5.3 Les etapes Flashcards
etapes de l’initiation
1- ARN pol se lie au promoteur: il y a formation du “complexe ferme”
2- la double helice d’ADN est ouverte sur environ 14 nt: formation d’une bulle de transcription: “complexe ouvert”
3- Les ribonucléotides initiaux, moins que 10,
sont assemblés sur la matrice (processus
inefficace): «complexe de transcription
initiale». Par contre, l’enzyme s’y prend à
plusieurs reprises avant d’échapper au
promoteur (de petits transcrits sont
souvent relâchés à ce stade).
etapes de l’elongation
1- Lorsque la synthèse dépasse le stade des 10 nd, elle se poursuit jusqu’à la fin.
C’est-à-dire que le complexe de transcription initial a réussi à former le
complexe ternaire stable (ARNpol-ADN-ARN). Au fur et à mesure, l’ARN pol
ouvre l’ADN devant elle, ferme l’ADN derrière elle, et synthétise l’ARN
etape de la termination
1- La terminaison est le signal qui permet de décrocher l’ARN pol et de larguer
l’ARN nouvellement synthétisé.
c’est quoi un promoteur?
une séquence d’ADN en amont du gène transcrit
qu’est qui determine les parties du genome a transcrire?
-les sequences promotrices
qu’est-ce qui determine l’orientation du gene?
- La liaison de la polymérase au promoteur se fait dans une
orientation particulière, ainsi le promoteur détermine quel brin sera
matrice pour la transcription et dans quel sens la transcription se fera.
qu’est ce qui determine la force d’un promoteur?
La « force » d’un promoteur est déterminée par le nombre de transcrits
générés à partir de ce promoteur dans un laps de temps donné.
les facteurs qui influencent la force d’un promoteur
1- La capacité du promoteur à lier l’ARN polymérase: plus de points de
contact entre l’enzyme et la séquence d’ADN = promoteur plus fort.
Ces points doivent être réconnus et liés
2- Une isomérisation efficace: le passage du complexe fermé au
complexe ouvert. La bulle de transcription apparait rapidement
dans un promoteur fort
3- La facilité de l’ARN pol à échapper au promoteur: le passage du
complexe de transcription initial vers le complexe ternaire stable
(début de la phase d’élongation passé le 10 premiers nds)
quel genre de sequence est favorable pour un promoteur fort?
la présence de A/T dans le promoteur (surtout à la région où l’ADN sera ouvert) est utile pour utiliser moins d’énergie afin d’ouvrir le double brin
quelle est la contradiction dans les 3 facteurs qui influencent la force d’un promoteur? et quel est le compromis a faire?
la contradiction se trouve entre le premier facteur (capacité de l’ARN pol à lier le promoteur) ainsi que le troisième facteur (facilité de l’ARN pol à échapper le promoteur). Cela s’expliquerait par le fait que le promoteur doit attirer l’ARN pol avec une force suffisante afin qu’elle puisse s’y lier et le reconnaitre, mais pas trop grande afin que l’ARN pol puisse d’échapper pour amorcer la transcription de l’ADN
Un compromis doit être fait entre la force du complexe fermé et la facilité d’isomériser vers le complexe ouvert. Si le complexe fermé est trop fort cela rend la séparation des brins beaucoup plus ardue et la réversion vers le complexe fermé peut parfois même survenir
Le promoteur doit fortement lier la pol, mais cette liaison doit être de courte durée
