

1- Formation d’un intermédiaire réactionnel (aminoacyl adénylate) : Acide aminé + ATP = Aminoacyl-adénylate + PPi
2- Transfert du groupe aminoacyl de l’intermédiaire à l’ARNt
Aminoacyl-adénylate + ARNt = Aminoacyl-ARNt + AMP

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23
Q

Quelles sont les unités ribosomales des procaryotes

A

30S (ARNr 16S vaut 1.5 kb) et 50S = 70S

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24
Q

Quelles sont les unités ribosomales des eucaryotes

A

60s et 40S = 80S

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25
Q

Comment appelle-t-on les sous-unités de 40S

A

S-u Svedberg

26
Q

Les ribosomes sont quoi
De quelle manière est composé un ribosome

A

Des ribonucleoproteines

2/3 d’ARNr
1/3 de protéines

27
Q

ARNr 23S a cb de kb
ARNr 5S a cb de nt

A

2.9

120nt

28
Q

Ou se place ARNt chargé qui porte la chaine naissante

A

Directement dans P

29
Q

Quelle est la matrice de la synthèse protéique
Que faut-il pour démarrer la synthèse protéique

A

L’ARNm

Assemblage d’un complexe d’initiation au départ du cadre de lecture

30
Q

Quelle est le rôle de la réaction d’initiation

A

Bon codon d’initiation et bon cadre doivent être choisis

31
Q

La synthèse de la protéine commence sur quelle extrémité ?

A

Sur l’extrémité aminée

32
Q

ARNt initiateur des eucaryotes vs eubactéries

A

Eubactérie : Utilise formyltransférase pour acquérir un fMet-ARNtfMet
-1er a.a incorporé = formylméthionine

Eucaryote: Met-ARNtiMet (ARNt initiateur n’est pas formylé)
-1er a.a incorporé = méthionine

33
Q

Comment se déroule l’initiation de la traduction chez les procaryotes

A

1) Dissociation des s-u ribosomales
2) Assemblage du complexe d’initiation 30S:
petite s-u + complexe ternaire fMet-ARNtfMet se met sur AUG
3) 50S vient sur ARNm grâce à hydrolyse de GTP

34
Q

Qui sont les facteurs d’initiation chez les procaryotes

A

IF-1 : S’attache sur 30S et provoque la dissociation entre les 2 s-u
IF-2 : Prot de liaison au GTP, ramene ARNt initiateur + aide à sa fixation à 30S
IF-3 : Fixe ARNm sur ribosome (empêche 30S de s’associer à 50S)

35
Q

De quoi dépend le choix du codon d’initiation chez les procaryotes

A

-interaction entre anti-codon de l’ARNt et codon de l’ARNm
-interaction entre 30S (petite s-u) et matrice d’ARNm

36
Q

À quoi s’associe la 30S (avec les 3 IF et ARNt initiateur) chez les procaryotes

A

Région riche en purines placé en amont du codon initiateur ARNm (séquence Shine-Galgarno)

37
Q

Comment s’appelle la séquence à laquelle s’attache 30S

A

Shine-Dalgarno

38
Q

La séquence Shine-Delgarno s’associe à quoi (Quelle ARNr)

A

Elle est complémentaire à un segment riche en pyrimidines du bout 3’ de la molécule d’ARNr 16S

39
Q

Comment se déroule l’initiation de la traduction chez les eucaryotes

A

40S se fixe à 5’ de ARNm et parcourt de 5’ en 3’ jusqu’à ce qu’elle trouve le codon initiateur (Balayage)
Elle privilègera son attachement à la séquence Kozacs (ACCAUGG)

40
Q

Quelles sont les étapes de l’initiation chez les eucaryotes

A

Dissociation
Assemblage complexe ternaire ARNt-Met et 40S
Recrutement complexe ternaire sur le 5’ de l’ARNm et balayage
Association 60S-40S

41
Q

Quelles sont les facteurs d’initiation des eucaryotes

A

eIF2
eIF4F:
-eIF4A
-eIF4G
-eIF4E

42
Q

Que fait eIF2
Que fait eIF4F

A

Se lie à GTP, Met-ARNtiMet = complexe ternaire
-ajout de 40S au complexe ternaire

Lie complexe ternaire (40S + ARNt chargé) avec ARNm

43
Q

C’est quoi le microcycle de 3 étapes dans l’élongation

A

Mise en place correcte de l’aminoacyl-ARNt au site A
Formation de liaison peptidique
Translocation (ce qui fait avancer le ribosome)

44
Q

Quand est-ce que l’allongement commence

A

Quand le premier ARNt chargé non initiateur se met sur le site A

45
Q

Par quoi est catalysée l’ajout de ARNt chargé au site A

A

par facteur d’élongation EF-Tu
-possède site de fixation pour GTP

46
Q

Quelle est la caractéristique de EF-Tu

A

Elle possède un site de liaison pour GTP ce qui lui permet de lier l’aminoacyl-ARNt avec le site A

47
Q

À quoi sert de EF-Ts

A

Aide EF-Tu à échanger GDP en GTP

48
Q

Équivalents de EF-Tu et EF-Ts chez les eucaryotes

A

EF1A
EF1B

49
Q

Dans quelle s-u se trouve l’anticodon

Dans quelle s-u se trouve les extrémités aminoacylés

A

30S

50S

50
Q

Que y’a-t-il dans l’interface 30S-50S

A

site de fixation de l’ARNm

51
Q

Qu’est-ce qui permet le transfert d’un acide aminé à un autre ARNt

A

la peptidyl transférase (formation de la liaison peptidique)
-se fait après l’hydrolyse de GTP
-enzyme appartient à la grande s-u du ribosome

52
Q

Ou se trouve la peptidyl transferase

A

Grande s-u ribosome

53
Q

Que permet EF-G

A

Catalyse la translocation (ribosome glisse de 5’ en 3’, de 3nt/1 codon)
-Ce glissement fait passer le peptidyl-ARNt du site A au site P
-Hydrolyse de GTP

54
Q

C’est quoi le bilan énergétique de chaque liaison peptidique

A

4 ATP:
-ATP en AMP pour la synthèse de l’aminoacyl-ARNt synthétase
-2 GTP utilisés durant l’élongation (EF-Ts et EF-G)

HYDROLYSE DU GTP ASSURE L’IRÉVERSIBILITÉ DES RÉACTIONS DE LÉLONGATION

55
Q

Comment se déroule la terminaison concrètement

A

Codons de terminaison ne sont pas reconnus par les ARNt, mais ils sont reconnus par des prot de relargage

56
Q

Quel facteur de relargage reconnait quelle codon stop

A

RF1
UAA
UAG

RF2
UAA
UGA

57
Q

Que fait RF3

A

Lié à un GTP et rend plus efficace l’action des RF1 et RF2

58
Q

Que se pass-t-il lors de la dernière translocation?

A

1 des 3 codons de terminaisons arrive en face du site A

59
Q

Comment RF3-GTP catalyse RF1 et RF2?

A

La fixation des 2 au site A modifie l’activité de la peptidyl-transférase de sorte qu’elle hydrolyse la liaison ester du peptidyl-ARNt

60
Q

Terminaison =

A

-hydrolyse de GTP
-départ des facteurs de relargage
-sous-unités du ribosome se détachent de l’ARNm et se dissocient

61
Q

Cmb de facteurs de relargage procaryotes vs eucaryotes?

A

procaryotes= 3
eucaryotes = 2 (eRF1 ou eRF2 + RF3)

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