6.0-6.1 les generalites de la maturation des ARNm, autres ARN et les extremites 5' et 3' de l'ARNm Flashcards

1
Q

les ARN polymerase produisent quoi?

A

une molecule d’ARN complementaire a la matrice d’ADN durant la transcription

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2
Q

vrai ou faux? chez les procaryotes, les ARN doivent etre modifies pour pouvoir jouer leur role

A

FAUX: Les ARN sont utilisés tels quels. En fait, puisqu’il n’y a pas de l’enveloppe
nucléaire, les ARNm peuvent recruter les ribosomes pour la traduction avant
même la fin de la transcription. Traduction co-transcriptionnelle

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3
Q

pourquoi chez les procaryotes les ARN sont utilises tels quels?

A

puisqu’il n’y a pas de l’enveloppe
nucléaire, les ARNm peuvent recruter les ribosomes pour la traduction avant
même la fin de la transcription. Traduction co-transcriptionnelle

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4
Q

vrai ou faux? les ARN sont utilises tels quels chez les eucaryotes

A

FAUX: Dans la plupart des cas, les ARN doivent être modifiés pour pouvoir jouer leur rôle. Ces modifications
diffèrent selon que l’on considère les ARNm, les ARNt ou les ARNr

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5
Q

qu’arrivent aux ARNm euca avant d’etre traduits?

A
Les ARNm euca
doivent subir une série
complexe de
modifications pendant
et après la transcription,
et être exportés du
noyau au cytoplasme
avant d’être traduits.
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6
Q

vrai ou faux? chaque etape du processus peut etre regulee par une cellule donnee durant un moment precis du developpement

A

vrai

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7
Q

quels sont les 3 processus qui ont lieu dans le noyau au fur et a mesure que le transcrit primaire est produit par l’ARN pol II?

A
1- ajout rapide de la coiffe en 5’ du
transcrit
2- épissage des exons, clivage 
3- polyadénylation de l’extrémité 3’ à
la fin de la transcription
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8
Q

l’epissage peut debuter quand?

A

dès que le premier intron a
complètement émergé de la polymérase, et se poursuit souvent après la fin
de la transcription

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9
Q

les facteurs de maturation de l’ARNm s’associent a quoi?

A

Les
enzymes responsables de l’assemblage de la coiffe, de la reconnaissance du
site de polyadénylation, et de l’épissage des exons sont associées au CTD
durant la transcription

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10
Q

vrai ou faux? la queue CTD est tres courte proportionnellement a la polymerase

A

FAUX: La queue CTD est très longue proportionnellement à la polymérase

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11
Q

l’association des facteur de maturation de l’ARNm au domaine CTD stimule quoi?

A

le taux de transcription par l’ARN pol II

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12
Q

la coiffe en 5’ est quoi?

A

La coiffe en 5’ est une 7-méthylguanylate (GTP méthylé en position 7) ajoutée
au transcrit initial lorsqu’il atteint 25-30 nt

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13
Q

la reaction d’ajout de coiffe est catalysee par quoi?

A

une

enzyme de la coiffe qui s’associe au domaine CTD phosphorylé de l’ARN pol II

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14
Q

etapes de l’ajout de coiffe

A

1- Une phosphatase retire le phosphate
γ du premier nucléotide du transcrit.

2- Une guanylyltransférase ajoute un
GMP en liaison inverse (5’-5’ avec un
pont triphosphate).

3- Une méthylase ajoute un
groupement CH3 sur la guanosine et
parfois sur les sucres des nt
adjacents

L’ajout de la coiffe défère légèrement entre les espèces, mais les trois
étapes sont toujours là.

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15
Q

role de la coiffe en 5’

A
  • La coiffe en 5’ distingue les ARNm des autres espèces d’ARN présents dans
    le noyau et les protègent contre la dégradation par les exonucléases
- La coiffe joue
également un rôle
important dans la
reconnaissance et la
traduction de l’ARNm
par les ribosomes dans
le cytoplasme.
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16
Q

coiffe en 5’ s’unit a quoi?

A

Elle s’unit à un complex protéique particulier, le CBC (cap binding complex:
Cbp80 + Cbp20), qui facilite la maturation correcte de l’ARNm et son
transport à travers le pore nucléaire

17
Q

Chez les eucaryotes, les ARNm ont une queue Poly (A) à quel extremite?

A

extremite 3’

18
Q

Chez les eucaryotes, la queue Poly (A) à l’extrémité 3’ fait quoi?

A

Elle
protège contre la dégradation par les exonucléases et permet l’exportation du
noyau vers le cytoplasme

19
Q

qu’arrive aux transcrits incorrectement polyadenyles?

A

Les transcrits incorrectement polyadénylés sont

rapidement dégradés dans le noyau

20
Q

vrai ou faux? Les transcrits primaires continuent au-delà du site où commence la séquence
Poly (A). Il y a donc clivage de l’extrémité 3’ avant l’ajout des adénines

A

vrai

21
Q

sequence AAUAAA est surtout retrouve ou?

A

Presque tous les ARNm trouvés dans les cellules animales contiennent la
séquence AAUAAA un peu en amont de la queue Poly (A).

Un autre élément de séquence important est une région riche en GU ou U un
peu en aval du site de clivage

22
Q

qu’arrive a la polyadenylation d’un transcrit si AAUAAA est mutee?

A

La polyadénylation

d’un transcrit est grandement réduite si cette séquence est mutée.

23
Q

CPSF fait quoi?

A

lie le transcrit primaire sur la

séquence AAUAAA

24
Q

CStF se lie avec quel region?

A

CStF se lie avec la région riche en G/U ou
en U. Il interagit avec CPSF, ce qui induit la
formation d’une boucle dans le transcrit

25
Q

mecanisme de polyadenylation en 3’

A

-CPSF lie le transcrit primaire sur la
séquence AAUAAA.

-CStF se lie avec la région riche en G/U ou
en U. Il interagit avec CPSF, ce qui induit la
formation d’une boucle dans le transcrit.

-Les protéines CFI et CFII se lient au
complexe et le stabilisent.

-Résultat: la structure est prête à récevoir
l’enzyme PAP et à être clivée (bon
positionnement de l’ARN).

-L’enzyme PAP (Poly (A)polymérase) se
joint au complexe. Elle stimule le
clivage du transcrit un peu en aval de
la première partie du signal de
polyadénylation.

-Le fait que la PAP soit nécessaire pour
le clivage du transcrit assure qu’il sera
rapidement polyadénylé après le
clivage (et donc protégé).

-Le clivage proprement dit est effectué
par le CF I et II (en vert)

-Les facteurs de clivage (CStF, CFI et II) et
l’extrémité 3’ clivé du transcrit sont
relâchés. Le fragment résiduel d’ARN est
rapidement dégradé (modèle torpedo).

-L’enzyme PAP ajoute alors une douzaine
d’adénines à l’extrémité 3’ libre.

-Ce fragment Poly (A) initial recrute la
protéine PABPII.

-La présence de PABPII (une par chaque
tranche de 12 A) accélère la réaction de
polyadénylation par PAP.

-Lorsque la queue poly (A) atteint 200-250
nucléotides, PABPII signale l’arrêt de la
réaction.

26
Q

proteines CFI et CFII font quoi?

A

Les protéines CFI et CFII se lient au

complexe et le stabilisent

27
Q

le fait que la PAP soit necessaire pour le clivage du transcrit assure quoi?

A

Le fait que la PAP soit nécessaire pour
le clivage du transcrit assure qu’il sera
rapidement polyadénylé après le
clivage (et donc protégé).

28
Q

dans la polyadenylation en 3’, le clivage est effectue par quoi?

A

le CF I et II

29
Q

quels sont les facteurs de clivage?

A

CStF, CFI et II

30
Q

Fragment Poly A initial recrute quoi?

A

la proteine PABPII

31
Q

La présence de PABPII (une par chaque

tranche de 12 A) fait quoi?

A

La présence de PABPII (une par chaque
tranche de 12 A) accélère la réaction de
polyadénylation par PAP.

32
Q

cest quand que PABPII signale l’arret de la reaction?

A

Lorsque la queue poly (A) atteint 200-250
nucléotides, PABPII signale l’arrêt de la
réaction