10 AS Flashcards

1
Q

Dit le nom complet de l’ADN et l’ARN

A

ADN:
acide désoxyribonucléique
ArN :
acide ribonucléique

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

De quoi son formés les nucléotides?

A

PO4(2-) et de nucléoside (constitués d’une base azoté et de pentose)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Explique les liaisons entre les molécules formant un nucléotide

A

Pentose - liaison phosphoester - phosphate (sucre à 5 c)
Pentose - liaison glycosidique -base azotée (formé d’azote et de carbone)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Quelles bases azotés sont:
a) des purines
b) des pyrimidines
c) font la liaison glycosidique à l’aide de l’azote (N) en position 9
d) font la liaison glycosidique à l’aide du N en position 1
e) ont deux cycle carboné
f)ont 1 cycle carboné

A

a) adénine et guanine
b) cytosine, thymine, uracile
c) les purines
d) les pyrimidines
e) purines
f) pyrimidines

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Comment on distingue un brin d’ADN d’un brin d’ARN

A

Deux différences
1)
ADN : on retrouve de la thymine
ARN : on retrouve de l’uracile a la place de la thymine
2)
ADN: 2-deoxy-beta-D-ribofuranose (c’est le pentose)
ARN: beta-D-ribofuranose
*la différence est qu’en position 2, ADN le pentose a un H et ARN il a un OH

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Au pH de la cellule, le phosphate des nucléotide est chargé comment

A

possède deux charges négatives

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Explique la structure d’un nucléoside

A

Formé d’une base azotée liée à un pentose

Liaison covalente N-glycosidique entre le C-1’ du sucre et N-1 des pyrimidines ou N-9 des purines

groupement OH:

Chez les ribonucléosides: en 2’, 3’ et 5’

Chez les désoxyribonucléosides : en 3’ et 5’

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Comment se forme les liaisons phosphoester entre le sucre et le phosphate?

A

OH du sucre est estérifiable par le PO4 (2-)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Nomme les nucléosides et explique la logique de la nomenclature

A

nomenclature : purine=osine, pyrimidine=idine

Adénosine, guanosine, cytidine, uridine

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

À quoi ressemble la structure de la majorité des nucléotides

A

ribonucléotides phosphorylés en 5’

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Quelle est la liaison qui lie les 2ieme et 3 ieme phosphate accroché au pentose?

A

liaison phosphoanhydre= riche en énergie

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Quelle est la principale fonction des nucléotides?

A

transfert d’un groupement phosphate ou diphosphate aà différents substrats (énergise les substrats)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Nomme une autre fonction des nucléotides

A

transfert d’un groupe adénilyl, guanidilyl, cytidilyl,uridilyl ou thmidilyl

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Différence entre un nucléoside et nucléotide

A

Nucléoside n’a pas de groupement phosphate

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Donne l’abréviation pour l’adénosine 5’-monophosphate, la molécule de sucre qui le compose et si on le retrouve dans l’ADN ou l’ArN

A

AMP, ribose, ARN

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Quelle liaison relie les nucléotides entre eux

A

liaison phosphodiester 3’-5’

17
Q

L’ADN et l’ARN sont des polymères ______ mais peuvent aussi être _______

A

linéaires
circulaires

18
Q

VRAI OU FAUX: la longueur des ADN et ARN est limitée

A

FAUX: elle est illimitée

19
Q

cmb de charges négatives par nucléotide?
cmb de charges négatives à l’extrémité 5’ ?

20
Q

Comment on détermine le nombre de molécules différentes selon les 4 types de monomères?

A

4 exposant n
ou n=nombre de nucléotide

21
Q

dans quel sens se synthétise l’adn et l’ArN et dans quel sens on note les nucléotide

A

5’ à 3’

22
Q

Explique la règle de chargaff (2)

A
  1. Ratio Pu/Py =1
  2. A=T et G=C

donc A+G = C+T mais A+T/G+C varie

23
Q

Lors du pairage de l’Adénine avec la tyrosine, comment a lieu la liaison

A

charge delta+ sur NH2 en pos 6 de l’Adénine rencontre charge delta -de O en pos 4 de la tyrosine

Charge delta - sur N en position 1 de l’adénine rencontre charge delta + de NH en position 3 de la tyrosine

2 liaisons

24
Q

Qu’est ce qui pourrait faire croire que les paires de base n’ont pas le meme diametre?

A

Parce qu’il y a trois liaisons entre G et C et seulement deux entre A-T et A-U

mais même diamètre des paires de bases

25
Qui a decouvert l'adN Comment?
Watson et crick Par analyse des patrons de diffraction des rayon X et des règles de Chargaff
26
Explique les différences entre AdN B, A et Z
A ADN B hélice droite, favorisée en milieu aqueux, 10-10,5 base/tour, 0,34nm entre les pb ADN A (forme déshydratée) hélice droite, 11 bases/tour, - espace entre les pb, + compacte, sillon égaux (pas de majeur et mineur) ADN-Z structure riche en G-C, hélice gauche, pas de sillon
27
Quelles forces stabilisent l'ADN B (5)
Effet hydrophobe (entre les paires de base) Force de Van der Waals (empilement des bases) Ponts H (AT et GC on se rappelle que GC plus fort que AT parceque 3 liaisons au lieu de 2) Ponts salins (groupe phosphodiester neg et cation mg++) Température de fusion
28
Explique les conditions qui font varier la température de fusion TM avec le graphique de l'absorbance
lorsque l'absorbance augmente, on a plus d'ADN simple brin Lorsque l'absorbance diminue, on a plus d'ADN double brin Si on a plus de A-T, la température de fusion sera plus faible parce que lien moins fort qu'avec G-C donc plus facile à briser et donc absorbance augmente plus rapidement Si on a plus de G-C température de fusion plus grande parce que besoin de plus d'énergie pour briser 3 liaison absorbance augmente plus tard
29
Explique la notion de température de fucsion TM
Température a laquelle 50% de l'ADN est simple brin et l'autre 50% est double brin
30
Quelle est la structure quaternaire de l'ADN
la chromatine
31
Qu'est ce que le nucléosome
octamère d'histone autour duquel l'ADN s'enroule Cela constitue le premier niveau d'enroulement
32
De quelles prot est composé l'histone riches en quoi?
5 protéines: H1, H2A, H2B, H3, H4 protéines basiques richez en lysine et arginine
33
Facteur de condensation du premier niveau d'enroulement
10X
34
Quelle structure on peut observer quand on met la chromatine en milieu de faible force ionique
il y a décondensation de la chromatine et on peut voir le collier de perle (ADN double brin qui lie les histones) perle= nucléosome
35
Combien de pb d'une perle à l'autre dans la structure en collier de perle
200pb (146 enroulées + 54 de liaisons)
36
Explique le deuxieme niveau de condensation de l'AdN
forme solénoide 6 nucléosomes par tour (1200pb/ tour) Stabilisation par l'histone H1 facteur de condensation 4X (40X au total avec le premier niveau)
37
Explique le troisième facteur de condensation
Boucles et mini bandes 60 000 à 150 000 pb ancrées à une charpente de protéine NON-HISTONE enroulement des boucles en mini-bandes de 18 loupes facteur d'enroulement 200x en tout 10X+4X+200X (8000)
38
Explique la structure du chromosome
Empilement de mini-bandes stabilisé par des complexes de prot et d'ARN 1 chromosome= 2,4x10*8 pb longueur 10 um 23 paires de chromo = 46 molécules d'ADN double-brin