6.3 Un ARNm mature Flashcards
vrai ou faux? Un ARNm mature contient toujours des régions non-codantes
vrai
dans un ARNm typique, les sequences noncodantes sont appelees comment?
Un ARNm typique contient toujours des séquences noncodantes à ses deux
extrémités, appelées régions 5’UTR et 3’UTR. Ces régions peuvent contenir
des éléments régulateurs
vrai ou faux? regions 5’UTR et 3’UTR ne peuvent pas contenir des elements regulateurs
FAUX: 5’UTR et 3’UTR peuvent contenir des elements regulateurs
la region codante est delimitee par quoi?
La région codante est délimitée par le codon initiateur (généralement AUG)
et un codon stop.
vrai ou faux? Certains transcrits sont altérés à la suite de leur transcription complète (au
niveau l’ARNm mature).
vrai: Par exemple, une base est changée par une autre. Ce
phénomène d’édition est relativement fréquent dans les mitochondries des
protozoaires et des plantes
le phenomene d’edition (transcrits sont altérés à la suite de leur transcription complète) est relativement frequent ou?
Ce
phénomène d’édition est relativement fréquent dans les mitochondries des
protozoaires et des plantes.
Chez les eucaryotes supérieurs, il est beaucoup plus rare et se limite à des changement mineurs (une seule base). Cette édition mineure a pourtant de grandes conséquences (changement de codon = changement d’a.a.).
Inosine se retrouve ou?
frequente dans les ARNt et essentielle pour la traduction
2 mecanismes controles de l’edition des bases
- desamination (A ou C)
- insertion/deletion d’uridine
1 seul ARNm mature des proteines ApoB produit quoi?
Un seul ARNm mature produit 2 protéines différentes: ApoB-100 et ApoB-48.
proteine ApoB-100 (pleine longueur) est produite ou?
La protéine ApoB-100 (pleine longueur) est produite dans le foie tandis que ApoB-48
(seulement les 48 premiers acides aminés) est produite dans l’intestin
difference entre ApoB-100 et ApoB-48
La protéine ApoB-100 (pleine longueur) est produite dans le foie tandis que ApoB-48
(seulement 48 acides aminés) est produite dans l’intestin.
ApoB-100 dans le transport des
lipides (foie) tandis que ApoB-48 dans l’absorption des lipides (intestin).
exemple d’edition des bases: les proteines ApoB
Un seul ARNm mature produit 2 protéines différentes: ApoB-100 et ApoB-48.
La protéine ApoB-100 (pleine longueur) est produite dans le foie tandis que ApoB-48
(seulement les 48 premiers acides aminés) est produite dans l’intestin.
Une enzyme intestinale désamine la cytosine C6666 dans l’exon 26 de l’ARNm:
le C devient un U et le codon CAA (glutamine) devient ainsi un codon UAA (stop).
La moitié commune de la protéine (les premiers 48 a.a.) lie les lipides et la seconde
moitié, lie les récepteurs lipidiques de la membrane cellulaire.
Les 2 protéines jouent ainsi un rôle très différent: ApoB-100 dans le transport des
lipides (foie) tandis que ApoB-48 dans l’absorption des lipides (intestin).
la concentration d’un ARNm dans la cellule depend de quoi?
- son taux de transcription
- sa stabilite (taux de degradation)
Chez les procaryotes, la demie-vie d’un ARNm n’est que de
quelques minutes. Chez les eucaryotes, un ARNm peut durer plusieurs heures
la stabilite d’un ARNm controle quoi?
La stabilité d’un ARNm contrôle l’arrêt de synthèse
d’une protéine (ARNm dégradé = arrêt de traduction)
ARNm stables: Traduction continue après arrêt de la transcription
ARNm non stables: Arrêt rapide de la production de protéines
la degradation de l’ARNm se fait a l’aide de quoi?
3 types d’enzymes
1) exonuclease a partir de 5’
2) exonuclease a partir de 3’
3) endonuclease
D’autres enzymes
spécifiques sont nécessaires selon le bout par lequel la dégradation commence.
dans mecanisme de degradation, avant de passer aux exonucleases 5’ regulieres, il faut faire quoi?
Avant de passer aux exonucléases 5’
régulières, il faut enlever le 7-
méthylguanylate par une enzyme
décoiffante
la plupart des ARNm sont degradees en commencant par quoi?
La plupart des ARNm sont dégradées en
commençant par la queue poly-A
Déadénylase (jaune), racourssit la suite des adénines
et les exonucléases 3’ régulières embarquent par la
suite. Ces dernières forment un complexe nommée
exosome.
deadenylase fait quoi?
Déadénylase (jaune), racourssit la suite des adénines
et les exonucléases 3’ régulières embarquent par la
suite. Ces dernières forment un complexe nommée
exosome.
les ARNm instables contiennent quel sequence?
Les ARNm instables contiennent plusieurs copies de la séquence AUUUA
dans leur extrémité 3’ non traduite.
pourquoi les ARNm qui contiennent plusieurs copies de la sequence AUUUA dans leur extremite 3’ non traduite sont instables?
Des protéines liant l’ARN (TTP/TIS11b) reconnaissent spécifiquement cette séquence. Ces protéines interagissent avec la déadénylase et l’exosome induisant une déadénylation rapide du messager suivi de sa dégradation 3’→5’.
Les TTP/TIS11b peuvent aussi recruter les enzymes nécessaires à la dégradation 5’→3’.
vrai ou faux? chaque ARNm est predestine a un type de degradation specifique
vrai
comment chaque ARNm est prédestiné à un type de dégradation spécifique
Le choix de la méthode dépend des protéines liées à l’ARNm. Ces protéines
réconnaissent certaines séquences et peuvent protéger le bout 5’ et/ou 3’.
La dégradation commence par l’endroit le moins protégé.
Peu importe la méthode utilisée, la durée de vie d’un ARNm est prédéfinie
par sa séquence (certaines protéines protectrices ainsi que les protéines
qui recrutent les enzymes de la dégradation sont séquence-spécifiques).
la duree de vie d’un ARNm est determine par quoi?
la durée de vie d’un ARNm est prédéfinie
par sa séquence (certaines protéines protectrices ainsi que les protéines
qui recrutent les enzymes de la dégradation sont séquence-spécifiques).
quels sont les sequences necessaires pour la regulation de la degradation?
1) 5’UTR (pas tranduit)
2) 3’UTR (pas traduit)
