11 AS (2) Flashcards by Amira Amira

Quelles sont les étapes de l’initiation de la transcription chez les eucaryotes

Remodelage de la chromatine
Recrutement médiateur
Recrutement de facteurs généraux de la transcription et de l’ARN polymérase

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À quoi sert le remodelage de la chromatine

À rendre les séquences d’ADN plus accessibles à la machinerie de transcription

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À quoi servent les facteurs spécifiques

Ils sont des pionniers, ils vont recruter les complexes qui vont ouvrir la chromatine et exposer la région du promoteur

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Que contiennent les complexe de remodelage de la chromatine

ATPase de la SNF2

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Que font les complexes de remodelage

Catalysent le glissement ou le déroulement des nucléosomes, éviction des histones ou l’échange d’histones

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Que possède les histones dans leur queue

N-terminale avec lysines qui peuvent être modifiés par acétylation ou méthylation

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La queue terminale des histones peuvent être modifiés par quoi

Acétylation/Méthylation

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Combien y’a-t-il d’histones et cb de types différents

8 histones 4 types

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Quelles modifications ferment la chromatine/repression des gènes

Méthylation des lys 9 et 27 de H3

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Quelles modifications servent à l’activation de la chromatine

Méthylation de la lys 4 H3
Acétylation des lys 9 H3
Acétylation lys 16 H4

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Que détermine le code des histones?

détermine la conformation ouverte ou fermée de la chromatine

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Pk l’acétylation aide à décompresser l’ADN

Pcq histones acétyltransferases (HAT) aident à decondenser l’ADN en ajoutant des groupements acétyles sur lys et est une marque d’activation

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Que fait HDAC

Annule les modification de l’acétylation sur lysine

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Que permet le médiateur de la transcription

Il recrute l’ARN pol 2 en présence des facteurs de transcription et s’attacher conjointement avec FGT
-entraine l’assemblage des complexes de préinitiation

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Quelle est l’équivalent des facteurs sigma chez les eucaryotes

Les FTG (TF2B)

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Qu’est-ce qu’un activateur

Facteurs de transcription ou facteurs de transcription spécifique

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Qui sont les FG

TF2A à TF2I

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Quelles FTG sont les mieux étudiés

TF2D et TF2H

À quoi sert TF2B et tf2d

Lient plusieurs éléments du promoteurs

De quoi est formé TF2D

TBP (TATA Binding protein)
TAF1,2,7

Pk TF2D a besoin d’autant d’éléments pour reconnaitre un promoteur

Pcq un gène peut contenir plusieurs éléments mais pas tous, ce qui fait en sorte que TF2D n’est pas composé des mêmes éléments selon le type cellulaire

Que fait TBP

Lie la boite TATA

Qui recrutent TAF1

Activateurs (fts)

Que fait le bromodomaine

Lie les histones acétyles

Que permettent les motifs de TAF1

-Lier TBP -Activité HAT H3 -Activité kinase -Activité ubiquitine ligase sur H1 -Bromodomaine peut lier lysines acétylées

Quelle rôles jouent la TF2H

Hélicase et kinase

Le domaine CTD de mammifères contiennent quoi

52 pseudorépétitions de la séquence YSPTSPS

Quelles sérines peuvent-elles être phosphorylées

2, 5 et 7

Comment le promoteur est dégagé dans la transcription

ARN pol fait transcription abortive (2-3 nt), reste collé au promoteur avec FGT TF2H permet à ARN pol de dégager le promoteur et perd contact avec la plupart des FGT

Que permet TF2H

-Formation de la bulle de transcription -Dégagement de promoteur -Mode élongation

En quoi consiste la formation de la bulle de transcription

Hélicases XPB, XPD = Déroulement de l’ADN = permet formation de la bulle de transcription = activation de l’ARN pol cdk7 + Sérine 5 CTD de la s-u RBP1 génère forme active de la pol 2.

Quelle est le problème de la forme active de l’ARN pol 2

Elle fait transcriptions abortives

Comment la bulle de transcription avance

ARN pol dégage le promoteur, hybride ARN-ADN atteint longueur max (10nt) et bulle de transcription avance 5’ vers 3’ par rapport au brin codant (juste 5’ vers 3’)

En quoi consiste le mode élongation

Recrutement de la kinase CDK9 pour phosphoryler le CTD en sérine 2

Initiation de la transcription chez les eubactéries

-facteur sigma aide ARN pol à lier promoteur -élément enhancer généralement proximal au moteur de base et est occupé par un ou quelques activateurs

Initiation de la transcription chez les archea

-FGT substituent facteurs sigma -Plusieurs enhancers en amont du promoteur pour recruter ARN polymérase et FGT

Initiation de la transcription chez les eucaryotes

-FGT augmentent -Activateurs lient enhancers qui peuvent être éloignés du promoteur de base -Médiateur aide activateurs à recruter ARN pol et FGT

C’est quoi Archea

3ème domaine du vivant Unicellulaires sans noyau très différents des eucaryotes et procaryotes

En quoi consiste l’élongation de la transcription

-2 brins d’ADN se séparent en avant du site de polymérisation et réhybrident en arrière du site de la sortie de l’ARN -Durant la transcription, la pince se referme sur l’ADN matriciel en bleu (haute processivité) -Taille de la bulle de transcription (24 nt) et ARN-ADN (9nt) demeurent constants

Qu’est-ce qui sépare l’hybride ARN-ADN

Une partie conservée de la pol 2, le gouvernail

Comment la correction sur épreuve se fait

-ARN mésapparié ressort du site actif à travers le canal par lequel rentre les nucléotides -TF2S situmule ARN pol à raboter ARN -Transcription reprend 3’ de l’ARN tronqué

Est-ce que l’octamère d’histones peut se dissocier au complet de l’ADN transcrit ?

Jamais

Comment se passe la terminaison de la transcription chez les procaryotes

But : déstabiliser l’hybride ADN-ARN qui est dans le site active de l’ARN polymérase à l’aide de 2 mécanismes

Qui a découvert la transcription

Francois Jacob et Jacques Monod