11 AS Flashcards
Comment classifie-t-on les types d’ARN
Selon leur relation avec les protéines
ARN codant vs non codant
codant : détermine la séquence d’une protéine
non codant : fonction directement accompli par l’ARN
Quelles sont les ARN non-codants les plus importants dans la traduction
ARNr et ARNt jouent un rôle dans la traduction
En terme de masse (%) quelle ARN est le plus abondant
En terme de quantité (%) quelle ARN est + nombreux
ARNr
ARNt
ARN vs ADN caractéristiques
-Ribose (2’-OH) vs Deoxyribose
U vs T
-Ribopolynucléotides MONOcaténaires
-Appariements de bases intramoléculaire
-Structures 3D variés
-Régions appariées + courte
-Plusieurs bases modifiées
Exemples de modifications des bases des molécules d’ARNt
-méthylation
-pseudo-uridylation (liaison N-glycosidique devient C-glycosidique)
Quelle est le dogme central de la biologie établi dans années 60
L’ARN fait des structures 3D complexes qui vont se former en protéine, ce qui tenait à faire croire que les premiers organismes étaient à l’origine des ARN
Qu’est-ce qu’un ribozyme
ARN doué d’avitité enzymatique
Quelles sont les caractéristiques des ribozymes
-Spécificité de substrat
-Non modifiés par la réaction
-Accélèrent les réactions, comme auto-épissage des introns, ARN de la ribonucléase P
ribosome est un ribozyme
Qui ont découvert les ribozymes
Cech et Altman
Que permet RNase P
C’est un ribozyme
Switch extrémité 3’OH avec une coiffe 5’
(rôle dans maturation ARNt)
De quelles ARN a-t-on besoin pour la transcription
-ARNt (apporte acides aminés à la machinerie de trad)
-ARNr : occupe + grande partie du ribosome
-ARNm : séquence complémentaire à un des brins d’ADN qui est traduit au niveau des ribosomes en protéines
En quoi consiste l’initiation de la transcription
Assemblage du complexe transcripteur au site d’initiation
L’ARN nouvellement synthétisé est libéré sous quelle forme
Molécule simple brin
-excepté une petite hélice ARN/ADN de 8-9 nt
Combien de sous-unités ont les procaryotes dans leur ARN pol
5
À quoi correspondent les RPB
RPB1 = b’
RPB2 = b
RPB3 = a
Quelles sont les étapes de la synthèse de l’ARN
- 3’OH attaque le P(a) d’un NTP
- Formation de liaison phophodiester
3.Libération de PPi
Quelle est la différence entre ADN pol et ARN pol
ARN pol n’a pas besoin d’amorce
C’est quoi un promoteur
Région de l’ADN ou s’amorce la transcription
Que permet sigma et chez qui
Permet reconnaissance du promoteur chez les procaryotes
Qu’est-ce qu’un opéron
L’ensemble des gènes qui sont transcrits quand le promoteur commence la transcription
Comment se fait la reconnaissance du promoteur chez les eucaryotes
Par des facteurs généraux de transcription
Y’a-t-il des opérons chez les eucaryotes ?
Non, car chaque gène possède en général son propre promoteur
Quelle séquence promotrice se trouve à -35
TTGACA
Quelle séquence promotrice se trouve à -10
TATAAT
Quelles sont les promoteurs de E. coli (procaryote)
TTGACA et TATAAT
Quels sont les 3 régions consensus?
-35, -10 et site d’initiation
TATA box équivaut à quelle région chez les procaryotes?
-10
Que fait sigma
Lie les séquences -35 et -10
Comment les cellules bactériennes regulent les différents patrons d’expression des gènes
En utilisant différents facteurs sigma, chacun spécifique d’une séquence promotrice différente
Pourquoi l’initiation de la transcription chez les eucaryotes ne peut pas commencer avec l’ARN pol et ses facteurs accessoires qui lient les séquences du promoteur
1) Pcq le génome non-codant deivient de plus en plus important compte tenu du fait que sa taille augmente selon le nombre de types cellulaires encore plus que le génome codant
2)La chromatine est une barrière pour l’ARN polymérase car elle enroule le noyau d’une manière extrêmement épaisse
Qu’a-t-on besoin pour le remodelage de la chromatine
-De facteurs de transcription spécifiques pour qu’ils ne lient pas le promoteur
-De complexe de remodelage pour qu’ils ouvrent la chromatine