11 AS (2) Flashcards
Quelles sont les étapes de l’initiation de la transcription chez les eucaryotes
Remodelage de la chromatine
Recrutement médiateur
Recrutement de facteurs généraux de la transcription et de l’ARN polymérase
À quoi sert le remodelage de la chromatine
À rendre les séquences d’ADN plus accessibles à la machinerie de transcription
À quoi servent les facteurs spécifiques
Ils sont des pionniers, ils vont recruter les complexes qui vont ouvrir la chromatine et exposer la région du promoteur
Que contiennent les complexe de remodelage de la chromatine
ATPase de la SNF2
Que font les complexes de remodelage
Catalysent le glissement ou le déroulement des nucléosomes, éviction des histones ou l’échange d’histones
Que possède les histones dans leur queue
N-terminale avec lysines qui peuvent être modifiés par acétylation ou méthylation
La queue terminale des histones peuvent être modifiés par quoi
Acétylation/Méthylation
Combien y’a-t-il d’histones et cb de types différents
8 histones 4 types
Quelles modifications ferment la chromatine/repression des gènes
Méthylation des lys 9 et 27 de H3
Quelles modifications servent à l’activation de la chromatine
Méthylation de la lys 4 H3
Acétylation des lys 9 H3
Acétylation lys 16 H4
Que détermine le code des histones?
détermine la conformation ouverte ou fermée de la chromatine
Pk l’acétylation aide à décompresser l’ADN
Pcq histones acétyltransferases (HAT) aident à decondenser l’ADN en ajoutant des groupements acétyles sur lys et est une marque d’activation
Que fait HDAC
Annule les modification de l’acétylation sur lysine
Que permet le médiateur de la transcription
Il recrute l’ARN pol 2 en présence des facteurs de transcription et s’attacher conjointement avec FGT
-entraine l’assemblage des complexes de préinitiation
Quelle est l’équivalent des facteurs sigma chez les eucaryotes
Les FTG (TF2B)
Qu’est-ce qu’un activateur
Facteurs de transcription ou facteurs de transcription spécifique
Qui sont les FG
TF2A à TF2I
Quelles FTG sont les mieux étudiés
TF2D et TF2H
À quoi sert TF2B et tf2d
Lient plusieurs éléments du promoteurs
De quoi est formé TF2D
TBP (TATA Binding protein)
TAF1,2,7
Pk TF2D a besoin d’autant d’éléments pour reconnaitre un promoteur
Pcq un gène peut contenir plusieurs éléments mais pas tous, ce qui fait en sorte que TF2D n’est pas composé des mêmes éléments selon le type cellulaire
Que fait TBP
Lie la boite TATA
Qui recrutent TAF1
Activateurs (fts)
Que fait le bromodomaine
Lie les histones acétyles
Que permettent les motifs de TAF1
-Lier TBP
-Activité HAT H3
-Activité kinase
-Activité ubiquitine ligase sur H1
-Bromodomaine peut lier lysines acétylées
Quelle rôles jouent la TF2H
Hélicase et kinase
Le domaine CTD de mammifères contiennent quoi
52 pseudorépétitions de la séquence YSPTSPS
Quelles sérines peuvent-elles être phosphorylées
2, 5 et 7
Comment le promoteur est dégagé dans la transcription
ARN pol fait transcription abortive (2-3 nt), reste collé au promoteur avec FGT
TF2H permet à ARN pol de dégager le promoteur et perd contact avec la plupart des FGT
Que permet TF2H
-Formation de la bulle de transcription
-Dégagement de promoteur
-Mode élongation
En quoi consiste la formation de la bulle de transcription
Hélicases XPB, XPD = Déroulement de l’ADN = permet formation de la bulle de transcription = activation de l’ARN pol
cdk7 + Sérine 5 CTD de la s-u RBP1 génère forme active de la pol 2.
Quelle est le problème de la forme active de l’ARN pol 2
Elle fait transcriptions abortives
Comment la bulle de transcription avance
ARN pol dégage le promoteur, hybride ARN-ADN atteint longueur max (10nt) et bulle de transcription avance 5’ vers 3’ par rapport au brin codant (juste 5’ vers 3’)
En quoi consiste le mode élongation
Recrutement de la kinase CDK9 pour phosphoryler le CTD en sérine 2
Initiation de la transcription chez les eubactéries
-facteur sigma aide ARN pol à lier promoteur
-élément enhancer généralement proximal au moteur de base et est occupé par un ou quelques activateurs
Initiation de la transcription chez les archea
-FGT substituent facteurs sigma
-Plusieurs enhancers en amont du promoteur pour recruter ARN polymérase et FGT
Initiation de la transcription chez les eucaryotes
-FGT augmentent
-Activateurs lient enhancers qui peuvent être éloignés du promoteur de base
-Médiateur aide activateurs à recruter ARN pol et FGT
C’est quoi Archea
3ème domaine du vivant
Unicellulaires sans noyau très différents des eucaryotes et procaryotes
En quoi consiste l’élongation de la transcription
-2 brins d’ADN se séparent en avant du site de polymérisation et réhybrident en arrière du site de la sortie de l’ARN
-Durant la transcription, la pince se referme sur l’ADN matriciel en bleu (haute processivité)
-Taille de la bulle de transcription (24 nt) et ARN-ADN (9nt) demeurent constants
Qu’est-ce qui sépare l’hybride ARN-ADN
Une partie conservée de la pol 2, le gouvernail
Comment la correction sur épreuve se fait
-ARN mésapparié ressort du site actif à travers le canal par lequel rentre les nucléotides
-TF2S situmule ARN pol à raboter ARN
-Transcription reprend 3’ de l’ARN tronqué
Est-ce que l’octamère d’histones peut se dissocier au complet de l’ADN transcrit ?
Jamais
Comment se passe la terminaison de la transcription chez les procaryotes
But : déstabiliser l’hybride ADN-ARN qui est dans le site active de l’ARN polymérase à l’aide de 2 mécanismes
Qui a découvert la transcription
Francois Jacob et Jacques Monod
