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BIOLOGIE MOLECULAIRE > 6.5 Les ARNr et les ARNt > Flashcards

6.5 Les ARNr et les ARNt Flashcards

1
Q

vrai ou faux? les 3 transcriptases dans eucaryotes dependent des memes facteurs de transcription

A

FAUX: les 3 polymérases
dépendent de facteurs de
transcription différents.

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2
Q

l’initiation de la transcription par pol I (ARNr) et pol III (ARNt et ARNr 5S) est etroitement reliee a quoi?

A 
L’initiation de la transcription par
pol I (ARNr) et pol III (ARNt et ARNr 5S)
est étroitement reliée à la
prolifération et à la croissance
cellulaire
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3
Q

chez eucaryotes, un seul gene est transcrit par Pol I. Cest lequel?

A

Un seul gène, le précurseur des ARNr (18S,
5.8S et 28S), est transcrit par Pol I. C’est le
gène le plus transcrit du génome.

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4
Q

promoteur du gene transcrit par Pol I contient 2 elements. Que sont-ils?

A

Son promoteur contient 2 éléments: l’élément
central « core » essentiel à l’initiation et la
séquence UCE (upstream control element) qui
active la transcription x10.

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5
Q

comment pol I transcrit gene

A

Au début, les facteurs de transcription
spécifiques à Pol I se lient à la séquence UCE
(complexe UAF: 6 protéines dont 2 sont des
histones) et par la suite, à l’élément central
(facteur central: CF).
TBP fait partie du CF et y joue le même rôle
que pour Pol II et Pol III (liaison et courbure
d’ADN).

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6
Q

Dans une cellule en croissance, environ 80% de tous les ARN sont de quelle sorte?

A

ARNr

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7
Q

Dans une cellule en croissance, environ 15% de tous les ARN sont de quelle sorte?

A

ARNt

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8
Q

Dans une cellule en croissance, environ 5% de tous les ARN sont de quelle sorte?

A

ARNm

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9
Q

les ARNr matures quittent le noyau quand?

A

Les ARNr matures quittent le noyau seulement lorsqu’ils sont incorporés
dans les sous-unités ribosomales.

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10
Q

ARNr chez E.coli sont codes par quoi?

A

Les ARNr chez E. coli sont codés par 7 opérons (rrnA à G) et chacun est
transcrit en un long précurseur, 30S.

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11
Q

chez E. coli, le clivage de 30s par la RNase III produit quoi?

A

Le clivage de 30S par la RNase III produit les 3 ARNr matures: 16S (petite
sous-unité ribosomale) et 5S + 23S (grosse sous-unité ribosomale.

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12
Q

vrai ou faux?Les ARNr 18S, 5.8S et 27S sont inclus dans un même pré-ARNr 45S transcrit par
l’ARN Pol I. L’ARNr 5S est produit par un autre gène.

A

FAUX: Les ARNr 18S, 5.8S et 28S sont inclus dans un même pré-ARNr 45S transcrit par
l’ARN Pol I. L’ARNr 5S est produit par un autre gène.

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13
Q

les genes codant 45S sont organise comment?

A

Les gènes codant 45S sont organisés en tandem, séparés par 2 à 30 kb d’ADN
non transcrit. Ces régions génomiques sont toujours organisées dans la même
orientation 5’-3’ : 18S, 5.8S, 28S

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14
Q

ARNr sont produits ou?

A

Les ARNr sont produits dans les centres
fibrillaires du nucléole. Leur maturation se fait
autour de ces centres (dense fibrillar component)

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15
Q

les sous-unites ribosomales sont assemblees ou?

A

Les sous-unités ribosomales sont assemblées
en périphérie du nucléole (granular component)
et par la suite, exportées du noyau.

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16
Q

modifications chimiques du 45S se fait comment?

A 
Modifications chimiques du 45S :
plus de 100 réactions de
méthylation en 2’-OH des sucres
des nucléotides.
Plus de 100 isomérisation des
uridines en pseudouridines.
Chaque modification s’effectue à
une position précise dans la
séquence

Le but: une configuration 3D
particulière, des interactions
ARN-ARN ou ARN-protéines,
activités enzymatiques.

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17
Q

dans maturation des ARNr eucaryotes: les ARNsno (small nucleolar RNA) servent de quoi?

A

Les ARNsno (small nucleolar RNA)
servent de guide pour les
modifications chimiques et le clivage
du précurseur des ARNr

18
Q

la plupart des ARNsno font partie de quoi?

A 
La plupart de ces ARNsno font partie
de ribonucléoprotéines et se placent
à une séquence spécifique sur le 45S
par appariement de leur séquence
avec celle de l’ARNr.

Les enzymes de maturation peuvent
ainsi être recrutées aux bons
endroits.

19
Q

plusieurs ARNsno sont quoi?

A

Plusieurs ARNsno sont des introns
excisés des autres gènes, en
particulier des gènes codant les
protéines ribosomales.

20
Q

La transcription par l’ARN Pol III des ARNt et de l’ARNr 5S est régit par
quoi?

A

La transcription par l’ARN Pol III des ARNt et de l’ARNr 5S est régit par
des séquences à l’intérieur de la région codante (promoteurs internes)

21
Q

qu’est qui controlent la transcription des ARNt?

A

Les boîtes A et B contrôlent la transcription des ARNt. Ces régions correspondent à des
séquences conservées dans tous les ARNt et nécessaires à la traduction, soit les boucles D
et TѰC. La transcription de l’ARNr 5S est régie par une seule région, la boîte C.

22
Q

vrai ou faux? 2 facteurs multimériques TFIIIB (contient TBP et dirige la Pol-III)
et TFIIIC sont requis pour la transcription des ARNt et de l’ARNr 5S.
TFIIIA participe seulement à la transcription de l’ARNr 5S (un
adaptateur pour TFIIIC).

A

vrai

23
Q

ARNt matures contiennent cb de nucleotides?

A

Les ARNt matures contiennent 75-95
nucléotides, mais ils sont synthétisés sous
forme de précurseurs plus longs.

24
Q

la maturation des ARNt implique quoi?

A

La maturation implique un clivage au 5’
par la RNase P et modification de
plusieurs bases (environ 10% des nd).

25
Q

vrai ou faux? aucun ARNt peut etre episse

A

FAUX: Certains ARNt peuvent être épissés

26
Q

cest quand que ARNt quittent le noyau?

A

Les ARNt quittent le noyau

lorsqu’ils sont matures.

27
Q

ARNt subissent quoi comme modifications pendant sa maturation?

A
  • Les U en 3’ sont remplacés
    par CCA (un acide aminé est
    attaché à cette extrémité
    plus tard).

-Méthylation sur 2’ des
riboses (méthylguanine).

-Conversion de U spécifiques
en pseudouridine,
ribothymidine (T) ou
dihydrouridine (D).

28
Q

pour distinguer les ARNt, les AAS(aminoacyl-ARNt-synthétase) se basent sur quoi?

A

pour distinguer les ARNt, les AAS se basent sur
l’anticodon et le bras 3’ (sequences); et la boucle
variable (forme)

29
Q

aminoacyl-ARNt-synthétase (AAS) fait quoi?

A

reconnait ARNt et charge un a.a. sur le bras accepteur de l’ARNt: La boucle D de
l’ARNt aide à s’attacher à l’AAS. Il existe plusieurs AAS dont chacune est
spécifique à 1 a.a et reconnait les anticodons correspondants à cet a.a.

30
Q

aminoacyl-ARNt-synthetase fonctionne comment?

A 
1. Le site actif de l’enzyme se lie à un
acide aminé et à un ATP.
2. L’ATP est coupé pour lui enlever 2P.
L’AMP qui en résulte est collé sur
l’acide aminé (le a.a. est énergisé).
3. L’ARNt approprié déplace l’AMP du
site actif tout en se liant à l’acide
aminé toujours en place
4. L’enzyme libère l’aminoacyl-ARNt
(complexe formé d’un acide aminé
et d’un ARNt).
31
Q

il existe cb de types d’ARNt?

A

Il n’existe que 45 types d’ARNt

pour 61 codons d’acides aminés.

32
Q

cest quoi regle du wobble? (regle de la base fluctuante ou bancale)

A

L’appariement des bases 1 et 2 du codon avec les bases 3 et 2 de l’anticodon suit
les règles de l’appariement des bases A-U et C-G. Le numéro de chaque base est
selon l’ordre de 5’ vers 3’. La 3e position du codon peut cependant former des
appariements inhabituels, ce qui permet une certaine flexibilité à cette position:

La base au 5’ de l’anticodon est moins confinée dans l’espace:
possibilités des liaisons H inhabituelles en autant qu’ils ont la
même distance que les appariements «standards» de nucléotides.

33
Q

quels sont les avantages de la base fluctuante?

A
  1. moins d’ARNt nécessaires
  2. facilite la dissociation de l’ARNt
    pendant la synthèse protéique
    (liaison plus faible)
  3. les mutations en position 3 du
    codon sont, le plus souvent, sans
    conséquence.
34
Q

vrai ou faux? Un ARNt peut s’apparier avec 2 codons qui diffèrent par la 3e base.

A

VRAI: Un ARNt peut s’apparier avec 2 codons qui diffèrent par la 3e base.
Ces 2 codons doivent coder le même acide aminé

  1. Appariement Guanine-Uracile
  2. Présence d’une 5e base : l’inosine
35
Q

La terminaison de la transcription

du pré-ARNr par Pol I dépend de quoi?

A 
La terminaison de la transcription
du pré-ARNr par Pol I dépend d’un
facteur de terminaison spécifique.
Cette protéine se lie à une
séquence spécifique d’ADN en aval
du gène transcrit et arrête la pol I.
L’orientation de la séquence doit
être respectée
36
Q

La transcription par l’ARN Pol III

se termine quand?

A 
La transcription par l’ARN Pol III
se termine après que l’enzyme
eut incorporé une série de U à
la molécule d’ARN.
 L’hybride A-U ADN-ARN est le
plus instable et facilite
probablement le détachement
de l’ARN naissant.
37
Q

mitochondrie possede quel sorte d’ADN?

A

possèdent un petit ADN circulaire codant 13 protéines essentielles à
la fonction mitochondriale ainsi que des ARNr et ARNt.

38
Q

ARN des mitochondries sont transcrits par quoi?

A

une polymérase simple, apparentée aux
polymérases procaryotes. Cette polymérase est codée par l’ADN
nucléaire et l’enzyme est transportée dans la mitochondrie.

39
Q

vrai ou faux? l’ADN de la chloroplaste est plus petite que celui de la mitochondrie

A

FAUX:
Les chloroplastes
contiennent aussi une molécule d’ADN (plus volumineuse que celle
des mitochondries).

40
Q

ADN des chloroplastes contient quoi?

A

Les séquences des protomères α, β et β’ homologues à ceux de E. coli
sont incluses dans ce génome, et codent une ARN polymérase qu’on
peut isoler de chloroplastes.

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