4. Traducción Flashcards
¿Por qué el tRNA tiene esa forma?
Porque los nucleótidos son complementarios
Códigos de paro
Codones
UAA
UAG
UGA
Código de inicio
Metionina: AUG
Proceso de unión de aminoácido al tRNA
El aminoácido se une a ATP, se liberan dos fosfatos y queda aminoácido unido a AMP.
El AMP transfiere el aminoácido al tRNA, se libera AMP y queda un aminoacil-tRNA
¿Cómo se asegura que se una el aminoácido correcto al tRNA?
- Exclusión por tamaño: no cabe el aminoácido en el sitio de aminoacetilación
- Edición pre transferencia: se mete el aminoácido y se edita sin el tRNA
- Edición post-transferencia: se mete el aminoácido con el tRNA y en el sitio de edición se remueve
- Aminoácido correcto: se mete el aminoácido, se une al tRNA y no se remueve
Código genético: degenerado
Varios codones codifican para el mismo aminoácido. Los 2 primeros del tRNA son los importantes.
Codones importantes:
inicio: metionina: AGU
Término: UAA, UAG, UGA
Wobbling
Al momento de unión del codón con el anticodón, las primeras dos bases del codón tienen unión perfecta
La tercera base del codón se tambalea, puede ser G-C, U-A, A/G-U, U/C-G, U/C/A - I
Sitios del ribosoma
A: aminocil
P: peptidil
E: empty
Generalidades de la traducción
Los factores de iniciación meten a la metionina en el sitio P del ribosoma.
El factor de elongación Tu mete al siguiente aminoacil tRNA en el sitio A del ribosoma.
La ribosoma peptidil trasnferasa cataliza la formación del enlace peptídico
El factor de elongación G promueve el movimiento del complejo mRNA y tRNA
Se elonga lo necesario
Se reconoce el codón de paro,se libera la cadena.
El factor de reciclado RRF y la EFG promueven la liberación de tRNA y mRNA y la disociación del ribosoma
Iniciación de la traducción en bacterias
Están en la subunidad pequeña los factores IF1 en la posición A, IF3 en la posición E. La f-metionina se une al codón de inicio, el IF2 se une al IF1. El anti-shine-Dalgarno se une al shine-dalgarno, posición antes del codón de inicio.
Después se une la subunidad grande, que tiene GTPasa, rompe el GTP de la IF2, y se liberan los factores IF1, IF3 y GDP (IF2)
Proceso de iniciación de la traducción en los Eucariontes
En eucariontes se pliega el mRNA. Esto se logra por la PABP, que se une a un extremo del mRNA y los factores 4G, 4E, 4A, 4B que se unen al otro extremo y se unen a PABP.
El complejo de preiniciación se une a los factores 4, los cuales lo meten al sitio de inicio, utilizando energía de GTP a GDP del factor 2.
El complejo de preinicación está formado por la subunida pequeña, los factores 1(E), 1A (A), 3 y 5 unidos a 1, 2 GTP unido a la metionina en el sitio P.
Se une el factor elF5B, que con GTP mete la subunidad grande al ribosoma, y libera a el factor 1, 1A, 2, 3, 5 y el GDP utilizado.
Proceso de elongación en bacterias
Después de iniciado el proceso, se une el siguiente tRNA con el factor EFTu, para asegurarse que sea la unión adecuada. Una vez que se une, se utiliza el GTP del EFTu , se libera GDP y si fue la unión adecuada, se forma el enlace peptídico, si no, se libera el tRNA.
El factor de elongación G mueve al ribosoma para poder continuar con la elongación
Proceso de elongación en eucariontes
Se une el aa-tRNA (que incluye el factor EF1α con GTP). Se da la hidrólisis del GTP, se libera el factor EF1α, GDP y un fosfato. Se da cambios conformacionales en el ribosoma
Se forma el enlace peptídico, se trasloca el ribosoma por el factor EF2+GTP, después se libera el factor EF2 con GDP y un fosfato
Se vuelve a realizar el proceso
Formación del enlace peptídico en la traducción
El aminoácido que está en el sitio P forma el enlace con el del sitio A mediante la unión del NH2 del A con el RCOO’ del P
Traslocación en la traducción
En bacterias: factor de elongación G (EF-G)
En eucariontes: El EF2
Terminación de la traducción
Se da por los factores de liberación = RF1 pegado al tRNA. Desensamblan todo
En el codón de paro se unen el factror eRF1 y unido a éste el eRF3 con GTP. Se da la hidrólisis del GTP, se libera un fosfato, se queda el GDP que causa que se libere la cadena de aminoácidos, y se liberan los factores de terminación.
Queda el ribosoma con un tRNA sin aminoácido en la posición P
Fallas en la traducción
Falla en la terminación (nonsense suppression)
Cambio de aminoácidos (frameshifting): se recorren los codones y se leen combinados, causando que se unan tRNA incorrectos
Puromicina
se une al sitio A y se lleva toda la cadena de aminoácidos, impidiendo la formación de la proteína
¿Qué pasa cuando no se frena la traducción?
Después de la proteína truncada se sinteetiza una cadena de poli lisina.
Se une el factor Ski7 a la proteína truncada, el cual recluta exosomas. Los exosomas separan el ribosoma, degradan el mRNA y la proteasa degrada la proteína truncada
Qué sucede cuando se frena la traducción por un codón de paro prematuro
Cuando el ribosoma llega al codón de paro prematuro, se unen los factores upf1 y2, los cualez atraen a la enzima decapping, la cual quita el cap, y la endonucleasa deshace el mRNA
Antibióticos: lugares de inhibición
Inhiben la iniciación, inhiben la elongación, inhiben la traslocación
Antibióticos inhibidores de la iniciación
Edeína
Kasugamicina
Ortosomicina (avilamicina)
Pactamicina
Antibióticos inhibidores de la elongación
Aminoglucócidos (neomicina)
Anfenicoles (cloranfenicol)
Enaciloxina y kiromicinas (aurodox)
Lincosamidas (clindamicina)
Macrólidos (acitromicina)
Oxazoliciclonas (cicloserina)
Antibióticos inhibidores de la traslocación
Aminoglucósidos (spectinomicina)
Ácido fusídico (esteroide)
Ricina (proteína)
Tiopéptidos (micrococcina)
Tuberactinomicinas (capreomicina)
Otros antibióticos que inhiben la traducción
Pleuromutilina (retapamulina): inhiben la iniciación
Sparsomicina: inhibe la elongación
Estreptograminas (dalfopristinas): inhibe iniciación y elongación
Tetraciclinas: Inhibe la unión del ribosoma
Ribosomas en el retículo endoplásmico
El retículo endoplásmico tiene receptores de ribosomas, los ribosomas se unen a este receptor que tiene un complejo de traslocación de péptidos y un receptor SRP
La SRP se une a la señal de secuencia de la proteína producida, se une y ayuda a que el ribosoma se una al rc endoplásmico
Una vez que se une el ribosoma, se libera la SRP por la peptidasa señaladora. Cuando se termina de sintetizar, se libera todo el complejo y la proteína queda dentro del RE
