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bioCH > 11 AS (2) > Flashcards

11 AS (2) Flashcards

1
Q

Quelles sont les étapes de l’initiation de la transcription chez les eucaryotes

A

Remodelage de la chromatine
Recrutement médiateur
Recrutement de facteurs généraux de la transcription et de l’ARN polymérase

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Q

À quoi sert le remodelage de la chromatine

A

À rendre les séquences d’ADN plus accessibles à la machinerie de transcription

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Q

À quoi servent les facteurs spécifiques

A

Ils sont des pionniers, ils vont recruter les complexes qui vont ouvrir la chromatine et exposer la région du promoteur

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4
Q

Que contiennent les complexe de remodelage de la chromatine

A

ATPase de la SNF2

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5
Q

Que font les complexes de remodelage

A

Catalysent le glissement ou le déroulement des nucléosomes, éviction des histones ou l’échange d’histones

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6
Q

Que possède les histones dans leur queue

A

N-terminale avec lysines qui peuvent être modifiés par acétylation ou méthylation

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7
Q

La queue terminale des histones peuvent être modifiés par quoi

A

Acétylation/Méthylation

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8
Q

Combien y’a-t-il d’histones et cb de types différents

A

8 histones 4 types

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9
Q

Quelles modifications ferment la chromatine/repression des gènes

A

Méthylation des lys 9 et 27 de H3

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10
Q

Quelles modifications servent à l’activation de la chromatine

A

Méthylation de la lys 4 H3
Acétylation des lys 9 H3
Acétylation lys 16 H4

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11
Q

Que détermine le code des histones?

A

détermine la conformation ouverte ou fermée de la chromatine

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12
Q

Pk l’acétylation aide à décompresser l’ADN

A

Pcq histones acétyltransferases (HAT) aident à decondenser l’ADN en ajoutant des groupements acétyles sur lys et est une marque d’activation

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13
Q

Que fait HDAC

A

Annule les modification de l’acétylation sur lysine

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14
Q

Que permet le médiateur de la transcription

A

Il recrute l’ARN pol 2 en présence des facteurs de transcription et s’attacher conjointement avec FGT
-entraine l’assemblage des complexes de préinitiation

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15
Q

Quelle est l’équivalent des facteurs sigma chez les eucaryotes

A

Les FTG (TF2B)

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16
Q

Qu’est-ce qu’un activateur

A

Facteurs de transcription ou facteurs de transcription spécifique

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17
Q

Qui sont les FG

A

TF2A à TF2I

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18
Q

Quelles FTG sont les mieux étudiés

A

TF2D et TF2H

19
Q

À quoi sert TF2B et tf2d

A

Lient plusieurs éléments du promoteurs

20
Q

De quoi est formé TF2D

A

TBP (TATA Binding protein)
TAF1,2,7

21
Q

Pk TF2D a besoin d’autant d’éléments pour reconnaitre un promoteur

A

Pcq un gène peut contenir plusieurs éléments mais pas tous, ce qui fait en sorte que TF2D n’est pas composé des mêmes éléments selon le type cellulaire

22
Q

Que fait TBP

A

Lie la boite TATA

23
Q

Qui recrutent TAF1

A

Activateurs (fts)

24
Q

Que fait le bromodomaine

A

Lie les histones acétyles

25
Q

Que permettent les motifs de TAF1

A

-Lier TBP
-Activité HAT H3
-Activité kinase
-Activité ubiquitine ligase sur H1
-Bromodomaine peut lier lysines acétylées

26
Q

Quelle rôles jouent la TF2H

A

Hélicase et kinase

27
Q

Le domaine CTD de mammifères contiennent quoi

A

52 pseudorépétitions de la séquence YSPTSPS

28
Q

Quelles sérines peuvent-elles être phosphorylées

A

2, 5 et 7

29
Q

Comment le promoteur est dégagé dans la transcription

A

ARN pol fait transcription abortive (2-3 nt), reste collé au promoteur avec FGT
TF2H permet à ARN pol de dégager le promoteur et perd contact avec la plupart des FGT

30
Q

Que permet TF2H

A

-Formation de la bulle de transcription
-Dégagement de promoteur
-Mode élongation

31
Q

En quoi consiste la formation de la bulle de transcription

A

Hélicases XPB, XPD = Déroulement de l’ADN = permet formation de la bulle de transcription = activation de l’ARN pol
cdk7 + Sérine 5 CTD de la s-u RBP1 génère forme active de la pol 2.

32
Q

Quelle est le problème de la forme active de l’ARN pol 2

A

Elle fait transcriptions abortives

33
Q

Comment la bulle de transcription avance

A

ARN pol dégage le promoteur, hybride ARN-ADN atteint longueur max (10nt) et bulle de transcription avance 5’ vers 3’ par rapport au brin codant (juste 5’ vers 3’)

34
Q

En quoi consiste le mode élongation

A

Recrutement de la kinase CDK9 pour phosphoryler le CTD en sérine 2

35
Q

Initiation de la transcription chez les eubactéries

A

-facteur sigma aide ARN pol à lier promoteur
-élément enhancer généralement proximal au moteur de base et est occupé par un ou quelques activateurs

36
Q

Initiation de la transcription chez les archea

A

-FGT substituent facteurs sigma
-Plusieurs enhancers en amont du promoteur pour recruter ARN polymérase et FGT

37
Q

Initiation de la transcription chez les eucaryotes

A

-FGT augmentent
-Activateurs lient enhancers qui peuvent être éloignés du promoteur de base
-Médiateur aide activateurs à recruter ARN pol et FGT

38
Q

C’est quoi Archea

A

3ème domaine du vivant
Unicellulaires sans noyau très différents des eucaryotes et procaryotes

39
Q

En quoi consiste l’élongation de la transcription

A

-2 brins d’ADN se séparent en avant du site de polymérisation et réhybrident en arrière du site de la sortie de l’ARN
-Durant la transcription, la pince se referme sur l’ADN matriciel en bleu (haute processivité)
-Taille de la bulle de transcription (24 nt) et ARN-ADN (9nt) demeurent constants

40
Q

Qu’est-ce qui sépare l’hybride ARN-ADN

A

Une partie conservée de la pol 2, le gouvernail

41
Q

Comment la correction sur épreuve se fait

A

-ARN mésapparié ressort du site actif à travers le canal par lequel rentre les nucléotides
-TF2S situmule ARN pol à raboter ARN
-Transcription reprend 3’ de l’ARN tronqué

42
Q

Est-ce que l’octamère d’histones peut se dissocier au complet de l’ADN transcrit ?

A

Jamais

43
Q

Comment se passe la terminaison de la transcription chez les procaryotes

A

But : déstabiliser l’hybride ADN-ARN qui est dans le site active de l’ARN polymérase à l’aide de 2 mécanismes

44
Q

Qui a découvert la transcription

A

Francois Jacob et Jacques Monod

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