6. Na Translatie

Question 1

Wat is structural genomics ?

Answer 1

Onbekende eiwitstructuur voorspellen op basis van AZ sequentie

Question 2

Wat is Hsp70 ?

Answer 2

= Heat shock protein 70
= chaperone eiwit
* Als in eiwitseq uit ribosoom 7 tal hydrofobe AZ elkaar opvolgen, wordt het herkend door Hsp70
* Binding van ATP stelt hydrofobe bindingsplaats open voor interactie met hydrofobe eiwitdelen
* Omzetting ATP  ADP = hsp 70 sluit en eiwit deel neem juiste conformatie aan

Question 3

Wat is Hsp60 ?

Answer 3

= chaperotine
* Kamertje uit 2 ringen
* Eiwit juiste conformatie gekregen = conformatieverandering kamer waardoor deksel los komt

Question 4

Wat is proteolyse ?

Answer 4

hydrolyseren van polypeptideketens

Question 5

Wat doen protease ?

Answer 5

• proteïne selectief en gecontroleerd afbreken en AZ recycleren
• eiwitten uit voedsel afbreken tot korte polypeptideketens + AZ
• activering pro-enzymen door verwijdering eiwitfragmenten

Question 6

Wat doet chymotrypsine ?

Answer 6

Vertering eiwitten
In maag :
* Polypeptidebindingen bereikbaar voor proteasen en hydrolyseren ze
Dunne darm :
* Afbraak tot di- en tripeptiden
* Verdere afbraak intracellulair tot vrije AZ
!! chymotrypsine : extracellulair actief en splitst peptidebindingen selectief
* Covalente modificatie : nucleofiele aanval van actief Serine zorgt voor binding met substraat

Question 7

Wat gebeurt er in de catalytic traid ?

Answer 7

Aspartaat residu oriënteert histidine residu : His wordt dan betere acceptor voor p+ van Serine en His wordt zeer reactief en kan peptideketens aanvallen

Question 8

Wat is een hydrofobe pocket ?

Answer 8

Substraat-specifiteit van proteasen waarmee ze aan zijketens kunnen binden

Question 9

Wat zijn de 4 klassen in proteasen ?

Answer 9

• Serine protease : Serine is reactief residu
• Cysteïne protease
• Aspartyl protease
• Metalloprotease
  ! altijd nucleofiele aanval op carbonylgroep in peptide binding

Question 10

Wat zijn zymogenen ?

Answer 10

enzymen die gesynthetiseerd zijn als inactieve precursor

Question 11

Wat is Trasylol ?

Answer 11

Inhibitor aprotenin - bloedstolling
Serine protease inhibitor
* vroeger gebruikt bij traumatische of hemorragische shock maar had ernstige bijwerkingen

Question 12

Wat doet een proteasoom ?

Answer 12

Intracellulaire afbraak eiwitten (ATP afhankelijk)
* Ubiquitine merking
* Controlerende functie (afbraak cyclines, synchronisatie ORIs door cdc6)
* deksel : 19S dat geubiquineerde eiwitten herkent + 20S cilinder dat catalytische activiteit uitvoerd

Question 13

Wat doet het E1 enzyme ?

Answer 13

= ubiquitine-activerend enzyme
* Bestaat maar 1 van
* Ubiquitine-activerend enzym (ubi activeren en binden op sulfhydrylgroep van cysteïne-residu)

Question 14

Wat doet het E2 enzyme ?

Answer 14

= Ubiquitine-conjugerend enzym
* 1 familie met meerdere enzymen (transfer naar cysteïne residu)

Question 15

Wat doet het E3 enzyme?

Answer 15

= Ubiquitine-proteïne-ligase
* Meerdere families (ubi verplaatsen naar Lys van doeleiwit)

Question 16

Wat doet het HPV?

Answer 16

= Humane papillomavirussen
Gen dat codeert voor eiwit dat p53 eiwitten (tumor-suppresor eiwitten) stimuleert om af te breken
* Infectie : E6 eiwit expressie (> virus) * bindt met E6 -AP eiwit (> lichaamseigen) - dat complex zal als E3 reageren en p53 polyubiquineren

Question 17

Wat zijn de functies van poly-ubiquitine ?

Answer 17

• degratatiesignaal sturen
• groeit op Lys 48 waardoor het herkent wordt door een proteasoom
• stabiliseert eiwitten + herkenning door andere eiwitten

Question 18

Wat is de functie van monoubiquitine ?

Answer 18

histonen gemonoubiquineerd op histonstaart zorgt voor herkenning door specifieke types chromatine-remodellingcomplexen