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bioCH > 10 AS > Flashcards

10 AS Flashcards

1
Q

Dit le nom complet de l’ADN et l’ARN

A

ADN:
acide désoxyribonucléique
ArN :
acide ribonucléique

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Q

De quoi son formés les nucléotides?

A

PO4(2-) et de nucléoside (constitués d’une base azoté et de pentose)

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3
Q

Explique les liaisons entre les molécules formant un nucléotide

A

Pentose - liaison phosphoester - phosphate (sucre à 5 c)
Pentose - liaison glycosidique -base azotée (formé d’azote et de carbone)

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4
Q

Quelles bases azotés sont:
a) des purines
b) des pyrimidines
c) font la liaison glycosidique à l’aide de l’azote (N) en position 9
d) font la liaison glycosidique à l’aide du N en position 1
e) ont deux cycle carboné
f)ont 1 cycle carboné

A

a) adénine et guanine
b) cytosine, thymine, uracile
c) les purines
d) les pyrimidines
e) purines
f) pyrimidines

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5
Q

Comment on distingue un brin d’ADN d’un brin d’ARN

A

Deux différences
1)
ADN : on retrouve de la thymine
ARN : on retrouve de l’uracile a la place de la thymine
2)
ADN: 2-deoxy-beta-D-ribofuranose (c’est le pentose)
ARN: beta-D-ribofuranose
*la différence est qu’en position 2, ADN le pentose a un H et ARN il a un OH

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6
Q

Au pH de la cellule, le phosphate des nucléotide est chargé comment

A

possède deux charges négatives

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7
Q

Explique la structure d’un nucléoside

A

Formé d’une base azotée liée à un pentose

Liaison covalente N-glycosidique entre le C-1’ du sucre et N-1 des pyrimidines ou N-9 des purines

groupement OH:

Chez les ribonucléosides: en 2’, 3’ et 5’

Chez les désoxyribonucléosides : en 3’ et 5’

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8
Q

Comment se forme les liaisons phosphoester entre le sucre et le phosphate?

A

OH du sucre est estérifiable par le PO4 (2-)

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9
Q

Nomme les nucléosides et explique la logique de la nomenclature

A

nomenclature : purine=osine, pyrimidine=idine

Adénosine, guanosine, cytidine, uridine

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10
Q

À quoi ressemble la structure de la majorité des nucléotides

A

ribonucléotides phosphorylés en 5’

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11
Q

Quelle est la liaison qui lie les 2ieme et 3 ieme phosphate accroché au pentose?

A

liaison phosphoanhydre= riche en énergie

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12
Q

Quelle est la principale fonction des nucléotides?

A

transfert d’un groupement phosphate ou diphosphate aà différents substrats (énergise les substrats)

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13
Q

Nomme une autre fonction des nucléotides

A

transfert d’un groupe adénilyl, guanidilyl, cytidilyl,uridilyl ou thmidilyl

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14
Q

Différence entre un nucléoside et nucléotide

A

Nucléoside n’a pas de groupement phosphate

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15
Q

Donne l’abréviation pour l’adénosine 5’-monophosphate, la molécule de sucre qui le compose et si on le retrouve dans l’ADN ou l’ArN

A

AMP, ribose, ARN

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16
Q

Quelle liaison relie les nucléotides entre eux

A

liaison phosphodiester 3’-5’

17
Q

L’ADN et l’ARN sont des polymères ______ mais peuvent aussi être _______

A

linéaires
circulaires

18
Q

VRAI OU FAUX: la longueur des ADN et ARN est limitée

A

FAUX: elle est illimitée

19
Q

cmb de charges négatives par nucléotide?
cmb de charges négatives à l’extrémité 5’ ?

A

1
2

20
Q

Comment on détermine le nombre de molécules différentes selon les 4 types de monomères?

A

4 exposant n
ou n=nombre de nucléotide

21
Q

dans quel sens se synthétise l’adn et l’ArN et dans quel sens on note les nucléotide

A

5’ à 3’

22
Q

Explique la règle de chargaff (2)

A
  1. Ratio Pu/Py =1
  2. A=T et G=C

donc A+G = C+T mais A+T/G+C varie

23
Q

Lors du pairage de l’Adénine avec la tyrosine, comment a lieu la liaison

A

charge delta+ sur NH2 en pos 6 de l’Adénine rencontre charge delta -de O en pos 4 de la tyrosine

Charge delta - sur N en position 1 de l’adénine rencontre charge delta + de NH en position 3 de la tyrosine

2 liaisons

24
Q

Qu’est ce qui pourrait faire croire que les paires de base n’ont pas le meme diametre?

A

Parce qu’il y a trois liaisons entre G et C et seulement deux entre A-T et A-U

mais même diamètre des paires de bases

25
Q

Qui a decouvert l’adN
Comment?

A

Watson et crick
Par analyse des patrons de diffraction des rayon X et des règles de Chargaff

26
Q

Explique les différences entre AdN B, A et Z

A

A
ADN B

hélice droite, favorisée en milieu aqueux, 10-10,5 base/tour, 0,34nm entre les pb

ADN A (forme déshydratée)

hélice droite, 11 bases/tour, - espace entre les pb, + compacte, sillon égaux (pas de majeur et mineur)

ADN-Z

structure riche en G-C, hélice gauche, pas de sillon

27
Q

Quelles forces stabilisent l’ADN B (5)

A

Effet hydrophobe (entre les paires de base)

Force de Van der Waals (empilement des bases)

Ponts H (AT et GC on se rappelle que GC plus fort que AT parceque 3 liaisons au lieu de 2)

Ponts salins (groupe phosphodiester neg et cation mg++)

Température de fusion

28
Q

Explique les conditions qui font varier la température de fusion TM avec le graphique de l’absorbance

A

lorsque l’absorbance augmente, on a plus d’ADN simple brin

Lorsque l’absorbance diminue, on a plus d’ADN double brin

Si on a plus de A-T, la température de fusion sera plus faible parce que lien moins fort qu’avec G-C donc plus facile à briser et donc absorbance augmente plus rapidement

Si on a plus de G-C température de fusion plus grande parce que besoin de plus d’énergie pour briser 3 liaison absorbance augmente plus tard

29
Q

Explique la notion de température de fucsion TM

A

Température a laquelle 50% de l’ADN est simple brin et l’autre 50% est double brin

30
Q

Quelle est la structure quaternaire de l’ADN

A

la chromatine

31
Q

Qu’est ce que le nucléosome

A

octamère d’histone autour duquel l’ADN s’enroule

Cela constitue le premier niveau d’enroulement

32
Q

De quelles prot est composé l’histone
riches en quoi?

A

5 protéines: H1, H2A, H2B, H3, H4

protéines basiques richez en lysine et arginine

33
Q

Facteur de condensation du premier niveau d’enroulement

A

10X

34
Q

Quelle structure on peut observer quand on met la chromatine en milieu de faible force ionique

A

il y a décondensation de la chromatine et on peut voir le collier de perle (ADN double brin qui lie les histones)

perle= nucléosome

35
Q

Combien de pb d’une perle à l’autre dans la structure en collier de perle

A

200pb (146 enroulées + 54 de liaisons)

36
Q

Explique le deuxieme niveau de condensation de l’AdN

A

forme solénoide

6 nucléosomes par tour (1200pb/ tour)

Stabilisation par l’histone H1

facteur de condensation 4X (40X au total avec le premier niveau)

37
Q

Explique le troisième facteur de condensation

A

Boucles et mini bandes

60 000 à 150 000 pb ancrées à une charpente de protéine NON-HISTONE

enroulement des boucles en mini-bandes de 18 loupes

facteur d’enroulement 200x

en tout 10X+4X+200X (8000)

38
Q

Explique la structure du chromosome

A

Empilement de mini-bandes stabilisé par des complexes de prot et d’ARN

1 chromosome= 2,4x10*8 pb

longueur 10 um

23 paires de chromo = 46 molécules d’ADN double-brin

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